Result of SIM4 for
pF1KA1885
seq1 = pF1KA1885.tfa, 3189 bp
seq2 = pF1KA1885/gi568815592f_30814837.tfa (gi568815592f:30814837_31026207), 211371 bp
>pF1KA1885 3189
>gi568815592f:30814837_31026207 (Chr6)
1-201 (100001-100201) 100% ->
202-283 (100320-100401) 100% ->
284-384 (100519-100619) 100% ->
385-506 (100910-101031) 100% ->
507-573 (101145-101211) 100% ->
574-671 (101316-101413) 100% ->
672-753 (102042-102123) 100% ->
754-873 (102269-102388) 100% ->
874-985 (102859-102970) 100% ->
986-1074 (103991-104079) 100% ->
1075-1165 (104922-105012) 100% ->
1166-1293 (105253-105380) 100% ->
1294-1397 (105497-105600) 100% ->
1398-1479 (105832-105913) 100% ->
1480-1556 (106229-106305) 100% ->
1557-1632 (106394-106469) 100% ->
1633-1735 (106753-106855) 100% ->
1736-1806 (107089-107159) 100% ->
1807-1932 (107280-107405) 100% ->
1933-2037 (107614-107718) 100% ->
2038-2106 (107870-107938) 100% ->
2107-2185 (108062-108140) 100% ->
2186-2313 (108268-108395) 100% ->
2314-2466 (108517-108669) 100% ->
2467-2673 (109518-109724) 100% ->
2674-2785 (110438-110549) 100% ->
2786-2961 (110708-110883) 100% ->
2962-3090 (111044-111172) 99% ->
3091-3189 (111273-111371) 98%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCTCATTTGCCTCTCGCCTCTTTTCGACCACCATTTTGGGGGCTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCCTCATTTGCCTCTCGCCTCTTTTCGACCACCATTTTGGGGGCTGAG
50 . : . : . : . : . :
51 GCACTCACGGGGCCTCCCCAGGTTTCACTCCGTTTCTACACAGTCGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GCACTCACGGGGCCTCCCCAGGTTTCACTCCGTTTCTACACAGTCGGAGC
100 . : . : . : . : . :
101 CCCATGGATCTCCCATCTCCCGGAGGAACCGTGAAGCCAAACAGAAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CCCATGGATCTCCCATCTCCCGGAGGAACCGTGAAGCCAAACAGAAGCGC
150 . : . : . : . : . :
151 CTGCGAGAGAAGCAGGCGACTCTGGAGGCTGAGATAGCAGGGGAGAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CTGCGAGAGAAGCAGGCGACTCTGGAGGCTGAGATAGCAGGGGAGAGCAA
200 . : . : . : . : . :
201 G TCACCTGCAGAATCCATTAAGGCCTGGAGGCCTAAGGAGT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GGTT...CAGTCACCTGCAGAATCCATTAAGGCCTGGAGGCCTAAGGAGT
250 . : . : . : . : . :
242 TAGTATTGTATGAAATCCCTACGAAACCCGGTGAAAAGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
100360 TAGTATTGTATGAAATCCCTACGAAACCCGGTGAAAAGAAAGGTA...CA
300 . : . : . : . : . :
284 ATGTCTCTGGGCCCCTGCCTCCTGCATACAGCCCCCGATATGTTGAGGC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100518 GATGTCTCTGGGCCCCTGCCTCCTGCATACAGCCCCCGATATGTTGAGGC
350 . : . : . : . : . :
333 TGCCTGGTACCCGTGGTGGGTACGAGAGGGCTTCTTCAAACCAGAATATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100568 TGCCTGGTACCCGTGGTGGGTACGAGAGGGCTTCTTCAAACCAGAATATC
400 . : . : . : . : . :
383 AG GCCCGGCTGCCCCAAGCTACAGGGGAGACCTTTTCCATG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100618 AGGTT...TAGGCCCGGCTGCCCCAAGCTACAGGGGAGACCTTTTCCATG
450 . : . : . : . : . :
424 TGTATCCCACCTCCCAATGTCACTGGCTCCCTGCACATTGGCCACGCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100949 TGTATCCCACCTCCCAATGTCACTGGCTCCCTGCACATTGGCCACGCACT
