seq1 = pF1KA1910.tfa, 2088 bp
seq2 = pF1KA1910/gi568815585r_83779420.tfa (gi568815585r:83779420_83981507), 202088 bp

>pF1KA1910 2088
>gi568815585r:83779420_83981507 (Chr13)

(complement)

1-2088  (100001-102088)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCTTTGGATTCTGTTGCTGGAGACGTCTCTTTGTTTTGCCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCTTTGGATTCTGTTGCTGGAGACGTCTCTTTGTTTTGCCGCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAACGTTACAGGGGACGTTTGCAAAGAGAAGATCTGTTCCTGCAATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAACGTTACAGGGGACGTTTGCAAAGAGAAGATCTGTTCCTGCAATGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGAAGGGGACCTACACGTAGACTGTGAAAAAAAGGGCTTCACAAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAGAAGGGGACCTACACGTAGACTGTGAAAAAAAGGGCTTCACAAGTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCGTTTCACTGCCCCGACTTCCCAGTTTTACCATTTATTTCTGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCGTTTCACTGCCCCGACTTCCCAGTTTTACCATTTATTTCTGCATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAATTCCCTCACTCGACTTTTCCCTAATGAGTTCGCTAACTTTTATAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAATTCCCTCACTCGACTTTTCCCTAATGAGTTCGCTAACTTTTATAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGTTAGTTTGCACATGGAAAACAATGGCTTGCATGAAATCGTTCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGTTAGTTTGCACATGGAAAACAATGGCTTGCATGAAATCGTTCCGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCTTTTCTGGGGCTGCAGCTGGTGAAAAGGCTGCACATCAACAACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCTTTTCTGGGGCTGCAGCTGGTGAAAAGGCTGCACATCAACAACAACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATCAAGTCTTTTCGAAAGCAGACTTTTCTGGGGCTGGACGATCTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATCAAGTCTTTTCGAAAGCAGACTTTTCTGGGGCTGGACGATCTGGAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATCTCCAGGCTGATTTTAATTTATTACGAGATATAGACCCGGGGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATCTCCAGGCTGATTTTAATTTATTACGAGATATAGACCCGGGGGCCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGGACTTGAACAAGCTGGAGGTGCTCATTTTAAATGACAATCTCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGGACTTGAACAAGCTGGAGGTGCTCATTTTAAATGACAATCTCATCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACCCTACCTGCCAACGTGTTCCAGTATGTGCCCATCACCCACCTCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACCCTACCTGCCAACGTGTTCCAGTATGTGCCCATCACCCACCTCGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCGGGGTAACAGGCTGAAAACGCTGCCCTATGAGGAGGTCTTGGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCGGGGTAACAGGCTGAAAACGCTGCCCTATGAGGAGGTCTTGGAGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCCCTGGTATTGCGGAGATCCTGCTAGAGGATAACCCTTGGGACTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCCCTGGTATTGCGGAGATCCTGCTAGAGGATAACCCTTGGGACTGCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGTGATCTGCTCTCCCTGAAAGAATGGCTGGAAAACATTCCCAAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTGTGATCTGCTCTCCCTGAAAGAATGGCTGGAAAACATTCCCAAGAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCTGATCGGCCGAGTGGTCTGCGAAGCCCCCACCAGACTGCAGGGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCCTGATCGGCCGAGTGGTCTGCGAAGCCCCCACCAGACTGCAGGGTAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GACCTCAATGAAACCACCGAACAGGACTTGTGTCCTTTGAAAAACCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GACCTCAATGAAACCACCGAACAGGACTTGTGTCCTTTGAAAAACCGAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGATTCTAGTCTCCCGGCGCCCCCTGCCCAAGAAGAGACCTTTGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGATTCTAGTCTCCCGGCGCCCCCTGCCCAAGAAGAGACCTTTGCTCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GACCCCTGCCAACTCCTTTCAAGACAAATGGGCAAGAGGATCATGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GACCCCTGCCAACTCCTTTCAAGACAAATGGGCAAGAGGATCATGCCACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCAGGGTCTGCTCCAAACGGAGGTACAAAGATCCCAGGCAACTGGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCAGGGTCTGCTCCAAACGGAGGTACAAAGATCCCAGGCAACTGGCAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAAATCAGACCCACAGCAGCGATAGCGACGGGTAGCTCCAGGAACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAAATCAGACCCACAGCAGCGATAGCGACGGGTAGCTCCAGGAACAAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCTTAGCTAACAGTTTACCCTGCCCTGGGGGCTGCAGCTGCGACCