Result of SIM4 for
pF1KA1944
seq1 = pF1KA1944.tfa, 3297 bp
seq2 = pF1KA1944/gi568815586r_128973878.tfa (gi568815586r:128973878_130003339), 1029462 bp
>pF1KA1944 3297
>gi568815586r:128973878_130003339 (Chr12)
(complement)
1-79 (100001-100079) 100% ->
80-969 (302642-303531) 100% ==
1113-1300 (665520-665707) 100% ==
1442-1649 (918636-918843) 100% ->
1650-1923 (921308-921581) 100% ->
1924-2115 (924615-924806) 100% ->
2116-3297 (928281-929462) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTGCCCGTCTGAGATGGGGACGCTGTGGCACCACTGGTCGCCGGTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTGCCCGTCTGAGATGGGGACGCTGTGGCACCACTGGTCGCCGGTACT
50 . : . : . : . : . :
51 CATCAGCCTGGCCGCCCTGTTTTCCAAAG TGACGGAAGGTC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
100051 CATCAGCCTGGCCGCCCTGTTTTCCAAAGGTG...CAGTGACGGAAGGTC
100 . : . : . : . : . :
92 GAGGGATCCTTGAGAGCATCCAGAGGTTTTCCTTGCTGCCCACCTACCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302654 GAGGGATCCTTGAGAGCATCCAGAGGTTTTCCTTGCTGCCCACCTACCTC
150 . : . : . : . : . :
142 CCCGTGACCTACCACATCAACAACGCGGACGTCTCCTTCTTCCTGAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302704 CCCGTGACCTACCACATCAACAACGCGGACGTCTCCTTCTTCCTGAAGGA
200 . : . : . : . : . :
192 GGCCAACCAGGATATCATGAGGAACTCCAGCCTGCAGTCCCGGGTGGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302754 GGCCAACCAGGATATCATGAGGAACTCCAGCCTGCAGTCCCGGGTGGAGT
250 . : . : . : . : . :
242 CATTTCTGATTTACAAATCCAGGAGGCTGCCTGTCCTCAATGCCAGCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302804 CATTTCTGATTTACAAATCCAGGAGGCTGCCTGTCCTCAATGCCAGCTAC
300 . : . : . : . : . :
292 GGGCCTTTCTCCATCGAGCAAGTGGTGCCCCAGGATTTAATGCTACCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302854 GGGCCTTTCTCCATCGAGCAAGTGGTGCCCCAGGATTTAATGCTACCTTC
350 . : . : . : . : . :
342 CAACCCATTTGGATTCACCAACAAATTTTCTCTTAACTGGAAACTAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302904 CAACCCATTTGGATTCACCAACAAATTTTCTCTTAACTGGAAACTAAAAG
400 . : . : . : . : . :
392 CCCACATCCTGCGGGACAAAGTCTACCTGAGCCGGCCCAAAGTGCAGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302954 CCCACATCCTGCGGGACAAAGTCTACCTGAGCCGGCCCAAAGTGCAGGTT
450 . : . : . : . : . :
442 CTGTTCCACATCATGGGCAGAGACTGGGACGACCGCAGCGCCGGGGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303004 CTGTTCCACATCATGGGCAGAGACTGGGACGACCGCAGCGCCGGGGAGAA
500 . : . : . : . : . :
492 GCTGCCGTGCCTGAGGGTCTTTGCTTTCCGAGAGACCCGAGAGGTGCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303054 GCTGCCGTGCCTGAGGGTCTTTGCTTTCCGAGAGACCCGAGAGGTGCGGG
550 . : . : . : . : . :
542 GCAGCTGCCGGCTGCAGGGGGACCTGGGGCTGTGCGTGGCCGAGCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303104 GCAGCTGCCGGCTGCAGGGGGACCTGGGGCTGTGCGTGGCCGAGCTGGAG
600 . : . : . : . : . :
592 CTCCTGTCCAGCTGGTTCAGCCCCCCCACGGTGGTTGCCGGGAGGAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303154 CTCCTGTCCAGCTGGTTCAGCCCCCCCACGGTGGTTGCCGGGAGGAGGAA
650 . : . : . : . : . :
642 GTCCGTGGACCAGCCGGAGGGGACCCCCGTGGAGCTCTACTACACCGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303204 GTCCGTGGACCAGCCGGAGGGGACCCCCGTGGAGCTCTACTACACCGTGC
