seq1 = pF1KB0459.tfa, 1524 bp
seq2 = pF1KB0459/gi568815579r_3678186.tfa (gi568815579r:3678186_3889347), 211162 bp

>pF1KB0459 1524
>gi568815579r:3678186_3889347 (Chr19)

(complement)

1-75  (100001-100075)   100% ->
76-135  (104464-104523)   100% ->
136-249  (104897-105010)   100% ->
250-365  (105109-105224)   100% ->
366-585  (105315-105534)   100% ->
586-679  (106129-106222)   100% ->
680-745  (107676-107741)   100% ->
746-845  (109551-109650)   100% ->
846-930  (109731-109815)   100% ->
931-1004  (109897-109970)   100% ->
1005-1200  (110161-110356)   100% ->
1201-1287  (110753-110839)   100% ->
1288-1524  (110926-111162)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGGACATTTCCCTGCTGAACGAAGAGAAGGCAGACCTCGGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGGACATTTCCCTGCTGAACGAAGAGAAGGCAGACCTCGGCGAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCCGTGGTCAGCAGCAGCTTCTG         GTGAGCCCCCGCTTCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100051 GACCCGTGGTCAGCAGCAGCTTCTGGTG...CAGGTGAGCCCCCGCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCGAGCCTGGCACCCCCCTCCCGTCTCAGCCAGGATGCCAACG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104480 TCCGAGCCTGGCACCCCCCTCCCGTCTCAGCCAGGATGCCAACGGTG...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    136    AGGCGCTGGGCCCCGGGCACCCAGTGTATCACCAAATGCGAGCACAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104894 CAGAGGCGCTGGGCCCCGGGCACCCAGTGTATCACCAAATGCGAGCACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCGCCCCAAGCCAGGGGAGCTGGCCTTCCGCAAGGGCGACGTGGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104944 CCGCCCCAAGCCAGGGGAGCTGGCCTTCCGCAAGGGCGACGTGGTCACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCTGGAGGCCTGCGAG         AACAAGAGCTGGTACCGCGTCAAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104994 TCCTGGAGGCCTGCGAGGTG...CAGAACAAGAGCTGGTACCGCGTCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CACCACACCAGTGGACAGGAGGGGCTGCTGGCAGCTGGGGCGCTGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105133 CACCACACCAGTGGACAGGAGGGGCTGCTGGCAGCTGGGGCGCTGCGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCGGGAGGCCCTCTCCGCAGACCCCAAGCTCAGCCTCATGCC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105183 GCGGGAGGCCCTCTCCGCAGACCCCAAGCTCAGCCTCATGCCGTG...CA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    366  GTGGTTCCACGGGAAGATCTCGGGCCAGGAGGCTGTCCAGCAGCTGCAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105314 GGTGGTTCCACGGGAAGATCTCGGGCCAGGAGGCTGTCCAGCAGCTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCTCCCGAGGATGGGCTGTTCCTGGTGCGGGAGTCCGCGCGCCACCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105364 CCTCCCGAGGATGGGCTGTTCCTGGTGCGGGAGTCCGCGCGCCACCCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGACTACGTCCTGTGCGTGAGCTTTGGCCGCGACGTCATCCACTACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105414 CGACTACGTCCTGTGCGTGAGCTTTGGCCGCGACGTCATCCACTACCGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCTGCACCGCGACGGCCACCTCACAATCGATGAGGCCGTGTTCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105464 TGCTGCACCGCGACGGCCACCTCACAATCGATGAGGCCGTGTTCTTCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACCTCATGGACATGGTGGAG         CATTACAGCAAGGACAAGGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105514 AACCTCATGGACATGGTGGAGGTG...CAGCATTACAGCAAGGACAAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CGCTATCTGCACCAAGCTGGTGAGACCAAAGCGGAAACACGGGACCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106149 CGCTATCTGCACCAAGCTGGTGAGACCAAAGCGGAAACACGGGACCAAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CGGCCGAGGAGGAGCTGGCCAGGG         CGGGCTGGTTACTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 106199 