seq1 = pF1KB0463.tfa, 1527 bp
seq2 = pF1KB0463/gi568815581f_7183245.tfa (gi568815581f:7183245_7386626), 203382 bp

>pF1KB0463 1527
>gi568815581f:7183245_7386626 (Chr17)

1-33  (98691-98723)   100% ->
34-150  (100001-100117)   100% ->
151-323  (100229-100401)   100% ->
324-448  (100494-100618)   99% ->
449-564  (100730-100845)   100% ->
565-727  (100973-101135)   100% ->
728-915  (101241-101428)   100% ->
916-1020  (101591-101695)   100% ->
1021-1122  (101844-101945)   100% ->
1123-1326  (102461-102664)   100% ->
1327-1527  (103182-103382)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGTCGGGCTTCCAACAGATAGGCTCCGAA         GATGGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  98691 ATGCCGTCGGGCTTCCAACAGATAGGCTCCGAAGTA...CAGGATGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACCCCCTCAGCAGCGAGTGACTGGGACCCTGGTCCTTGCTGTGTTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 ACCCCCTCAGCAGCGAGTGACTGGGACCCTGGTCCTTGCTGTGTTCTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGGTGCTTGGCTCCCTGCAGTTTGGGTACAACATTGGGGTCATCAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 CGGTGCTTGGCTCCCTGCAGTTTGGGTACAACATTGGGGTCATCAATGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTCAGAAG         GTGATTGAACAGAGCTACAATGAGACGTGGCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100109 CCTCAGAAGGTG...CAGGTGATTGAACAGAGCTACAATGAGACGTGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGGGAGGCAGGGGCCTGAGGGACCCAGCTCCATCCCTCCAGGCACCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100261 GGGGAGGCAGGGGCCTGAGGGACCCAGCTCCATCCCTCCAGGCACCCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCACCCTCTGGGCCCTCTCCGTGGCCATCTTTTCCGTGGGCGGCATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100311 CCACCCTCTGGGCCCTCTCCGTGGCCATCTTTTCCGTGGGCGGCATGATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCCTCCTTCCTCATTGGTATCATCTCTCAGTGGCTTGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100361 TCCTCCTTCCTCATTGGTATCATCTCTCAGTGGCTTGGAAGGTT...CAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAAAGGGCCATGCTGGTCAACAATGTCCTGGCGGTGCTGGGGGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100494 GAAAAGGGCCATGCTGGTCAACAATGTCCTGGCGGTGCTGGGGGGCAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCATGGGCCTGGCCAACGCTGCTGCCTCCTATGAAATGCTCATCCTTGGA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100544 TCATGGGCCTGGCCAATGCTGCTGCCTCCTATGAAATGCTCATCCTTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGATTCCTCATTGGCGCCTACTCAG         GGCTGACATCAGGGCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100594 CGATTCCTCATTGGCGCCTACTCAGGTA...CAGGGCTGACATCAGGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGTGCCCATGTACGTGGGGGAGATTGCTCCCACTCACCTGCGGGGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100746 GGTGCCCATGTACGTGGGGGAGATTGCTCCCACTCACCTGCGGGGCGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGGGACGCTCAACCAACTGGCCATTGTTATCGGCATTCTGATCGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100796 TGGGGACGCTCAACCAACTGGCCATTGTTATCGGCATTCTGATCGCCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565          GTGCTGGGCTTGGAGTCCCTCCTGGGCACTGCCAGCCTGTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100846 GTG...CAGGTGCTGGGCTTGGAGTCCCTCCTGGGCACTGCCAGCCTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCCACTGCTCCTGGGCCTCACAGTGCTACCTGCCCTCCTGCAGCTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101014 GCCACTGCTCCTGGGCCTCACAGTGCTACCTGCCCTCCTGCAGCTGGTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGCTGCCCTTCTGTCCCGAGAGCCCCCGCTACCTCTACATCATCCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101064 