seq1 = pF1KB0462.tfa, 2928 bp
seq2 = pF1KB0462/gi568815591f_74408081.tfa (gi568815591f:74408081_74702430), 294350 bp

>pF1KB0462 2928
>gi568815591f:74408081_74702430 (Chr7)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-265  (104750-104891)   100% ->
266-517  (107265-107516)   100% ->
518-701  (110059-110242)   100% ->
702-1012  (111329-111639)   100% ->
1013-1102  (113128-113217)   100% ->
1103-1186  (115991-116074)   100% ->
1187-1370  (121654-121837)   100% ->
1371-1396  (127033-127058)   100% ->
1397-1505  (128087-128195)   100% ->
1506-1543  (130056-130093)   100% ->
1544-1624  (130600-130680)   100% ->
1625-1714  (131799-131888)   100% ->
1715-1762  (136675-136722)   100% ->
1763-1828  (137664-137729)   100% ->
1829-2012  (139023-139206)   100% ->
2013-2062  (147094-147143)   100% ->
2063-2119  (147358-147414)   100% ->
2120-2203  (149559-149642)   100% ->
2204-2387  (150781-150964)   100% ->
2388-2416  (151547-151575)   100% ->
2417-2494  (181771-181848)   100% ->
2495-2687  (182745-182937)   100% ->
2688-2725  (186934-186971)   100% ->
2726-2862  (192964-193100)   100% ->
2863-2928  (194285-194350)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTTGCTGGGTAAGCGCTGTGACGTCCCCACCAACGGCTGCGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTTGCTGGGTAAGCGCTGTGACGTCCCCACCAACGGCTGCGGACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACCGCTGGAACTCCGCGTTCACCCGCAAAGACGAGATCATCACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACCGCTGGAACTCCGCGTTCACCCGCAAAGACGAGATCATCACCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGTGTCTGCCTTAGACTCCATG         TGCTCAGCGCTGTCCAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 TCGTGTCTGCCTTAGACTCCATGGTG...CAGTGCTCAGCGCTGTCCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGAACGCCGAGGTGGCCTGTGTCGCCGTGCACGATGAGAGCGCCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104768 CTGAACGCCGAGGTGGCCTGTGTCGCCGTGCACGATGAGAGCGCCTTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTGGGCACAGAGAAGGGGAGAATGTTCCTGAATGCCCGGAAGGAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104818 GGTGGGCACAGAGAAGGGGAGAATGTTCCTGAATGCCCGGAAGGAGCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTCAGACTTCCTCAGGTTCTGCC         TCTCCGCAGCTCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104868 AGTCAGACTTCCTCAGGTTCTGCCGTG...CAGTCTCCGCAGCTCAGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGGGCAGCGACATCCCAGCTCGAAGGCCGGGTGGTGAGACGGGTGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107282 AGGGCAGCGACATCCCAGCTCGAAGGCCGGGTGGTGAGACGGGTGCTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTGGCCTCGCGTGCTCTGTGTCCCACAGGAGGGCCCCCGTGGAAGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107332 TGTGGCCTCGCGTGCTCTGTGTCCCACAGGAGGGCCCCCGTGGAAGGATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGGAGGCAGAGCACCCCAAGAAGGTGCAGCGGGGCGAGGGTGGAGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107382 CGGAGGCAGAGCACCCCAAGAAGGTGCAGCGGGGCGAGGGTGGAGGCCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCCTCCCTCGGTCCTCCCTGGAACATGGCTCAGATGTGTACCTTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107432 AGCCTCCCTCGGTCCTCCCTGGAACATGGCTCAGATGTGTACCTTCTGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAAGATGGTAGAGGAGGTGTTTGATGTTCTTTATA         GCGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 107482 GAAGATGGTAGAGGAGGTGTTTGATGTTCTTTATAGTA...CAGGCGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCCTGGGAAGGGCCAGTGTGGTGCCACTGCCCTATGAGAGGCTGCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110065 