seq1 = pF1KA2014.tfa, 3081 bp
seq2 = pF1KA2014/gi568815586r_49545818.tfa (gi568815586r:49545818_49807180), 261363 bp

>pF1KA2014 3081
>gi568815586r:49545818_49807180 (Chr12)

(complement)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-210  (138627-138710)   100% ->
211-291  (140974-141054)   100% ->
292-368  (141273-141349)   100% ->
369-452  (145132-145215)   100% ->
453-605  (148587-148739)   100% ->
606-714  (149991-150099)   100% ->
715-791  (150282-150358)   100% ->
792-885  (150684-150777)   100% ->
886-960  (152197-152271)   100% ->
961-1071  (152879-152989)   100% ->
1072-1221  (153307-153456)   100% ->
1222-1323  (153854-153955)   100% ->
1324-1603  (154969-155248)   100% ->
1604-1672  (155731-155799)   100% ->
1673-1797  (155889-156013)   100% ->
1798-2000  (156303-156505)   100% ->
2001-2235  (157256-157490)   100% ->
2236-2304  (157643-157711)   100% ->
2305-2385  (157842-157922)   100% ->
2386-2515  (158023-158152)   100% ->
2516-2676  (158828-158988)   100% ->
2677-2778  (159377-159478)   100% ->
2779-2871  (159813-159905)   100% ->
2872-2995  (160172-160295)   100% ->
2996-3081  (161278-161363)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAACCTGGAGAGCGCCGAGGGGGTCCCGGGAGAGCCCCCCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAACCTGGAGAGCGCCGAGGGGGTCCCGGGAGAGCCCCCCTCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGTTGTTGCTGCCGCCCGGCAAGATGCCGATGCCTGAGCCCTGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCGTTGTTGCTGCCGCCCGGCAAGATGCCGATGCCTGAGCCCTGTGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAGGAAAGGTTCGCCCTGGTGCTG         AGCTCCATGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 TGGAGGAAAGGTTCGCCCTGGTGCTGGTG...CAGAGCTCCATGAACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTCCAGACAAGGCCCGGCTCCTGCGGCAGTATGACAATGAGAAGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138642 CCTCCAGACAAGGCCCGGCTCCTGCGGCAGTATGACAATGAGAAGAAATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGATCTGATCTGTGACCAG         GAACGATTCCAGGTGAAGAATC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 138692 GGATCTGATCTGTGACCAGGTA...CAGGAACGATTCCAGGTGAAGAATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTCCCCACACTTACATTCAGAAACTCCAGAGCTTCTTGGACCCCAGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140996 CTCCCCACACTTACATTCAGAAACTCCAGAGCTTCTTGGACCCCAGTGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACTCGGAAG         AAGTTCAGGAGGAGGGTGCAGGAGTCAACCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 141046 ACTCGGAAGGTG...CAGAAGTTCAGGAGGAGGGTGCAGGAGTCAACCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTACTAAGGGAGCTGGAGATCTCTCTTCGCACCAACCACATTGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 141305 AGTACTAAGGGAGCTGGAGATCTCTCTTCGCACCAACCACATTGGGTG..

