Result of SIM4 for
pF1KA1973
seq1 = pF1KA1973.tfa, 3345 bp
seq2 = pF1KA1973/gi568815589r_101473177.tfa (gi568815589r:101473177_101837979), 364803 bp
>pF1KA1973 3345
>gi568815589r:101473177_101837979 (Chr9)
(complement)
1-699 (100001-100699) 100% ->
700-1304 (150780-151384) 100% ->
1305-2352 (166873-167920) 100% ->
2353-2498 (209579-209724) 100% ->
2499-2614 (214547-214662) 99% ->
2615-2766 (224453-224604) 100% ->
2767-2931 (258620-258784) 100% ->
2932-3008 (260136-260212) 100% ->
3009-3345 (264467-264803) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAGGAGACTGAGTTTGTGGTGGCTGCTGAGCAGGGTCTGTCTGCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAGGAGACTGAGTTTGTGGTGGCTGCTGAGCAGGGTCTGTCTGCTGTT
50 . : . : . : . : . :
51 GCCGCCGCCCTGCGCACTGGTGCTGGCCGGGGTGCCCAGCTCCTCCTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GCCGCCGCCCTGCGCACTGGTGCTGGCCGGGGTGCCCAGCTCCTCCTCGC
100 . : . : . : . : . :
101 ACCCGCAGCCCTGCCAGATCCTCAAGCGCATCGGGCACGCGGTGAGGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ACCCGCAGCCCTGCCAGATCCTCAAGCGCATCGGGCACGCGGTGAGGGTG
150 . : . : . : . : . :
151 GGCGCGGTGCACTTGCAGCCCTGGACCACCGCCCCCCGCGCGGCCAGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GGCGCGGTGCACTTGCAGCCCTGGACCACCGCCCCCCGCGCGGCCAGCCG
200 . : . : . : . : . :
201 CGCTCCGGACGACAGCCGAGCAGGAGCCCAGAGGGATGAGCCGGAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 CGCTCCGGACGACAGCCGAGCAGGAGCCCAGAGGGATGAGCCGGAGCCAG
250 . : . : . : . : . :
251 GGACTAGGCGGTCCCCGGCGCCCTCGCCGGGCGCACGCTGGTTGGGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 GGACTAGGCGGTCCCCGGCGCCCTCGCCGGGCGCACGCTGGTTGGGGAGC
300 . : . : . : . : . :
301 ACCCTGCATGGCCGGGGGCCGCCGGGCTCCCGTAAGCCCGGGGAGGGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 ACCCTGCATGGCCGGGGGCCGCCGGGCTCCCGTAAGCCCGGGGAGGGCGC
350 . : . : . : . : . :
351 CAGGGCGGAGGCCCTGTGGCCACGGGACGCCCTCCTATTTGCCGTGGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 CAGGGCGGAGGCCCTGTGGCCACGGGACGCCCTCCTATTTGCCGTGGACA
400 . : . : . : . : . :
401 ACCTGAACCGCGTGGAAGGGCTGCTACCCTACAACCTGTCTTTGGAAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 ACCTGAACCGCGTGGAAGGGCTGCTACCCTACAACCTGTCTTTGGAAGTA
450 . : . : . : . : . :
451 GTGATGGCCATCGAGGCAGGCCTGGGCGATCTGCCACTTTTGCCCTTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 GTGATGGCCATCGAGGCAGGCCTGGGCGATCTGCCACTTTTGCCCTTCTC
500 . : . : . : . : . :
501 CTCCCCTAGTTCGCCATGGAGCAGTGACCCTTTCTCCTTCCTGCAAAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 CTCCCCTAGTTCGCCATGGAGCAGTGACCCTTTCTCCTTCCTGCAAAGTG
550 . : . : . : . : . :
551 TGTGCCATACCGTGGTGGTGCAAGGGGTGTCGGCGCTGCTCGCCTTCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 TGTGCCATACCGTGGTGGTGCAAGGGGTGTCGGCGCTGCTCGCCTTCCCC
600 . : . : . : . : . :
601 CAGAGCCAGGGCGAAATGATGGAGCTCGACTTGGTCAGCTTAGTCCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 CAGAGCCAGGGCGAAATGATGGAGCTCGACTTGGTCAGCTTAGTCCTGCA
650 . : . : . : . : . :
651 CATTCCAGTGATCAGCATCGTGCGCCACGAGTTTCCACGGGAGAGTCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
100651 CATTCCAGTGATCAGCATCGTGCGCCACGAGTTTCCACGGGAGAGTCAGG
700 . : . : . : . : . :
700 AATCCCCTTCACCTACAACTGAGTTTAGAAAATTCATTAAGT
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 TG...CAGAATCCCCTTCACCTACAACTGAGTTTAGAAAATTCATTAAGT
750 . : . : . : . : . :
