Result of SIM4 for
pF1KA2032
seq1 = pF1KA2032.tfa, 2832 bp
seq2 = pF1KA2032/gi568815585r_38911368.tfa (gi568815585r:38911368_39137242), 225875 bp
>pF1KA2032 2832
>gi568815585r:38911368_39137242 (Chr13)
(complement)
1-45 (100001-100045) 100% ->
46-111 (103047-103112) 100% ->
112-180 (105612-105680) 100% ->
181-275 (107868-107962) 100% ->
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481-564 (112687-112770) 100% ->
565-643 (114113-114191) 100% ->
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776-2561 (122767-124552) 100% ->
2562-2712 (125010-125160) 100% ->
2713-2832 (125756-125875) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGATAAAAAGTCCTTTGAAATGGTGCTGGATGAAATTAGAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
100001 ATGGATAAAAAGTCCTTTGAAATGGTGCTGGATGAAATTAGAAAGGTA..
50 . : . : . : . : . :
46 GCTGTTTTGACAGAATACAAATTAAAAGCAATTGAATATGTGCATG
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 .TAGGCTGTTTTGACAGAATACAAATTAAAAGCAATTGAATATGTGCATG
100 . : . : . : . : . :
92 GATACTTTTCTAGTGAACAG GTGGTTGATTTGCTGAGATAT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
103093 GATACTTTTCTAGTGAACAGGTA...CAGGTGGTTGATTTGCTGAGATAT
150 . : . : . : . : . :
133 TTTTCCTGGGCCGAGCCCCAGTTGAAGGCAATGAAAGCATTACAGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
105633 TTTTCCTGGGCCGAGCCCCAGTTGAAGGCAATGAAAGCATTACAGCATGT
200 . : . : . : . : . :
181 AAAATGGTGGCTGTCCAGCCAACAGAAGTGGTCAATATACTCA
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105683 A...CAGAAAATGGTGGCTGTCCAGCCAACAGAAGTGGTCAATATACTCA
250 . : . : . : . : . :
224 ACTGTTTCACTTTCAGTAAAGACAAACTAGTTGCTCTTGAACTGTTAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107911 ACTGTTTCACTTTCAGTAAAGACAAACTAGTTGCTCTTGAACTGTTAGCC
300 . : . : . : . : . :
274 TC GAACATTATTGATGCACAGAATTCTCGTCCTATTGAAGA
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107961 TCGTA...TAGGAACATTATTGATGCACAGAATTCTCGTCCTATTGAAGA
350 . : . : . : . : . :
315 TTTATTCAGGGTAAATATGTCTGAGAAGAAACGGTGCAAGAGAATACTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108962 TTTATTCAGGGTAAATATGTCTGAGAAGAAACGGTGCAAGAGAATACTTG
400 . : . : . : . : . :
365 AACAG GCTTTCAAGGGGGGCTGCAAAGCTCCTCATGCTATG
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109012 AACAGGTA...CAGGCTTTCAAGGGGGGCTGCAAAGCTCCTCATGCTATG
450 . : . : . : . : . :
406 ATATCTTCTTGTGGAACAATCCCAGGAAATCCATATCCCAAAGGAAGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110892 ATATCTTCTTGTGGAACAATCCCAGGAAATCCATATCCCAAAGGAAGACC
500 . : . : . : . : . :
456 TAGCCGCATAAATGGAATTTTCCCA GGAACTCCTTTGAAAA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
110942 TAGCCGCATAAATGGAATTTTCCCAGTA...TAGGGAACTCCTTTGAAAA
550 . : . : . : . : . :
497 AAGATGGTGAAGAATGTACTAACGAAGGCAAAGGAATAGCTGCACGAATT
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112703 AAGATGGTGAAGAATGTACTAACGAAGGCAAAGGAATAGCTGCACGAATT
600 . : . : . : . : . :
547 CTTGGGCCATCCAAACCA CCTCCTTCAACATATAATCCACA
