Result of SIM4 for
pF1KB0356
seq1 = pF1KB0356.tfa, 3204 bp
seq2 = pF1KB0356/gi568815595f_179098826.tfa (gi568815595f:179098826_179334361), 235536 bp
>pF1KB0356 3204
>gi568815595f:179098826_179334361 (Chr3)
1-352 (100001-100352) 100% ->
353-562 (100865-101074) 100% ->
563-813 (102465-102715) 100% ->
814-1059 (104719-104964) 100% ->
1060-1145 (105678-105763) 100% ->
1146-1251 (110770-110875) 100% ->
1252-1404 (111361-111513) 100% ->
1405-1539 (111606-111740) 100% ->
1540-1664 (119385-119509) 100% ->
1665-1746 (120371-120452) 100% ->
1747-1911 (120746-120910) 100% ->
1912-2015 (121124-121227) 100% ->
2016-2187 (122161-122332) 100% ->
2188-2294 (125256-125362) 100% ->
2295-2416 (125875-125996) 100% ->
2417-2495 (127137-127215) 100% ->
2496-2666 (130447-130617) 100% ->
2667-2784 (131179-131296) 100% ->
2785-2936 (131400-131551) 100% ->
2937-3204 (135269-135536) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCTCCACGACCATCATCAGGTGAACTGTGGGGCATCCACTTGATGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCCTCCACGACCATCATCAGGTGAACTGTGGGGCATCCACTTGATGCC
50 . : . : . : . : . :
51 CCCAAGAATCCTAGTAGAATGTTTACTACCAAATGGAATGATAGTGACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CCCAAGAATCCTAGTAGAATGTTTACTACCAAATGGAATGATAGTGACTT
100 . : . : . : . : . :
101 TAGAATGCCTCCGTGAGGCTACATTAATAACCATAAAGCATGAACTATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TAGAATGCCTCCGTGAGGCTACATTAATAACCATAAAGCATGAACTATTT
150 . : . : . : . : . :
151 AAAGAAGCAAGAAAATACCCCCTCCATCAACTTCTTCAAGATGAATCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 AAAGAAGCAAGAAAATACCCCCTCCATCAACTTCTTCAAGATGAATCTTC
200 . : . : . : . : . :
201 TTACATTTTCGTAAGTGTTACTCAAGAAGCAGAAAGGGAAGAATTTTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 TTACATTTTCGTAAGTGTTACTCAAGAAGCAGAAAGGGAAGAATTTTTTG
250 . : . : . : . : . :
251 ATGAAACAAGACGACTTTGTGACCTTCGGCTTTTTCAACCCTTTTTAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 ATGAAACAAGACGACTTTGTGACCTTCGGCTTTTTCAACCCTTTTTAAAA
300 . : . : . : . : . :
301 GTAATTGAACCAGTAGGCAACCGTGAAGAAAAGATCCTCAATCGAGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 GTAATTGAACCAGTAGGCAACCGTGAAGAAAAGATCCTCAATCGAGAAAT
350 . : . : . : . : . :
351 TG GTTTTGCTATCGGCATGCCAGTGTGTGAATTTGATATGG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 TGGTA...AAGGTTTTGCTATCGGCATGCCAGTGTGTGAATTTGATATGG
400 . : . : . : . : . :
392 TTAAAGATCCAGAAGTACAGGACTTCCGAAGAAATATTCTGAACGTTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100904 TTAAAGATCCAGAAGTACAGGACTTCCGAAGAAATATTCTGAACGTTTGT
450 . : . : . : . : . :
442 AAAGAAGCTGTGGATCTTAGGGACCTCAATTCACCTCATAGTAGAGCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100954 AAAGAAGCTGTGGATCTTAGGGACCTCAATTCACCTCATAGTAGAGCAAT
500 . : . : . : . : . :
492 GTATGTCTATCCTCCAAATGTAGAATCTTCACCAGAATTGCCAAAGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101004 GTATGTCTATCCTCCAAATGTAGAATCTTCACCAGAATTGCCAAAGCACA
550 . : . : . : . : . :
542 TATATAATAAATTAGATAAAG GGCAAATAATAGTGGTGATC
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
101054 TATATAATAAATTAGATAAAGGTA...TAGGGCAAATAATAGTGGTGATC
