seq1 = pF1KB0442.tfa, 2706 bp
seq2 = pF1KB0442/gi568815584f_24268341.tfa (gi568815584f:24268341_24477702), 209362 bp

>pF1KB0442 2706
>gi568815584f:24268341_24477702 (Chr14)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-1196  (101159-102254)   100% ->
1197-1359  (104101-104263)   100% ->
1360-1559  (104831-105030)   100% ->
1560-1732  (105355-105527)   100% ->
1733-1873  (105986-106126)   100% ->
1874-1929  (107320-107375)   100% ->
1930-2056  (107635-107761)   100% ->
2057-2641  (107954-108538)   100% ->
2642-2706  (109298-109362)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGCGGCCAGCTGCGAGGATGAGGAGCTGGAATTTAAGCTGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGCGGCCAGCTGCGAGGATGAGGAGCTGGAATTTAAGCTGGTGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGGAGGAAAAGGAGGCCCCCCCGCTGGGCGCGGGGGGATTGGGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGGAGGAAAAGGAGGCCCCCCCGCTGGGCGCGGGGGGATTGGGGGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          AACTGGACTCAGAGGATGCCCCGCCATGCTGCCGTCTGGCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTT...CAGAACTGGACTCAGAGGATGCCCCGCCATGCTGCCGTCTGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGGGAGAGCCCCCTCCCTATGGCGCTGCACCTATCGGTATTCCCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101200 TTGGGAGAGCCCCCTCCCTATGGCGCTGCACCTATCGGTATTCCCCGACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCACCCCCTCGGCCTGGCATGCATTCGCCACCGCCGCGACCAGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101250 TCCACCCCCTCGGCCTGGCATGCATTCGCCACCGCCGCGACCAGCCCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CACCTGGCACCTGGGAGAGCCAGCCCGCCAGGTCGGTGAGGCTGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101300 CACCTGGCACCTGGGAGAGCCAGCCCGCCAGGTCGGTGAGGCTGGGAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCAGGAGGGGGTGCTGGGGGTGCTGGGGGTGGCCGTGTTCTCGAGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101350 CCAGGAGGGGGTGCTGGGGGTGCTGGGGGTGGCCGTGTTCTCGAGTGTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGCATCCGCATCACCTCCATCTCTCCCACGCCGGAGCCGCCAGCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101400 CAGCATCCGCATCACCTCCATCTCTCCCACGCCGGAGCCGCCAGCAGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGAGGACAACCCTGATGCCTGGGGGGACGGCTCTCCTAGAGATTACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101450 TGGAGGACAACCCTGATGCCTGGGGGGACGGCTCTCCTAGAGATTACCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCACCAGAAGGCTTTGGGGGCTACAGAGAAGCAGGGGGCCAGGGTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101500 CCACCAGAAGGCTTTGGGGGCTACAGAGAAGCAGGGGGCCAGGGTGGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGCCTTCTTCAGCCCAAGCCCTGGCAGCAGCAGCCTGTCCTCGTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101550 GGCCTTCTTCAGCCCAAGCCCTGGCAGCAGCAGCCTGTCCTCGTGGAGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCTTCTCCGATGCCTCTGACGAGGCAGCCCTGTATGCAGCCTGCGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101600 TCTTCTCCGATGCCTCTGACGAGGCAGCCCTGTATGCAGCCTGCGACGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTGGAGTCTGAGCTAAATGAGGCGGCCTCCCGCTTTGGCCTGGGCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101650 GTGGAGTCTGAGCTAAATGAGGCGGCCTCCCGCTTTGGCCTGGGCTCCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTGCCCTCGCCCCGGGCCTCCCCTCGGCCATGGACCCCCGAAGATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101700 GCTGCCCTCGCCCCGGGCCTCCCCTCGGCCATGGACCCCCGAAGATCCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GGAGCCTGTATGGTCCAAGCCCCGGAGGCCGAGGGCCAGAGGATAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101750 GGAGCCTGTATGGTCCAAGCCCCGGAGGCCGAGGGCCAGAGGATAGCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTACTCCTCAGTGCTCCTGGGCCCACCCCAGCCTCCCCGCGGCCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101800 CTACTCCTCAGTGCTCCTGGGCCCACCCCAGCCTCCCCGCGGCCTGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCCATGTGGCAAGCGGCGCTATTCCAGCTCGGGAACCCCATCTTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101850 