742 TCTGATGCTGATGTCACTGTCTCAATCCTGACCATGAACAACTGGTACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150822 TCTGATGCTGATGTCACTGTCTCAATCCTGACCATGAACAACTGGTACAA
800 . : . : . : . : . :
792 TTTTAGCTTGTTGCTGTGCCAGGAAGACTGGAACATCACCGACTTCCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150872 TTTTAGCTTGTTGCTGTGCCAGGAAGACTGGAACATCACCGACTTCCTCC
850 . : . : . : . : . :
842 TCCTTACCCAGAATAATTCCAAGTTCCACCTTGGTTCTATCATCAACATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150922 TCCTTACCCAGAATAATTCCAAGTTCCACCTTGGTTCTATCATCAACATC
900 . : . : . : . : . :
892 ACCGCTAACCTCCCCTCCACCCAGGACCTCTTGAGCTTCCTACAGATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150972 ACCGCTAACCTCCCCTCCACCCAGGACCTCTTGAGCTTCCTACAGATCCA
950 . : . : . : . : . :
942 GCTTGAGAGTATTAAGAACAGCACACCCACAGTGGTGATGTTTGGCTGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151022 GCTTGAGAGTATTAAGAACAGCACACCCACAGTGGTGATGTTTGGCTGCG
1000 . : . : . : . : . :
992 ACATGGAAAGTATCCGGCGGATTTTCGAAATTACAACCCAGTTTGGGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151072 ACATGGAAAGTATCCGGCGGATTTTCGAAATTACAACCCAGTTTGGGGTC
1050 . : . : . : . : . :
1042 ATGCCCCCTGAACTTCGTTGGGTGCTGGGAGATTCCCAGAATGTGGAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151122 ATGCCCCCTGAACTTCGTTGGGTGCTGGGAGATTCCCAGAATGTGGAGGA
1100 . : . : . : . : . :
1092 ACTGAGGACAGAGGGTCTGCCCTTAGGGCTCATTGCTCATGGAAAAACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151172 ACTGAGGACAGAGGGTCTGCCCTTAGGGCTCATTGCTCATGGAAAAACAA
1150 . : . : . : . : . :
1142 CACAGTCTGTCTTTGAGCACTACGTACAAGATGCTATGGAGCTGGTCGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151222 CACAGTCTGTCTTTGAGCACTACGTACAAGATGCTATGGAGCTGGTCGCA
1200 . : . : . : . : . :
1192 AGAGCTGTAGCCACAGCCACCATGATCCAACCAGAACTTGCTCTCATTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151272 AGAGCTGTAGCCACAGCCACCATGATCCAACCAGAACTTGCTCTCATTCC
1250 . : . : . : . : . :
1242 CAGCACGATGAACTGCATGGAGGTGGAAACTACAAATCTCACTTCAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151322 CAGCACGATGAACTGCATGGAGGTGGAAACTACAAATCTCACTTCAGGAC
1300 . : . : . : . : . :
1292 AATATTTATCAAG GTTTCTAGCCAATACCACTTTCAGAGGC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
151372 AATATTTATCAAGGTA...CAGGTTTCTAGCCAATACCACTTTCAGAGGC
1350 . : . : . : . : . :
1333 CTCAGTGGTTCCATCAGAGTAAAAGGTTCCACCATCGTCAGCTCAGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166901 CTCAGTGGTTCCATCAGAGTAAAAGGTTCCACCATCGTCAGCTCAGAAAA
1400 . : . : . : . : . :
1383 CAACTTTTTCATCTGGAATCTTCAACATGACCCCATGGGAAAGCCAATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166951 CAACTTTTTCATCTGGAATCTTCAACATGACCCCATGGGAAAGCCAATGT
1450 . : . : . : . : . :
1433 GGACCCGCTTGGGCAGCTGGCAGGGGGGAAAGATTGTCATGGACTATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167001 GGACCCGCTTGGGCAGCTGGCAGGGGGGAAAGATTGTCATGGACTATGGA
1500 . : . : . : . : . :
1483 ATATGGCCAGAGCAGGCCCAGAGACACAAAACCCACTTCCAACATCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167051 ATATGGCCAGAGCAGGCCCAGAGACACAAAACCCACTTCCAACATCCAAG
1550 . : . : . : . : . :
1533 TAAGCTACACTTGAGAGTGGTTACCCTGATTGAGCATCCTTTTGTCTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167101 TAAGCTACACTTGAGAGTGGTTACCCTGATTGAGCATCCTTTTGTCTTCA
1600 . : . : . : . : . :
1583 CAAGGGAGGTAGATGATGAAGGCTTGTGCCCTGCTGGCCAACTCTGTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167151 CAAGGGAGGTAGATGATGAAGGCTTGTGCCCTGCTGGCCAACTCTGTCTA
1650 . : . : . : . : . :