CCCTGGGAAGGGCCAGTGTGGTGCCACTGCCCTATGAGAGGCTGCTCAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGCCAGGGCTGCTGGCCGTGCAGGGGCTGCCCGAAGGCCTGGCCTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110115 GAGCCAGGGCTGCTGGCCGTGCAGGGGCTGCCCGAAGGCCTGGCCTTCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAGGCCAGCCGAGTATGACCCCAAGGCCCTCATGGCCATCCTGGAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110165 AAGGCCAGCCGAGTATGACCCCAAGGCCCTCATGGCCATCCTGGAACACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCCACCGCATCCGCTTCAAGCTCAAGAG         GCCACTTGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 110215 GCCACCGCATCCGCTTCAAGCTCAAGAGGTG...CAGGCCACTTGAGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGCGGGCGGGACTCGAAGGCCCTGGTGGAGCTGAACGGTGTCTCCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111342 GGCGGGCGGGACTCGAAGGCCCTGGTGGAGCTGAACGGTGTCTCCCTGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TCCCAAGGGGTCACGGGACTGTGGCCTGCATGGCCAGGCCCCCAAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111392 TCCCAAGGGGTCACGGGACTGTGGCCTGCATGGCCAGGCCCCCAAGGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CACCCCAGGACCTGCCCCCAACCGCCACCTCCTCCTCCATGGCCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111442 CACCCCAGGACCTGCCCCCAACCGCCACCTCCTCCTCCATGGCCAGCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTGTACAGCACGGCGCTCCCCAACCACGCCATCCGAGAGCTCAAGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111492 CTGTACAGCACGGCGCTCCCCAACCACGCCATCCGAGAGCTCAAGCAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AGCACCTTCCTGCCCCCTTGCCCCCAGCGACCTGGGCCTGAGTCGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111542 AGCACCTTCCTGCCCCCTTGCCCCCAGCGACCTGGGCCTGAGTCGGCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGCCAGAGCCCAAGGCCACCGGTGCCCAAGACTTCTCCGACTGTTGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 111592 TGCCAGAGCCCAAGGCCACCGGTGCCCAAGACTTCTCCGACTGTTGTGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1013        GACAGAAGCCCACTGGGCCTGGTGGGCCTCTCATCCAGAACGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111642 A...CAGGACAGAAGCCCACTGGGCCTGGTGGGCCTCTCATCCAGAACGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCATGCCTCCAAGCGCATTCTCTTCTCCATCGTCCATGACAAGTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 113171 CCATGCCTCCAAGCGCATTCTCTTCTCCATCGTCCATGACAAGTCAGGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1103       AGAAGTGGGACGCCTTCATAAAGGAAACCGAGGACATCAACACG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113221 ...TAGAGAAGTGGGACGCCTTCATAAAGGAAACCGAGGACATCAACACG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CTCCGGGAGTGTGTGCAGATCCTGTTTAACAGCAGATATG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 116035 CTCCGGGAGTGTGTGCAGATCCTGTTTAACAGCAGATATGGTG...CAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGAAGCCCTGGGCCTGGACCACATGGTCCCCGTGCCCTACCGGAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121655 GGAAGCCCTGGGCCTGGACCACATGGTCCCCGTGCCCTACCGGAAGATTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CCTGTGACCCGGAGGCTGTGGAGATCGTGGGCATCCCGGACAAGATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121705 CCTGTGACCCGGAGGCTGTGGAGATCGTGGGCATCCCGGACAAGATCCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TTCAAGCGCCCCTGCACTTATGGAGTCCCCAAGCTGAAGCGGATCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121755 TTCAAGCGCCCCTGCACTTATGGAGTCCCCAAGCTGAAGCGGATCCTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGAGCGCCATAGTATCCACTTCATCATTAAGAG         GATGTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 121805 GGAGCGCCATAGTATCCACTTCATCATTAAGAGGTG...CAGGATGTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ATGAGCGAATTTTCACAG         GGAACAAGTTTACCAAAGACACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 127041 ATGAGCGAATTTTCACAGGTA...CAGGGAACAAGTTTACCAAAGACACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ACGAAGCTGGAGCCAGCCAGCCCGCCAGAGGACACCTCTGCAGAGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128110 ACGAAGCTGGAGCCAGCCAGCCCGCCAGAGGACACCTCTGCAGAGGTCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TAGGGCCACCGTCCTTGACCTTGCTGGGAATGCTCG         GTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 128160 TAGGGCCACCGTCCTTGACCTTGCTGGGAATGCTCGGTG...CAGGTCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 ACAAGGGCAGCATGTCTGAAGACTGTGGGCCAG         GAACCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 130061 ACAAGGGCAGCATGTCTGAAGACTGTGGGCCAGGTG...CAGGAACCTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GGGGAGCTGGGCGGGCTGAGGCCGATCAAAATTGAGCCAGAGGATCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130608 GGGGAGCTGGGCGGGCTGAGGCCGATCAAAATTGAGCCAGAGGATCTGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CATCATTCAGGTCACCGTCCCAG         ACCCCTCGCCAACCTCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 130658 CATCATTCAGGTCACCGTCCCAGGTA...CAGACCCCTCGCCAACCTCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AGGAAATGACAGACTCGATGCCTGGGCACCTGCCATCGGAGGATTCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131817 AGGAAATGACAGACTCGATGCCTGGGCACCTGCCATCGGAGGATTCTGGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TATGGGATGGAGATGCTGACAG         ACAAAGGTCTGAGTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 131867 TATGGGATGGAGATGCTGACAGGTA...TAGACAAAGGTCTGAGTGAGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CGCGCGGCCCGAGGAGAGGCCCGTGGAGG         ACAGCCACGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 136694 CGCGCGGCCCGAGGAGAGGCCCGTGGAGGGTG...CAGACAGCCACGGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 ACGTGATCCGGCCCCTGCGGAAGCAGGTGGAGCTGCTCTTCAACACACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137676 ACGTGATCCGGCCCCTGCGGAAGCAGGTGGAGCTGCTCTTCAACACACGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TACG         CCAAGGCCATTGGCATCTCGGAGCCCGTCAAGGTGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137726 TACGGTG...CAGCCAAGGCCATTGGCATCTCGGAGCCCGTCAAGGTGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GTACTCCAAGTTTCTGATGCACCCGGAGGAGCTGTTTGTGGTGGGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139060 GTACTCCAAGTTTCTGATGCACCCGGAGGAGCTGTTTGTGGTGGGACTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CTGAAGGCATCTCCCTCCGCAGGCCCAACTGCTTCGGGATCGCCAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139110 CTGAAGGCATCTCCCTCCGCAGGCCCAACTGCTTCGGGATCGCCAAGCTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CGGAAGATTCTGGAGGCCAGCAACAGCATCCAGTTTGTCATCAAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 139160 CGGAAGATTCTGGAGGCCAGCAACAGCATCCAGTTTGTCATCAAGAGGTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2013       GCCCGAGCTGCTCACTGAGGGAGTCAAAGAGCCCATCATGGATA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139210 ...CAGGCCCGAGCTGCTCACTGAGGGAGTCAAAGAGCCCATCATGGATA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 GTCAAG         AGAGGGATTCCGGGGACCCTCTGGTGGACGAGAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147138 GTCAAGGTA...CAGAGAGGGATTCCGGGGACCCTCTGGTGGACGAGAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CTGAAGAGACAGGGCTTTCAAG         AAAATTATGACGCGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 147393 CTGAAGAGACAGGGCTTTCAAGGTA...CAGAAAATTATGACGCGAGGCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CTCACGGATCGACATCGCCAACACACTAAGGGAGCAGGTCCAGGACCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149578 