600 . : . : . : . : . :
583 TGGGTAATAGTTTCTCCAAATAATGACAAGCAGAAGTATACTCTGAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102485 TGGGTAATAGTTTCTCCAAATAATGACAAGCAGAAGTATACTCTGAAAAT
650 . : . : . : . : . :
633 CAACCATGACTGTGTACCAGAACAAGTAATTGCTGAAGCAATCAGGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102535 CAACCATGACTGTGTACCAGAACAAGTAATTGCTGAAGCAATCAGGAAAA
700 . : . : . : . : . :
683 AAACTCGAAGTATGTTGCTATCCTCTGAACAACTAAAACTCTGTGTTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102585 AAACTCGAAGTATGTTGCTATCCTCTGAACAACTAAAACTCTGTGTTTTA
750 . : . : . : . : . :
733 GAATATCAGGGCAAGTATATTTTAAAAGTGTGTGGATGTGATGAATACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102635 GAATATCAGGGCAAGTATATTTTAAAAGTGTGTGGATGTGATGAATACTT
800 . : . : . : . : . :
783 CCTAGAAAAATATCCTCTGAGTCAGTATAAG TATATAAGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
102685 CCTAGAAAAATATCCTCTGAGTCAGTATAAGGTG...CAGTATATAAGAA
850 . : . : . : . : . :
824 GCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104729 GCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAA
900 . : . : . : . : . :
874 AGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104779 AGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTC
950 . : . : . : . : . :
924 CAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104829 CAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAA
1000 . : . : . : . : . :
974 AATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104879 AATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCA
1050 . : . : . : . : . :
1024 ACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAG ATCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
104929 ACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTA...TAGATCTA
1100 . : . : . : . : . :
1065 TGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105683 TGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGA
1150 . : . : . : . : . :
1115 ACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAG GTGGAATGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
105733 ACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTA...TAGGTGGAATGAA
1200 . : . : . : . : . :
1156 TGGCTGAATTATGATATATACATTCCTGATCTTCCTCGTGCTGCTCGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110780 TGGCTGAATTATGATATATACATTCCTGATCTTCCTCGTGCTGCTCGACT
1250 . : . : . : . : . :
1206 TTGCCTTTCCATTTGCTCTGTTAAAGGCCGAAAGGGTGCTAAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
110830 TTGCCTTTCCATTTGCTCTGTTAAAGGCCGAAAGGGTGCTAAAGAGGTA.
1300 . : . : . : . : . :
1252 GAACACTGTCCATTGGCATGGGGAAATATAAACTTGTTTGATTAC
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110880 ..AAGGAACACTGTCCATTGGCATGGGGAAATATAAACTTGTTTGATTAC
1350 . : . : . : . : . :
1297 ACAGACACTCTAGTATCTGGAAAAATGGCTTTGAATCTTTGGCCAGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111406 ACAGACACTCTAGTATCTGGAAAAATGGCTTTGAATCTTTGGCCAGTACC
1400 . : . : . : . : . :
1347 TCATGGATTAGAAGATTTGCTGAACCCTATTGGTGTTACTGGATCAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111456 TCATGGATTAGAAGATTTGCTGAACCCTATTGGTGTTACTGGATCAAATC