TCCATGTGGCAAGCGGCGCTATTCCAGCTCGGGAACCCCATCTTCAGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CCCCAGCTCTGTCCCGCCGTGGCAGCCTGGGGGAAGAGGGGTCTGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101900 CCCCAGCTCTGTCCCGCCGTGGCAGCCTGGGGGAAGAGGGGTCTGAGCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CCTCCACCACCCCCATTGCCTCTGGCCCGGGACCCGGGCTCCCCTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101950 CCTCCACCACCCCCATTGCCTCTGGCCCGGGACCCGGGCTCCCCTGGTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTTTGACTATGTGGGGGCCCCACCAGCTGAGAGCATCCCTCAGAAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102000 CTTTGACTATGTGGGGGCCCCACCAGCTGAGAGCATCCCTCAGAAGACAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GGCGGACTTCCAGCGAGCAGGCAGTGGCTCTGCCTCGGTCTGAGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102050 GGCGGACTTCCAGCGAGCAGGCAGTGGCTCTGCCTCGGTCTGAGGAGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GCCTCATGCAATGGGAAGCTGCCCTTGGGAGCAGAGGAGTCTGTGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102100 GCCTCATGCAATGGGAAGCTGCCCTTGGGAGCAGAGGAGTCTGTGGCTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TCCAGGAGGTTCCCGGAAGGAGGTGGCTGGCATGGACTACCTGGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102150 TCCAGGAGGTTCCCGGAAGGAGGTGGCTGGCATGGACTACCTGGCAGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CCTCCCCACTCGCTTGGTCCAAGGCCCGGATTGGGGGACACAGCCCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102200 CCTCCCCACTCGCTTGGTCCAAGGCCCGGATTGGGGGACACAGCCCTATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TTCAG         GACCTCTGCCCTACCCCCACTGGACTGGCCTCTGCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102250 TTCAGGTG...CAGGACCTCTGCCCTACCCCCACTGGACTGGCCTCTGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CAGCCAATATGAGCAGCTGGAGCTGAGGATCGAGGTACAGCCTAGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104137 CAGCCAATATGAGCAGCTGGAGCTGAGGATCGAGGTACAGCCTAGAGCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 ACCACCGGGCCCACTATGAGACAGAAGGCAGCCGTGGAGCTGTCAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104187 ACCACCGGGCCCACTATGAGACAGAAGGCAGCCGTGGAGCTGTCAAAGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GCCCCTGGCGGTCACCCCGTAGTCAAG         CTCCTAGGCTACAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 104237 GCCCCTGGCGGTCACCCCGTAGTCAAGGTA...CAGCTCCTAGGCTACAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TGAGAAGCCACTGACCCTACAGATGTTCATCGGCACTGCAGATGAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104845 TGAGAAGCCACTGACCCTACAGATGTTCATCGGCACTGCAGATGAAAGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 ACCTGCGGCCTCATGCCTTCTATCAGGTGCACCGTATCACAGGCAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104895 ACCTGCGGCCTCATGCCTTCTATCAGGTGCACCGTATCACAGGCAAGATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GTGGCCACGGCCAGCTATGAAGCCGTAGTCAGTGGCACCAAGGTGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104945 GTGGCCACGGCCAGCTATGAAGCCGTAGTCAGTGGCACCAAGGTGTTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 GATGACTCTGCTGCCTGAGAACAACATGGCGGCCAA         CATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104995 GATGACTCTGCTGCCTGAGAACAACATGGCGGCCAAGTA...CAGCATTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 ACTGCGCGGGAATCCTGAAGCTTCGGAATTCAGACATTGAGCTTCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105360 ACTGCGCGGGAATCCTGAAGCTTCGGAATTCAGACATTGAGCTTCGGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 GGTGAGACGGACATCGGGCGCAAAAACACACGTGTACGGCTGGTGTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105410 GGTGAGACGGACATCGGGCGCAAAAACACACGTGTACGGCTGGTGTTCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 GGTACACGTGCCCCAGGGCGGCGGGAAGGTCGTCTCAGTACAGGCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105460 GGTACACGTGCCCCAGGGCGGCGGGAAGGTCGTCTCAGTACAGGCAGCAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 CGGTGCCCATCGAGTGCT         CCCAGCGCTCAGCCCAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 105510 CGGTGCCCATCGAGTGCTGTG...CAGCCCAGCGCTCAGCCCAGGAGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CCCCAGGTGGAGGCCTACAGCCCCAGTGCCTGCTCTGTGAGAGGAGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106009 