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    369     GTGGGTGCGGGAATTTCTGAATGATGAAAACAAAGGCCTGGATGTA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141355 .CAGGTGGGTGCGGGAATTTCTGAATGATGAAAACAAAGGCCTGGATGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGGTGGATTACCTGTCCTTTGCCCAGTGTTCTGTCAT         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 145178 CTGGTGGATTACCTGTCCTTTGCCCAGTGTTCTGTCATGTG...CAGGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGACTTTGAGGGTCTGGAAAGTGGTGACGATGGTGCATTTGACAAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148590 TGACTTTGAGGGTCTGGAAAGTGGTGACGATGGTGCATTTGACAAACTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GGTCCTGGAGCAGGTCAATCGAGGACCTGCAGCCACCCAGCGCCCTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148640 GGTCCTGGAGCAGGTCAATCGAGGACCTGCAGCCACCCAGCGCCCTGTCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCCCCCTTCACCAACAGCCTCGCTCGCTCTGCGCGCCAGTCTGTGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148690 GCCCCCTTCACCAACAGCCTCGCTCGCTCTGCGCGCCAGTCTGTGCTCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606          GTATAGCACTCTCCCTGGGCGCAGGGCCCTGAAGAACTCCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148740 GTA...CAGGTATAGCACTCTCCCTGGGCGCAGGGCCCTGAAGAACTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCCTAGTGAGCCAGAAGGATGACGTCCACGTCTGTATCCTTTGTCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150032 GCCTAGTGAGCCAGAAGGATGACGTCCACGTCTGTATCCTTTGTCTCAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCCATCATGAACTATCAG         TACGGATTCAACCTGGTCATGTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 150082 GCCATCATGAACTATCAGGTA...CAGTACGGATTCAACCTGGTCATGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCACCCCCATGCTGTCAATGAGATTGCACTTAGCCTCAATAACAAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150305 CCACCCCCATGCTGTCAATGAGATTGCACTTAGCCTCAATAACAAGAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CAAG         GACCAAAGCCCTTGTCTTAGAGCTTCTGGCAGCTGTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150355 CAAGGTG...TAGGACCAAAGCCCTTGTCTTAGAGCTTCTGGCAGCTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TGTTTGGTGCGAGGAGGTCACGAAATCATCCTTGCTGCCTTTGACAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150721 TGTTTGGTGCGAGGAGGTCACGAAATCATCCTTGCTGCCTTTGACAATTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CAAAGAG         GTATGCAAGGAGCTGCACCGCTTTGAGAAGCTGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150771 CAAAGAGGTC...CAGGTATGCAAGGAGCTGCACCGCTTTGAGAAGCTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGGAGTATTTCCGGAATGAGGACAGCAATATTGACTTCATG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 152231 TGGAGTATTTCCGGAATGAGGACAGCAATATTGACTTCATGGTG...CAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GTGGCCTGCATGCAGTTCATCAACATCGTGGTGCACTCGGTGGAGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152879 GTGGCCTGCATGCAGTTCATCAACATCGTGGTGCACTCGGTGGAGGACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GAACTTCCGGGTCCACCTGCAGTATGAGTTTACCAAGCTGGGGCTAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152929 GAACTTCCGGGTCCACCTGCAGTATGAGTTTACCAAGCTGGGGCTAGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AGTTCCTGCAG         AAGTCAAGGCACACAGAGAGCGAGAAGCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 152979 AGTTCCTGCAGGTG...CAGAAGTCAAGGCACACAGAGAGCGAGAAGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 CAGGTGCAGATTCAGGCATATCTGGACAACGTGTTTGATGTCGGGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153337 CAGGTGCAGATTCAGGCATATCTGGACAACGTGTTTGATGTCGGGGGTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GTTGGAGGATGCTGAGACCAAGAATGTAGCCCTGGAGAAGGTGGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153387 GTTGGAGGATGCTGAGACCAAGAATGTAGCCCTGGAGAAGGTGGAGGAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TGGAGGAGCATGTGTCCCAT         CTCACAGAGAAGCTTCTGGAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 153437 TGGAGGAGCATGTGTCCCATGTA...CAGCTCACAGAGAAGCTTCTGGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CTAGAGAATGAAAACATGATGCGGGTGGCAGAACTAGAGAAGCAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153875 CTAGAGAATGAAAACATGATGCGGGTGGCAGAACTAGAGAAGCAGCTGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 ACAGCGGGAGAAGGAACTAGAGAGCATCAAG         GAGACATATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 153925 ACAGCGGGAGAAGGAACTAGAGAGCATCAAGGTA...CAGGAGACATATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 AGAACACAAGCCACCAGGTGCACACCCTGCGGAGGCTCATTAAAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154979 AGAACACAAGCCACCAGGTGCACACCCTGCGGAGGCTCATTAAAGAGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GAGGAGGCCTTTCAGCGTCGATGTCATTTGGAGCCAAATGTCCGGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155029 GAGGAGGCCTTTCAGCGTCGATGTCATTTGGAGCCAAATGTCCGGGGCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 