1450 . : . : . : . : . :
1397 CAAATAAA GAAACTCCATGCTTAGAGTTGGAGTTTGACTGG
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
111506 CAAATAAAGTA...TAGGAAACTCCATGCTTAGAGTTGGAGTTTGACTGG
1500 . : . : . : . : . :
1438 TTCAGCAGTGTGGTAAAGTTCCCAGATATGTCAGTGATTGAAGAGCATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111639 TTCAGCAGTGTGGTAAAGTTCCCAGATATGTCAGTGATTGAAGAGCATGC
1550 . : . : . : . : . :
1488 CAATTGGTCTGTATCCCGAGAAGCAGGATTTAGCTATTCCCACGCAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111689 CAATTGGTCTGTATCCCGAGAAGCAGGATTTAGCTATTCCCACGCAGGAC
1600 . : . : . : . : . :
1538 TG AGTAACAGACTAGCTAGAGACAATGAATTAAGGGAAAAT
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111739 TGGTA...CAGAGTAACAGACTAGCTAGAGACAATGAATTAAGGGAAAAT
1650 . : . : . : . : . :
1579 GACAAAGAACAGCTCAAAGCAATTTCTACACGAGATCCTCTCTCTGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119424 GACAAAGAACAGCTCAAAGCAATTTCTACACGAGATCCTCTCTCTGAAAT
1700 . : . : . : . : . :
1629 CACTGAGCAGGAGAAAGATTTTCTATGGAGTCACAG ACACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
119474 CACTGAGCAGGAGAAAGATTTTCTATGGAGTCACAGGTA...CAGACACT
1750 . : . : . : . : . :
1670 ATTGTGTAACTATCCCCGAAATTCTACCCAAATTGCTTCTGTCTGTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120376 ATTGTGTAACTATCCCCGAAATTCTACCCAAATTGCTTCTGTCTGTTAAA
1800 . : . : . : . : . :
1720 TGGAATTCTAGAGATGAAGTAGCCCAG ATGTATTGCTTGGT
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
120426 TGGAATTCTAGAGATGAAGTAGCCCAGGTA...CAGATGTATTGCTTGGT
1850 . : . : . : . : . :
1761 AAAAGATTGGCCTCCAATCAAACCTGAACAGGCTATGGAACTTCTGGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120760 AAAAGATTGGCCTCCAATCAAACCTGAACAGGCTATGGAACTTCTGGACT
1900 . : . : . : . : . :
1811 GTAATTACCCAGATCCTATGGTTCGAGGTTTTGCTGTTCGGTGCTTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120810 GTAATTACCCAGATCCTATGGTTCGAGGTTTTGCTGTTCGGTGCTTGGAA
1950 . : . : . : . : . :
1861 AAATATTTAACAGATGACAAACTTTCTCAGTATTTAATTCAGCTAGTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120860 AAATATTTAACAGATGACAAACTTTCTCAGTATTTAATTCAGCTAGTACA
2000 . : . : . : . : . :
1911 G GTCCTAAAATATGAACAATATTTGGATAACTTGCTTGTGA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120910 GGTA...TAGGTCCTAAAATATGAACAATATTTGGATAACTTGCTTGTGA
2050 . : . : . : . : . :
1952 GATTTTTACTGAAGAAAGCATTGACTAATCAAAGGATTGGGCACTTTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121164 GATTTTTACTGAAGAAAGCATTGACTAATCAAAGGATTGGGCACTTTTTC
2100 . : . : . : . : . :
2002 TTTTGGCATTTAAA ATCTGAGATGCACAATAAAACAGTTAG
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
121214 TTTTGGCATTTAAAGTA...TAGATCTGAGATGCACAATAAAACAGTTAG
2150 . : . : . : . : . :
2043 CCAGAGGTTTGGCCTGCTTTTGGAGTCCTATTGTCGTGCATGTGGGATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122188 CCAGAGGTTTGGCCTGCTTTTGGAGTCCTATTGTCGTGCATGTGGGATGT
2200 . : . : . : . : . :
2093 ATTTGAAGCACCTGAATAGGCAAGTCGAGGCAATGGAAAAGCTCATTAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122238 ATTTGAAGCACCTGAATAGGCAAGTCGAGGCAATGGAAAAGCTCATTAAC
2250 . : . : . : . : . :
