seq1 = pF1KA2027.tfa, 2328 bp
seq2 = pF1KA2027/gi568815594r_89147783.tfa (gi568815594r:89147783_89350110), 202328 bp

>pF1KA2027 2328
>gi568815594r:89147783_89350110 (Chr4)

(complement)

1-2328  (100001-102328)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGACTGTACCTGACCCTCTGAGATCAGCTAAAACTTCCCTGATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGACTGTACCTGACCCTCTGAGATCAGCTAAAACTTCCCTGATTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCTTCCGGAAAAGAAGACGATCTAGGAGAGCCACAGGCTGCCTCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCTTCCGGAAAAGAAGACGATCTAGGAGAGCCACAGGCTGCCTCACCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCATCGACCAGCTCTCCTGTGTAAGAATGCCAATGGCTTTTCAGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCATCGACCAGCTCTCCTGTGTAAGAATGCCAATGGCTTTTCAGGTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTGCAGAACCAGACCTCAGCCCCAGGGCAGCTGCCGAAGCCCTGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTGCAGAACCAGACCTCAGCCCCAGGGCAGCTGCCGAAGCCCTGATGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTTTGTGAGCATGAGACCACCCAACCAGATATGTCTTCTCCTGGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTTTGTGAGCATGAGACCACCCAACCAGATATGTCTTCTCCTGGTGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAATGAAGTGCAGAAAGCACCTGCCACATTCAACTCTCCCGGCAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAATGAAGTGCAGAAAGCACCTGCCACATTCAACTCTCCCGGCAATCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGCTGCCAGGGAGCAGCCAGCCCGCAGCATCAGCCCCGAGTTCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGCTGCCAGGGAGCAGCCAGCCCGCAGCATCAGCCCCGAGTTCTGCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGGAAGGGATCTTATACACACACCATTGACAATGCCCGCCAATCAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGGAAGGGATCTTATACACACACCATTGACAATGCCCGCCAATCAGCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTGCCAGTCCATCCCAGGTGATCAGCCCAATGCCATCACCTCATCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTGCCAGTCCATCCCAGGTGATCAGCCCAATGCCATCACCTCATCCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTGAAGATTCCCTGATGAGATCACAGAGAACCTCAAATAGAGAGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTGAAGATTCCCTGATGAGATCACAGAGAACCTCAAATAGAGAGCAACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGAGAAACCAAGTTGTCCTGTGGGAGGCGTCCTCAGTAGCAGCAAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGAGAAACCAAGTTGTCCTGTGGGAGGCGTCCTCAGTAGCAGCAAAGATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGTGTCCTGTGAGTTTCCTTCTCCAGAAACAATCCAGGGAACAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGTGTCCTGTGAGTTTCCTTCTCCAGAAACAATCCAGGGAACAGTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACTCCAGTGACAGCAGCCAGGGTGGTCAGTCACTCATCCTCTCCTGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACTCCAGTGACAGCAGCCAGGGTGGTCAGTCACTCATCCTCTCCTGTAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGACCTGAAGGGGAAAGGCAGGGAGCCATCTGTGACTCTGAAATGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGACCTGAAGGGGAAAGGCAGGGAGCCATCTGTGACTCTGAAATGAGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTGTAAACCTCTAACTAGAGAATCTGGATGTTCAGAGAACAAGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTGTAAACCTCTAACTAGAGAATCTGGATGTTCAGAGAACAAGCAGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCTGTCACTGCCTCGGGCCCCCAAGGCACAACTTCTGTGACACCTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCTGTCACTGCCTCGGGCCCCCAAGGCACAACTTCTGTGACACCTCAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AACCCCCCTCACTAGCGAACCTTCGGCATGTCCCCCAGGTCCAGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AACCCCCCTCACTAGCGAACCTTCGGCATGTCCCCCAGGTCCAGAGAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCCGCTGCCAGCACAGCGTCAGATGTCAAGGTTCAAAGAAGCCAGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCCGCTGCCAGCACAGCGTCAGATGTCAAGGTTCAAAGAAGCCAGTACG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATGACCAACCAAGCTGAAAGTGAAATCAAGGAAGTTCCCAGCAGGGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATGACCAACCAAGCTGAAAGTGAAATCAAGGAAGTTCCCAGCAGGGCTTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCAAGATGCGGAGGTGCAGGCAGTGGCGAGTGTCGAGAGCAGATCCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCAAGATGCGGAGGTGCAGGCAGTGGCGAGTGTCGAGAGCAGATCCGTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCACCAGCCCCAGTATCCTCACTGCATTTCTGAAGGAAAGCCGTGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCACCAGCCCCAGTATCCTCACTGCATTTCTGAAGGAAAGCCGTGCTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGCATTTTGAACAAGAGCAGCTGCGTGTCATTTGCCACAGCAGTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGCATTTTGAACAAGAGCAGCTGCGTGTCATTTGCCACAGCAGTGGGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCACACACTGGAGCTCTCTGACAGCACGCTAGCCCCCCAGGAGTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCACACACTGGAGCTCTCTGACAGCACGCTAGCCCCCCAGGAGTCCAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGTGCCCTGGCATCATGCCACAGGTGCACATTCAGGCAGCTGCAGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGTGCCCTGGCATCATGCCACAGGTGCACATTCAGGCAGCTGCAGCTGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TCTACAGCTTTCCAACGGGAAAATAAACTTGCGAGCCTACCAGGTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TCTACAGCTTTCCAACGGGAAAATAAACTTGCGAGCCTACCAGGTGGGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCTTAAAACCTCATCAATCAATTTGGTCTCCAGTAATGCCCAGCATACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCTTAAAACCTCATCAATCAATTTGGTCTCCAGTAATGCCCAGCATACGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GTAAAGAAGATGGGAGGTTAGCAGGAATGACTCCAGTGAGGGAAGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GTAAAGAAGATGGGAGGTTAGCAGGAATGACTCCAGTGAGGGAAGAGTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ACTGCTAAAAAGCTCGCAGGTACTAATTCTAGCTCCCTGAAAGCTACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ACTGCTAAAAAGCTCGCAGGTACTAATTCTAGCTCCCTGAAAGCTACCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CATTGACCAGATTTCTATCAGTGCATGCAGTCAAGCTGAAACAAGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CATTGACCAGATTTCTATCAGTGCATGCAGTCAAGCTGAAACAAGTTATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GATTGGGGAAATTTGAAACCAGGCCATCTGAGTTTGCAGAGAAAACGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GATTGGGGAAATTTGAAACCAGGCCATCTGAGTTTGCAGAGAAAACGACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AACGGCCACAAAACAGACCCAGATTGCAAACTATCTGACTCTTGTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AACGGCCACAAAACAGACCCAGATTGCAAACTATCTGACTCTTGTGGCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TATCAGCAAAGCTGATCATTCTGGGAGCTTGGATCCCACTAATAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TATCAGCAAAGCTGATCATTCTGGGAGCTTGGATCCCACTAATAAAGGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ATGCAAGGGAAAAGAAGCCTGCATCTCCTCAGGTAGTAAAAGAAAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ATGCAAGGGAAAAGAAGCCTGCATCTCCTCAGGTAGTAAAAGAAAAAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TCTACTGGCACTGATACCTCGGATGCCAAAACCCTACTGCTCAATCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TCTACTGGCACTGATACCTCGGATGCCAAAACCCTACTGCTCAATCCTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 ATCCCAAGAAAGTGGAGGCACAGAATCAGCTGCTAATCCTACACCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 ATCCCAAGAAAGTGGAGGCACAGAATCAGCTGCTAATCCTACACCCTCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CAATTAGGAAGAACCAGGAGAGCACCTTAGAAGAAAACAGACAGACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CAATTAGGAAGAACCAGGAGAGCACCTTAGAAGAAAACAGACAGACCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 ACAGCCACCAGCCTGAGCCTGCCATCTGATCCCATGGGTGACTCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 ACAGCCACCAGCCTGAGCCTGCCATCTGATCCCATGGGTGACTCCAGCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 AGGTTCTGGCAAGAAGACCCCATCTCGCTCCGTCAAAGCCAGCCCACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 AGGTTCTGGCAAGAAGACCCCATCTCGCTCCGTCAAAGCCAGCCCACGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 GGCCCAGCCGCGTCAGCGAGTTCCTCAAGGAGCAAAAGTTAAATGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 GGCCCAGCCGCGTCAGCGAGTTCCTCAAGGAGCAAAAGTTAAATGTGACA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 GCAGCTGCTGCTCAGGTAGGACTCACTCCAGGAGATAAGAAAAAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 GCAGCTGCTGCTCAGGTAGGACTCACTCCAGGAGATAAGAAAAAGCAGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 TGGCGCAGACTCCAAGCTCCAGCTGAAACAGTCCAAGCGTGTCAGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 TGGCGCAGACTCCAAGCTCCAGCTGAAACAGTCCAAGCGTGTCAGGGACG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 TCGTGTGGGATGAGCAGGGAATGACCTGGGAAGTGTATGGTGCATCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 TCGTGTGGGATGAGCAGGGAATGACCTGGGAAGTGTATGGTGCATCCTTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 GACGCAGAGTCCCTGGGAATCGCGATCCAGAACCATTTGCAAAGACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 GACGCAGAGTCCCTGGGAATCGCGATCCAGAACCATTTGCAAAGACAAAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 CAGGGAACATGAGAAATTAATCAAAACTCAAAATAGCCAGACCCGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 CAGGGAACATGAGAAATTAATCAAAACTCAAAATAGCCAGACCCGGAGAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 CCATTTCCTCAGATACTTCTTCAAATAAGAAGCTCAGAGGAAGGCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 CCATTTCCTCAGATACTTCTTCAAATAAGAAGCTCAGAGGAAGGCAGCAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 AGTGTTTTCCAGTCCATGCTGCAGAACTTCCGACGCCCCAACTGCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 AGTGTTTTCCAGTCCATGCTGCAGAACTTCCGACGCCCCAACTGCTGCGT

   2300     .    :    .    :    .
   2301 CCGTCCTGCCCCGTCTTCTGTGTTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CCGTCCTGCCCCGTCTTCTGTGTTAGAT