seq1 = pF1KA2010.tfa, 2460 bp
seq2 = pF1KA2010/gi568815584r_91358762.tfa (gi568815584r:91358762_91609647), 250886 bp

>pF1KA2010 2460
>gi568815584r:91358762_91609647 (Chr14)

(complement)

1-142  (100001-100142)   100% ->
143-198  (118846-118901)   100% ->
199-297  (123918-124016)   100% ->
298-915  (127455-128072)   100% ->
916-993  (132662-132739)   100% ->
994-1110  (133124-133240)   100% ->
1111-1227  (133682-133798)   100% ->
1228-1359  (136278-136409)   100% ->
1360-1462  (136513-136615)   100% ->
1463-1621  (138653-138811)   100% ->
1622-1791  (144229-144398)   100% ->
1792-1934  (146771-146913)   100% ->
1935-2125  (147409-147599)   100% ->
2126-2352  (148041-148267)   100% ->
2353-2460  (150779-150886)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGACACCCGGCGGCGGGTGAAGGTGTACACGCTCAACGAGGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGACACCCGGCGGCGGGTGAAGGTGTACACGCTCAACGAGGACCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGTGGGACGACCGGGGCACCGGGCATGTGTCGTCTGGCTACGTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGTGGGACGACCGGGGCACCGGGCATGTGTCGTCTGGCTACGTGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCTGAAGGGCATGTCCCTGCTTGTCAGGGCTGAGAGCGACG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100101 GGCTGAAGGGCATGTCCCTGCTTGTCAGGGCTGAGAGCGACGGTA...TA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    143  GTTCTCTACTTTTAGAGTCGAAAATAAATCCTAACACTGCATACCAGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118845 GGTTCTCTACTTTTAGAGTCGAAAATAAATCCTAACACTGCATACCAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACAACAG         GACACTCTGATTGTGTGGTCTGAAGCAGAAAATT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118895 ACAACAGGTA...AAGGACACTCTGATTGTGTGGTCTGAAGCAGAAAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGACTTGGCCCTTAGCTTTCAAGAAAAAGCTGGATGTGATGAAATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123952 ATGACTTGGCCCTTAGCTTTCAAGAAAAAGCTGGATGTGATGAAATTTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGAAAATATGTCAG         GTTCAAGGAAAGGACCCTTCCGTGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 124002 GAGAAAATATGTCAGGTA...TAGGTTCAAGGAAAGGACCCTTCCGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATCACTCAGGACCTTGTGGATGAATCTGAAGAGGAGCGTTTTGATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127481 CATCACTCAGGACCTTGTGGATGAATCTGAAGAGGAGCGTTTTGATGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGTCATCGCCAGGCTTAGAATTGCCATCTTGTGAATTAAGTCGCCTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127531 TGTCATCGCCAGGCTTAGAATTGCCATCTTGTGAATTAAGTCGCCTTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAATTGCAGAACTTGTGGCATCATCTTTACCTTCACCTCTTCGTCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127581 GAAATTGCAGAACTTGTGGCATCATCTTTACCTTCACCTCTTCGTCGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAACTTGCACTGGCACTAGAAAATGAGGGTTATATTAAAAAGCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127631 AAAACTTGCACTGGCACTAGAAAATGAGGGTTATATTAAAAAGCTCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGCTTTTTCATGTGTGTGAAGATTTGGAAAATATTGAAGGACTGCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127681 AGCTTTTTCATGTGTGTGAAGATTTGGAAAATATTGAAGGACTGCACCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTGTATGAAATTATCAAAGGCATCTTTCTCTTGAATCGAACTGCTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127731 TTGTATGAAATTATCAAAGGCATCTTTCTCTTGAATCGAACTGCTCTTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGAAGTTATGTTCTCTGAAGAATGTATAATGGACGTCATTGGATGTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127781 TGAAGTTATGTTCTCTGAAGAATGTATAATGGACGTCATTGGATGTTTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AATATGATCCTGCTTTATCACAACCACGAAAACACAGGGAATTTCTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127831 