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCTTAGCTAACAGTTTACCCTGCCCTGGGGGCTGCAGCTGCGACCACATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CCAGGGTCGGGTTTAAAGATGAACTGCAACAACAGGAACGTGAGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CCAGGGTCGGGTTTAAAGATGAACTGCAACAACAGGAACGTGAGCAGCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCTGATTTGAAGCCCAAGCTCTCTAACGTGCAGGAGCTTTTCCTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCTGATTTGAAGCCCAAGCTCTCTAACGTGCAGGAGCTTTTCCTACGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ATAACAAGATCCACAGCATCCGAAAATCGCACTTTGTGGATTACAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ATAACAAGATCCACAGCATCCGAAAATCGCACTTTGTGGATTACAAGAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CTCATTCTGTTGGATCTGGGCAACAATAACATCGCTACTGTAGAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CTCATTCTGTTGGATCTGGGCAACAATAACATCGCTACTGTAGAGAACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CACTTTCAAGAACCTTTTGGACCTCAGGTGGCTATACATGGATAGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CACTTTCAAGAACCTTTTGGACCTCAGGTGGCTATACATGGATAGCAATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACCTGGACACGCTGTCCCGGGAGAAATTCGCGGGGCTGCAAAACCTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACCTGGACACGCTGTCCCGGGAGAAATTCGCGGGGCTGCAAAACCTAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TACCTGAACGTGGAGTACAACGCTATCCAGCTCATCCTCCCGGGCACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TACCTGAACGTGGAGTACAACGCTATCCAGCTCATCCTCCCGGGCACTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CAATGCCATGCCCAAACTGAGGATCCTCATTCTCAACAACAACCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CAATGCCATGCCCAAACTGAGGATCCTCATTCTCAACAACAACCTGCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GGTCCCTGCCTGTGGACGTGTTCGCTGGGGTCTCGCTCTCTAAACTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GGTCCCTGCCTGTGGACGTGTTCGCTGGGGTCTCGCTCTCTAAACTCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTGCACAACAATTACTTCATGTACCTCCCGGTGGCAGGGGTGCTGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTGCACAACAATTACTTCATGTACCTCCCGGTGGCAGGGGTGCTGGACCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GTTAACCTCCATCATCCAGATAGACCTCCACGGAAACCCCTGGGAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GTTAACCTCCATCATCCAGATAGACCTCCACGGAAACCCCTGGGAGTGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CCTGCACAATTGTGCCTTTCAAGCAGTGGGCAGAACGCTTGGGTTCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CCTGCACAATTGTGCCTTTCAAGCAGTGGGCAGAACGCTTGGGTTCCGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GTGCTGATGAGCGACCTCAAGTGTGAGACGCCGGTGAACTTCTTTAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GTGCTGATGAGCGACCTCAAGTGTGAGACGCCGGTGAACTTCTTTAGAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GGATTTCATGCTCCTCTCCAATGACGAGATCTGCCCTCAGCTGTACGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GGATTTCATGCTCCTCTCCAATGACGAGATCTGCCCTCAGCTGTACGCTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GGATCTCGCCCACGTTAACTTCGCACAGTAAAAACAGCACTGGGTTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GGATCTCGCCCACGTTAACTTCGCACAGTAAAAACAGCACTGGGTTGGCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GAGACCGGGACGCACTCCAACTCCTACCTAGACACCAGCAGGGTGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GAGACCGGGACGCACTCCAACTCCTACCTAGACACCAGCAGGGTGTCCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 CTCGGTGTTGGTCCCGGGACTGCTGCTGGTGTTTGTCACCTCCGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 CTCGGTGTTGGTCCCGGGACTGCTGCTGGTGTTTGTCACCTCCGCCTTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CCGTGGTGGGCATGCTCGTGTTTATCCTGAGGAACCGAAAGCGGTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CCGTGGTGGGCATGCTCGTGTTTATCCTGAGGAACCGAAAGCGGTCCAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 AGACGAGATGCCAACTCCTCCGCGTCCGAGATTAATTCCCTACAGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 AGACGAGATGCCAACTCCTCCGCGTCCGAGATTAATTCCCTACAGACAGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CTGTGACTCTTCCTACTGGCACAATGGGCCTTACAACGCAGATGGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CTGTGACTCTTCCTACTGGCACAATGGGCCTTACAACGCAGATGGGGCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .
   2051 ACAGAGTGTATGACTGTGGCTCTCACTCGCTCTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 ACAGAGTGTATGACTGTGGCTCTCACTCGCTCTCAGAC