seq1 = pF1KA1995.tfa, 2937 bp
seq2 = pF1KA1995/gi568815584r_74984567.tfa (gi568815584r:74984567_75226921), 242355 bp

>pF1KA1995 2937
>gi568815584r:74984567_75226921 (Chr14)

(complement)

1-219  (100001-100219)   100% ->
220-397  (102699-102876)   99% ->
398-453  (105748-105803)   100% ->
454-524  (106342-106412)   100% ->
525-630  (107987-108092)   100% ->
631-762  (109596-109727)   100% ->
763-873  (112609-112719)   100% ->
874-938  (113519-113583)   100% ->
939-989  (116551-116601)   100% ->
990-1182  (117045-117237)   100% ->
1183-1327  (119435-119579)   99% ->
1328-1528  (120220-120420)   100% ->
1529-1575  (120926-120972)   100% ->
1576-1731  (122925-123080)   100% ->
1732-1840  (125157-125265)   100% ->
1841-2002  (125769-125930)   100% ->
2003-2173  (129652-129822)   100% ->
2174-2233  (131491-131550)   100% ->
2234-2442  (135444-135652)   100% ->
2443-2604  (138281-138442)   100% ->
2605-2817  (139692-139904)   100% ->
2818-2937  (142236-142355)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGTGCTGGGCGAGTACGAGCGACACTGCGATTCCATCAACTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGTGCTGGGCGAGTACGAGCGACACTGCGATTCCATCAACTCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGGGAGCGAGTCCGGGGGTTGCGGGGACTCGAGTCCGGGGCCTAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTGGGAGCGAGTCCGGGGGTTGCGGGGACTCGAGTCCGGGGCCTAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGTCAGGGGCCGCGAGCCGGCGGCGGCGCGGCGGAGCAGGAGGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAGTCAGGGGCCGCGAGCCGGCGGCGGCGCGGCGGAGCAGGAGGAACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACTACATCCCCATCCGCGTCCTGGGCCGCGGCGCCTTCGGGGAAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACTACATCCCCATCCGCGTCCTGGGCCGCGGCGCCTTCGGGGAAGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGTACCGCCGCACCGAG         GATGACTCACTGGTTGTGTGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGTACCGCCGCACCGAGGTA...TAGGATGACTCACTGGTTGTGTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAAGTCGATTTGACCCGGCTGTCTGAGAAGGAACGTCGTGATGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102721 AGGAAGTCGATTTGACCCGGCTGTCTGAGAAGGAACGTCGTGATGCCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AATGAGATTGTTATTCTGGCACTGCTGCAGCATGACAACATTATTGCCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 102771 AATGAGATTGTTATTCTGGCACTGCTGCAGCACGACAACATTATTGCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTACAATCACTTCATGGACAATACCACGCTGCTGATTGAGCTGGAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102821 CTACAATCACTTCATGGACAATACCACGCTGCTGATTGAGCTGGAATATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTAATG         GAGGGAACCTGTATGACAAAATCCTTCGTCAGAAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102871 GTAATGGTA...CAGGAGGGAACCTGTATGACAAAATCCTTCGTCAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACAAGTTGTTTGAGGAAGAG         ATGGTGGTGTGGTACCTATT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105783 GACAAGTTGTTTGAGGAAGAGGTA...CAGATGGTGGTGTGGTACCTATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCAGATTGTTTCAGCAGTGAGCTGCATCCATAAAGCTGGAATCCTTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106362 TCAGATTGTTTCAGCAGTGAGCTGCATCCATAAAGCTGGAATCCTTCATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 G         AGATATAAAGACATTAAATATTTTTCTGACCAAGGCAAAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106412 GGTA...CAGAGATATAAAGACATTAAATATTTTTCTGACCAAGGCAAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGATAAAACTTGGAGATTATGGCCTAGCAAAGAAACTTAATTCTGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108027 CTGATAAAACTTGGAGATTATGGCCTAGCAAAGAAACTTAATTCTGAGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTCCATGGCTGAGACG         CTTGTGGGAACCCCATATTACATGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 108077 TTCCATGGCTGAGACGGTA...CAGCTTGTGGGAACCCCATATTACATGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTCCAGAGCTCTGTCAAGGAGTAAAGTACAATTTCAAGTCTGATATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109621 CTCCAGAGCTCTGTCAAGGAGTAAAGTACAATTTCAAGTCTGATATCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCAGTTGGCTGCGTCATTTTTGAACTGCTTACCTTAAAGAGGACGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109671 GCAGTTGGCTGCGTCATTTTTGAACTGCTTACCTTAAAGAGGACGTTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGCTACA         AACCCACTTAACCTGTGTGTGAAGATCGTGCAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109721 TGCTACAGTA...TAGAACCCACTTAACCTGTGTGTGAAGATCGTGCAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GAATTCGGGCCATGGAAGTTGACTCTAGCCAGTACTCTTTGGAATTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112643 GAATTCGGGCCATGGAAGTTGACTCTAGCCAGTACTCTTTGGAATTGATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAAATGGTTCATTCGTGCCTTGACCAG         GATCCTGAGCAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 112693 CAAATGGTTCATTCGTGCCTTGACCAGGTA...TAGGATCCTGAGCAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ACCTACTGCAGATGAACTTCTAGATCGCCCTCTTCTCAGGAAACGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113533 ACCTACTGCAGATGAACTTCTAGATCGCCCTCTTCTCAGGAAACGCAGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 G         AGAGATGGAGGAAAAAGTCACTCTGCTTAATGCACCTACA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113583 GGTA...TAGAGAGATGGAGGAAAAAGTCACTCTGCTTAATGCACCTACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAGAGACCAAG         GTCAAGCACTGTGACTGAAGCACCCATTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 116591 AAGAGACCAAGGTA...CAGGTCAAGCACTGTGACTGAAGCACCCATTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGTAGTAACATCACGAACCAGTGAAGTCTATGTTTGGGGTGGTGGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117075 TGTAGTAACATCACGAACCAGTGAAGTCTATGTTTGGGGTGGTGGAAAAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CCACCCCCCAGAAACTGGATGTTATCAAGAGTGGCTGTAGTGCCCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117125 CCACCCCCCAGAAACTGGATGTTATCAAGAGTGGCTGTAGTGCCCGGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GTCTGTGCAGGGAATACCCACTTTGCTGTGGTCACAGTGGAGAAGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117175 GTCTGTGCAGGGAATACCCACTTTGCTGTGGTCACAGTGGAGAAGGAACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GTACACTTGGGTG         AACATGCAAGGAGGCACTAAACTCCATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 117225 GTACACTTGGGTGGTA...CAGAACATGCAAGGAGGCACTAAACTCCATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GTCAGCTGGGCCATGGAGACAAAGCCTCCTATCGACAGCCAAAGCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119463 GTCAGCTGGGCCATGGAGACAAAGCCTCCTATCGACAGCCAAAGCATGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GAAAAGTTGCAAGGCAAAGCTATCCATCAGGTGTCATGTGGTGATGATTT
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 119513 GAAAAGTTGCAAGGCAAAGCTATCCGTCAGGTGTCATGTGGTGATGATTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CACTGTCTGTGTGACTG         ATGAGGGTCAGCTCTATGCCTTCG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 119563 CACTGTCTGTGTGACTGGTA...CAGATGAGGGTCAGCTCTATGCCTTCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GATCAGATTATTATGGCTGCATGGGGGTGGACAAAGTTGCTGGCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120244 GATCAGATTATTATGGCTGCATGGGGGTGGACAAAGTTGCTGGCCCTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTGCTAGAACCCATGCAGCTGAACTTCTTCCTCAGCAATCCAGTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120294 GTGCTAGAACCCATGCAGCTGAACTTCTTCCTCAGCAATCCAGTGGAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGTCTCCTGTGGAGATAATCATGTGGTGGTTCTGACACGAAACAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120344 GGTCTCCTGTGGAGATAATCATGTGGTGGTTCTGACACGAAACAAGGAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TCTATTCTTGGGGCTGTGGCGAATATG         GACGACTGGGTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 120394 TCTATTCTTGGGGCTGTGGCGAATATGGTA...CAGGACGACTGGGTTTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GATTCAGAAGAGGATTATTATACACCACAAAAG         GTGGATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 120940 GATTCAGAAGAGGATTATTATACACCACAAAAGGTA...CAGGTGGATGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TCCCAAGGCCTTGATTATTGTTGCAGTTCAATGTGGCTGTGATGGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122933 TCCCAAGGCCTTGATTATTGTTGCAGTTCAATGTGGCTGTGATGGGACAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TTCTGTTGACCCAGTCAGGCAAAGTGCTGGCCTGTGGACTCAATGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122983 TTCTGTTGACCCAGTCAGGCAAAGTGCTGGCCTGTGGACTCAATGAATTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 AATAAGCTGGGTCTGAATCAGTGCATGTCGGGAATTATCAACCATGAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 123033 AATAAGCTGGGTCTGAATCAGTGCATGTCGGGAATTATCAACCATGAAGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1732        GCATACCATGAAGTTCCCTACACAACGTCCTTTACCTTGGCCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123083 G...CAGGCATACCATGAAGTTCCCTACACAACGTCCTTTACCTTGGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 AACAGTTGTCCTTTTATAAGATCCGTACCATTGCCCCAGGCAAGACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125200 AACAGTTGTCCTTTTATAAGATCCGTACCATTGCCCCAGGCAAGACTCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 ACAGCTGCTATTGATG         AGCGAGGCCGGCTGCTGACCTTTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 125250 ACAGCTGCTATTGATGGTA...CAGAGCGAGGCCGGCTGCTGACCTTTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CTGCAACAAGTGTGGGCAGCTGGGCGTTGGGAACTACAAGAAGCGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125794 