seq1 = pF1KB0423.tfa, 1422 bp
seq2 = pF1KB0423/gi568815597r_45528259.tfa (gi568815597r:45528259_45759087), 230829 bp

>pF1KB0423 1422
>gi568815597r:45528259_45759087 (Chr1)

(complement)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-190  (103769-103898)   100% ->
191-477  (104259-104545)   100% ->
478-550  (116589-116661)   100% ->
551-744  (118685-118878)   100% ->
745-885  (124852-124992)   100% ->
886-1044  (125441-125599)   100% ->
1045-1169  (128482-128606)   100% ->
1170-1272  (129410-129512)   100% ->
1273-1422  (130680-130829)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCAGCATGATTTTGTTCCTGCTTGGCTAAATTTCTCAACACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCAGCATGATTTTGTTCCTGCTTGGCTAAATTTCTCAACACCACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCAGCTAAG         TCACCTACTGCCACCTTCGAAAAACACGGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCAGCTAAGGTA...TAGTCACCTACTGCCACCTTCGAAAAACACGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCACCTACCCAGAGGAGAAGGTAGATTTGGAGTAAGCCGCCGTCGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103800 AGCACCTACCCAGAGGAGAAGGTAGATTTGGAGTAAGCCGCCGTCGACAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATTCCTCTGATGGTTTTTTTAACAATGGTCCCCTACGAACTGCAGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103850 AATTCCTCTGATGGTTTTTTTAACAATGGTCCCCTACGAACTGCAGGAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         ATTCTTGGCACCAGCCCTCCCTGTTCCGCCATGATTCTGTGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103900 TG...TAGATTCTTGGCACCAGCCCTCCCTGTTCCGCCATGATTCTGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTCTGGTGTCTCTAAGGGAGCATATGCTGGAATCACAGGGAACCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104301 ACTCTGGTGTCTCTAAGGGAGCATATGCTGGAATCACAGGGAACCCATCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGTTGGCATAGCTCTTCCCGAGGTCATGATGGCATGAGCCAACGTAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104351 GGTTGGCATAGCTCTTCCCGAGGTCATGATGGCATGAGCCAACGTAGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGTGGCACAGGGAACCATCGCCATTGGAATGGCAGCTTCCACTCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104401 AGGTGGCACAGGGAACCATCGCCATTGGAATGGCAGCTTCCACTCCCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGGGTGTGCTTTTCAGGAAAAGCCACCTATGGAGATTAGGGAAGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104451 AAGGGTGTGCTTTTCAGGAAAAGCCACCTATGGAGATTAGGGAAGAAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAGAAGACAAGGTGGAAAAGTTGCAGTTTGAAGAGGAGGACTTT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104501 AAAGAAGACAAGGTGGAAAAGTTGCAGTTTGAAGAGGAGGACTTTGTA..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    478     CCTTCCTTGAATCCAGAAGCTGGCAAACAGCATCAGCCATGCAGAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104551 .TAGCCTTCCTTGAATCCAGAAGCTGGCAAACAGCATCAGCCATGCAGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTATTGGGACACCTTCTGGAGTATGGG         AAAACCCGCCTAGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 116635 CTATTGGGACACCTTCTGGAGTATGGGGTA...CAGAAAACCCGCCTAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCAAGCAACCCTCCAAGATGCTAGTTATCAAAAAAGTTTCCAAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118699 GCCAAGCAACCCTCCAAGATGCTAGTTATCAAAAAAGTTTCCAAAGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCCTGCTGCTGCCTTCTCTGCTGCATTCACCTCACCAGGATCTCACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118749 TCCTGCTGCTGCCTTCTCTGCTGCATTCACCTCACCAGGATCTCACCATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAAATGGGAACAAATTGTCATCCGTGGTTCCAAGTGTCTATAAGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118799 CAAATGGGAACAAATTGTCATCCGTGGTTCCAAGTGTCTATAAGAACCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTTCCTAAGCCTGTACCACCTCCTTCCAAG         CCTAATGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 118849 GTTCCTAAGCCTGTACCACCTCCTTCCAAGGTA...TAGCCTAATGCATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAAAGCTAACAGGATGGAGCACAAGTCAGGATCCCTTTCCTCTAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124863 GAAAGCTAACAGGATGGAGCACAAGTCAGGATCCCTTTCCTCTAGCCGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGTCTGCTTTTACCAGTCCAATCTCTGTTACCAAACCAGTGGTACTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124913 AGTCTGCTTTTACCAGTCCAATCTCTGTTACCAAACCAGTGGTACTGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGTGGTGCAGCTCTGAGTTCTCCCAAAGAG         AGTCCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 124963 AGTGGTGCAGCTCTGAGTTCTCCCAAAGAGGTG...CAGAGTCCCTCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CACCACCCCTCCAATTGAGATCAGCTCCTCTCGTCTGACCAAGTTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125452 CACCACCCCTCCAATTGAGATCAGCTCCTCTCGTCTGACCAAGTTGACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCCGAACCACCGACAGGAAGAGTGAGTTCCTGAAAACTCTGAAGGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125502 GCCGAACCACCGACAGGAAGAGTGAGTTCCTGAAAACTCTGAAGGATGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CGGAATGGAGACTTCTCAGAGAATAGAGACTGTGACAAGCTGGAAGAT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 125552 CGGAATGGAGACTTCTCAGAGAATAGAGACTGTGACAAGCTGGAAGATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1045        TTGGAGGACAACAGCACACCTGAACCAAAGGAAAATGGGGAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125602 A...CAGTTGGAGGACAACAGCACACCTGAACCAAAGGAAAATGGGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AAGGCTGTCATCAAAATGGTCTTGCCCTCCCTGTAGTGGAAGAAGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128525 AAGGCTGTCATCAAAATGGTCTTGCCCTCCCTGTAGTGGAAGAAGGGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTTCTCTCACACTCTCTAGAAGCAGAGCACAG         GTTATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 128575 GTTCTCTCACACTCTCTAGAAGCAGAGCACAGGTA...CAGGTTATTGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGCTATGGGTTGGCAGGAATATCCTGAAAATGATGAGAATTGCCTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129419 AGCTATGGGTTGGCAGGAATATCCTGAAAATGATGAGAATTGCCTTCCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TCACAGAGGATGAGCTCAAAGAGTTCCACATGAAGACAGAGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 129469 TCACAGAGGATGAGCTCAAAGAGTTCCACATGAAGACAGAGCAGGTA...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1273    CTGAGAAGAAATGGCTTTGGAAAGAATGGCTTCTTGCAGAGCCGCAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130677 TAGCTGAGAAGAAATGGCTTTGGAAAGAATGGCTTCTTGCAGAGCCGCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TTCCAGTCTGTTCTCCCCTTGGAGAAGCACTTGCAAAGCAGAGTTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130727 TTCCAGTCTGTTCTCCCCTTGGAGAAGCACTTGCAAAGCAGAGTTTGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 ACTCAGACACCGAAACCAGTAGCAGTGAAACATCAGATGACGATGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130777 ACTCAGACACCGAAACCAGTAGCAGTGAAACATCAGATGACGATGCCTGG

   1500 
   1420 AAG
        |||
 130827 AAG