seq1 = pF1KB0419.tfa, 1416 bp
seq2 = pF1KB0419/gi568815593r_179514844.tfa (gi568815593r:179514844_179723133), 208290 bp

>pF1KB0419 1416
>gi568815593r:179514844_179723133 (Chr5)

(complement)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-253  (101737-101892)   100% ->
254-397  (102099-102242)   100% ->
398-536  (103727-103865)   100% ->
537-715  (104811-104989)   100% ->
716-787  (105074-105145)   100% ->
788-921  (105202-105335)   100% ->
922-1057  (105485-105620)   100% ->
1058-1117  (106024-106083)   100% ->
1118-1207  (106176-106265)   100% ->
1208-1300  (106916-107008)   100% ->
1301-1416  (108175-108290)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTTGGGCACGGAAGGTGGAGAGGGATTCGTGGTGAAGGTCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTTGGGCACGGAAGGTGGAGAGGGATTCGTGGTGAAGGTCCGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGCCCTGGTCTTGCTCGGCCGATGAAGTGCAGAGGTTTTTTTCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 CTTGCCCTGGTCTTGCTCGGCCGATGAAGTGCAGAGGTTTTTTTCTGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       ACTGCAAAATTCAAAATGGGGCTCAAGGTATTCGTTTCATCTAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...CAGACTGCAAAATTCAAAATGGGGCTCAAGGTATTCGTTTCATCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGCGAGGCTTTTGTTGAACTTGAATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101781 ACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGCGAGGCTTTTGTTGAACTTGAATCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATGAAGTCAAATTGGCCCTGAAAAAAGACAGAGAAACTATGGGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101831 AGATGAAGTCAAATTGGCCCTGAAAAAAGACAGAGAAACTATGGGACACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATATGTTGAAG         TATTCAAGTCAAACAACGTTGAAATGGAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101881 GATATGTTGAAGGTT...CAGTATTCAAGTCAAACAACGTTGAAATGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGGGTGTTGAAGCATACTGGTCCAAATAGTCCTGACACGGCCAATGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102128 TGGGTGTTGAAGCATACTGGTCCAAATAGTCCTGACACGGCCAATGATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTTGTACGGCTTAGAGGACTTCCCTTTGGATGTAGCAAGGAAGAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102178 CTTTGTACGGCTTAGAGGACTTCCCTTTGGATGTAGCAAGGAAGAAATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCAGTTCTTCTCAG         GGTTGGAAATCGTGCCAAATGGGATA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102228 TTCAGTTCTTCTCAGGTA...AAGGGTTGGAAATCGTGCCAAATGGGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACATTGCCGGTGGACTTCCAGGGGAGGAGTACGGGGGAGGCCTTCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103753 ACATTGCCGGTGGACTTCCAGGGGAGGAGTACGGGGGAGGCCTTCGTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTTGCTTCACAGGAAATAGCTGAAAAGGCTCTAAAGAAACACAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103803 GTTTGCTTCACAGGAAATAGCTGAAAAGGCTCTAAAGAAACACAAGGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAATAGGGCACAG         GTATATTGAAATCTTTAAGAGCAGTAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103853 GAATAGGGCACAGGTG...TAGGTATATTGAAATCTTTAAGAGCAGTAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCTGAAGTTAGAACTCATTATGATCCACCACGAAAGCTTATGGCCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104839 GCTGAAGTTAGAACTCATTATGATCCACCACGAAAGCTTATGGCCATGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCGGCCAGGTCCTTATGACAGACCTGGGGCTGGTAGAGGGTATAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104889 GCGGCCAGGTCCTTATGACAGACCTGGGGCTGGTAGAGGGTATAACAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTGGCAGAGGAGCTGGCTTTGAGAGGATGAGGCGTGGTGCTTATGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104939 TTGGCAGAGGAGCTGGCTTTGAGAGGATGAGGCGTGGTGCTTATGGTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 G         GCTATGGAGGCTATGATGATTACAATGGCTATAATGATGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104989 GGTA...CAGGCTATGGAGGCTATGATGATTACAATGGCTATAATGATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTATGGATTTGGGTCAGATAGATTTGGAAGAG         ACCTCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105114 CTATGGATTTGGGTCAGATAGATTTGGAAGAGGTA...TAGACCTCAATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACTGTTTTTCAGGAATGTCTGATCACAGATACGGGGATGGTGGCTCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105211 ACTGTTTTTCAGGAATGTCTGATCACAGATACGGGGATGGTGGCTCTACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTCCAGAGCACAACAGGACACTGTGTACACATGCGGGGATTACCTTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105261 TTCCAGAGCACAACAGGACACTGTGTACACATGCGGGGATTACCTTACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGCTACTGAGAATGACATTTATAAT         TTTTTTTCACCGCTCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105311 AGCTACTGAGAATGACATTTATAATGTA...TAGTTTTTTTCACCGCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACCCTGTGAGAGTACACATTGAAATTGGTCCTGATGGCAGAGTAACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105501 ACCCTGTGAGAGTACACATTGAAATTGGTCCTGATGGCAGAGTAACTGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAAGCAGATGTCGAGTTCGCAACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105551 GAAGCAGATGTCGAGTTCGCAACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AAAAGACAAAGCAAATATGC         AACACAGATATGTAGAACTCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105601 AAAAGACAAAGCAAATATGCGTA...CAGAACACAGATATGTAGAACTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTACG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106045 TCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTACGGTA...CAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CACAGATATGTAGAACTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106178 CACAGATATGTAGAACTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGCATGGGCTTGT         CAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106228 TGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGCATGGGCTTGTGTA...CAGCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ACCAGTCCAGCTACGGGGGCCCAGCCAGCCAGCAGCTGAGTGGGGGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106919 ACCAGTCCAGCTACGGGGGCCCAGCCAGCCAGCAGCTGAGTGGGGGTTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GGAGGCGGCTACGGTGGCCAGAGCAGCATGAGTGGATACG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106969 GGAGGCGGCTACGGTGGCCAGAGCAGCATGAGTGGATACGGTA...CAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TAACCAAGGAGCAGTGAACAGCAGCTACTACAGTAGTGGAAGCCGTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108176 TAACCAAGGAGCAGTGAACAGCAGCTACTACAGTAGTGGAAGCCGTGCAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CTATGGGCGTGAACGGAATGGGAGGGTTGTCTAGCATGTCCAGTATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108226 CTATGGGCGTGAACGGAATGGGAGGGTTGTCTAGCATGTCCAGTATGAGT

   1500     .    :    .
   1402 GGTGGATGGGGAATG
        |||||||||||||||
 108276 GGTGGATGGGGAATG