CGGCCGAGGAGGAGCTGGCCAGGGGTA...CAGCGGGCTGGTTACTGAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGCAGCATTTGACATTGGGAGCACAGATCGGAGAGGGAGAGTTTGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 107693 CTGCAGCATTTGACATTGGGAGCACAGATCGGAGAGGGAGAGTTTGGAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    746         CTGTCCTGCAGGGTGAGTACCTGGGGCAAAAGGTGGCCGTGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107743 TG...CAGCTGTCCTGCAGGGTGAGTACCTGGGGCAAAAGGTGGCCGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGAATATCAAGTGTGATGTGACAGCCCAGGCCTTCCTGGACGAGACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109593 AGAATATCAAGTGTGATGTGACAGCCCAGGCCTTCCTGGACGAGACGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTCATGAC         GAAGATGCAACACGAGAACCTGGTGCGTCTCCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109643 GTCATGACGTG...CAGGAAGATGCAACACGAGAACCTGGTGCGTCTCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGGCGTGATCCTGCACCAGGGGCTGTACATTGTCATGGAGCACGTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109764 GGGCGTGATCCTGCACCAGGGGCTGTACATTGTCATGGAGCACGTGAGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AG         GGCAACCTGGTGAACTTTCTGCGGACCCGGGGTCGAGCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109814 AGGTG...CAGGGCAACCTGGTGAACTTTCTGCGGACCCGGGGTCGAGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CTCGTGAACACCGCTCAGCTCCTGCAGTTTTCTCT         GCACGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 109936 CTCGTGAACACCGCTCAGCTCCTGCAGTTTTCTCTGTA...CAGGCACGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GGCCGAGGGCATGGAGTACCTGGAGAGCAAGAAGCTTGTGCACCGCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110167 GGCCGAGGGCATGGAGTACCTGGAGAGCAAGAAGCTTGTGCACCGCGACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TGGCCGCCCGCAACATCCTGGTCTCAGAGGACCTGGTGGCCAAGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110217 TGGCCGCCCGCAACATCCTGGTCTCAGAGGACCTGGTGGCCAAGGTCAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GACTTTGGCCTGGCCAAAGCCGAGCGGAAGGGGCTAGACTCAAGCCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110267 GACTTTGGCCTGGCCAAAGCCGAGCGGAAGGGGCTAGACTCAAGCCGGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GCCCGTCAAGTGGACGGCGCCCGAGGCTCTCAAACACGGG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 110317 GCCCGTCAAGTGGACGGCGCCCGAGGCTCTCAAACACGGGGTG...CAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AGTTCACCAGCAAGTCGGATGTCTGGAGTTTTGGGGTGCTGCTCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110754 AGTTCACCAGCAAGTCGGATGTCTGGAGTTTTGGGGTGCTGCTCTGGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GTCTTCTCATATGGACGGGCTCCGTACCCTAAAATG         TCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110804 GTCTTCTCATATGGACGGGCTCCGTACCCTAAAATGGTG...CAGTCACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GAAAGAGGTGTCGGAGGCCGTGGAGAAGGGGTACCGCATGGAACCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110931 GAAAGAGGTGTCGGAGGCCGTGGAGAAGGGGTACCGCATGGAACCCCCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AGGGCTGTCCAGGCCCCGTGCACGTCCTCATGAGCAGCTGCTGGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110981 AGGGCTGTCCAGGCCCCGTGCACGTCCTCATGAGCAGCTGCTGGGAGGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GAGCCCGCCCGCCGGCCACCCTTCCGCAAACTGGCCGAGAAGCTGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111031 GAGCCCGCCCGCCGGCCACCCTTCCGCAAACTGGCCGAGAAGCTGGCCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGAGCTACGCAGTGCAGGTGCCCCAGCCTCCGTCTCAGGGCAGGACGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111081 GGAGCTACGCAGTGCAGGTGCCCCAGCCTCCGTCTCAGGGCAGGACGCCG

   1600     .    :    .    :    .    :
   1493 ACGGCTCCACCTCGCCCCGAAGCCAGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 111131 ACGGCTCCACCTCGCCCCGAAGCCAGGAGCCC