700 . : . : . : . : . :
692 ACCCAGGGGGTGAGAGAGGGGACTGCGTCAGGGAAGACGCGAGGAGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303254 ACCCAGGGGGTGAGAGAGGGGACTGCGTCAGGGAAGACGCGAGGAGAAGC
750 . : . : . : . : . :
742 AATGGGATCCGGACAGGCCACAGTGACATCGATGAGTCCGGGCCCCCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303304 AATGGGATCCGGACAGGCCACAGTGACATCGATGAGTCCGGGCCCCCCTT
800 . : . : . : . : . :
792 GCAGAGGATCGGGAGCATCTTCCTTTATCAGACACACAGGAAACCCTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303354 GCAGAGGATCGGGAGCATCTTCCTTTATCAGACACACAGGAAACCCTCCC
850 . : . : . : . : . :
842 TGAGAGAACTGCGTCTGGACAACAGCGTGGCCATCCACTATATACCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303404 TGAGAGAACTGCGTCTGGACAACAGCGTGGCCATCCACTATATACCAAAG
900 . : . : . : . : . :
892 ACCGTGAGGAAAGGAGACGTGCTGACTTTTCCTGTTTCCATCTCCAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
303454 ACCGTGAGGAAAGGAGACGTGCTGACTTTTCCTGTTTCCATCTCCAGAAA
950 . : . : .
942 TTCCACTGAAGATCGCTTCACGTTGAGG
||||||||||||||||||||||||||||
303504 TTCCACTGAAGATCGCTTCACGTTGAGG
0 . : . : . : . : . :
1113 CAGTGCGGATGGCGCCTCCTACGAGGTCATGCAGATCGATGTGGAGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
665520 CAGTGCGGATGGCGCCTCCTACGAGGTCATGCAGATCGATGTGGAGGTGG
50 . : . : . : . : . :
1163 AAGAGCCTGGTGACCTGCCAGCCACACAGCTGGTCACGTGGCAGGTCGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
665570 AAGAGCCTGGTGACCTGCCAGCCACACAGCTGGTCACGTGGCAGGTCGAG
100 . : . : . : . : . :
1213 TACCCCGGAGAGATCACGTCTGACTTGGGAGTGTCCAAGATCTATGTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
665620 TACCCCGGAGAGATCACGTCTGACTTGGGAGTGTCCAAGATCTATGTGAG
150 . : . : . : .
1263 CCCAAAGGACTTGATTGGAGTTGTGCCGCTGGCTATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
665670 CCCAAAGGACTTGATTGGAGTTGTGCCGCTGGCTATGG
0 . : . : . : . : . :
1442 AGGTTTCTGACAGATGTGACTACGTCTTTGTCAATGGGAAAGAAATGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
918636 AGGTTTCTGACAGATGTGACTACGTCTTTGTCAATGGGAAAGAAATGAAA
50 . : . : . : . : . :
1492 GGCAAGGTCAACGTGGTGGTGAACTTCACCTACCAGCACCTGAGCAGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
918686 GGCAAGGTCAACGTGGTGGTGAACTTCACCTACCAGCACCTGAGCAGCCC
100 . : . : . : . : . :
1542 CCTGGAGATGACGGTGTGGGTGCCCCGGCTTCCGCTGCAGATCGAGGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
918736 CCTGGAGATGACGGTGTGGGTGCCCCGGCTTCCGCTGCAGATCGAGGTCT
150 . : . : . : . : . :
1592 CCGACACCGAGCTCAATCAGATCAAGGGTTGGAGAGTGCCCATCGTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
918786 CCGACACCGAGCTCAATCAGATCAAGGGTTGGAGAGTGCCCATCGTCTCC
200 . : . : . : . : . :
1642 AGCAGGAG GCCTGCCGGGGACAGTGAAGAGGAGGAGGATGA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
918836 AGCAGGAGGTG...CAGGCCTGCCGGGGACAGTGAAGAGGAGGAGGATGA
250 . : . : . : . : . :
1683 TGAGCGGAGGGGCCGCGGCTGCACCCTGCAGTACCAGCACGCCATGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
921341 TGAGCGGAGGGGCCGCGGCTGCACCCTGCAGTACCAGCACGCCATGGTGC
300 . : . : . : . : . :
