seq1 = pF1KB0447.tfa, 1503 bp
seq2 = pF1KB0447/gi568815590r_27498459.tfa (gi568815590r:27498459_27714781), 216323 bp

>pF1KB0447 1503
>gi568815590r:27498459_27714781 (Chr8)

(complement)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-253  (104182-104307)   100% ->
254-402  (105696-105844)   100% ->
403-573  (108258-108428)   100% ->
574-985  (109447-109858)   99% ->
986-1090  (110387-110491)   100% ->
1091-1320  (114773-115002)   100% ->
1321-1503  (116147-116327)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGTTTGCAGCCAGCCCCAAAGGGGGTGTGTGCGCGAGCAGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGTTTGCAGCCAGCCCCAAAGGGGGTGTGTGCGCGAGCAGAGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATAAATACGGCGCCTCCCAGTGCCCACAACGCGGCGTCGCCAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATAAATACGGCGCCTCCCAGTGCCCACAACGCGGCGTCGCCAGGAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCGCGGGCACAGGGTGCCGCTGACCG         AGGCGTGCAAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 CGCGCGGGCACAGGGTGCCGCTGACCGGTG...CAGAGGCGTGCAAAGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCAGAATTGGAGGCATGATGAAGACTCTGCTGCTGTTTGTGGGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104196 TCCAGAATTGGAGGCATGATGAAGACTCTGCTGCTGTTTGTGGGGCTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGACCTGGGAGAGTGGGCAGGTCCTGGGGGACCAGACGGTCTCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104246 GCTGACCTGGGAGAGTGGGCAGGTCCTGGGGGACCAGACGGTCTCAGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGAGCTCCAGG         AAATGTCCAATCAGGGAAGTAAGTACGTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104296 ATGAGCTCCAGGGTG...CAGAAATGTCCAATCAGGGAAGTAAGTACGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATAAGGAAATTCAAAATGCTGTCAACGGGGTGAAACAGATAAAGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105725 AATAAGGAAATTCAAAATGCTGTCAACGGGGTGAAACAGATAAAGACTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATAGAAAAAACAAACGAAGAGCGCAAGACACTGCTCAGCAACCTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105775 CATAGAAAAAACAAACGAAGAGCGCAAGACACTGCTCAGCAACCTAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGCCAAGAAGAAGAAAGAG         GATGCCCTAAATGAGACCAGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105825 AAGCCAAGAAGAAGAAAGAGGTC...TAGGATGCCCTAAATGAGACCAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAATCAGAGACAAAGCTGAAGGAGCTCCCAGGAGTGTGCAATGAGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108279 GAATCAGAGACAAAGCTGAAGGAGCTCCCAGGAGTGTGCAATGAGACCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATGGCCCTCTGGGAAGAGTGTAAGCCCTGCCTGAAACAGACCTGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108329 GATGGCCCTCTGGGAAGAGTGTAAGCCCTGCCTGAAACAGACCTGCATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTTCTACGCACGCGTCTGCAGAAGTGGCTCAGGCCTGGTTGGCCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108379 AGTTCTACGCACGCGTCTGCAGAAGTGGCTCAGGCCTGGTTGGCCGCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574          CTTGAGGAGTTCCTGAACCAGAGCTCGCCCTTCTACTTCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108429 GTG...CAGCTTGAGGAGTTCCTGAACCAGAGCTCGCCCTTCTACTTCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATGAATGGTGACCGCATCGACTCCCTGCTGGAGAACGACCGGCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109488 GATGAATGGTGACCGCATCGACTCCCTGCTGGAGAACGACCGGCAGCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGCACATGCTGGATGTCATGCAGGACCACTTCAGCCGCGCGTCCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109538 CGCACATGCTGGATGTCATGCAGGACCACTTCAGCCGCGCGTCCAGCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATAGACGAGCTCTTCCAGGACAGGTTCTTCACCCGGGAGCCCCAGGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109588 ATAGACGAGCTCTTCCAGGACAGGTTCTTCACCCGGGAGCCCCAGGATAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTACCACTACCTGCCCTTCAGCCTGCCCCACCGGAGGCCTCACTTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109638 CTACCACTACCTGCCCTTCAGCCTGCCCCACCGGAGGCCTCACTTCTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TTCCCAAGTCCCGCATCGTCCGCAGCTTGATGCCCTTCTCTCCGTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109688 TTCCCAAGTCCCGCATCGTCCGCAGCTTGATGCCCTTCTCTCCGTACGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCCCTGAACTTCCACGCCATGTTCCAGCCCTTCCTTGAGATGATACACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109738 CCCCTGAACTTCCACGCCATGTTCCAGCCCTTCCTTGAGATGATACACGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGCTCAGCAGGCCATGGACATCCACTTCCACAGCCCGGCCTTCCAGCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 109788 GGCTCAGCAGGCCATGGACATCCACTTCCATAGCCCGGCCTTCCAGCACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CGCCAACAGAATTCATACGAG         AAGGCGACGATGACCGGACT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 109838 CGCCAACAGAATTCATACGAGGTG...CAGAAGGCGACGATGACCGGACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GTGTGCCGGGAGATCCGCCACAACTCCACGGGCTGCCTGCGGATGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110407 GTGTGCCGGGAGATCCGCCACAACTCCACGGGCTGCCTGCGGATGAAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCAGTGTGACAAGTGCCGGGAGATCTTGTCTGTGG         ACTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110457 CCAGTGTGACAAGTGCCGGGAGATCTTGTCTGTGGGTG...CAGACTGTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCACCAACAACCCCTCCCAGGCTAAGCTGCGGCGGGAGCTCGACGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114779 CCACCAACAACCCCTCCCAGGCTAAGCTGCGGCGGGAGCTCGACGAATCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CTCCAGGTCGCTGAGAGGTTGACCAGGAAATACAACGAGCTGCTAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114829 CTCCAGGTCGCTGAGAGGTTGACCAGGAAATACAACGAGCTGCTAAAGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CTACCAGTGGAAGATGCTCAACACCTCCTCCTTGCTGGAGCAGCTGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114879 CTACCAGTGGAAGATGCTCAACACCTCCTCCTTGCTGGAGCAGCTGAACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGCAGTTTAACTGGGTGTCCCGGCTGGCAAACCTCACGCAAGGCGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114929 AGCAGTTTAACTGGGTGTCCCGGCTGGCAAACCTCACGCAAGGCGAAGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CAGTACTATCTGCGGGTCACCACG         GTGGCTTCCCACACTTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 114979 CAGTACTATCTGCGGGTCACCACGGTG...TAGGTGGCTTCCCACACTTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGACTCGGACGTTCCTTCCGGTGTCACTGAGGTGGTCGTGAAGCTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116164 TGACTCGGACGTTCCTTCCGGTGTCACTGAGGTGGTCGTGAAGCTCTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 ACTCTGATCCCATCACTGTGACGGTCCCTGTAGAAGTCTCCAGGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116214 ACTCTGATCCCATCACTGTGACGGTCCCTGTAGAAGTCTCCAGGAAGAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CCTAAATTTATGGAGACCGTGGCGGAGAAAGCGCTGCAGGAATACCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116264 CCTAAATTTATGGAGACCGTGGCGGAGAAAGCGCTGCAGGAATACCGCAA

   1550     .    :    .
   1488 AAAGCACCGGGAGGAG
        |||||||||| |--||
 116314 AAAGCACCGGTA  AG