seq1 = pF1KB0026.tfa, 3174 bp
seq2 = pF1KB0026/gi568815579r_45721103.tfa (gi568815579r:45721103_45954495), 233393 bp

>pF1KB0026 3174
>gi568815579r:45721103_45954495 (Chr19)

(complement)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-171  (100256-100321)   100% ->
172-225  (101961-102014)   100% ->
226-299  (102111-102184)   100% ->
300-426  (105620-105746)   100% ->
427-676  (106495-106744)   100% ->
677-847  (110296-110466)   100% ->
848-1087  (112007-112246)   100% ->
1088-1242  (115881-116035)   100% ->
1243-1393  (119268-119418)   100% ->
1394-1598  (122908-123112)   100% ->
1599-1749  (124292-124442)   100% ->
1750-1985  (125291-125526)   100% ->
1986-2067  (126578-126659)   100% ->
2068-2181  (126873-126986)   100% ->
2182-2329  (128123-128270)   100% ->
2330-2490  (129165-129325)   100% ->
2491-2599  (130621-130729)   100% ->
2600-2700  (131024-131124)   100% ->
2701-2791  (131650-131740)   100% ->
2792-3174  (133011-133393)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAGCGGCAGTGGAGACAGCGTCACCCGTCGGAGCGTGGCATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAGCGGCAGTGGAGACAGCGTCACCCGTCGGAGCGTGGCATCACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTTTTCACTCAAGAGGAGGGGCCGGGCATCGATGGCATGACCACCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTTTTCACTCAAGAGGAGGGGCCGGGCATCGATGGCATGACCACCTCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGG         GTGGTGGATCTTCTGAACCAGGCGGCGCTGATCACC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAGGGTG...CAGGTGGTGGATCTTCTGAACCAGGCGGCGCTGATCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATGACTCAAAGATCACAGTGCTCAAACAG         GTCCAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100292 AATGACTCAAAGATCACAGTGCTCAAACAGGTG...CAGGTCCAGGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATCATCAACAAAGACCCCACACTACTGGACAACTTCCTGGAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101972 GATCATCAACAAAGACCCCACACTACTGGACAACTTCCTGGATGTG...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    226   GAGATCATCGCATTCCAAGCAGACAAGTCAATCGAAGTGCGAAAATTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102109 AGGAGATCATCGCATTCCAAGCAGACAAGTCAATCGAAGTGCGAAAATTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTCATCGGCTTCATCGAGGAGGCATG         CAAGCGAGACATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102159 GTCATCGGCTTCATCGAGGAGGCATGGTA...CAGCAAGCGAGACATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GTTGCTGCTGAAACTCATTGCAAACCTCAACATGCTCTTGAGGGACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105635 GTTGCTGCTGAAACTCATTGCAAACCTCAACATGCTCTTGAGGGACGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGTGAACGTGGTGAAGAAGGCTATCCTCACCATGACCCAGCTCTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105685 ATGTGAACGTGGTGAAGAAGGCTATCCTCACCATGACCCAGCTCTACAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGGCCCTGCAG         TGGATGGTAAAGTCACGGGTCATTAGCGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 105735 GTGGCCCTGCAGGTG...CAGTGGATGGTAAAGTCACGGGTCATTAGCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCTACAGGAGGCCTGCTGGGACATGGTATCTGCCATGGCGGGGGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106524 GCTACAGGAGGCCTGCTGGGACATGGTATCTGCCATGGCGGGGGACATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCCTGCTATTGGACTCTGACAATGACGGCATCCGCACCCACGCCATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106574 TCCTGCTATTGGACTCTGACAATGACGGCATCCGCACCCACGCCATCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTTGTGGAGGGCCTCATTGTCACCCTGTCACCCCGCATGGCTGACTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106624 TTTGTGGAGGGCCTCATTGTCACCCTGTCACCCCGCATGGCTGACTCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GATACCCCGACGCCAGGAGCATGATATCAGCCTGGACCGCATCCCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106674 