seq1 = pF1KA1909.tfa, 3813 bp
seq2 = pF1KA1909/gi568815593f_40308.tfa (gi568815593f:40308_282320), 242013 bp

>pF1KA1909 3813
>gi568815593f:40308_282320 (Chr5)

1-409  (100001-100409)   100% ->
410-619  (102740-102949)   100% ->
620-743  (103073-103196)   100% ->
744-837  (104520-104613)   100% ->
838-924  (111206-111292)   100% ->
925-1041  (114568-114684)   100% ->
1042-1140  (115038-115136)   100% ->
1141-1280  (115764-115903)   100% ->
1281-1419  (116466-116604)   100% ->
1420-1581  (121476-121637)   100% ->
1582-2408  (122415-123241)   99% ->
2409-2661  (129033-129285)   100% ->
2662-2751  (130736-130825)   100% ->
2752-2982  (130907-131137)   100% ->
2983-3153  (132590-132760)   100% ->
3154-3334  (133611-133791)   99% ->
3335-3496  (141207-141368)   98% ->
3497-3813  (141697-142013)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCCTTGCGGAACCCCATGCCCCTGGGCAGCTCTGAGGAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGCCTTGCGGAACCCCATGCCCCTGGGCAGCTCTGAGGAGGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGGACCTGGCCTGCAGCTCCCTGACTGGAGCCAGCAGGGACCTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGGACCTGGCCTGCAGCTCCCTGACTGGAGCCAGCAGGGACCTGGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGGGGCAGTAGCCAGTGGGACCCAGGAGGAAACCTCTGGCCCCCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGGGGCAGTAGCCAGTGGGACCCAGGAGGAAACCTCTGGCCCCCGGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCCCCAACAGACCCCAAGTCTAGAGAAGGAGAGGCACACACCCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACCCCCAACAGACCCCAAGTCTAGAGAAGGAGAGGCACACACCCAGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACAGGTCCAGGAGCTGCAGGGCGGACTCTTCCCAGGAGATCTCGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACAGGTCCAGGAGCTGCAGGGCGGACTCTTCCCAGGAGATCTCGGTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGAAAGGGCACCCAGAAGCTCCAGAGGGGCCCAGGCTGCAGCCTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGAAAGGGCACCCAGAAGCTCCAGAGGGGCCCAGGCTGCAGCCTGCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCTCCCACCACTCAGCAGGCTCCAGGCCTGGGGGCCACCTAGGAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCTCCCACCACTCAGCAGGCTCCAGGCCTGGGGGCCACCTAGGAGGACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCTGTGGGGACCCCAAACTGTGTCCCAGTAGAGGGTCCCGGCTGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCTGTGGGGACCCCAAACTGTGTCCCAGTAGAGGGTCCCGGCTGCACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAGAGGAAG         ACGTTCTTGCATCCTCAGCCTGTGTCAGCACA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAGAGGAAGGTA...CAGACGTTCTTGCATCCTCAGCCTGTGTCAGCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GACGGCGGCAGCCTCCATTGCCACAACCCCAGCGGGCCTTCCGATGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102772 GACGGCGGCAGCCTCCATTGCCACAACCCCAGCGGGCCTTCCGATGTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGCCCGGCAGCCACACCCCGAGCAAGAAGGGTGGCCACCCGGCACAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102822 TGCCCGGCAGCCACACCCCGAGCAAGAAGGGTGGCCACCCGGCACAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACTTCCCCAGCCAGGTGCCCAAGCAGGTGCTGGACGTCAGTCAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102872 ACTTCCCCAGCCAGGTGCCCAAGCAGGTGCTGGACGTCAGTCAGGAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTGCAGTCCGGGGTCGTCACCCTCCCAG         GGACCCGAGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102922 CTGCAGTCCGGGGTCGTCACCCTCCCAGGTG...CAGGGACCCGAGACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCATGGCAGAGCAGTGGTGCAGGTCCGCACCAGGAGCCTGCTCTGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103086 TCATGGCAGAGCAGTGGTGCAGGTCCGCACCAGGAGCCTGCTCTGGACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GGGAACACTCGTCCTGTGCTGAGCTGACCCGCCTGCTGCTGTACTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103136 GGGAACACTCGTCCTGTGCTGAGCTGACCCGCCTGCTGCTGTACTTCCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGCATCCCCAG         GAAAGAGGTCCGGGACCTGGGGCTGGTTGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103186 AGCATCCCCAGGTG...CAGGAAAGAGGTCCGGGACCTGGGGCTGGTTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCTGGTGGATGCACGCAGGAGTCCAGCTGCCCCTGCCGTCTCCCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104550 CCTGGTGGATGCACGCAGGAGTCCAGCTGCCCCTGCCGTCTCCCAGGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCTCAGGATTGCAG         AACAACACATCTCCTATAATTCATAGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104600 TCTCAGGATTGCAGGTA...CAGAACAACACATCTCCTATAATTCATAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATCTTGCTGTTGGTAGATAAAGAATCTGCATTTAGGCCTGACAAGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111233 ATCTTGCTGTTGGTAGATAAAGAATCTGCATTTAGGCCTGACAAGGATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AATAATTCAG         TGTGAGGTCGTGAGCTCCCTGAAGGCCGTGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111283 AATAATTCAGGTA...CAGTGTGAGGTCGTGAGCTCCCTGAAGGCCGTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACAAATTTGTTGACAGCTGCCAGCTGACCGCAGACCTCGACGGCTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114599 ACAAATTTGTTGACAGCTGCCAGCTGACCGCAGACCTCGACGGCTCCTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCCTACAGCCATGGTGACTGGATCTGCTTCCGTCAG         AGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 114649 CCCTACAGCCATGGTGACTGGATCTGCTTCCGTCAGGTA...CAGAGGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGAACACTTCGCTGCAAACTGTGAAGAAGCCATCATTTTCCTACAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115043 GGAACACTTCGCTGCAAACTGTGAAGAAGCCATCATTTTCCTACAGAATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CATTCTGCTCCCTGAACACCCACAGAACCCCAAGAACAGCCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 115093 CATTCTGCTCCCTGAACACCCACAGAACCCCAAGAACAGCCCAGGTG...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1141    GAAGTCGCCGAGTTAATTGACCAGCATGAGACGATGATGAAGCTTGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115761 CAGGAAGTCGCCGAGTTAATTGACCAGCATGAGACGATGATGAAGCTTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CCTGGAAGACCCACTGCTTGTGTCTCTCAGGCTGGAGGGGGGCACCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115811 CCTGGAAGACCCACTGCTTGTGTCTCTCAGGCTGGAGGGGGGCACCGTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TGGCGCGGCTGAGGAGAGAAGAGCTTGGCACAGAAGACAGCCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 115861 TGGCGCGGCTGAGGAGAGAAGAGCTTGGCACAGAAGACAGCCGGTG...C