CTGCAACAAGTGTGGGCAGCTGGGCGTTGGGAACTACAAGAAGCGTCTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GAATCAACCTGTTGGGGGGACCCCTTGGTGGGAAGCAAGTGATCAGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125844 GAATCAACCTGTTGGGGGGACCCCTTGGTGGGAAGCAAGTGATCAGGGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 TCCTGCGGTGATGAGTTTACCATTGCTGCCACTGATG         ATAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 125894 TCCTGCGGTGATGAGTTTACCATTGCTGCCACTGATGGTG...TAGATAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TCACATTTTTGCCTGGGGCAATGGTGGTAATGGCCGCCTGGCAATGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129656 TCACATTTTTGCCTGGGGCAATGGTGGTAATGGCCGCCTGGCAATGACCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CCACAGAGAGACCACATGGCTCTGATATCTGTACCTCATGGCCTCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129706 CCACAGAGAGACCACATGGCTCTGATATCTGTACCTCATGGCCTCGGCCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 ATTTTTGGATCTCTGCATCATGTCCCGGACCTGTCTTGCCGTGGATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129756 ATTTTTGGATCTCTGCATCATGTCCCGGACCTGTCTTGCCGTGGATGGCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 TACCATTCTCATCGTTG         AGAAAGTATTGAATTCTAAGACCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 129806 TACCATTCTCATCGTTGGTA...CAGAGAAAGTATTGAATTCTAAGACCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TCCGTTCCAATAGCAGTGGCTTATCCATTGGAACTG         TGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 131515 TCCGTTCCAATAGCAGTGGCTTATCCATTGGAACTGGTA...CAGTGTTT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 CAGAGCTCTAGCCCGGGAGGAGGCGGCGGGGGCGGCGGTGGTGAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135449 CAGAGCTCTAGCCCGGGAGGAGGCGGCGGGGGCGGCGGTGGTGAAGAAGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GGACAGTCAGCAGGAATCTGAAACTCCTGACCCAAGTGGAGGCTTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135499 GGACAGTCAGCAGGAATCTGAAACTCCTGACCCAAGTGGAGGCTTCCGAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 GAACAATGGAAGCAGACCGAGGAATGGAAGGTTTAATCAGTCCCACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135549 GAACAATGGAAGCAGACCGAGGAATGGAAGGTTTAATCAGTCCCACAGAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 GCCATGGGGAACAGTAATGGGGCCAGCAGCTCCTGTCCTGGCTGGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135599 GCCATGGGGAACAGTAATGGGGCCAGCAGCTCCTGTCCTGGCTGGCTTCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 AAAG         GAGCTGGAAAATGCAGAATTTATCCCCATGCCTGACA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135649 AAAGGTA...TAGGAGCTGGAAAATGCAGAATTTATCCCCATGCCTGACA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 GCCCATCTCCTCTCAGTGCAGCGTTTTCAGAATCTGAGAAAGATACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138318 GCCCATCTCCTCTCAGTGCAGCGTTTTCAGAATCTGAGAAAGATACCCTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CCCTATGAAGAGCTGCAAGGACTCAAAGTGGCCTCTGAAGCTCCTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138368 CCCTATGAAGAGCTGCAAGGACTCAAAGTGGCCTCTGAAGCTCCTTTGGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 ACACAAACCCCAAGTAGAAGCCTCG         TCACCTCGGCTGAATC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 138418 ACACAAACCCCAAGTAGAAGCCTCGGTA...TAGTCACCTCGGCTGAATC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 CTGCAGTAACCTGTGCTGGGAAGGGAACACCACTGACTCCTCCTGCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139708 CTGCAGTAACCTGTGCTGGGAAGGGAACACCACTGACTCCTCCTGCGTGT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 GCGTGCAGCTCTCTGCAGGTGGAGGTTGAGAGATTGCAGGGTCTGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139758 GCGTGCAGCTCTCTGCAGGTGGAGGTTGAGAGATTGCAGGGTCTGGTGTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 AAAGTGTCTGGCTGAACAACAGAAGCTACAGCAAGAAAACCTCCAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139808 AAAGTGTCTGGCTGAACAACAGAAGCTACAGCAAGAAAACCTCCAGATTT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 TTACCCAACTGCAGAAGTTGAACAAGAAATTAGAAGGAGGGCAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 139858 TTACCCAACTGCAGAAGTTGAACAAGAAATTAGAAGGAGGGCAGCAGGTG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2818       GTGGGGATGCATTCCAAAGGAACTCAGACAGCAAAGGAAGAGAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139908 ...CAGGTGGGGATGCATTCCAAAGGAACTCAGACAGCAAAGGAAGAGAT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 GGAAATGGATCCAAAGCCTGACTTAGATTCAGATTCCTGGTGCCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142280 GGAAATGGATCCAAAGCCTGACTTAGATTCAGATTCCTGGTGCCTCCTGG

   3100     .    :    .    :    .
   2912 GAACAGACTCCTGTAGACCCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||
 142330 GAACAGACTCCTGTAGACCCAGCCTC