GATACCCCGACGCCAGGAGCATGATATCAGCCTGGACCGCATCCCTCGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACCACCCCTACATCCAGTACA         ACGTGCTATGGGAAGAGGGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106724 ACCACCCCTACATCCAGTACAGTG...TAGACGTGCTATGGGAAGAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAGGCAGCCTTGGAGCAGCTGCTTAAGTTCATGGTGCACCCTGCCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110316 AAGGCAGCCTTGGAGCAGCTGCTTAAGTTCATGGTGCACCCTGCCATCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTCCATCAACCTGACCACAGCGCTGGGCTCCCTTGCCAATATCGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110366 CTCCATCAACCTGACCACAGCGCTGGGCTCCCTTGCCAATATCGCCCGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGAGACCCATGTTCATGTCTGAGGTGATCCAGGCCTATGAAACTCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110416 AGAGACCCATGTTCATGTCTGAGGTGATCCAGGCCTATGAAACTCTGCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 G         CCAACCTGCCCCCGACGCTGGCCAAATCGCAGGTGAGCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110466 GGTA...CAGCCAACCTGCCCCCGACGCTGGCCAAATCGCAGGTGAGCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGTGCGTAAGAATCTGAAGCTGCACCTGTTGAGTGTGCTGAAGCACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112047 TGTGCGTAAGAATCTGAAGCTGCACCTGTTGAGTGTGCTGAAGCACCCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTTCCTTGGAGTTCCAGGCCCAGATCACCACCCTGCTGGTGGACCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112097 CTTCCTTGGAGTTCCAGGCCCAGATCACCACCCTGCTGGTGGACCTGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACACCTCAGGCCGAGATCGCCCGCAACATGCCGAGCAGCAAGGACACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112147 ACACCTCAGGCCGAGATCGCCCGCAACATGCCGAGCAGCAAGGACACCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAAGCGGCCCCGCGATGACTCGGACTCCACACTCAAGAAGATGAAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112197 CAAGCGGCCCCGCGATGACTCGGACTCCACACTCAAGAAGATGAAGCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088          AGCCCAACCTGGGGGAGGACGATGAGGACAAAGACTTGGAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112247 GTG...CAGAGCCCAACCTGGGGGAGGACGATGAGGACAAAGACTTGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CCAGGCCCGTCGGGGACCTCGAAGGCCTCAGCGCAGATCTCCGGCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115922 CCAGGCCCGTCGGGGACCTCGAAGGCCTCAGCGCAGATCTCCGGCCAGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGACACGGACATCACAGCTGAGTTCCTGCAGCCTCTGCTGACGCCTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115972 AGACACGGACATCACAGCTGAGTTCCTGCAGCCTCTGCTGACGCCTGATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATGTGGCTAATCTG         GTCCTCATCAGCATGGTGTACCTACCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 116022 ATGTGGCTAATCTGGTG...CAGGTCCTCATCAGCATGGTGTACCTACCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GAGGCCATGCCAGCCTCCTTCCAGGCCATCTACACCCCCGTGGAGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119295 GAGGCCATGCCAGCCTCCTTCCAGGCCATCTACACCCCCGTGGAGTCAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGGCACGGAAGCCCAGATCAAGCACCTGGCTCGGCTCATGGCCACACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119345 AGGCACGGAAGCCCAGATCAAGCACCTGGCTCGGCTCATGGCCACACAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGACAGCTGCCGGACTGGGACCAG         GTGTAGAGCAGACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 119395 TGACAGCTGCCGGACTGGGACCAGGTG...CAGGTGTAGAGCAGACCAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CAGTGCAAGGAGGAGCCCAAGGAGGAGAAGGTGGTGAAGACAGAGAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122925 CAGTGCAAGGAGGAGCCCAAGGAGGAGAAGGTGGTGAAGACAGAGAGCGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CCTGATCAAGCGGCGCCTGTCAGCCCAGGGCCAAGCCATCTCGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122975 