500 . : . : . : . : . :
474 CACGGTGGCCATACAGGATGCCCTCGTGCGCTG GCACCGGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
100999 CACGGTGGCCATACAGGATGCCCTCGTGCGCTGGTG...CAGGCACCGGA
550 . : . : . : . : . :
515 TGCGTGGGGATCAAGTGCTGTGGGTCCCTGGTTCAGATCATGCAGGAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101153 TGCGTGGGGATCAAGTGCTGTGGGTCCCTGGTTCAGATCATGCAGGAATT
600 . : . : . : . : . :
565 GCTACACAA GCTGTGGTGGAGAAACAACTGTGGAAGGAACG
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
101203 GCTACACAAGTA...CAGGCTGTGGTGGAGAAACAACTGTGGAAGGAACG
650 . : . : . : . : . :
606 GGGAGTGAGGAGACATGAGCTGAGCCGGGAGGCCTTCCTTAGGGAGGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101348 GGGAGTGAGGAGACATGAGCTGAGCCGGGAGGCCTTCCTTAGGGAGGTGT
700 . : . : . : . : . :
656 GGCAGTGGAAGGAGGC GAAAGGTGGAGAGATCTGTGAGCAG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
101398 GGCAGTGGAAGGAGGCGTG...CAGGAAAGGTGGAGAGATCTGTGAGCAG
750 . : . : . : . : . :
697 CTGCGAGCTCTGGGTGCCTCCCTGGACTGGGATCGAGAGTGTTTTACCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102067 CTGCGAGCTCTGGGTGCCTCCCTGGACTGGGATCGAGAGTGTTTTACCAT
800 . : . : . : . : . :
747 GGATGTT GGCTCCTCAGTGGCTGTGACTGAAGCTTTTGTGC
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
102117 GGATGTTGTG...CAGGGCTCCTCAGTGGCTGTGACTGAAGCTTTTGTGC
850 . : . : . : . : . :
788 GGCTCTACAAGGCGGGGTTGCTGTACCGGAACCATCAGCTTGTCAACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102303 GGCTCTACAAGGCGGGGTTGCTGTACCGGAACCATCAGCTTGTCAACTGG
900 . : . : . : . : . :
838 TCATGTGCTTTAAGATCAGCCATCTCGGACATTGAG GTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
102353 TCATGTGCTTTAAGATCAGCCATCTCGGACATTGAGGTG...CAGGTGGA
950 . : . : . : . : . :
879 GAACCGGCCCCTGCCTGGCCACACACAGCTTCGACTGCCTGGCTGCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102864 GAACCGGCCCCTGCCTGGCCACACACAGCTTCGACTGCCTGGCTGCCCCA
1000 . : . : . : . : . :
929 CCCCCGTGTCTTTTGGCCTCCTATTTTCTGTTGCCTTCCCCGTGGATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102914 CCCCCGTGTCTTTTGGCCTCCTATTTTCTGTTGCCTTCCCCGTGGATGGA
1050 . : . : . : . : . :
979 GAGCCTG ATGCAGAGGTTGTGGTAGGAACCACAAGGCCAGA
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
102964 GAGCCTGGTG...CAGATGCAGAGGTTGTGGTAGGAACCACAAGGCCAGA
1100 . : . : . : . : . :
1020 GACGCTGCCTGGAGATGTGGCTGTGGCCGTTCATCCAGACGACTCGCGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104025 GACGCTGCCTGGAGATGTGGCTGTGGCCGTTCATCCAGACGACTCGCGAT
1150 . : . : . : . : . :
1070 ACACA CATCTACACGGGCGACAGCTTCGTCACCCCTTGATG
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104075 ACACAGTA...CAGCATCTACACGGGCGACAGCTTCGTCACCCCTTGATG
1200 . : . : . : . : . :
1111 GGGCAGCCTCTTCCCCTCATCACAGACTATGCTGTTCAGCCACATGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104958 GGGCAGCCTCTTCCCCTCATCACAGACTATGCTGTTCAGCCACATGTGGG
1250 . : . : . : . : . :
1161 CACGG GGGCAGTGAAGGTGACTCCAGCTCACAGTCCTGCCG