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1281   GGACACCCTGGAGGCCGCCACAAGCCTGTACGACCGAGTGGATGAGGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116464 AGGGACACCCTGGAGGCCGCCACAAGCCTGTACGACCGAGTGGATGAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGTGCACAGGCTGGTCCTCACCTCGAACAATCGTCTCCAGCAGCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116514 GGTGCACAGGCTGGTCCTCACCTCGAACAATCGTCTCCAGCAGCTGGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ACCTCCGGGAGCTGGCGTCACTCCTGGAAGGGAATGACCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 116564 ACCTCCGGGAGCTGGCGTCACTCCTGGAAGGGAATGACCAGGTC...CAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CAATCCTGCCAGAAAGGACTACAGCTGGCGAAGGAGAACCCGCAACGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121476 CAATCCTGCCAGAAAGGACTACAGCTGGCGAAGGAGAACCCGCAACGTAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 AGAGGAAATGGTCCAGGATTTCAGAAGGGGCCTGAGCGCCGTGGTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121526 AGAGGAAATGGTCCAGGATTTCAGAAGGGGCCTGAGCGCCGTGGTCAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AGGCTGAGTGCAGGGAGGGAGAGCTGGCCAGGTGGACCCGCTCGTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121576 AGGCTGAGTGCAGGGAGGGAGAGCTGGCCAGGTGGACCCGCTCGTCCGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TTGTGCGAGACG         GTGAGCAGCTGGATGGGGCCCCTGGACCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 121626 TTGTGCGAGACGGTA...CAGGTGAGCAGCTGGATGGGGCCCCTGGACCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GGAGGCTTGTCCCTCCTCACCCGTGGCTGAGTGTTTGAGGAGCTGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122444 GGAGGCTTGTCCCTCCTCACCCGTGGCTGAGTGTTTGAGGAGCTGTCACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AGGAGGCTACCTCGGTGGCTGCAGAGGCCTTCCCCGGGGCAGGTGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122494 AGGAGGCTACCTCGGTGGCTGCAGAGGCCTTCCCCGGGGCAGGTGTGGCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GTGCTGAAGCCTCATGCCCTGGGGAAACCGTGGGCATCACAGCAAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122544 GTGCTGAAGCCTCATGCCCTGGGGAAACCGTGGGCATCACAGCAAGACCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GTGGCTGCAGTACCCCCAGACCCGGCTCCGTCTGGAAGAGGCCCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122594 GTGGCTGCAGTACCCCCAGACCCGGCTCCGTCTGGAAGAGGCCCTTTCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 AGGCTGCCCCAGACCCCAGCTTACCGCCCCTTGCCCAGAGCCCCCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122644 AGGCTGCCCCAGACCCCAGCTTACCGCCCCTTGCCCAGAGCCCCCCAAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CATGAGCGTGCCCAGGAGGCCATGAGGAGGCACCAGAAGCCACCCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122694 CATGAGCGTGCCCAGGAGGCCATGAGGAGGCACCAGAAGCCACCCTCATT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CCCCAGCACGGACAGTGGGGGTGGTGCCTGGGAACCTGCCCAACCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 122744 CCCCAGCACGGACAGTGGGGGTGGTGCCTGGGAACCTGCGCAACCACTGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 CCGGCCTCCCTGGACGAGCGCTTCTGTGTGGACAGGACGGGGAGCCCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 122794 CCGGCCTCCCTGGACGAGCGCTTCTGTGTGGACAGGACGGGGAGACCCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GGCCCAGGGCTGTGTGCTCTGTGGGACCCACTGTCCCTCCTCAGGGGCCT
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122844 CGCCCAGGGCTGTGTGCTCTGTGGGACCCACTGTCCCTCCTCAGGGGCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 TCCAGGGGCAGGGGCCACCACGGCCCACCTGGAGGACAGCTCTGCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122894 TCCAGGGGCAGGGGCCACCACGGCCCACCTGGAGGACAGCTCTGCCTGTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 CCTCTGAGCCCACCCAGACCCTGGCCAGCCGCCCCAGGAAACATCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122944 CCTCTGAGCCCACCCAGACCCTGGCCAGCCGCCCCAGGAAACATCCCCAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 AAGAAAATGATAAAGAAAACGCAAAGTTTCGAGATACCTCAGCCCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122994 AAGAAAATGATAAAGAAAACGCAAAGTTTCGAGATACCTCAGCCCGACAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 TGGCCCCAGGGACTCCTGCCAGCCAGACCATACTAGTGTCTTCAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123044 TGGCCCCAGGGACTCCTGCCAGCCAGACCATACTAGTGTCTTCAGCAAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 GCCTGGAGGTAACCAGCACTGTAGCCACAGAGAAGAAGCTCCCGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123094 GCCTGGAGGTAACCAGCACTGTAGCCACAGAGAAGAAGCTCCCGCTGTGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 CAGCATGCCAGGAGCCCCCCGGTCACTCAGAGCCGGAGTCTGTCCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123144 CAGCATGCCAGGAGCCCCCCGGTCACTCAGAGCCGGAGTCTGTCCTCCCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2361 CTCGGGGCTCCACCCTGCTGAGGAGGATGGGAGGCAGCAGGTGGGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 123194 CTCGGGGCTCCACCCTGCTGAGGAGGATGGGAGGCAGCAGGTGGGCAGGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2409        CAGCCGACTGAGGCACATCATGGCCGAGATGATCGCCACAGAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123244 