1733 GGGTCCTGACGCAGTTTGTGGCTGAGGCGGCCGGCCCTGGGGGACACCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
921391 GGGTCCTGACGCAGTTTGTGGCTGAGGCGGCCGGCCCTGGGGGACACCTG
350 . : . : . : . : . :
1783 GCCCACCTGCTGGGCTCAGACTGGCAAGTGGACATCACGGAGCTGATAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
921441 GCCCACCTGCTGGGCTCAGACTGGCAAGTGGACATCACGGAGCTGATAAA
400 . : . : . : . : . :
1833 TGACTTCATGCAGGTGGAGGAGCCCAGGATCGCCAAGCTGCAAGGCGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
921491 TGACTTCATGCAGGTGGAGGAGCCCAGGATCGCCAAGCTGCAAGGCGGAC
450 . : . : . : . : . :
1883 AGATCCTGATGGGGCAGGAGCTTGGGATGACCACCATTCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
921541 AGATCCTGATGGGGCAGGAGCTTGGGATGACCACCATTCAGGTA...CAG
500 . : . : . : . : . :
1924 ATCCTGTCTCCTCTGTCAGACACCATCCTCGCTGAAAAGACCATCACTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
924615 ATCCTGTCTCCTCTGTCAGACACCATCCTCGCTGAAAAGACCATCACTGT
550 . : . : . : . : . :
1974 GCTGGACGAGAAGGTGACCATCACAGACCTCGGGGTGCAGCTGGTGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
924665 GCTGGACGAGAAGGTGACCATCACAGACCTCGGGGTGCAGCTGGTGACAG
600 . : . : . : . : . :
2024 GGCTGTCACTCTCCTTGCAGCTCAGCCCAGGAAGCAACAGGGCCATCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
924715 GGCTGTCACTCTCCTTGCAGCTCAGCCCAGGAAGCAACAGGGCCATCTTT
650 . : . : . : . : . :
2074 GCCACTGCAGTGGCTCAGGAACTTCTGCAGAGGCCAAAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
924765 GCCACTGCAGTGGCTCAGGAACTTCTGCAGAGGCCAAAACAGGTA...TA
700 . : . : . : . : . :
2116 GAAGCAGCCATCAGTTGCTGGGTCCAGTTCAGTGATGGCTCAGTCACAC
>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
928280 GGAAGCAGCCATCAGTTGCTGGGTCCAGTTCAGTGATGGCTCAGTCACGC
750 . : . : . : . : . :
2165 CCTTGGATATTTACGATGGGAAAGACTTCTCCTTGATGGCCACATCTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928330 CCTTGGATATTTACGATGGGAAAGACTTCTCCTTGATGGCCACATCTTTG
800 . : . : . : . : . :
2215 GATGAGAAGGTAGTCTCCATCCACCAAGACCCCAAATTCAAGTGGCCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928380 GATGAGAAGGTAGTCTCCATCCACCAAGACCCCAAATTCAAGTGGCCTAT
850 . : . : . : . : . :
2265 CATTGCTGCGGAAACAGAAGGACAAGGCACCCTGGTCAAGGTGGAAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928430 CATTGCTGCGGAAACAGAAGGACAAGGCACCCTGGTCAAGGTGGAAATGG
900 . : . : . : . : . :
2315 TTATTAGTGAATCCTGCCAGAAATCCAAGCGGAAGAGTGTGTTAGCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928480 TTATTAGTGAATCCTGCCAGAAATCCAAGCGGAAGAGTGTGTTAGCTGTT
950 . : . : . : . : . :
2365 GGAACGGCAAACATCAAAGTTAAATTTGGCCAAAACGATGCTAACCCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928530 GGAACGGCAAACATCAAAGTTAAATTTGGCCAAAACGATGCTAACCCCAA
1000 . : . : . : . : . :
2415 CACCAGTGACAGCAGACACACAGGGGCAGGGGTTCACATGGAAAACAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928580 CACCAGTGACAGCAGACACACAGGGGCAGGGGTTCACATGGAAAACAATG
1050 . : . : . : . : . :
2465 TCAGTGACAGAAGGCCCAAAAAACCCTCGCAGGAATGGGGGAGTCAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928630 TCAGTGACAGAAGGCCCAAAAAACCCTCGCAGGAATGGGGGAGTCAGGAA