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
112753 CTTGGGCCATCCAAACCAGTA...TAGCCTCCTTCAACATATAATCCACA
650 . : . : . : . : . :
588 TAAACCTGTTCCTTATCCGATACCTCCATGCCGACCACATGCAACTATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114136 TAAACCTGTTCCTTATCCGATACCTCCATGCCGACCACATGCAACTATTG
700 . : . : . : . : . :
638 CACCAA GTGCTTATAACAATGCAGGTCTGGTACCATTAGCG
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
114186 CACCAAGTA...TAGGTGCTTATAACAATGCAGGTCTGGTACCATTAGCG
750 . : . : . : . : . :
679 AATGTCATAGCTCCACCTCCACCTCCATATACTCCTAATCCTGTAGGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114866 AATGTCATAGCTCCACCTCCACCTCCATATACTCCTAATCCTGTAGGAAC
800 . : . : . : . : . :
729 AG AGAATGAAGACCTTTCGAATCCGTCAAAACCTATACAGA
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114916 AGGTA...TAGAGAATGAAGACCTTTCGAATCCGTCAAAACCTATACAGA
850 . : . : . : . : . :
770 ATCAAA CATTTTCCACCCCAGCAAGTCAACTCTTTTCTCCT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
119738 ATCAAAGTA...TAGCATTTTCCACCCCAGCAAGTCAACTCTTTTCTCCT
900 . : . : . : . : . :
811 CATGGTTCTAATCCTTCAACACCTGCTGCAACTCCTGTTCCTACTGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122802 CATGGTTCTAATCCTTCAACACCTGCTGCAACTCCTGTTCCTACTGCATC
950 . : . : . : . : . :
861 CCCAGTCAAGGCAATTAATCATCCATCAGCATCAGCAGCTGCCACCGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122852 CCCAGTCAAGGCAATTAATCATCCATCAGCATCAGCAGCTGCCACCGTTT
1000 . : . : . : . : . :
911 CTGGAATGAACCTGCTGAATACTGTCCTTCCTGTGTTCCCAGGGCAGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122902 CTGGAATGAACCTGCTGAATACTGTCCTTCCTGTGTTCCCAGGGCAGGTC
1050 . : . : . : . : . :
961 TCCTCAGCCGTTCACACACCTCAGCCATCAATACCAAACCCAACAGTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122952 TCCTCAGCCGTTCACACACCTCAGCCATCAATACCAAACCCAACAGTTAT
1100 . : . : . : . : . :
1011 CAGAACCCCTTCATTGCCCACTGCACCTGTTACATCCATCCACAGTACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123002 CAGAACCCCTTCATTGCCCACTGCACCTGTTACATCCATCCACAGTACAA
1150 . : . : . : . : . :
1061 CCACCACTCCTGTTCCTTCCATTTTTTCTGGCCTAGTGTCACTGCCAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123052 CCACCACTCCTGTTCCTTCCATTTTTTCTGGCCTAGTGTCACTGCCAGGT
1200 . : . : . : . : . :
1111 CCTTCTGCCACTCCTACCGCAGCCACTCCTACCCCAGGACCTACACCACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123102 CCTTCTGCCACTCCTACCGCAGCCACTCCTACCCCAGGACCTACACCACG
1250 . : . : . : . : . :
1161 GTCCACTCTTGGTTCCAGTGAAGCATTTGCTTCTACTTCTGCACCTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123152 GTCCACTCTTGGTTCCAGTGAAGCATTTGCTTCTACTTCTGCACCTTTCA
1300 . : . : . : . : . :
1211 CTAGCCTCCCCTTTTCCACCAGCTCTTCTGCTGCTTCTACCAGCAACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123202 CTAGCCTCCCCTTTTCCACCAGCTCTTCTGCTGCTTCTACCAGCAACCCA
1350 . : . : . : . : . :
1261 AATTCTGCTTCATTGTCATCAGTTTTTGCAGGGCTCCCTTTGCCCTTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123252 AATTCTGCTTCATTGTCATCAGTTTTTGCAGGGCTCCCTTTGCCCTTACC