CCTGATCAAGCGGCGCCTGTCAGCCCAGGGCCAAGCCATCTCGGTGGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GTTCCCTGAGCTCCATGTCCCCCCTGGAGGAAGAGGCACCGCAGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123025 GTTCCCTGAGCTCCATGTCCCCCCTGGAGGAAGAGGCACCGCAGGCCAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AGGAGGCCAGAGCCCATTATCCCTGTCACTCAGCCCCG         GCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 123075 AGGAGGCCAGAGCCCATTATCCCTGTCACTCAGCCCCGGTG...CAGGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GGCAGGCGCTGGTGGGCGCAAGAAAATTTTCCGTCTCAGCGACGTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124295 GGCAGGCGCTGGTGGGCGCAAGAAAATTTTCCGTCTCAGCGACGTGCTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AGCCCCTTACCGATGCCCAGGTGGAAGCCATGAAGCTGGGCGCTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124345 AGCCCCTTACCGATGCCCAGGTGGAAGCCATGAAGCTGGGCGCTGTGAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CGGATCCTGCGGGCTGAGAAGGCTGTGGCCTGCAGCGGGGCAGCCCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 124395 CGGATCCTGCGGGCTGAGAAGGCTGTGGCCTGCAGCGGGGCAGCCCAGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1750        GTCCGCATAAAGATCCTGGCCAGCCTGGTGACACAGTTCAACT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124445 G...CAGGTCCGCATAAAGATCCTGGCCAGCCTGGTGACACAGTTCAACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CGGGCCTGAAGGCGGAGGTCCTGTCCTTCATCCTGGAGGATGTGCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125334 CGGGCCTGAAGGCGGAGGTCCTGTCCTTCATCCTGGAGGATGTGCGGGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CGCCTGGACCTGGCCTTCGCCTGGCTCTACCAGGAGTACAACGCCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125384 CGCCTGGACCTGGCCTTCGCCTGGCTCTACCAGGAGTACAACGCCTACCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GGCCGCAGGTGCCTCGGGCTCCCTGGACAAGTATGAGGACTGCCTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125434 GGCCGCAGGTGCCTCGGGCTCCCTGGACAAGTATGAGGACTGCCTCATCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 GCCTGTTGTCTGGCCTGCAGGAGAAACCAGACCAGAAGGATGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 125484 GCCTGTTGTCTGGCCTGCAGGAGAAACCAGACCAGAAGGATGGGTG...C

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1986   GATCTTCACCAAGGTTGTGCTGGAGGCGCCACTCATCACAGAGAGTGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126576 AGGATCTTCACCAAGGTTGTGCTGGAGGCGCCACTCATCACAGAGAGTGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CCTGGAGGTGGTCCGCAAGTACTGCGAGGATGAG         AGTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 126626 CCTGGAGGTGGTCCGCAAGTACTGCGAGGATGAGGTG...CAGAGTCGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CCTATCTGGGCATGTCCACACTTCGAGACCTGATCTTCAAGCGCCCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126880 CCTATCTGGGCATGTCCACACTTCGAGACCTGATCTTCAAGCGCCCGTCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CGCCAGTTCCAGTACCTGCATGTCCTCCTCGACCTCAGCTCCCATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126930 CGCCAGTTCCAGTACCTGCATGTCCTCCTCGACCTCAGCTCCCATGAGAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GGACAAG         GTGCGCTCCCAGGCCCTGCTGTTCATCAAACGCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126980 GGACAAGGTG...CAGGTGCGCTCCCAGGCCCTGCTGTTCATCAAACGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TGTATGAGAAGGAGCAGCTGCGGGAGTATGTGGAGAAATTTGCCCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128157 TGTATGAGAAGGAGCAGCTGCGGGAGTATGTGGAGAAATTTGCCCTCAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 TACCTGCAGCTCCTGGTGCACCCCAACCCACCGTCTGTGCTGTTTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128207 TACCTGCAGCTCCTGGTGCACCCCAACCCACCGTCTGTGCTGTTTGGAGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 TGACAAGGACACAG         