GGAGTCTGTGGACAGTGAGGCCCTGGCCAGAGTAGGCCCTGCAGAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155079 GGAGTCTGTGGACAGTGAGGCCCTGGCCAGAGTAGGCCCTGCAGAGCTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GTGAGGGCATGCCACCCTCCGACCTGGACCTTCTGGCTCCAGCCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155129 GTGAGGGCATGCCACCCTCCGACCTGGACCTTCTGGCTCCAGCCCCACCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 CCTGAGGAGGTCCTGCCTCTTCCTCCACCACCAGCTCCGCCCTTGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155179 CCTGAGGAGGTCCTGCCTCTTCCTCCACCACCAGCTCCGCCCTTGCCCCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TCCACCTCCCCCATTACCAG         ACAAGTGTCCCCCAGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 155229 TCCACCTCCCCCATTACCAGGTA...CAGACAAGTGTCCCCCAGCCCCAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 CTCTCCCTGGTGCTGCACCCTCTGTGGTGTTGACAGTGGGCCTGTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 155752 CTCTCCCTGGTGCTGCACCCTCTGTGGTGTTGACAGTGGGCCTGTCAGGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1673        CCATTCGAATTAAGAAACCTATCAAGACCAAGTTCCGGCTGCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155802 G...TAGCCATTCGAATTAAGAAACCTATCAAGACCAAGTTCCGGCTGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 TGTCTTCAACTGGACAGCACTGAAACCCAACCAGATCAGTGGCACTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155932 TGTCTTCAACTGGACAGCACTGAAACCCAACCAGATCAGTGGCACTGTCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TCAGCGAACTTGATGATGAGAAGATCTTGGAG         GACCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 155982 TCAGCGAACTTGATGATGAGAAGATCTTGGAGGTA...CAGGACCTGGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 CTTGATAAGTTTGAAGAATTATTCAAGACAAAAGCGCAGGGCCCTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156312 CTTGATAAGTTTGAAGAATTATTCAAGACAAAAGCGCAGGGCCCTGCCCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 TGACCTCATCTGCTCCAAAAACAAGACAGCGCAAAAAGCTGCCAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156362 TGACCTCATCTGCTCCAAAAACAAGACAGCGCAAAAAGCTGCCAGCAAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TGACTCTGTTGGAAGCCAATCGTGCCAAGAACCTGGCCATCACCCTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156412 TGACTCTGTTGGAAGCCAATCGTGCCAAGAACCTGGCCATCACCCTACGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 AAGGCTGGCCGCTCGGCTGAGGAGATCTGCAGGGCCATTCATAC      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 156462 AAGGCTGGCCGCTCGGCTGAGGAGATCTGCAGGGCCATTCATACGTG...

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001    GTTTGACTTGCAGACACTACCTGTGGACTTCGTGGAGTGCCTGATGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157253 CAGGTTTGACTTGCAGACACTACCTGTGGACTTCGTGGAGTGCCTGATGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 GCTTCCTGCCCACAGAGGCTGAGGTAAAGCTGCTGCGGCAATATGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157303 GCTTCCTGCCCACAGAGGCTGAGGTAAAGCTGCTGCGGCAATATGAGCGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GAGCGGCAGCCCCTGGAGGAGTTGGCAGCTGAGGACCGCTTCATGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157353 GAGCGGCAGCCCCTGGAGGAGTTGGCAGCTGAGGACCGCTTCATGCTGCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CTTCAGCAAGGTGGAACGGTTGACCCAGCGAATGGCTGGCATGGCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157403 CTTCAGCAAGGTGGAACGGTTGACCCAGCGAATGGCTGGCATGGCCTTCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TGGGGAACTTCCAGGATAACCTGCAGATGCTCACACCG         CAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 157453 TGGGGAACTTCCAGGATAACCTGCAGATGCTCACACCGGTA...CAGCAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 CTCAATGCCATCATTGCGGCGTCCGCTTCCGTCAAGTCTTCACAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157646 CTCAATGCCATCATTGCGGCGTCCGCTTCCGTCAAGTCTTCACAGAAGCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GAAGCAGATGTTGGAG         ATCATACTTGCACTGGGGAACTACA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 157696 GAAGCAGATGTTGGAGGTG...CAGATCATACTTGCACTGGGGAACTACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 TGAACAGCAGCAAGCGGGGAGCTGTGTATGGCTTCAAGCTCCAGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157867 TGAACAGCAGCAAGCGGGGAGCTGTGTATGGCTTCAAGCTCCAGAGCCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GATCTG         CTGCTGGATACCAAGTCCACTGACCGGAAGATGAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157917 GATCTGGTA...TAGCTGCTGGATACCAAGTCCACTGACCGGAAGATGAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 ACTGCTTCATTTCATCGCCTTGACAGTGAAGGAGAAATACCCAGACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158058 ACTGCTTCATTTCATCGCCTTGACAGTGAAGGAGAAATACCCAGACCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 CTAACTTCTGGCATGAGCTGCACTTTGTTGAGAAGGCTGCAGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 158108 CTAACTTCTGGCATGAGCTGCACTTTGTTGAGAAGGCTGCAGCAGGTG..