2143 TTAACTGACATTCTCAAACAGGAGAAGAAGGATGAAACACAAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
122288 TTAACTGACATTCTCAAACAGGAGAAGAAGGATGAAACACAAAAGGTG..
2300 . : . : . : . : . :
2188 GTACAGATGAAGTTTTTAGTTGAGCAAATGAGGCGACCAGATTTCA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122338 .CAGGTACAGATGAAGTTTTTAGTTGAGCAAATGAGGCGACCAGATTTCA
2350 . : . : . : . : . :
2234 TGGATGCTCTACAGGGCTTTCTGTCTCCTCTAAACCCTGCTCATCAACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125302 TGGATGCTCTACAGGGCTTTCTGTCTCCTCTAAACCCTGCTCATCAACTA
2400 . : . : . : . : . :
2284 GGAAACCTCAG GCTTGAAGAGTGTCGAATTATGTCCTCTGC
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
125352 GGAAACCTCAGGTA...AAGGCTTGAAGAGTGTCGAATTATGTCCTCTGC
2450 . : . : . : . : . :
2325 AAAAAGGCCACTGTGGTTGAATTGGGAGAACCCAGACATCATGTCAGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125905 AAAAAGGCCACTGTGGTTGAATTGGGAGAACCCAGACATCATGTCAGAGT
2500 . : . : . : . : . :
2375 TACTGTTTCAGAACAATGAGATCATCTTTAAAAATGGGGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
125955 TACTGTTTCAGAACAATGAGATCATCTTTAAAAATGGGGATGGTA...CA
2550 . : . : . : . : . :
2417 ATTTACGGCAAGATATGCTAACACTTCAAATTATTCGTATTATGGAAAA
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127136 GATTTACGGCAAGATATGCTAACACTTCAAATTATTCGTATTATGGAAAA
2600 . : . : . : . : . :
2466 TATCTGGCAAAATCAAGGTCTTGATCTTCG AATGTTACCTT
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
127186 TATCTGGCAAAATCAAGGTCTTGATCTTCGGTA...CAGAATGTTACCTT
2650 . : . : . : . : . :
2507 ATGGTTGTCTGTCAATCGGTGACTGTGTGGGACTTATTGAGGTGGTGCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130458 ATGGTTGTCTGTCAATCGGTGACTGTGTGGGACTTATTGAGGTGGTGCGA
2700 . : . : . : . : . :
2557 AATTCTCACACTATTATGCAAATTCAGTGCAAAGGCGGCTTGAAAGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130508 AATTCTCACACTATTATGCAAATTCAGTGCAAAGGCGGCTTGAAAGGTGC
2750 . : . : . : . : . :
2607 ACTGCAGTTCAACAGCCACACACTACATCAGTGGCTCAAAGACAAGAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130558 ACTGCAGTTCAACAGCCACACACTACATCAGTGGCTCAAAGACAAGAACA
2800 . : . : . : . : . :
2657 AAGGAGAAAT ATATGATGCAGCCATTGACCTGTTTACACGT
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
130608 AAGGAGAAATGTG...TAGATATGATGCAGCCATTGACCTGTTTACACGT
2850 . : . : . : . : . :
2698 TCATGTGCTGGATACTGTGTAGCTACCTTCATTTTGGGAATTGGAGATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131210 TCATGTGCTGGATACTGTGTAGCTACCTTCATTTTGGGAATTGGAGATCG
2900 . : . : . : . : . :
2748 TCACAATAGTAACATCATGGTGAAAGACGATGGACAA CTGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
131260 TCACAATAGTAACATCATGGTGAAAGACGATGGACAAGTA...AAGCTGT
2950 . : . : . : . : . :
2789 TTCATATAGATTTTGGACACTTTTTGGATCACAAGAAGAAAAAATTTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131404 TTCATATAGATTTTGGACACTTTTTGGATCACAAGAAGAAAAAATTTGGT
3000 . : . : . : . : . :
2839 TATAAACGAGAACGTGTGCCATTTGTTTTGACACAGGATTTCTTAATAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131454 TATAAACGAGAACGTGTGCCATTTGTTTTGACACAGGATTTCTTAATAGT
3050 . : . : . : . : . :
2889 GATTAGTAAAGGAGCCCAAGAATGCACAAAGACAAGAGAATTTGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
131504 GATTAGTAAAGGAGCCCAAGAATGCACAAAGACAAGAGAATTTGAGAGGT
3100 . : . : . : . : . :
2937 GTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131554 G...TAGGTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAG
3150 . : . : . : . : . :
2980 CATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135312 CATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAAT
3200 . : . : . : . : . :
3030 GCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135362 GCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAG
3250 . : . : . : . : . :
3080 CCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135412 CCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATG
3300 . : . : . : . : . :
3130 AATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135462 AATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCA
3350 . : . : .
3180 CACAATTAAACAGCATGCATTGAAC
|||||||||||||||||||||||||
135512 CACAATTAAACAGCATGCATTGAAC