G...CAGCAGCCGACTGAGGCACATCATGGCCGAGATGATCGCCACAGAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2452 AGGGAGTACATTCGGTGCTTAGGATACGTCATTGACAACTATTTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129076 AGGGAGTACATTCGGTGCTTAGGATACGTCATTGACAACTATTTTCCAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2502 AATGGAAAGAATGGACTTGCCCCAGGGCCTTCGAGGGAAGCACCACGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129126 AATGGAAAGAATGGACTTGCCCCAGGGCCTTCGAGGGAAGCACCACGTTA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2552 TTTTCGGCAACTTGGAGAAGCTCCACGACTTCCACCAGCAGCACTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129176 TTTTCGGCAACTTGGAGAAGCTCCACGACTTCCACCAGCAGCACTTCCTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2602 CGGGAGCTGGAGCGCTGCCAGCACTGCCCCTTGGCCGTGGGCCGCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129226 CGGGAGCTGGAGCGCTGCCAGCACTGCCCCTTGGCCGTGGGCCGCAGTTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 CCTGAGACAC         GAAGAGCAGTTTGGGATGTACGTGATCTACA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 129276 CCTGAGACACGTA...CAGGAAGAGCAGTTTGGGATGTACGTGATCTACA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2693 GCAAAAACAAGCCGCAGTCGGATGCCCTGCTCAGCAGCCATGGCAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130767 GCAAAAACAAGCCGCAGTCGGATGCCCTGCTCAGCAGCCATGGCAACGCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2743 TTCTTCAAG         GACAAGCAGCGGGAGCTAGGTGACAAAATGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 130817 TTCTTCAAGGTC...CAGGACAAGCAGCGGGAGCTAGGTGACAAAATGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2784 CCTGGCCTCCTACCTGCTGCGGCCCGTGCAGCGTGTGGCCAAGTACGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130939 CCTGGCCTCCTACCTGCTGCGGCCCGTGCAGCGTGTGGCCAAGTACGCGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2834 TGCTACTCCAGGACCTGCTCAAGGAGGCCAGCTGTGGCCTGGCCCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130989 TGCTACTCCAGGACCTGCTCAAGGAGGCCAGCTGTGGCCTGGCCCAGGGG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2884 CAGGAGCTGGGCGAGCTCCGAGCCGCCGAGGTCGTGGTCTGCTTCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131039 CAGGAGCTGGGCGAGCTCCGAGCCGCCGAGGTCGTGGTCTGCTTCCAGCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2934 GCGTCACGGCAATGACCTGCTGGCCATGGACGCCATCCGCGGCTGTGAC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 131089 GCGTCACGGCAATGACCTGCTGGCCATGGACGCCATCCGCGGCTGTGACG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2983         GTGAATTTGAAGGAACAGGGGCAGCTGAGATGCCGGGATGAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131139 TA...CAGGTGAATTTGAAGGAACAGGGGCAGCTGAGATGCCGGGATGAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3025 TTTATCGTTTGCTGCGGGAGGAAGAAGTATCTGAGGCATGTGTTCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132632 TTTATCGTTTGCTGCGGGAGGAAGAAGTATCTGAGGCATGTGTTCCTCTT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3075 TGAAGACCTCATCCTGTTTAGCAAGACCCAGAAGGTGGAGGGCAGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132682 TGAAGACCTCATCCTGTTTAGCAAGACCCAGAAGGTGGAGGGCAGCCACG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3125 ACGTCTACCTGTACAAGCAGTCCTTCAAG         ACGGCCGAGATC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 132732 ACGTCTACCTGTACAAGCAGTCCTTCAAGGTA...CAGACGGCCGAGATC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3166 GGGATGACAGAGAACGTCGGGGACAGTGGCTTGAGGTTTGAGATTTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133623 GGGATGACAGAGAACGTCGGGGACAGTGGCTTGAGGTTTGAGATTTGGTT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3216 TCGCAGGCGGCAGAAATCTCAGGACACCTACATTCTCCAAGCAAGCTCGG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133673 TCGCAGGCGGCGGAAATCTCAGGACACCTACATTCTCCAAGCAAGCTCGG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3266 CAGAGGTCAAGAGTGCATGGACCGATGTCATAGGGAGGATCCTGTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133723 CAGAGGTCAAGAGTGCATGGACCGATGTCATAGGGAGGATCCTGTGGCGG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3316 CAGGCACTAAAGAGCAGAG         AACTCAGAATCCAAGAAATGGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 133773 CAGGCACTAAAGAGCAGAGGTG...TAGAACTCAGAATCCAAGAAATGGC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3357 ATCCATGGGGATAGGCAACCAGCCATTCATGGATGTCAAGCCCAGAGACC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141229 ATCCATGGGTATAGGCAACCAGCCATTCATGGATGTCAAGCCCAGAGACC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3407 GGACCCCTGACTGTGCAGTGATAAGCGACGGGGCTCCCAAATGTGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 141279 GGACCCCTGACTGTGCAGTGATAAGCGACCGGGCTCCCAAATGTGCAGTG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3457 ATGAGCGACCGGGTCCCCGACAGCATCGTCAAGGGCACAG         A
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 141329 ATGAGCGACCGAGTCCCCGACAGCATCGTCAAGGGCACAGGTA...CAGA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3498 GTCACAAATGAGAGGGTCCACAGCGGTGTCCTCCTCTGACCACGCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141698 GTCACAAATGAGAGGGTCCACAGCGGTGTCCTCCTCTGACCACGCCGCCC