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516     TGTCCCTGGAGAACGTGCTGCTGGACGTGAAGGAGCTGGGCCGGGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158158 .CAGTGTCCCTGGAGAACGTGCTGCTGGACGTGAAGGAGCTGGGCCGGGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 CATGGAGCTGATTCGGCGTGAGTGCAGCATCCATGACAACAGCGTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158874 CATGGAGCTGATTCGGCGTGAGTGCAGCATCCATGACAACAGCGTCCTCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 GGAACTTCCTCAGTACCAATGAAGGCAAACTAGACAAGCTCCAGCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158924 GGAACTTCCTCAGTACCAATGAAGGCAAACTAGACAAGCTCCAGCGGGAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2662 GCCAAGACGGCTGAG         GAGGCCTACAATGCAGTTGTGCGCTA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 158974 GCCAAGACGGCTGAGGCA...CAGGAGGCCTACAATGCAGTTGTGCGCTA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 CTTTGGCGAGAGTCCCAAGACTACACCTCCTTCTGTATTCTTCCCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159403 CTTTGGCGAGAGTCCCAAGACTACACCTCCTTCTGTATTCTTCCCAGTAT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2753 TTGTCCGATTCATTCGTTCTTACAAG         GAAGCAGAACAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 159453 TTGTCCGATTCATTCGTTCTTACAAGGTA...TAGGAAGCAGAACAAGAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2794 AATGAAGCCCGCAAGAAGCAGGAGGAGGTAATGCGGGAGAAGCAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159828 AATGAAGCCCGCAAGAAGCAGGAGGAGGTAATGCGGGAGAAGCAGCTGGC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 TCAGGAAGCCAAGAAACTGGATGCCAAG         ACCCCATCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 159878 TCAGGAAGCCAAGAAACTGGATGCCAAGGTG...TAGACCCCATCCCAGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2885 GGAACAAGTGGCAACAGCAGGAGTTAATAGCAGAGTTGAGGCGGCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160185 GGAACAAGTGGCAACAGCAGGAGTTAATAGCAGAGTTGAGGCGGCGCCAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2935 GCCAAGGAACACCGGCCTGTTTATGAGGGGAAGGATGGTACCATCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160235 GCCAAGGAACACCGGCCTGTTTATGAGGGGAAGGATGGTACCATCGAGGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2985 CATCATCACAG         GCCTCCACTGCCAGCCTATGGTTGTTCGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 160285 CATCATCACAGGTG...CAGGCCTCCACTGCCAGCCTATGGTTGTTCGCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3026 ACCAAGCCAGGAGTGCTGCACCGCCCAGTGGTCCCCCTCGGGCTCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161308 ACCAAGCCAGGAGTGCTGCACCGCCCAGTGGTCCCCCTCGGGCTCCAGGC

   3300     .
   3076 CCCCAC
        ||||||
 161358 CCCCAC