seq1 = pF1KB0433.tfa, 1368 bp
seq2 = pF1KB0433/gi568815584f_20890003.tfa (gi568815584f:20890003_21096887), 206885 bp

>pF1KB0433 1368
>gi568815584f:20890003_21096887 (Chr14)

1-75  (100001-100075)   100% ->
76-229  (100228-100381)   100% ->
230-364  (100462-100596)   100% ->
365-446  (102122-102203)   100% ->
447-528  (102539-102620)   100% ->
529-602  (103116-103189)   100% ->
603-697  (103967-104061)   100% ->
698-774  (104541-104615)   96% ->
775-876  (104798-104899)   100% ->
877-945  (105163-105231)   100% ->
946-996  (105899-105949)   100% ->
997-1080  (106207-106290)   100% ->
1081-1265  (106525-106709)   100% ->
1266-1368  (106783-106885)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCACTGAAGTGTCTACTGACATTAGGAAGATGGTGCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCACTGAAGTGTCTACTGACATTAGGAAGATGGTGCCCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTGGAGTGGCTCCCCAGGCCCGG         GCGCTCGCCGCCTTAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100051 CCTTGGAGTGGCTCCCCAGGCCCGGGTG...CAGGCGCTCGCCGCCTTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TACCCGGAGTGACCCAGGTAGATAACAAGTCCGGTTTCCTGCAGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100244 TACCCGGAGTGACCCAGGTAGATAACAAGTCCGGTTTCCTGCAGAAGAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTCATCGCCAGCACCCTGGCATCCTAAAGCTGCCGCACGTGCGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100294 CCTCATCGCCAGCACCCTGGCATCCTAAAGCTGCCGCACGTGCGGCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACAGGCACTGGCTAACGGTGCCCAGTTATTGCTACTTG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100344 ACAGGCACTGGCTAACGGTGCCCAGTTATTGCTACTTGGTG...TAGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCGCTGGGCCCACTATGGAGAATCAGGTGCAAACACTGACCAGTTATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100465 GCGCTGGGCCCACTATGGAGAATCAGGTGCAAACACTGACCAGTTATCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGGAGCAGACATTTGCCTGTAGAGCCAGAGGAGTTGCAAAGACGGGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100515 TGGAGCAGACATTTGCCTGTAGAGCCAGAGGAGTTGCAAAGACGGGCTAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCATCTTGAGAAAAAATTCCTGGAAAACCCAG         ACTTATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100565 GCATCTTGAGAAAAAATTCCTGGAAAACCCAGGTA...CAGACTTATCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGACAGAGGAGAAACTTCGTGGAGCAGTGCTACACGCACTACGTAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102131 AGACAGAGGAGAAACTTCGTGGAGCAGTGCTACACGCACTACGTAAAACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCTACCATTGGCAAGAACTGAG         CTACACTGAGGGACTGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102181 ACCTACCATTGGCAAGAACTGAGGTA...CAGCTACACTGAGGGACTGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTGGTGTATATGGCAGCAAGACTGGATGGTGGCTTTGCAGCAGTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102557 CCTGGTGTATATGGCAGCAAGACTGGATGGTGGCTTTGCAGCAGTCTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAGCATTCCATGAG         ATCCGGGCTCGAAATCCAGCATTTCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102607 GAGCATTCCATGAGGTG...CAGATCCGGGCTCGAAATCCAGCATTTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCACAAACTTTGATGGACTTTGGCTCAGGTACTGGTTCTGTCACCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103143 CCACAAACTTTGATGGACTTTGGCTCAGGTACTGGTTCTGTCACCTGGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    603       GGCTGCTCACAGTATTTGGGGCCAGAGCCTACGTGAATATATGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103193 ...TAGGGCTGCTCACAGTATTTGGGGCCAGAGCCTACGTGAATATATGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GTGTGGACAGATCAGCTGCCATGTTGGTTTTGGCAGAAAAACTACTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104011 GTGTGGACAGATCAGCTGCCATGTTGGTTTTGGCAGAAAAACTACTGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 G         GTGGTTCAGAATCTGGGGAGCCTTATATTCCAGGTGTCTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104061 GGTG...CAGGTGGTTCAGAATCTGGGGAGCCTTATATTCCAGGTGTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TTTCAGACAGTTTCTACCTGTATCACCCAAGGTGCAG         TTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||--|| >>>...>>>||||
 104581 TTTCAGACAGTTTCTACCTGTATCACCCAAGG  CAAGTG...CAGTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATGTAGTAGTGTCAGCTTTTTCCTTAAGTGAACTGCCCAGCAAGGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104802 ATGTAGTAGTGTCAGCTTTTTCCTTAAGTGAACTGCCCAGCAAGGCTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CGCACTGAGGTAGTTCAAACCTTATGGCGTAAGACAGGTCATTTCCTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 104852 CGCACTGAGGTAGTTCAAACCTTATGGCGTAAGACAGGTCATTTCCTGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    877        GTACTGGTGGAGAATGGAACAAAAGCTGGGCACAGCCTTCTCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104902 G...CAGGTACTGGTGGAGAATGGAACAAAAGCTGGGCACAGCCTTCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGGATGCCAGGGATCTGGTCCTTAAG         GGAAAAGAGAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105206 TGGATGCCAGGGATCTGGTCCTTAAGGTA...CAGGGAAAAGAGAAGTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 CCTTTGGACCCTCGACCTGGTTTTGTCTTTGCCCCG         TGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105914 CCTTTGGACCCTCGACCTGGTTTTGTCTTTGCCCCGGTG...CAGTGTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 CCATGAACTCCCTTGTCCCCAGTTGACCAACCTGGCCTGTAGCTTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106212 CCATGAACTCCCTTGTCCCCAGTTGACCAACCTGGCCTGTAGCTTCTCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 AGGCGTACCATCCCATCCCCTTCAGCTGG         AACAAGAAACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 106262 AGGCGTACCATCCCATCCCCTTCAGCTGGGTA...TAGAACAAGAAACCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 AAGGAAGAAAAGTTCTCTATGGTGATCCTTGCTCGGGGGTCTCCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106537 AAGGAAGAAAAGTTCTCTATGGTGATCCTTGCTCGGGGGTCTCCAGAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GGCTCATCGCTGGCCCCGTATCACTCAGCCTGTCCTTAAACGGCCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106587 GGCTCATCGCTGGCCCCGTATCACTCAGCCTGTCCTTAAACGGCCTCGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 ATGTGCATTGTCACTTGTGCTGTCCAGATGGGCACATGCAGCATGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106637 ATGTGCATTGTCACTTGTGCTGTCCAGATGGGCACATGCAGCATGCTGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CTCACAGCCCGCCGGCACGGCAG         GGATTTGTATCGTTGTGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106687 CTCACAGCCCGCCGGCACGGCAGGTA...CAGGGATTTGTATCGTTGTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 CCGTGTCAGCTCCTGGGGAGATCTTTTACCTGTGCTTACTCCGTCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106801 CCGTGTCAGCTCCTGGGGAGATCTTTTACCTGTGCTTACTCCGTCTGCGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .
   1334 TTCCTCCATCTACGGCTCAGGATCCCTCTGAGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106851 TTCCTCCATCTACGGCTCAGGATCCCTCTGAGAGT