seq1 = pF1KB0031.tfa, 2745 bp
seq2 = pF1KB0031/gi568815593r_137840228.tfa (gi568815593r:137840228_138119111), 278884 bp

>pF1KB0031 2745
>gi568815593r:137840228_138119111 (Chr5)

(complement)

1-157  (100001-100157)   100% ->
158-370  (100598-100810)   100% ->
371-548  (107167-107344)   99% ->
549-690  (107963-108104)   100% ->
691-848  (111965-112122)   100% ->
849-890  (130797-130838)   100% ->
891-1046  (131496-131651)   100% ->
1047-1179  (133723-133855)   100% ->
1180-1244  (156643-156707)   100% ->
1245-1293  (158898-158946)   100% ->
1294-1441  (159349-159496)   100% ->
1442-1652  (164736-164946)   100% ->
1653-1782  (165647-165776)   100% ->
1783-1864  (166403-166484)   100% ->
1865-2094  (169928-170157)   100% ->
2095-2178  (172801-172884)   100% ->
2179-2274  (173115-173210)   100% ->
2275-2358  (175896-175979)   100% ->
2359-2522  (176074-176237)   100% ->
2523-2624  (177067-177168)   100% ->
2625-2745  (178764-178884)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGAAGAGCTCCTCCCCTTCCTTGAGTAACTGCAACTCCGTTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGAAGAGCTCCTCCCCTTCCTTGAGTAACTGCAACTCCGTTCTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAACAAAATATTTGGAATTCCACTTGATGAGCTGCAGCAGGGAGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAACAAAATATTTGGAATTCCACTTGATGAGCTGCAGCAGGGAGGACATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGACAATGAGGTTCCATTCATAGTCCGCCACGTTGTGGACTATATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGACAATGAGGTTCCATTCATAGTCCGCCACGTTGTGGACTATATTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAACATG         GAGGTCTGGAGCAACAAGGACTTTTTCAAGTCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAACATGGTA...TAGGAGGTCTGGAGCAACAAGGACTTTTTCAAGTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGAAATGCTGAGACAGTGGAGTGGCTTCGGCAGAGATACGACAGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100632 TGGAAATGCTGAGACAGTGGAGTGGCTTCGGCAGAGATACGACAGCGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGAGGTGGATTTGGTTAAGGAAGCAGATGTTCCCTCAGCTATTAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100682 AAGAGGTGGATTTGGTTAAGGAAGCAGATGTTCCCTCAGCTATTAGCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTTAGATTTTTTCTTCAAGAACTTCCTGAACCTGTTATCCCTGGCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100732 CTTAGATTTTTTCTTCAAGAACTTCCTGAACCTGTTATCCCTGGCAGTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACATATTCACTTGATGCAGCTTTCTCAAG         ATTATAATAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100782 ACATATTCACTTGATGCAGCTTTCTCAAGGTA...TAGATTATAATAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGATGAATTTGGAAGAAAGTTGAGGTTCCTCTTGCAACAGCTTCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107179 AAGATGAATTTGGAAGAAAGTTGAGGTTCCTCTTGCAACAGCTTCCACCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTTAATTATAGTTTGTTAAAGTTTCTGTGTAGATTTTTAGCCAATGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107229 GTTAATTATAGTTTGTTAAAGTTTCTGTGTAGATTTTTAGCCAATGTAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATCACATCATGAAGAAATTTGGTCTGCAAATTCTTTGGCTGCTGTCTTTG
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 107279 ATCACATCATGAAGAAATTTGGTCCGCAAATTCTTTGGCTGCTGTCTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTCCAGATGTCTTCCA         CATTTACACAGATGTGGAAGACATG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 107329 GTCCAGATGTCTTCCAGTA...TAGCATTTACACAGATGTGGAAGACATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAAGAGCAAGAAATAGTGAGCAGGATAATGGCTGGACTTCTGGAAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107988 AAAGAGCAAGAAATAGTGAGCAGGATAATGGCTGGACTTCTGGAAAACTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTATGAGTTTTTTGAGAATGAAGAGGAAGATTTTTCATCTAATGATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108038 CTATGAGTTTTTTGAGAATGAAGAGGAAGATTTTTCATCTAATGATTTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTTCAATTACTGAACAG         GTTAATGAACTTTCTGAGGAAGAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 108088 GTTCAATTACTGAACAGGTG...TAGGTTAATGAACTTTCTGAGGAAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAGGAAGATGAAAAGCTGGAACATATTGAAGAACTTCCAGAAGAGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111989 GAGGAAGATGAAAAGCTGGAACATATTGAAGAACTTCCAGAAGAGGGTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGAAAAATCAAATGACATGCCAGAGGTGGTACAATTAAGGATGACTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112039 