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105008 CACGGGTG...AAGGGGCAGTGAAGGTGACTCCAGCTCACAGTCCTGCCG
1300 . : . : . : . : . :
1202 ATGCTGAGATGGGGGCCCGACATGGCTTGAGCCCCTTGAATGTCATTGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105289 ATGCTGAGATGGGGGCCCGACATGGCTTGAGCCCCTTGAATGTCATTGCG
1350 . : . : . : . : . :
1252 GAGGATGGGACCATGACCTCCCTCTGCGGGGACTGGCTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
105339 GAGGATGGGACCATGACCTCCCTCTGCGGGGACTGGCTGCAGGTG...CA
1400 . : . : . : . : . :
1294 GGTCTTCACCGGTTTGTGGCCCGGGAAAAGATAATGTCTGTGCTGAGTG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105496 GGGTCTTCACCGGTTTGTGGCCCGGGAAAAGATAATGTCTGTGCTGAGTG
1450 . : . : . : . : . :
1343 AATGGGGCCTGTTCCGGGGCCTCCAGAACCACCCCATGGTACTGCCCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105546 AATGGGGCCTGTTCCGGGGCCTCCAGAACCACCCCATGGTACTGCCCATC
1500 . : . : . : . : . :
1393 TGCAG CCGTTCTGGGGATGTGATAGAATACCTGCTGAAGAA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105596 TGCAGGTA...CAGCCGTTCTGGGGATGTGATAGAATACCTGCTGAAGAA
1550 . : . : . : . : . :
1434 CCAGTGGTTTGTCCGCTGCCAGGAAATGGGGGCCCGAGCTGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
105868 CCAGTGGTTTGTCCGCTGCCAGGAAATGGGGGCCCGAGCTGCCAAGGTG.
1600 . : . : . : . : . :
1480 GCTGTGGAGTCGGGGGCCCTGGAGCTCAGTCCCTCCTTCCACCAG
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105918 ..CAGGCTGTGGAGTCGGGGGCCCTGGAGCTCAGTCCCTCCTTCCACCAG
1650 . : . : . : . : . :
1525 AAGAACTGGCAGCACTGGTTTTCCCATATTGG GGACTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
106274 AAGAACTGGCAGCACTGGTTTTCCCATATTGGGTA...CAGGGACTGGTG
1700 . : . : . : . : . :
1566 TGTCTCCCGGCAGCTGTGGTGGGGCCATCAGATTCCAGCCTACCTGGTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106403 TGTCTCCCGGCAGCTGTGGTGGGGCCATCAGATTCCAGCCTACCTGGTTG
1750 . : . : . : . : . :
1616 TAGAGGACCATGCGCAG GGAGAAGAGGACTGTTGGGTGGTT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
106453 TAGAGGACCATGCGCAGGTG...CAGGGAGAAGAGGACTGTTGGGTGGTT
1800 . : . : . : . : . :
1657 GGGCGGTCAGAGGCTGAGGCCAGAGAGGTAGCAGCGGAACTGACAGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106777 GGGCGGTCAGAGGCTGAGGCCAGAGAGGTAGCAGCGGAACTGACAGGGAG
1850 . : . : . : . : . :
1707 GCCAGGGGCAGAGCTGACCCTGGAGAGGG ATCCTGATGTCC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
106827 GCCAGGGGCAGAGCTGACCCTGGAGAGGGGTG...CAGATCCTGATGTCC
1900 . : . : . : . : . :
1748 TAGACACATGGTTTTCTTCTGCCCTGTTCCCCTTTTCTGCCCTGGGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107101 TAGACACATGGTTTTCTTCTGCCCTGTTCCCCTTTTCTGCCCTGGGCTGG
1950 . : . : . : . : . :
1798 CCCCAAGAG ACCCCAGACCTTGCTCGTTTCTACCCCCTGTC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
107151 CCCCAAGAGGTG...TAGACCCCAGACCTTGCTCGTTTCTACCCCCTGTC
2000 . : . : . : . : . :
1839 ACTTTTGGAAACGGGCAGCGACCTTCTGCTGTTCTGGGTGGGCCGCATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107312 ACTTTTGGAAACGGGCAGCGACCTTCTGCTGTTCTGGGTGGGCCGCATGG
2050 . : . : . : . : . :