CTCACGGATCGACATCGCCAACACACTAAGGGAGCAGGTCCAGGACCTTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 TCAATAAGAAATACG         GGGAAGCCTTGGGCATCAAGTACCCG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 149628 TCAATAAGAAATACGGTA...CAGGGGAAGCCTTGGGCATCAAGTACCCG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 GTCCAGGTCCCCTACAAGCGGATCAAGAGTAACCCCGGCTCCGTGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150807 GTCCAGGTCCCCTACAAGCGGATCAAGAGTAACCCCGGCTCCGTGATCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 CGAGGGGCTGCCCCCAGGAATCCCGTTCCGAAAGCCCTGTACCTTCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150857 CGAGGGGCTGCCCCCAGGAATCCCGTTCCGAAAGCCCTGTACCTTCGGCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 CCCAGAACCTGGAGAGGATTCTTGCTGTGGCTGACAAGATCAAGTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150907 CCCAGAACCTGGAGAGGATTCTTGCTGTGGCTGACAAGATCAAGTTCACA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GTCACCAG         GCCTTTCCAAGGACTCATCCCAAAGCCTG    
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 150957 GTCACCAGGTA...TAGGCCTTTCCAAGGACTCATCCCAAAGCCTGGTA.

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2417      ATGAAGATGACGCCAACAGACTCGGGGAGAAGGTGATCCTGCGGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151580 ..TAGATGAAGATGACGCCAACAGACTCGGGGAGAAGGTGATCCTGCGGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2462 AGCAGGTGAAGGAACTCTTCAACGAGAAATACG         GTGAGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 181816 AGCAGGTGAAGGAACTCTTCAACGAGAAATACGGTC...TAGGTGAGGCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 CTGGGCCTGAACCGGCCGGTGCTGGTCCCTTATAAACTAATCCGGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182753 CTGGGCCTGAACCGGCCGGTGCTGGTCCCTTATAAACTAATCCGGGACAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2553 CCCAGACGCCGTGGAGGTCACGGGTCTGCCTGATGACATCCCCTTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182803 CCCAGACGCCGTGGAGGTCACGGGTCTGCCTGATGACATCCCCTTCCGGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2603 ACCCCAACACGTACGACATCCACCGGCTGGAGAAGATCCTGAAGGCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182853 ACCCCAACACGTACGACATCCACCGGCTGGAGAAGATCCTGAAGGCCCGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 GAGCATGTCCGCATGGTCATCATTAACCAGCTCCA         ACCCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 182903 GAGCATGTCCGCATGGTCATCATTAACCAGCTCCAGTG...CAGACCCTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2694 TGCAGAAATCTGCAATGATGCCAAGGTGCCAG         CCAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 186940 TGCAGAAATCTGCAATGATGCCAAGGTGCCAGGTG...CAGCCAAAGACA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2735 GCAGCATTCCCAAGCGCAAGAGAAAGCGGGTCTCGGAAGGAAATTCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192973 GCAGCATTCCCAAGCGCAAGAGAAAGCGGGTCTCGGAAGGAAATTCCGTC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2785 TCCTCTTCCTCCTCGTCTTCCTCTTCCTCGTCCTCTAACCCGGATTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193023 TCCTCTTCCTCCTCGTCTTCCTCTTCCTCGTCCTCTAACCCGGATTCAGT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2835 GGCATCGGCCAACCAGATCTCACTCGTG         CAATGGCCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 193073 GGCATCGGCCAACCAGATCTCACTCGTGGTA...TAGCAATGGCCAATGT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2876 ACATGGTGGACTATGCCGGCCTGAACGTGCAGCTCCCGGGACCTCTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194298 ACATGGTGGACTATGCCGGCCTGAACGTGCAGCTCCCGGGACCTCTTAAT

   3150 
   2926 TAC
        |||
 194348 TAC