1633 GACCCCATGACTAATGACTCTTCCACATTGGACAGCCTTTTTAGCAGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167201 GACCCCATGACTAATGACTCTTCCACATTGGACAGCCTTTTTAGCAGCCT
1700 . : . : . : . : . :
1683 CCATAGCAGTAATGATACAGTGCCCATTAAATTCAAGAAGTGCTGCTATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167251 CCATAGCAGTAATGATACAGTGCCCATTAAATTCAAGAAGTGCTGCTATG
1750 . : . : . : . : . :
1733 GATATTGCATTGATCTGCTGGAAAAGATAGCAGAAGACATGAACTTTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167301 GATATTGCATTGATCTGCTGGAAAAGATAGCAGAAGACATGAACTTTGAC
1800 . : . : . : . : . :
1783 TTCGACCTCTATATTGTAGGGGATGGAAAGTATGGAGCATGGAAAAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167351 TTCGACCTCTATATTGTAGGGGATGGAAAGTATGGAGCATGGAAAAATGG
1850 . : . : . : . : . :
1833 GCACTGGACTGGGCTAGTGGGTGATCTCCTGAGAGGGACTGCCCACATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167401 GCACTGGACTGGGCTAGTGGGTGATCTCCTGAGAGGGACTGCCCACATGG
1900 . : . : . : . : . :
1883 CAGTCACTTCCTTTAGCATCAATACTGCACGGAGCCAGGTGATAGATTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167451 CAGTCACTTCCTTTAGCATCAATACTGCACGGAGCCAGGTGATAGATTTC
1950 . : . : . : . : . :
1933 ACCAGCCCTTTCTTCTCCACCAGCTTGGGCATCTTAGTGAGGACCCGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167501 ACCAGCCCTTTCTTCTCCACCAGCTTGGGCATCTTAGTGAGGACCCGAGA
2000 . : . : . : . : . :
1983 TACAGCAGCTCCCATTGGAGCCTTCATGTGGCCACTCCACTGGACAATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167551 TACAGCAGCTCCCATTGGAGCCTTCATGTGGCCACTCCACTGGACAATGT
2050 . : . : . : . : . :
2033 GGCTGGGGATTTTTGTGGCTCTGCACATCACTGCCGTCTTCCTCACTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167601 GGCTGGGGATTTTTGTGGCTCTGCACATCACTGCCGTCTTCCTCACTCTG
2100 . : . : . : . : . :
2083 TATGAATGGAAGAGTCCATTTGGTTTGACTCCCAAGGGGCGAAATAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167651 TATGAATGGAAGAGTCCATTTGGTTTGACTCCCAAGGGGCGAAATAGAAG
2150 . : . : . : . : . :
2133 TAAAGTCTTCTCCTTTTCTTCAGCCTTGAACATCTGTTATGCCCTCTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167701 TAAAGTCTTCTCCTTTTCTTCAGCCTTGAACATCTGTTATGCCCTCTTGT
2200 . : . : . : . : . :
2183 TTGGCAGAACAGTGGCCATCAAACCTCCAAAATGTTGGACTGGAAGGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167751 TTGGCAGAACAGTGGCCATCAAACCTCCAAAATGTTGGACTGGAAGGTTT
2250 . : . : . : . : . :
2233 CTAATGAACCTTTGGGCCATTTTCTGTATGTTTTGCCTTTCCACATACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167801 CTAATGAACCTTTGGGCCATTTTCTGTATGTTTTGCCTTTCCACATACAC
2300 . : . : . : . : . :
2283 GGCAAACTTGGCTGCTGTCATGGTAGGTGAGAAGATCTATGAAGAGCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167851 GGCAAACTTGGCTGCTGTCATGGTAGGTGAGAAGATCTATGAAGAGCTTT
2350 . : . : . : . : . :
2333 CTGGAATACATGACCCCAAG TTACATCATCCTTCCCAAGGA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
167901 CTGGAATACATGACCCCAAGGTA...TAGTTACATCATCCTTCCCAAGGA
2400 . : . : . : . : . :
2374 TTCCGCTTTGGAACTGTCCGAGAAAGCAGTGCTGAAGATTATGTGAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
209600 TTCCGCTTTGGAACTGTCCGAGAAAGCAGTGCTGAAGATTATGTGAGACA
2450 . : . : . : . : . :
2424 AAGTTTCCCAGAGATGCATGAATATATGAGAAGGTACAATGTTCCAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
209650 AAGTTTCCCAGAGATGCATGAATATATGAGAAGGTACAATGTTCCAGCCA
2500 . : . : . : . : . :
2474 CCCCTGATGGAGTGGAGTATCTGAA GAACGATCCAGAGAAA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| ||||||||||||