1889 TCATGTTGGGGACCCAGCTCACAGGGCAGCTGCCCTTCAGCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
107362 TCATGTTGGGGACCCAGCTCACAGGGCAGCTGCCCTTCAGCAAGGTA...
2100 . : . : . : . : . :
1933 GTGCTTCTTCATCCCATGGTTCGGGACAGGCAGGGCCGGAAGATGAG
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107611 CAGGTGCTTCTTCATCCCATGGTTCGGGACAGGCAGGGCCGGAAGATGAG
2150 . : . : . : . : . :
1980 CAAGTCCCTGGGGAATGTGCTGGACCCAAGAGACATCATCAGTGGGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107661 CAAGTCCCTGGGGAATGTGCTGGACCCAAGAGACATCATCAGTGGGGTGG
2200 . : . : . : . : . :
2030 AGATGCAG GTGCTGCAGGAAAAGCTGAGAAGCGGAAATTTG
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
107711 AGATGCAGGTG...CAGGTGCTGCAGGAAAAGCTGAGAAGCGGAAATTTG
2250 . : . : . : . : . :
2071 GACCCTGCAGAGCTGGCCATTGTGGCTGCAGCACAG AAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
107903 GACCCTGCAGAGCTGGCCATTGTGGCTGCAGCACAGGTG...CAGAAAAA
2300 . : . : . : . : . :
2112 GGACTTTCCTCACGGGATCCCTGAGTGTGGGACAGATGCCCTGAGATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108067 GGACTTTCCTCACGGGATCCCTGAGTGTGGGACAGATGCCCTGAGATTCA
2350 . : . : . : . : . :
2162 CACTCTGCTCCCATGGAGTTCAGG CGGGCGACTTGCACCTG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
108117 CACTCTGCTCCCATGGAGTTCAGGGTA...CAGCGGGCGACTTGCACCTG
2400 . : . : . : . : . :
2203 TCAGTCTCTGAGGTCCAGAGCTGCCGACATTTCTGCAACAAGATCTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108285 TCAGTCTCTGAGGTCCAGAGCTGCCGACATTTCTGCAACAAGATCTGGAA
2450 . : . : . : . : . :
2253 TGCTCTTCGCTTTATCCTCAATGCTTTAGGGGAGAAATTTGTGCCACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108335 TGCTCTTCGCTTTATCCTCAATGCTTTAGGGGAGAAATTTGTGCCACAGC
2500 . : . : . : . : . :
2303 CTGCTGAGGAG CTGTCTCCCTCCTCCCCGATGGATGCCTGG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
108385 CTGCTGAGGAGGTA...CAGCTGTCTCCCTCCTCCCCGATGGATGCCTGG
2550 . : . : . : . : . :
2344 ATCCTGAGCCGCCTTGCCCTGGCTGCCCAGGAGTGTGAGCGGGGCTTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108547 ATCCTGAGCCGCCTTGCCCTGGCTGCCCAGGAGTGTGAGCGGGGCTTCCT
2600 . : . : . : . : . :
2394 CACCCGAGAGCTCTCGCTCGTCACTCATGCCCTGCACCACTTCTGGCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108597 CACCCGAGAGCTCTCGCTCGTCACTCATGCCCTGCACCACTTCTGGCTTC
2650 . : . : . : . : . :
2444 ACAACCTCTGTGACGTCTACCTG GAGGCTGTGAAGCCCGTG
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
108647 ACAACCTCTGTGACGTCTACCTGGTG...CAGGAGGCTGTGAAGCCCGTG
2700 . : . : . : . : . :
2485 CTGTGGCACTCGCCCCGCCCCCTGGGGCCCCCTCAGGTCCTGTTCTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109536 CTGTGGCACTCGCCCCGCCCCCTGGGGCCCCCTCAGGTCCTGTTCTCCTG