AGAAAAATCAAATGACATGCCAGAGGTGGTACAATTAAGGATGACTGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACATCCTGGAATCAAATAGTGTTACGGCAACAAG         CACCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 112089 ACATCCTGGAATCAAATAGTGTTACGGCAACAAGGTA...CAGCACCCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ATATCTCCCATCAGCATCCTACCAGCCTCTACAGA         TATTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 130804 ATATCTCCCATCAGCATCCTACCAGCCTCTACAGAGTA...TAGTATTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGAAAGAACAATTAGAGCAGCTGTGGAACAGCACCTTTTTGATCTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131502 AGAAAGAACAATTAGAGCAGCTGTGGAACAGCACCTTTTTGATCTTCAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCAGCATAGATCATGATCTTAAGAATTTACAACAGCAAAGTGTGGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131552 GCAGCATAGATCATGATCTTAAGAATTTACAACAGCAAAGTGTGGTGTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AATAATGAAGCAGAAAGTATTCATTGTGATGGGGAAGGATCTAATAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131602 AATAATGAAGCAGAAAGTATTCATTGTGATGGGGAAGGATCTAATAACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047          GATTGATATTGCTGATGATATTATTAATGCCAGTGAAAGTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131652 GTA...TAGGATTGATATTGCTGATGATATTATTAATGCCAGTGAAAGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACAGAGACTGTTCAAAACCTGTGGCTAGCACTAATTTAGACAATGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133764 ACAGAGACTGTTCAAAACCTGTGGCTAGCACTAATTTAGACAATGAAGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATGCAGCAAGATTGTGTATTTGAGAATGAAGAAAATACCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 133814 ATGCAGCAAGATTGTGTATTTGAGAATGAAGAAAATACCCAGGTA...CA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1180  TCTGTAGGTATATTGTTAGAGCCATGCAGTGACCGTGGTGATAGTGAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156642 GTCTGTAGGTATATTGTTAGAGCCATGCAGTGACCGTGGTGATAGTGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATGGCTGTCTTGAGAG         GGAAGAATATTTGTTATTTGACAGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 156692 ATGGCTGTCTTGAGAGGTA...TAGGGAAGAATATTTGTTATTTGACAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GATAAATTGTCACACTTGATTCTG         GATTCTAGTAGCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 158923 GATAAATTGTCACACTTGATTCTGGTA...CAGGATTCTAGTAGCAAGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 ATGTGATTTGAATGCCAACACTGAATCAGAAGTACCAGGAGGTCAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159366 ATGTGATTTGAATGCCAACACTGAATCAGAAGTACCAGGAGGTCAGAGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTGGTGTTCAAGGGGAAGCAGCGTGTGTCAGTATTCCACATTTAGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159416 TTGGTGTTCAAGGGGAAGCAGCGTGTGTCAGTATTCCACATTTAGATCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AAGAATGTTTCTGATGGTGATAAATGGGAAG         AGCCATTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 159466 AAGAATGTTTCTGATGGTGATAAATGGGAAGGTA...TAGAGCCATTTCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGCTTTTAAGTCTTGGCAGGAGGACTCTGAGTCTGGAGAAGCTCAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164746 TGCTTTTAAGTCTTGGCAGGAGGACTCTGAGTCTGGAGAAGCTCAGCTGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CTCCACAAGCTGGAAGAATGAATCATCACCCCTTGGAAGAGGACTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164796 CTCCACAAGCTGGAAGAATGAATCATCACCCCTTGGAAGAGGACTGTCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CCAGTATTATCACACCGCAGTTTAGATTTTGGTCAAAGCCAGCGTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164846 CCAGTATTATCACACCGCAGTTTAGATTTTGGTCAAAGCCAGCGTTTCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 ACATGATCCAGAAAAGTTGGATTCCTCATCTAAAGCACTGTCTTTTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164896 ACATGATCCAGAAAAGTTGGATTCCTCATCTAAAGCACTGTCTTTTACTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 G         AATTCGAAGATCATCCTTTAGTTCAAAAGATGAAAAGAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164946 GGTA...CAGAATTCGAAGATCATCCTTTAGTTCAAAAGATGAAAAGAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GAGGACAGAACACCTTATCAGCTGGTCAAGAAACTTCAGAAGAAAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165687 GAGGACAGAACACCTTATCAGCTGGTCAAGAAACTTCAGAAGAAAATCAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 ACAATTTGAGGAACAGTTTGAAAGGGAAAGAAATAGCAAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 165737 