seq1 = pF1KB0421.tfa, 1230 bp
seq2 = pF1KB0421/gi568815596r_74426940.tfa (gi568815596r:74426940_74629629), 202690 bp

>pF1KB0421 1230
>gi568815596r:74426940_74629629 (Chr2)

(complement)

1-50  (100001-100050)   100% ->
51-188  (100131-100268)   100% ->
189-339  (100348-100498)   100% ->
340-524  (100695-100879)   100% ->
525-597  (101141-101213)   100% ->
598-671  (101309-101382)   100% ->
672-738  (101624-101690)   100% ->
739-841  (101792-101894)   100% ->
842-961  (102040-102159)   100% ->
962-1077  (102267-102382)   100% ->
1078-1196  (102571-102689)   100% ->
1197-1230  (102794-102827)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTTCCCTCAGGGCCGGGGCCGGAGCGGCTCTTTGACTCGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTTCCCTCAGGGCCGGGGCCGGAGCGGCTCTTTGACTCGCACCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51          GCTTCCGGGTGACTGCTTCCTACTGCTCGTGCTGCTGCTCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTA...CAGGCTTCCGGGTGACTGCTTCCTACTGCTCGTGCTGCTGCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGCGCCAGTCGGGTTCTGCCTCCTCGTCCTGCGCCTCTTTCTCGGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100172 ACGCGCCAGTCGGGTTCTGCCTCCTCGTCCTGCGCCTCTTTCTCGGGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACGTCTTCCTGGTCAGCTGCGCGCTGCCAGACAGCGTCCTTCGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100222 CACGTCTTCCTGGTCAGCTGCGCGCTGCCAGACAGCGTCCTTCGCAGGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       ATTCGTAGTGCGGACCATGTGTGCGGTGCTAGGGCTCGTGGCCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100272 ...CAGATTCGTAGTGCGGACCATGTGTGCGGTGCTAGGGCTCGTGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGCAGGAGGACTCCGGACTCCGGGATCACAGTGTCAGGGTCCTCATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100392 GGCAGGAGGACTCCGGACTCCGGGATCACAGTGTCAGGGTCCTCATTTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AACCATGTGACACCTTTCGACCACAACATAGTCAATTTGCTTACCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100442 AACCATGTGACACCTTTCGACCACAACATAGTCAATTTGCTTACCACCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAGCACC         CCTCTACTCAATAGTCCCCCCAGCTTTGTGTGCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100492 TAGCACCGTG...CAGCCTCTACTCAATAGTCCCCCCAGCTTTGTGTGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGTCTCGGGGCTTCATGGAGATGAATGGGCGGGGGGAGTTGGTGGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100729 GGTCTCGGGGCTTCATGGAGATGAATGGGCGGGGGGAGTTGGTGGAGTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTCAAGAGATTCTGTGCTTCCACGAGGCTTCCCCCCACTCCTCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100779 CTCAAGAGATTCTGTGCTTCCACGAGGCTTCCCCCCACTCCTCTGCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATTCCCTGAGGAAGAGGCCACCAATGGCCGGGAGGGGCTCCTGCGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100829 ATTCCCTGAGGAAGAGGCCACCAATGGCCGGGAGGGGCTCCTGCGCTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 G         TTCCTGGCCATTTTCTATCCAAGATGTGGTACAACCTCTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100879 GGTG...TAGTTCCTGGCCATTTTCTATCCAAGATGTGGTACAACCTCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACCCTGCAAGTTCAGAGACCCCTGGTCTCTGTG         ACGGTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101181 ACCCTGCAAGTTCAGAGACCCCTGGTCTCTGTGGTG...CAGACGGTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGATGCCTCCTGGGTCTCAGAACTGCTGTGGTCACTTTTCGTCCCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101317 AGATGCCTCCTGGGTCTCAGAACTGCTGTGGTCACTTTTCGTCCCTTTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CGGTGTATCAAGTAAG         GTGGCTTCGTCCTGTTCATCGCCAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101367 CGGTGTATCAAGTAAGGTA...CAGGTGGCTTCGTCCTGTTCATCGCCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTAGGGGAAGCGAATGAGGAGTTTGCACTCCGTGTACAACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101649 CTAGGGGAAGCGAATGAGGAGTTTGCACTCCGTGTACAACAGGTG...TA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    739  CTGGTGGCCAAGGAATTGGGCCAGACAGGGACACGGCTCACTCCAGCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101791 GCTGGTGGCCAAGGAATTGGGCCAGACAGGGACACGGCTCACTCCAGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACAAAGCAGAGCACATGAAGCGACAAAGACACCCCAGATTGCGCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101841 ACAAAGCAGAGCACATGAAGCGACAAAGACACCCCAGATTGCGCCCCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TCAG         CCCAGTCTTCTTTCCCTCCCTCCCCTGGTCCTTCTCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101891 TCAGGTA...CAGCCCAGTCTTCTTTCCCTCCCTCCCCTGGTCCTTCTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGATGTGCAACTGGCAACTCTGGCTCAGAGAGTCAAGGAAGTTTTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102077 TGATGTGCAACTGGCAACTCTGGCTCAGAGAGTCAAGGAAGTTTTGCCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATGTGCCATTGGGTGTCATCCAGAGAGACCTGG         CCAAGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102127 ATGTGCCATTGGGTGTCATCCAGAGAGACCTGGGTA...CAGCCAAGACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GGCTGTGTAGACTTGACTATCACTAATCTGCTTGAGGGGGCCGTAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102275 GGCTGTGTAGACTTGACTATCACTAATCTGCTTGAGGGGGCCGTAGCTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CATGCCTGAAGACATCACCAAGGGAACTCAGTCCCTACCCACAGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102325 CATGCCTGAAGACATCACCAAGGGAACTCAGTCCCTACCCACAGCCTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CCTCCAAG         TTTCCCAGCTCTGGCCCGGTGACCCCTCAGCCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102375 CCTCCAAGGTG...CAGTTTCCCAGCTCTGGCCCGGTGACCCCTCAGCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 ACAGCCCTAACATTTGCCAAGTCTTCCTGGGCCCGGCAGGAGAGCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102604 ACAGCCCTAACATTTGCCAAGTCTTCCTGGGCCCGGCAGGAGAGCCTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GGAGCGCAAGCAAGCACTATATGAATACGCAAGAAG         GAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102654 GGAGCGCAAGCAAGCACTATATGAATACGCAAGAAGGTG...CAGGAGAT

   1300     .    :    .    :    .
   1202 TCACAGAGAGACGAGCCCAGGAGGCTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 102799 TCACAGAGAGACGAGCCCAGGAGGCTGAC