2750 . : . : . : . : . :
2535 CGCTGACCTCGGCCTCCGCCTCCTGGCCCCACTGATGCCCTTCCTGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109586 CGCTGACCTCGGCCTCCGCCTCCTGGCCCCACTGATGCCCTTCCTGGCTG
2800 . : . : . : . : . :
2585 AAGAGCTCTGGCAGAGGCTGCCCCCCAGGCCTGGTTGCCCCCCTGCCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109636 AAGAGCTCTGGCAGAGGCTGCCCCCCAGGCCTGGTTGCCCCCCTGCCCCC
2850 . : . : . : . : . :
2635 AGCATCTCGGTTGCCCCCTACCCCAGCGCCTGCAGCTTG GA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
109686 AGCATCTCGGTTGCCCCCTACCCCAGCGCCTGCAGCTTGGTG...CAGGA
2900 . : . : . : . : . :
2676 GCACTGGCGCCAGCCAGAGCTGGAGCGGCGCTTCTCCCGGGTCCAAGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110440 GCACTGGCGCCAGCCAGAGCTGGAGCGGCGCTTCTCCCGGGTCCAAGAGG
2950 . : . : . : . : . :
2726 TCGTGCAGGTGCTAAGGGCTCTCCGAGCCACGTACCAGCTCACCAAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110490 TCGTGCAGGTGCTAAGGGCTCTCCGAGCCACGTACCAGCTCACCAAAGCC
3000 . : . : . : . : . :
2776 CGGCCCCGAG TGCTGCTGCAGAGCTCAGAGCCTGGGGACCA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
110540 CGGCCCCGAGGTG...CAGTGCTGCTGCAGAGCTCAGAGCCTGGGGACCA
3050 . : . : . : . : . :
2817 GGGCCTCTTCGAGGCCTTCTTGGAGCCCCTGGGCACCCTGGGCTACTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110739 GGGCCTCTTCGAGGCCTTCTTGGAGCCCCTGGGCACCCTGGGCTACTGTG
3100 . : . : . : . : . :
2867 GGGCTGTGGGCCTGTTACCCCCAGGCGCAGCAGCTCCCTCCGGCTGGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110789 GGGCTGTGGGCCTGTTACCCCCAGGCGCAGCAGCTCCCTCCGGCTGGGCC
3150 . : . : . : . : . :
2917 CAGGCTCCACTCAGTGACACGGCTCAAGTCTACATGGAGCTGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
110839 CAGGCTCCACTCAGTGACACGGCTCAAGTCTACATGGAGCTGCAGGTG..
3200 . : . : . : . : . :
2962 GGCCTGGTGGACCCGCAGATCCAGCTACCTCTGTTAGCCGCCCGAA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110889 .CAGGGCCTGGTGGACCCGCAGATCCAGCTACCTCTGTTAGCCGCCCGAA
3250 . : . : . : . : . :
3008 GGTACAAGTTGCAGAAGCAGCTTGATAGCCTCACAGCCAGGACCCCATCA
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
111090 GGTACAAGTTGCAGAAGCAGCTTGACAGCCTCACAGCCAGGACCCCATCA
3300 . : . : . : . : . :
3058 GAAGGGGAGGCAGGGACTCAGAGGCAACAAAAG CTTTCTTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
111140 GAAGGGGAGGCAGGGACTCAGAGGCAACAAAAGGTA...CAGCTTTCTTC
3350 . : . : . : . : . :
3099 CCTCCAGCTGGAATTGTCAAAACTGGACAAGGCAGCCTCTCACCTCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
111281 CCTCCAGCTGGAATTGTCAAAACTGGACAAGGCAGCCTCTCACCTCCGGC
3400 . : . : . : . :
3149 AGCTGATGGATGAGCCTCCAGCCCCAGGGAGCCCGGAGCTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111331 AGCTGATGGATGAGCCTCCAGCCCCAGGGAGCCCGGAGCTC