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3548 CCTTCAAGCGACCACACTCCACCATCTCAGACAGCAGCACCTCCTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141748 CCTTCAAGCGACCACACTCCACCATCTCAGACAGCAGCACCTCCTCTTCT

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3598 AGCAGCCAGTCCTCCTCCATCCTGGGGTCGCTGGGCCTGCTTGTGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141798 AGCAGCCAGTCCTCCTCCATCCTGGGGTCGCTGGGCCTGCTTGTGTCCTC

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3648 CAGCCCAGCCCACCCGGGCCTATGGAGCCCTGCCCACAGCCCCTGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141848 CAGCCCAGCCCACCCGGGCCTATGGAGCCCTGCCCACAGCCCCTGGTCAT

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3698 CTGATATCAGAGCCTGCGTCGAGGAAGATGAGCCAGAGCCAGAACTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141898 CTGATATCAGAGCCTGCGTCGAGGAAGATGAGCCAGAGCCAGAACTAGAG

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3748 ACGGGCACCCAGGCTGCAGTGTGTGAGGGGGCTCCTGCTGTGCTGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141948 ACGGGCACCCAGGCTGCAGTGTGTGAGGGGGCTCCTGCTGTGCTGCTGAG

   3950     .    :    .
   3798 CCGCACACGCCAGGCC
        ||||||||||||||||
 141998 CCGCACACGCCAGGCC