ACAATTTGAGGAACAGTTTGAAAGGGAAAGAAATAGCAAGGTA...CAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CCTCCTACAGTGATATTGCTGCCAATCCAAAGGTATTAAAATGGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166404 CCTCCTACAGTGATATTGCTGCCAATCCAAAGGTATTAAAATGGATGACA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GAGCTTACAAAACTGCGGAAGCAAATTAAAG         ATGCAAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 166454 GAGCTTACAAAACTGCGGAAGCAAATTAAAGGTA...TAGATGCAAAACA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CAAAAATTCTGATGGAGAATTTGTACCTCAGACACGTCCACGTAGTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169938 CAAAAATTCTGATGGAGAATTTGTACCTCAGACACGTCCACGTAGTAACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CACTTCCAAAAAGCTTTGGCTCTTCTCTAGACCATGAAGATGAAGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169988 CACTTCCAAAAAGCTTTGGCTCTTCTCTAGACCATGAAGATGAAGAGAAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GAAGATGAACCCAAGGTCATTCAGAAGGAGAAAAAACCATCTAAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170038 GAAGATGAACCCAAGGTCATTCAGAAGGAGAAAAAACCATCTAAAGAAGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 AACCCTTGAACTTATTCTTAAAAGACTGAAAGAAAAACGTATTGAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170088 AACCCTTGAACTTATTCTTAAAAGACTGAAAGAAAAACGTATTGAGAGGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GTCTTCCAGAAGATATCAAG         AAAATGACCAAAGATCATTTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 170138 GTCTTCCAGAAGATATCAAGGTA...CAGAAAATGACCAAAGATCATTTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GTAGAAGAGAAAGCTTCTCTTCAGAAAAGTCTTCTTTACTATGAAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172822 GTAGAAGAGAAAGCTTCTCTTCAGAAAAGTCTTCTTTACTATGAAAGTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 ACATGGAAGGCCG         GTGACCAAGGAAGAAAGGCACATTGTTA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 172872 ACATGGAAGGCCGGTA...CAGGTGACCAAGGAAGAAAGGCACATTGTTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 AACCTCTCTATGATAGATACAGGCTTGTAAAACAAATGCTGACAAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173143 AACCTCTCTATGATAGATACAGGCTTGTAAAACAAATGCTGACAAGAGCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 AGCATCACTCCTGTCCTT         GGATCTCCATCCACCAAGCGAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 173193 AGCATCACTCCTGTCCTTGTA...TAGGGATCTCCATCCACCAAGCGAAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GGGTCAGATGTTACAGCCAATCATAGAAGGAGAAACTGCACATTTTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175919 GGGTCAGATGTTACAGCCAATCATAGAAGGAGAAACTGCACATTTTTTTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 AAGAAATCAAG         GAGGAAGAAGAAGATGGTGTTAATCTGTCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 175969 AAGAAATCAAGGTA...TAGGAGGAAGAAGAAGATGGTGTTAATCTGTCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 TCTGAGTTAGGTGATATGTTGAAAACTGCAGTACAGGTACAGTCTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176104 TCTGAGTTAGGTGATATGTTGAAAACTGCAGTACAGGTACAGTCTTCATT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 AGAAAACTCTGAATCTGATGTTGAAGAAAATCAAGAAAAACTGGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176154 AGAAAACTCTGAATCTGATGTTGAAGAAAATCAAGAAAAACTGGCTCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 ATCTCCGATTGTCAAGTTCTCGAGCAGCTTCTAT         GCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 176204 ATCTCCGATTGTCAAGTTCTCGAGCAGCTTCTATGTA...TAGGCCTGAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 TTATTGGAACAACTTTGGAAAGCCAGAGCTGAAAAAAAGAAACTACGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177074 TTATTGGAACAACTTTGGAAAGCCAGAGCTGAAAAAAAGAAACTACGCAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 AACGTTGCGGGAATTTGAAGAAGCATTTTATCAACAAAATGGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 177124 AACGTTGCGGGAATTTGAAGAAGCATTTTATCAACAAAATGGAAGGTT..

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625     GAATGCCCAGAAAGAGGATCGTGTTCCAGTGCTTGAGGAGTACAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177174 .TAGGAATGCCCAGAAAGAGGATCGTGTTCCAGTGCTTGAGGAGTACAGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 GAGTACAAGAAAATTAAAGCCAAGCTTAGGCTTCTTGAAGTTCTTATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178810 GAGTACAAGAAAATTAAAGCCAAGCTTAGGCTTCTTGAAGTTCTTATAAG

   2900     .    :    .    :    .
   2721 CAAACAAGATTCTTCAAAATCCATA
        |||||||||||||||||||||||||
 178860 CAAACAAGATTCTTCAAAATCCATA