AATATGATCCTGCTTTATCACAACCACGAAAACACAGGGAATTTCTAACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAAACAGCCAAGTTTAAAGAAGTGATTCCCATATCAGATCCTGAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127881 AAAACAGCCAAGTTTAAAGAAGTGATTCCCATATCAGATCCTGAGCTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACAAAAAATTCATCAGACATACAGAGTTCAGTATATACAAGATATGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127931 ACAAAAAATTCATCAGACATACAGAGTTCAGTATATACAAGATATGGTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TACCAACTCCTTCGGTCTTTGAAGAAAACATGTTATCAACACTTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127981 TACCAACTCCTTCGGTCTTTGAAGAAAACATGTTATCAACACTTCACTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TTTATCTTTTTCAATAAGGTAGAGATTGTTGGCATGTTGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 128031 TTTATCTTTTTCAATAAGGTAGAGATTGTTGGCATGTTGCAGGTG...CA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    916  GAAGATGAAAAATTTCTGACAGATTTGTTTGCACAACTAACAGATGAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132661 GGAAGATGAAAAATTTCTGACAGATTTGTTTGCACAACTAACAGATGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CAACAGATGAGGAAAAAAGACAGGAATTG         GTTAACTTTTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 132711 CAACAGATGAGGAAAAAAGACAGGAATTGGTA...CAGGTTAACTTTTTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AAAGAATTTTGTGCGTTTTCCCAAACGCTACAGCCTCAAAACAGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133136 AAAGAATTTTGTGCGTTTTCCCAAACGCTACAGCCTCAAAACAGAGATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TTTTTTCAAGACTTTGTCAAACATGGGCATATTACCAGCTTTAGAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133186 TTTTTTCAAGACTTTGTCAAACATGGGCATATTACCAGCTTTAGAAGTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TCCTT         GGCATGGATGATACACAGGTGCGAAGTGCTGCTACT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133236 TCCTTGTA...CAGGGCATGGATGATACACAGGTGCGAAGTGCTGCTACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GATATATTCTCATACTTGGTTGAATATAATCCATCCATGGTACGAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133718 GATATATTCTCATACTTGGTTGAATATAATCCATCCATGGTACGAGAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGTCATGCAGGAGGCACAACAGAATGATGAT         GATATTTTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 133768 TGTCATGCAGGAGGCACAACAGAATGATGATGTA...CAGGATATTTTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCATCAACCTCATTATAGAACATATGATTTGTGATACAGATCCTGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136288 TCATCAACCTCATTATAGAACATATGATTTGTGATACAGATCCTGAACTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GGAGGAGCAGTCCAGCTTATGGGCCTGCTTCGAACTTTAGTTGACCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136338 GGAGGAGCAGTCCAGCTTATGGGCCTGCTTCGAACTTTAGTTGACCCAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GAACATGCTAGCCACTGCCAAT         AAAACAGAAAAGACTGAAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 136388 GAACATGCTAGCCACTGCCAATGTA...TAGAAAACAGAAAAGACTGAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TTCTGGGTTTCTTCTACAAGCACTGTATGCATGTTCTCACTGCTCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136532 TTCTGGGTTTCTTCTACAAGCACTGTATGCATGTTCTCACTGCTCCTTTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CTAGCAAATACAACAGAAGACAAACCTAGTAAAG         ATGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 136582 CTAGCAAATACAACAGAAGACAAACCTAGTAAAGGTA...TAGATGATTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TCAGACTGCCCAACTATTGGCACTTGTATTGGAATTGTTAACATTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138660 TCAGACTGCCCAACTATTGGCACTTGTATTGGAATTGTTAACATTTTGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TGGAGCACCATACCTACCACATAAAGAACTACATTATTAATAAGGATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138710 TGGAGCACCATACCTACCACATAAAGAACTACATTATTAATAAGGATATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CTCCGGAGAGTGCTAGTTCTTATGGCCTCGAAGCATGCTTTCTTGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138760 