209700 CCCCTGATGGAGTGGAGTATCTGAAGTG...TAGGAATGATCCAGAGAAA
2550 . : . : . : . : . :
2515 CTAGACGCCTTCATCATGGACAAAGCCCTTCTGGATTATGAAGTGTCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
214563 CTAGACGCCTTCATCATGGACAAAGCCCTTCTGGATTATGAAGTGTCAAT
2600 . : . : . : . : . :
2565 AGATGCTGACTGCAAACTTCTCACTGTGGGGAAGCCATTTGCCATAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
214613 AGATGCTGACTGCAAACTTCTCACTGTGGGGAAGCCATTTGCCATAGAAG
2650 . : . : . : . : . :
2615 GATACGGCATTGGCCTCCCACCCAACTCTCCATTGACCGCC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
214663 GTA...TAGGATACGGCATTGGCCTCCCACCCAACTCTCCATTGACCGCC
2700 . : . : . : . : . :
2656 AACATATCCGAGCTAATCAGTCAATACAAGTCACATGGGTTTATGGATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
224494 AACATATCCGAGCTAATCAGTCAATACAAGTCACATGGGTTTATGGATAT
2750 . : . : . : . : . :
2706 GCTCCATGACAAGTGGTACAGGGTGGTTCCCTGTGGCAAGAGAAGTTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
224544 GCTCCATGACAAGTGGTACAGGGTGGTTCCCTGTGGCAAGAGAAGTTTTG
2800 . : . : . : . : . :
2756 CTGTCACGGAG ACTTTGCAAATGGGCATCAAACACTTCTCT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
224594 CTGTCACGGAGGTA...CAGACTTTGCAAATGGGCATCAAACACTTCTCT
2850 . : . : . : . : . :
2797 GGGCTCTTTGTGCTGCTGTGCATTGGATTTGGTCTGTCCATTTTGACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
258650 GGGCTCTTTGTGCTGCTGTGCATTGGATTTGGTCTGTCCATTTTGACCAC
2900 . : . : . : . : . :
2847 CATTGGTGAGCACATAGTATACAGGCTGCTGCTACCACGAATCAAAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
258700 CATTGGTGAGCACATAGTATACAGGCTGCTGCTACCACGAATCAAAAACA
2950 . : . : . : . : . :
2897 AATCCAAGCTGCAATACTGGCTCCACACCAGCCAG AGATTA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
258750 AATCCAAGCTGCAATACTGGCTCCACACCAGCCAGGTG...CAGAGATTA
3000 . : . : . : . : . :
2938 CACAGAGCAATAAATACATCATTTATAGAGGAAAAGCAGCAGCATTTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
260142 CACAGAGCAATAAATACATCATTTATAGAGGAAAAGCAGCAGCATTTCAA
3050 . : . : . : . : . :
2988 GACCAAACGTGTGGAAAAGAG GTCTAATGTGGGACCCCGTC
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
260192 GACCAAACGTGTGGAAAAGAGGTA...TAGGTCTAATGTGGGACCCCGTC
3100 . : . : . : . : . :
3029 AGCTTACCGTATGGAATACTTCCAATCTGAGTCATGACAACCGACGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
264487 AGCTTACCGTATGGAATACTTCCAATCTGAGTCATGACAACCGACGGAAA
3150 . : . : . : . : . :
3079 TACATCTTTAGTGATGAGGAAGGACAAAACCAGCTGGGCATCCAGATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
264537 TACATCTTTAGTGATGAGGAAGGACAAAACCAGCTGGGCATCCGGATCCA
3200 . : . : . : . : . :
3129 CCAGGACATCCCCCTCCCTCCAAGGAGAAGAGAGCTCCCTGCCTTGCGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
264587 CCAGGACATCCCCCTCCCTCCAAGGAGAAGAGAGCTCCCTGCCTTGCGGA
3250 . : . : . : . : . :
3179 CCACCAATGGGAAAGCAGACTCCCTAAATGTATCTCGGAACTCAGTGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
264637 CCACCAATGGGAAAGCAGACTCCCTAAATGTATCTCGGAACTCAGTGATG
3300 . : . : . : . : . :
3229 CAGGAACTCTCAGAGCTCGAGAAGCAGATTCAGGTGATCCGTCAGGAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
264687 CAGGAACTCTCAGAGCTCGAGAAGCAGATTCAGGTGATCCGTCAGGAGCT
3350 . : . : . : . : . :
3279 GCAGCTGGCTGTGAGCAGGAAAACGGAGCTGGAGGAGTATCAAAGGACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
264737 GCAGCTGGCTGTGAGCAGGAAAACGGAGCTGGAGGAGTATCAAAGGACAA
3400 . : .
3329 GTCGGACTTGTGAGTCC
|||||||||||||||||
264787 GTCGGACTTGTGAGTCC