TGCTGCCCTTCTGTCCCGAGAGCCCCCGCTACCTCTACATCATCCAGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTCGAGGGGCCTGCCAGAAAGA         GTCTGAAGCGCCTGACAGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101114 CTCGAGGGGCCTGCCAGAAAGAGTA...CAGGTCTGAAGCGCCTGACAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTGGGCCGATGTTTCTGGAGTGCTGGCTGAGCTGAAGGATGAGAAGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101260 CTGGGCCGATGTTTCTGGAGTGCTGGCTGAGCTGAAGGATGAGAAGCGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCTGGAGCGTGAGCGGCCACTGTCCCTGCTCCAGCTCCTGGGCAGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101310 AGCTGGAGCGTGAGCGGCCACTGTCCCTGCTCCAGCTCCTGGGCAGCCGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ACCCACCGGCAGCCCCTGATCATTGCGGTCGTGCTGCAGCTGAGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101360 ACCCACCGGCAGCCCCTGATCATTGCGGTCGTGCTGCAGCTGAGCCAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCTCTCTGGCATCAATGCT         GTTTTCTATTATTCGACCAGCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101410 GCTCTCTGGCATCAATGCTGTA...TAGGTTTTCTATTATTCGACCAGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCTTCGAGACAGCAGGGGTAGGCCAGCCTGCCTATGCCACCATAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101613 TCTTCGAGACAGCAGGGGTAGGCCAGCCTGCCTATGCCACCATAGGAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGTGTGGTCAACACAGTCTTCACCTTGGTCTCG         GTGTTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101663 GGTGTGGTCAACACAGTCTTCACCTTGGTCTCGGTA...CAGGTGTTGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGTGGAGCGGGCGGGGCGCCGGACGCTCCATCTCCTGGGCCTGGCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101852 GGTGGAGCGGGCGGGGCGCCGGACGCTCCATCTCCTGGGCCTGGCGGGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGTGTGGCTGTGCCATCCTGATGACTGTGGCTCTGCTCCTGCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101902 TGTGTGGCTGTGCCATCCTGATGACTGTGGCTCTGCTCCTGCTGGTA...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1123    GAGCGAGTTCCAGCCATGAGCTACGTCTCCATTGTGGCCATCTTTGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102458 TAGGAGCGAGTTCCAGCCATGAGCTACGTCTCCATTGTGGCCATCTTTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTTCGTGGCATTTTTTGAGATTGGCCCTGGCCCCATTCCTTGGTTCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102508 CTTCGTGGCATTTTTTGAGATTGGCCCTGGCCCCATTCCTTGGTTCATCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TGGCCGAGCTCTTCAGCCAGGGACCCCGCCCGGCAGCCATGGCTGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102558 TGGCCGAGCTCTTCAGCCAGGGACCCCGCCCGGCAGCCATGGCTGTGGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GGTTTCTCCAACTGGACGAGCAACTTCATCATTGGCATGGGTTTCCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102608 GGTTTCTCCAACTGGACGAGCAACTTCATCATTGGCATGGGTTTCCAGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TGTTGCG         GAGGCTATGGGGCCCTACGTCTTCCTTCTATTTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102658 TGTTGCGGTA...CAGGAGGCTATGGGGCCCTACGTCTTCCTTCTATTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CGGTCCTCCTGCTGGGCTTCTTCATCTTCACCTTCTTAAGAGTACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103216 CGGTCCTCCTGCTGGGCTTCTTCATCTTCACCTTCTTAAGAGTACCTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ACTCGAGGCCGGACGTTTGACCAGATCTCAGCTGCCTTCCACCGGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103266 ACTCGAGGCCGGACGTTTGACCAGATCTCAGCTGCCTTCCACCGGACACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CTCTCTTTTAGAGCAGGAGGTGAAACCCAGCACAGAACTTGAGTATTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103316 CTCTCTTTTAGAGCAGGAGGTGAAACCCAGCACAGAACTTGAGTATTTAG

   1600     .    :    .
   1511 GGCCAGATGAGAACGAC
        |||||||||||||||||
 103366 GGCCAGATGAGAACGAC