1100 . : . : . : . : . :
2515 GGACAGTACTATGGCAGTTCTTCTATGGGACTCATGGAGGGACGGGGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928680 GGACAGTACTATGGCAGTTCTTCTATGGGACTCATGGAGGGACGGGGCAC
1150 . : . : . : . : . :
2565 CACGACAGACAGGTCCATCCTGCAGAAGAAGAAAGGCCAGGAAAGCCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928730 CACGACAGACAGGTCCATCCTGCAGAAGAAGAAAGGCCAGGAAAGCCTTT
1200 . : . : . : . : . :
2615 TAGATGACAACAGCCACTTGCAGACCATCCCCAGCGACCTCACCAGCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928780 TAGATGACAACAGCCACTTGCAGACCATCCCCAGCGACCTCACCAGCTTC
1250 . : . : . : . : . :
2665 CCAGCCCAGGTGGACCTCCCCAGAAGCAATGGGGAAATGGATGGGAATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928830 CCAGCCCAGGTGGACCTCCCCAGAAGCAATGGGGAAATGGATGGGAATGA
1300 . : . : . : . : . :
2715 CCTTATGCAGGCATCCAAAGGGCTGAGCGACTTAGAAATTGGGATGTATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928880 CCTTATGCAGGCATCCAAAGGGCTGAGCGACTTAGAAATTGGGATGTATG
1350 . : . : . : . : . :
2765 CTTTGTTGGGAGTCTTCTGTTTGGCCATTTTGGTCTTCTTGATAAACTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928930 CTTTGTTGGGAGTCTTCTGTTTGGCCATTTTGGTCTTCTTGATAAACTGT
1400 . : . : . : . : . :
2815 GTGACCTTTGCATTAAAATACAGACACAAACAGGTTCCCTTCGAGGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
928980 GTGACCTTTGCATTAAAATACAGACACAAACAGGTTCCCTTCGAGGAGCA
1450 . : . : . : . : . :
2865 GGAAGGGATGAGTCACTCTCATGACTGGGTTGGGTTAAGCAACCGGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
929030 GGAAGGGATGAGTCACTCTCATGACTGGGTTGGGTTAAGCAACCGGACAG
1500 . : . : . : . : . :
2915 AGCTGTTGGAGAATCACATCAACTTTGCCTCCTCGCAAGATGAGCAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
929080 AGCTGTTGGAGAATCACATCAACTTTGCCTCCTCGCAAGATGAGCAAATC
1550 . : . : . : . : . :
2965 ACTGCCATTGACAGGGGCATGGATTTCGAGGAAAGTAAATATCTCCTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
929130 ACTGCCATTGACAGGGGCATGGATTTCGAGGAAAGTAAATATCTCCTCAG
1600 . : . : . : . : . :
3015 CACAAACTCCCAAAAAAGCATCAATGGGCAGCTGTTCAAACCTTTGGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
929180 CACAAACTCCCAAAAAAGCATCAATGGGCAGCTGTTCAAACCTTTGGGAC
1650 . : . : . : . : . :
3065 CCATCATCATTGATGGGAAAGATCAGAAAAGTGAGCCCCCAACATCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
929230 CCATCATCATTGATGGGAAAGATCAGAAAAGTGAGCCCCCAACATCCCCT
1700 . : . : . : . : . :
3115 ACCTCAAAAAGGAAAAGGGTAAAATTTACCACCTTCACCGCCGTCTCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
929280 ACCTCAAAAAGGAAAAGGGTAAAATTTACCACCTTCACCGCCGTCTCCTC
1750 . : . : . : . : . :
3165 AGACGACGAGTACCCCACCAGGAACTCCATCGTGATGAGTAGCGAGGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
929330 AGACGACGAGTACCCCACCAGGAACTCCATCGTGATGAGTAGCGAGGATG
1800 . : . : . : . : . :
3215 ACATTAAGTGGGTCTGCCAGGATCTGGACCCTGGGGACTGCAAAGAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
929380 ACATTAAGTGGGTCTGCCAGGATCTGGACCCTGGGGACTGCAAAGAGCTG
1850 . : . : . :
3265 CACAACTACATGGAGAGGTTACATGAAAATGTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||
929430 CACAACTACATGGAGAGGTTACATGAAAATGTG