AGGTGGCAGCACCCTGGACGGAGGAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 128257 TGACAAGGACACAGGTT...CAGAGGTGGCAGCACCCTGGACGGAGGAGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 CAGTGAAGCAGTGTCTGTACCTCTACCTGGCCCTCCTGCCTCAGAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129192 CAGTGAAGCAGTGTCTGTACCTCTACCTGGCCCTCCTGCCTCAGAACCAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 AAGCTGATCCACGAACTGGCGGCCGTGTACACTGAAGCCATCGCCGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129242 AAGCTGATCCACGAACTGGCGGCCGTGTACACTGAAGCCATCGCCGACAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 CAAGCGGACGGTGCTGAGGGTCATTGAGCAGCCG         ATCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 129292 CAAGCGGACGGTGCTGAGGGTCATTGAGCAGCCGGTG...TAGATCCGAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 GAATGGGCATGAACTCCCCGGAGCTGCTCCTGCTGGTGGAAAATTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130628 GAATGGGCATGAACTCCCCGGAGCTGCTCCTGCTGGTGGAAAATTGTCCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 AAGGGAGCAGAGACACTGGTCACGAGATGTCTGCACAGCCTCACAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130678 AAGGGAGCAGAGACACTGGTCACGAGATGTCTGCACAGCCTCACAGACAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 AG         TCCCACCCTCCCCAGAGCTGGTGAAGCGGGTCCGGGATC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130728 AGGTG...CAGTCCCACCCTCCCCAGAGCTGGTGAAGCGGGTCCGGGATC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TCTACCACAAGCGACTGCCAGACGTCCGCTTCCTCATCCCGGTGCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131063 TCTACCACAAGCGACTGCCAGACGTCCGCTTCCTCATCCCGGTGCTCAAT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 GGGCTGGAGAAG         AAAGAGGTGATCCAGGCCCTGCCTAAACT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 131113 GGGCTGGAGAAGGTA...TAGAAAGAGGTGATCCAGGCCCTGCCTAAACT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 CATCAAACTCAACCCCATCGTGGTGAAGGAAGTCTTCAACCGCCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131679 CATCAAACTCAACCCCATCGTGGTGAAGGAAGTCTTCAACCGCCTGCTGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 GCACCCAGCATG         GTGAGGGAAACTCAGCCTTGTCCCCGCTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 131729 GCACCCAGCATGGTA...CAGGTGAGGGAAACTCAGCCTTGTCCCCGCTG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821 AACCCTGGAGAGCTCCTGATCGCATTACACAACATTGACTCCGTGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133040 AACCCTGGAGAGCTCCTGATCGCATTACACAACATTGACTCCGTGAAGTG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 CGACATGAAATCCATCATCAAAGGTGAGGCGCTTCCCCCCCACTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133090 CGACATGAAATCCATCATCAAAGGTGAGGCGCTTCCCCCCCACTCCAGTG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 GCCTGGCCCCTGCGACGCCAGGGCAGGACCTCAGTCACCCACATGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133140 GCCTGGCCCCTGCGACGCCAGGGCAGGACCTCAGTCACCCACATGCCCCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 ACTGGAATCTGCCAAGTCAAAGACTGTCACTCACAGCCCCACCTCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133190 ACTGGAATCTGCCAAGTCAAAGACTGTCACTCACAGCCCCACCTCAGAGC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 TCTGGAGAGCCACCTCCCTCCCTCCCTCCTTTTCTTGCCTCCTCTTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133240 TCTGGAGAGCCACCTCCCTCCCTCCCTCCTTTTCTTGCCTCCTCTTCCCT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 CCCTCCCTCCCTCCCTCCTCCTTCCTTCCTCCCAGGTTTTACCCTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133290 CCCTCCCTCCCTCCCTCCTCCTTCCTTCCTCCCAGGTTTTACCCTTTACA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 ACCCACCTTTTTCTGCCTCTGATGTACCTGCTGTGCCCTGGCACAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133340 ACCCACCTTTTTCTGCCTCTGATGTACCTGCTGTGCCCTGGCACAGAGTG

   3350 
   3171 GGCC
        ||||
 133390 GGCC