1400 . : . : . : . : . :
1311 ACCAACATCCCAAGGCCTATCCAACCCGACTCCTGTAATTGCTGGTGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123302 ACCAACATCCCAAGGCCTATCCAACCCGACTCCTGTAATTGCTGGTGGCT
1450 . : . : . : . : . :
1361 CTACTCCCAGCGTTGCCGGTCCACTTGGTGTGAACAGTCCTCTTTTGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123352 CTACTCCCAGCGTTGCCGGTCCACTTGGTGTGAACAGTCCTCTTTTGTCT
1500 . : . : . : . : . :
1411 GCGTTAAAAGGTTTTCTGACATCCAATGACACCAATTTAATCAACTCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123402 GCGTTAAAAGGTTTTCTGACATCCAATGACACCAATTTAATCAACTCCTC
1550 . : . : . : . : . :
1461 TGCTTTATCCTCTGCTGTCACAAGTGGGCTGGCTTCACTATCTTCTCTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123452 TGCTTTATCCTCTGCTGTCACAAGTGGGCTGGCTTCACTATCTTCTCTTA
1600 . : . : . : . : . :
1511 CTCTTCAGAACTCTGACTCTTCTGCTTCAGCCCCTAACAAGTGCTATGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123502 CTCTTCAGAACTCTGACTCTTCTGCTTCAGCCCCTAACAAGTGCTATGCC
1650 . : . : . : . : . :
1561 CCATCAGCCATCCCTACCCCACAGAGGACTTCCACTCCAGGGTTGGCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123552 CCATCAGCCATCCCTACCCCACAGAGGACTTCCACTCCAGGGTTGGCCCT
1700 . : . : . : . : . :
1611 GTTCCCAGGCCTGCCGTCTCCCGTGGCTAACTCAACTTCCACTCCCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123602 GTTCCCAGGCCTGCCGTCTCCCGTGGCTAACTCAACTTCCACTCCCCTGA
1750 . : . : . : . : . :
1661 CATTGCCTGTACAGTCTCCTTTAGCCACTGCTGCATCAGCTTCCACGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123652 CATTGCCTGTACAGTCTCCTTTAGCCACTGCTGCATCAGCTTCCACGTCA
1800 . : . : . : . : . :
1711 GTGCCAGTTAGCTGTGGCTCCTCAGCCTCCCTTTTGCGTGGCCCCCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123702 GTGCCAGTTAGCTGTGGCTCCTCAGCCTCCCTTTTGCGTGGCCCCCACCC
1850 . : . : . : . : . :
1761 AGGTACCTCAGATCTGCATATTTCATCTACCCCTGCTGCAACAACTCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123752 AGGTACCTCAGATCTGCATATTTCATCTACCCCTGCTGCAACAACTCTTC
1900 . : . : . : . : . :
1811 CTGTTATGATCAAAACTGAGCCCACAAGTCCTACTCCCTCGGCCTTCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123802 CTGTTATGATCAAAACTGAGCCCACAAGTCCTACTCCCTCGGCCTTCAAA
1950 . : . : . : . : . :
1861 GGTCCATCTCATTCTGGGAATCCCTCTCATGGCACTTTAGGTTTGTCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123852 GGTCCATCTCATTCTGGGAATCCCTCTCATGGCACTTTAGGTTTGTCAGG
2000 . : . : . : . : . :
1911 GACATTGGGCCGTGCATATACTTCAACATCCGTGCCCATCAGTTTATCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123902 GACATTGGGCCGTGCATATACTTCAACATCCGTGCCCATCAGTTTATCTG
2050 . : . : . : . : . :
1961 CTTGCCTTAATCCTGCATTGTCAGGTCTCTCCAGCTTGAGTACTCCTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123952 CTTGCCTTAATCCTGCATTGTCAGGTCTCTCCAGCTTGAGTACTCCTTTA
2100 . : . : . : . : . :
2011 AATGGTTCAAATCCTCTTTCCTCTATTTCCCTTCCACCACATGGTTCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124002 AATGGTTCAAATCCTCTTTCCTCTATTTCCCTTCCACCACATGGTTCCTC
2150 . : . : . : . : . :
