seq1 = pF1KA2001.tfa, 1707 bp
seq2 = pF1KA2001/gi568815575r_72029834.tfa (gi568815575r:72029834_72231540), 201707 bp

>pF1KA2001 1707
>gi568815575r:72029834_72231540 (ChrX)

(complement)

1-1707  (100001-101707)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGAGGCGTCAGGAAATCTCAACAGCCTCCGCATGGCGAATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGAGGCGTCAGGAAATCTCAACAGCCTCCGCATGGCGAATGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCGCGAAGAATTAAATGCCCTTCGCGGGGAGAATGCCAATTTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCGCGAAGAATTAAATGCCCTTCGCGGGGAGAATGCCAATTTGGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCAGCTCGGGAGAGCCCTGGCCGAGGTTAATTCCTTGCGGGGCAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCAGCTCGGGAGAGCCCTGGCCGAGGTTAATTCCTTGCGGGGCAATGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCAGCTACATCCGCTGGCCAGTACCCATAGTGCCCGTCCTTGCGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCAGCTACATCCGCTGGCCAGTACCCATAGTGCCCGTCCTTGCGGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAACTTGGAGTTCGCGCTCAGTGAGATCGAAGTCATTCCCGGGGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAACTTGGAGTTCGCGCTCAGTGAGATCGAAGTCATTCCCGGGGGAGAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCCTTCTTGTGCCGGCCTCCCCCACGCGCGGAGCCCGACTGTATCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCCTTCTTGTGCCGGCCTCCCCCACGCGCGGAGCCCGACTGTATCTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATGATCTTTTGATTAACGTGATCCAGGATCGCAGCACCCCCGACGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATGATCTTTTGATTAACGTGATCCAGGATCGCAGCACCCCCGACGGGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCTGACCCCCCTCTGCTGCCCATCCCGCCCCCGCCGGCGCTGCCTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCTGACCCCCCTCTGCTGCCCATCCCGCCCCCGCCGGCGCTGCCTCCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGCGTCAAAGGAACCGCCCCCGCAACCCCCTCTGGCACCGCTGGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGCGTCAAAGGAACCGCCCCCGCAACCCCCTCTGGCACCGCTGGAGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTGAGATAGAGCCCTTTTCAGGAGACCCAGTCTACCTGGCTGAATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTGAGATAGAGCCCTTTTCAGGAGACCCAGTCTACCTGGCTGAATTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GATGCAGCTAGAGACCTTCATAGCCGACCATGAGGTTCATTTCCCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GATGCAGCTAGAGACCTTCATAGCCGACCATGAGGTTCATTTCCCCGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCGCCGAGCGGGTGGCCTTTCTGATCTCCTTTTTCACTGGCGAAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCGCCGAGCGGGTGGCCTTTCTGATCTCCTTTTTCACTGGCGAAGCCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACTGGGCCATCTCGGTCACCCAGGAAGGAAGCCCCTTGCATGCCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACTGGGCCATCTCGGTCACCCAGGAAGGAAGCCCCTTGCATGCCAACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCCGCGCTTCCTGGATGAAATCCGTAAGGAATTCTGTGGCCCCATCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCCGCGCTTCCTGGATGAAATCCGTAAGGAATTCTGTGGCCCCATCCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CACGTGTGGCTAAAAAGGCCATTCGCAAGCTCAAGCAGGGCCACTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CACGTGTGGCTAAAAAGGCCATTCGCAAGCTCAAGCAGGGCCACTGTACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCGGCAGCTATGCAGATGCTTTTCAGTTCCTGGCCCAATTCTTGTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCGGCAGCTATGCAGATGCTTTTCAGTTCCTGGCCCAATTCTTGTCTTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGATGACTGCCGCCTCCAAAACCAATTCCTCAAAGGCCTGTCGGAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGATGACTGCCGCCTCCAAAACCAATTCCTCAAAGGCCTGTCGGAATTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCGCAAAGAGCTCTTATGGTCAACAGAAATGGCCGACCTGGATGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCGCAAAGAGCTCTTATGGTCAACAGAAATGGCCGACCTGGATGAGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATTCTCGAATGTGTGGAGATAGAAAGAAAAGTGCGCGTTCCCAAGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATTCTCGAATGTGTGGAGATAGAAAGAAAAGTGCGCGTTCCCAAGCCTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCCGCTCCCTGGAGTTCGAAATATCATCTTCCCTTTTGCTCCGAGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCCGCTCCCTGGAGTTCGAAATATCATCTTCCCTTTTGCTCCGAGTCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGAGGAAGAAAGTGAAGATGAAGAGTACTACAGTGAAGATGAAGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATGAGGAAGAAAGTGAAGATGAAGAGTACTACAGTGAAGATGAAGACCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGGCACGCAGGCACAGGCTTCACTCCAAGGACCAGAGGAAGCGCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGGCACGCAGGCACAGGCTTCACTCCAAGGACCAGAGGAAGCGCATGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCTTTTCAGCAAGAGATGAAGGAGAAGGAGGAGGAGGAGATGAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCTTTTCAGCAAGAGATGAAGGAGAAGGAGGAGGAGGAGATGAAGAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGGAAGAAATGAAGAAGAAGGAAGAGAAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGGAAGAAATGAAGAAGAAGGAAGAGAAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATGAAACAGAAAGAGGAGGAGGAGGAGATAAGGAACAAGAATGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATGAAACAGAAAGAGGAGGAGGAGGAGATAAGGAACAAGAATGAGGAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AGGAGAGAGTAAGGATGAAGAAGATGAAGATGAGGATGGGGGCCAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGGAGAGAGTAAGGATGAAGAAGATGAAGATGAGGATGGGGGCCAGAAAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CAGAAGGAGAGCCACAGCAGGATCCAGGGACTGAGGAGACCTATGGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CAGAAGGAGAGCCACAGCAGGATCCAGGGACTGAGGAGACCTATGGTGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GTGGAGGAGGAGCCACTGGATGAGGCCCAAGATGATGACCTAGATGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GTGGAGGAGGAGCCACTGGATGAGGCCCAAGATGATGACCTAGATGAGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GATGGAGATGGAGCCGACCTTTGTTCACGCGTCATCCCAGACTTCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GATGGAGATGGAGCCGACCTTTGTTCACGCGTCATCCCAGACTTCTGGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCACAAGTGGTTACCACGCCGAAAACTTCCTGGGTGCATCACCTCCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCACAAGTGGTTACCACGCCGAAAACTTCCTGGGTGCATCACCTCCCATA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ATACAGCCTAGCAGACGGAGGAACCAGAATCGAGTCCCACTTCTGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ATACAGCCTAGCAGACGGAGGAACCAGAATCGAGTCCCACTTCTGGAAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CCTTCCAGGCACCAATTCACCATTCTACAGCTCCCCCCAACTGATTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CCTTCCAGGCACCAATTCACCATTCTACAGCTCCCCCCAACTGATTCGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GCACAGGTCGTTTAGGGCAACGCCAAGTTCGAAGACGTCCCCCTGTGCTT
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
 101601 GCACAGGTCGTTTAGGACAACGCCAAGTTCGAAGACGCCCCCCTGTGCTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TTCCGCCTCACTCCGAGACAGGGGGGCCACCGAGCTGCTCGTGGCCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TTCCGCCTCACTCCGAGACAGGGGGGCCACCGAGCTGCTCGTGGCCGAAT

   1700     .
   1701 TCGAGTT
        |||||||
 101701 TCGAGTT