CCCCAGGTGGAGGCCTACAGCCCCAGTGCCTGCTCTGTGAGAGGAGGCGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GGAACTGGTACTGACTGGCTCCAACTTCCTGCCAGACTCCAAGGTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106059 GGAACTGGTACTGACTGGCTCCAACTTCCTGCCAGACTCCAAGGTGGTGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 TCATTGAGAGGGGTCCTG         ATGGGAAGCTGCAATGGGAGGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106109 TCATTGAGAGGGGTCCTGGTG...CAGATGGGAAGCTGCAATGGGAGGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 GAGGCCACAGTGAACCGACTGCAGAGCAACGAG         GTGACGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107343 GAGGCCACAGTGAACCGACTGCAGAGCAACGAGGTA...TAGGTGACGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 GACCCTGACTGTCCCCGAGTACAGCAACAAGAGGGTTTCCCGGCCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107643 GACCCTGACTGTCCCCGAGTACAGCAACAAGAGGGTTTCCCGGCCAGTCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 AGGTCTACTTTTATGTCTCCAATGGGCGGAGGAAACGCAGTCCTACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107693 AGGTCTACTTTTATGTCTCCAATGGGCGGAGGAAACGCAGTCCTACCCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 AGTTTCAGGTTTCTGCCTG         TGATCTGCAAAGAGGAGCCCCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107743 AGTTTCAGGTTTCTGCCTGGTG...CAGTGATCTGCAAAGAGGAGCCCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 ACCGGACTCATCTCTGCGGGGTTTCCCTTCAGCATCGGCAACCCCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107976 ACCGGACTCATCTCTGCGGGGTTTCCCTTCAGCATCGGCAACCCCCTTTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 GCACTGACATGGACTTCTCACCACCCAGGCCCCCCTACCCCTCCTATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108026 GCACTGACATGGACTTCTCACCACCCAGGCCCCCCTACCCCTCCTATCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 CATGAAGACCCTGCTTGCGAAACTCCTTACCTATCAGAAGGCTTCGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108076 CATGAAGACCCTGCTTGCGAAACTCCTTACCTATCAGAAGGCTTCGGCTA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 TGGCATGCCCCCTCTGTACCCCCAGACGGGGCCCCCACCATCCTACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108126 TGGCATGCCCCCTCTGTACCCCCAGACGGGGCCCCCACCATCCTACAGAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 CGGGCCTGCGGATGTTCCCTGAGACTAGGGGTACCACAGGTTGTGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108176 CGGGCCTGCGGATGTTCCCTGAGACTAGGGGTACCACAGGTTGTGCCCAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 CCACCTGCAGTTTCCTTCCTTCCCCGCCCCTTCCCTAGTGACCCGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108226 CCACCTGCAGTTTCCTTCCTTCCCCGCCCCTTCCCTAGTGACCCGTATGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 AGGGCGGGGCTCCTCTTTCTCCCTGGGGCTGCCATTCTCTCCGCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108276 AGGGCGGGGCTCCTCTTTCTCCCTGGGGCTGCCATTCTCTCCGCCAGCCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 CCTTTCGGCCGCCTCCTCTTCCTGCATCCCCACCGCTTGAAGGCCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108326 CCTTTCGGCCGCCTCCTCTTCCTGCATCCCCACCGCTTGAAGGCCCCTTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2479 CCTTCCCAGAGTGATGTGCATCCCCTACCTGCTGAGGGATACAATAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108376 CCTTCCCAGAGTGATGTGCATCCCCTACCTGCTGAGGGATACAATAAGGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2529 AGGGCCAGGCTATGGCCCTGGGGAGGGGGCTCCGGAGCAGGAGAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108426 AGGGCCAGGCTATGGCCCTGGGGAGGGGGCTCCGGAGCAGGAGAAATCCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2579 GGGGTGGCTACAGCAGCGGCTTCCGAGACAGTGTCCCTATCCAGGGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108476 GGGGTGGCTACAGCAGCGGCTTCCGAGACAGTGTCCCTATCCAGGGTATC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2629 ACGCTGGAGGAAG         TGAGTGAGATCATTGGCCGAGACCTGAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 108526 ACGCTGGAGGAAGGTG...CAGTGAGTGAGATCATTGGCCGAGACCTGAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .
   2670 TGGCTTCCCTGCACCTCCTGGAGAAGAGCCTCCTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109326 TGGCTTCCCTGCACCTCCTGGAGAAGAGCCTCCTGCC