2061 CACTCCCATTGCACCAGTATTCACTGCTCTTCCTTCTTTTACTTCTTTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124052 CACTCCCATTGCACCAGTATTCACTGCTCTTCCTTCTTTTACTTCTTTGA
2200 . : . : . : . : . :
2111 CCAACAATTTTCCTTTAACTGGCAACCCATCTCTTAATCCGTCAGTATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124102 CCAACAATTTTCCTTTAACTGGCAACCCATCTCTTAATCCGTCAGTATCT
2250 . : . : . : . : . :
2161 CTCCCAGGGTCATTAATAGCCACCTCATCTACCGCTGCCACCTCCACATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124152 CTCCCAGGGTCATTAATAGCCACCTCATCTACCGCTGCCACCTCCACATC
2300 . : . : . : . : . :
2211 TCTCCCTCATCCTAGCTCAACGGCAGCTGTTCTCTCAGGGCTTTCTGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124202 TCTCCCTCATCCTAGCTCAACGGCAGCTGTTCTCTCAGGGCTTTCTGCTT
2350 . : . : . : . : . :
2261 CAGCACCAGTCTCAGCAGCACCTTTCCCCCTCAACCTGTCCACTGCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124252 CAGCACCAGTCTCAGCAGCACCTTTCCCCCTCAACCTGTCCACTGCTGTT
2400 . : . : . : . : . :
2311 CCCTCACTTTTCTCTGTTACTCAAGGACCTCTGTCATCTTCAAATCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124302 CCCTCACTTTTCTCTGTTACTCAAGGACCTCTGTCATCTTCAAATCCCTC
2450 . : . : . : . : . :
2361 CTATCCAGGCTTTTCTGTCTCTAATACCCCAAGCGTTACCCCTGCTCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124352 CTATCCAGGCTTTTCTGTCTCTAATACCCCAAGCGTTACCCCTGCTCTTC
2500 . : . : . : . : . :
2411 CCTCATTCCCGGGGCTGCAGGCGCCCTCTACAGTCGCAGCTGTCACACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124402 CCTCATTCCCGGGGCTGCAGGCGCCCTCTACAGTCGCAGCTGTCACACCA
2550 . : . : . : . : . :
2461 CTACCTGTGGCTGCCACAGCCCCATCCCCAGCTCCAGTCCTCCCAGGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124452 CTACCTGTGGCTGCCACAGCCCCATCCCCAGCTCCAGTCCTCCCAGGATT
2600 . : . : . : . : . :
2511 CGCCTCAGCATTCAGTTCCAATTTCAACTCCGCTCTTGTTGCACAAGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124502 CGCCTCAGCATTCAGTTCCAATTTCAACTCCGCTCTTGTTGCACAAGCCG
2650 . : . : . : . : . :
2561 G TTTATCATCTGGACTTCAAGCTGCAGGCAGTTCTGTTTTT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124552 GGTA...TAGTTTATCATCTGGACTTCAAGCTGCAGGCAGTTCTGTTTTT
2700 . : . : . : . : . :
2602 CCAGGCCTTTTGTCCCTCCCGGGTATCCCTGGGTTTCCTCAGAATCCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125050 CCAGGCCTTTTGTCCCTCCCGGGTATCCCTGGGTTTCCTCAGAATCCTTC
2750 . : . : . : . : . :
2652 ACAATCATCCTTGCAAGAATTACAGCATAATGCGGCTGCGCAGTCAGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125100 ACAATCATCCTTGCAAGAATTACAGCATAATGCGGCTGCGCAGTCAGCAT
2800 . : . : . : . : . :
2702 TGTTACAGCAG GTCCATTCAGCTTCGGCTCTGGAAAGCTAT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
125150 TGTTACAGCAGGTA...CAGGTCCATTCAGCTTCGGCTCTGGAAAGCTAT
2850 . : . : . : . : . :
2743 CCAGCTCAGCCTGATGGGTTTCCTAGTTATCCTTCAGCGCCAGGAACACC
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125786 CCAGCTCAGCCTGATGGGTTTCCTAGTTATCCTTCAGCGCCAGGAACACC
2900 . : . : . : . :
2793 ATTTTCTTTGCAACCAAGCCTGTCCCAGAGTGGGTGGCAG
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125836 ATTTTCTTTGCAACCAAGCCTGTCCCAGAGTGGGTGGCAG