CTCCGGAGAGTGCTAGTTCTTATGGCCTCGAAGCATGCTTTCTTGGCATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AT         GTGCCCTTCGTTTTAAAAGAAAGATTATTGGATTAAAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138810 ATGTA...CAGGTGCCCTTCGTTTTAAAAGAAAGATTATTGGATTAAAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 ATGAGTTTTACAACCGCTACATAATGAAAAGTTTTTTGTTTGAACCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144268 ATGAGTTTTACAACCGCTACATAATGAAAAGTTTTTTGTTTGAACCAGTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GTGAAAGCATTTCTCAACAATGGATCCCGCTACAATCTGATGAACTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144318 GTGAAAGCATTTCTCAACAATGGATCCCGCTACAATCTGATGAACTCTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CATAATAGAGATGTTTGAATTTATTAGAGTG         GAAGATATAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 144368 CATAATAGAGATGTTTGAATTTATTAGAGTGGTA...TAGGAAGATATAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 AATCATTAACTGCTCATGTAATTGAAAATTACTGGAAAGCACTGGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146781 AATCATTAACTGCTCATGTAATTGAAAATTACTGGAAAGCACTGGAAGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GTAGATTATGTACAGACATTTAAAGGATTAAAACTGAGATTTGAACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146831 GTAGATTATGTACAGACATTTAAAGGATTAAAACTGAGATTTGAACAACA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 AAGAGAAAGGCAAGATAATCCCAAACTTGACAG         TATGCGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 146881 AAGAGAAAGGCAAGATAATCCCAAACTTGACAGGTA...TAGTATGCGTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CCATTTTGAGGAATCACAGATATCGAAGAGATGCCAGAACACTAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147417 CCATTTTGAGGAATCACAGATATCGAAGAGATGCCAGAACACTAGAAGAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GAAGAAGAGATGTGGTTTAACACAGATGAAGATGACATGGAAGATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147467 GAAGAAGAGATGTGGTTTAACACAGATGAAGATGACATGGAAGATGGAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 AGCTGTAGTGTCTCCATCTGACAAAACTAAAAATGATGATGATATTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147517 AGCTGTAGTGTCTCCATCTGACAAAACTAAAAATGATGATGATATTATGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 ATCCAATAAGTAAATTCATGGAAAGGAAGAAAT         TAAAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 147567 ATCCAATAAGTAAATTCATGGAAAGGAAGAAATGTA...TAGTAAAAGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 AGTGAGGAAAAGGAAGTGCTTCTGAAAACAAACCTTTCTGGACGGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148049 AGTGAGGAAAAGGAAGTGCTTCTGAAAACAAACCTTTCTGGACGGCAGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CCCAAGTTTCAAGCTTTCCCTGTCCAGTGGAACGAAGACTAACCTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148099 CCCAAGTTTCAAGCTTTCCCTGTCCAGTGGAACGAAGACTAACCTCACCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 GCCAGTCATCTACAACAAATCTGCCTGGTTCTCCGGGATCACCTGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148149 GCCAGTCATCTACAACAAATCTGCCTGGTTCTCCGGGATCACCTGGATCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 CCAGGATCTCCAGGCTCTCCTGGATCCGTACCTAAAAATACATCTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148199 CCAGGATCTCCAGGCTCTCCTGGATCCGTACCTAAAAATACATCTCAGAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 GGCAGCTATTACTACAAAG         GGAGGCCTCGTGGGTCTGGTAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 148249 GGCAGCTATTACTACAAAGGTA...CAGGGAGGCCTCGTGGGTCTGGTAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 ATTATCCTGATGATGATGAAGATGATGATGAGGATGAAGATAAGGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150801 ATTATCCTGATGATGATGAAGATGATGATGAGGATGAAGATAAGGAAGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .
   2425 ACGTTACCATTGTCAAAGAAAGCAAAATTTGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150851 ACGTTACCATTGTCAAAGAAAGCAAAATTTGATTCA