Result of SIM4 for
pF1KA1824
seq1 = pF1KA1824.tfa, 2826 bp
seq2 = pF1KA1824/gi568815584r_68953860.tfa (gi568815584r:68953860_69252978), 299119 bp
>pF1KA1824 2826
>gi568815584r:68953860_69252978 (Chr14)
(complement)
1-214 (100001-100214) 100% ->
215-358 (130619-130762) 100% ->
359-395 (133749-133785) 100% ->
396-535 (134701-134840) 100% ->
536-665 (136484-136613) 100% ->
666-879 (161092-161305) 100% ->
880-946 (177568-177634) 100% ->
947-1074 (190468-190595) 100% ->
1075-2826 (197368-199119) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAAGAGGAGAGCTGGCCTGGGGGGCAGCATGAGGTCAGTGGTGGGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAAGAGGAGAGCTGGCCTGGGGGGCAGCATGAGGTCAGTGGTGGGCTT
50 . : . : . : . : . :
51 CTTGTCCCAGCGGGGCTTGCATGGGGACCCCCTGCTCACTCAGGACTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTTGTCCCAGCGGGGCTTGCATGGGGACCCCCTGCTCACTCAGGACTTTC
100 . : . : . : . : . :
101 AGAGGAGACGCCTGCGGGGCTGCAGAAACCTCTACAAGAAGGACCTCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AGAGGAGACGCCTGCGGGGCTGCAGAAACCTCTACAAGAAGGACCTCCTC
150 . : . : . : . : . :
151 GGCCACTTCGGCTGTGTCAATGCCATTGAATTCTCCAACAATGGAGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GGCCACTTCGGCTGTGTCAATGCCATTGAATTCTCCAACAATGGAGGCCA
200 . : . : . : . : . :
201 GTGGCTGGTCTCAG GAGGAGATGACCGCCGGGTTCTGCTAT
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
100201 GTGGCTGGTCTCAGGTA...AAGGAGGAGATGACCGCCGGGTTCTGCTAT
250 . : . : . : . : . :
242 GGCACATGGAACAAGCCATCCACTCCAGGGTCAAGCCCATACAGCTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130646 GGCACATGGAACAAGCCATCCACTCCAGGGTCAAGCCCATACAGCTGAAA
300 . : . : . : . : . :
292 GGAGAGCACCATTCCAACATTTTTTGCCTGGCTTTCAACAGTGGGAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130696 GGAGAGCACCATTCCAACATTTTTTGCCTGGCTTTCAACAGTGGGAACAC
350 . : . : . : . : . :
342 TAAAGTGTTCTCTGGAG GCAATGATGAGCAAGTTATCCTCC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
130746 TAAAGTGTTCTCTGGAGGTA...CAGGCAATGATGAGCAAGTTATCCTCC
400 . : . : . : . : . :
383 ATGATGTTGAAAG CAGTGAGACATTGGACGTGTTTGCTCAT
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
133773 ATGATGTTGAAAGGTA...CAGCAGTGAGACATTGGACGTGTTTGCTCAT
450 . : . : . : . : . :
424 GAAGATGCAGTATATGGCTTGTCTGTGAGCCCAGTGAATGACAACATTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134729 GAAGATGCAGTATATGGCTTGTCTGTGAGCCCAGTGAATGACAACATTTT
500 . : . : . : . : . :
474 TGCCAGTTCCTCAGATGATGGCCGGGTTCTCATTTGGGACATTCGGGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134779 TGCCAGTTCCTCAGATGATGGCCGGGTTCTCATTTGGGACATTCGGGAAT
550 . : . : . : . : . :
524 CCCCCCATGGAG AGCCCTTCTGCCTGGCAAACTATCCATCA
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
134829 CCCCCCATGGAGGTA...CAGAGCCCTTCTGCCTGGCAAACTATCCATCA
600 . : . : . : . : . :
565 GCCTTTCATAGTGTCATGTTTAACCCTGTGGAGCCCAGGTTGTTGGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136513 GCCTTTCATAGTGTCATGTTTAACCCTGTGGAGCCCAGGTTGTTGGCCAC
650 . : . : . : . : . :
615 AGCCAATTCAAAGGAAGGAGTGGGACTCTGGGACATTCGAAAACCTCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136563 AGCCAATTCAAAGGAAGGAGTGGGACTCTGGGACATTCGAAAACCTCAGA
700 . : . : . : . : . :
665 G TTCTCTCCTGCGCTATGGTGGAAACCTGTCCCTCCAAAGT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136613 GGTG...CAGTTCTCTCCTGCGCTATGGTGGAAACCTGTCCCTCCAAAGT
750 . : . : . : . : . :
706 GCCATGAGTGTACGATTCAACAGCAACGGGACCCAGCTCCTGGCCCTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161132 GCCATGAGTGTACGATTCAACAGCAACGGGACCCAGCTCCTGGCCCTGAG
800 . : . : . : . : . :
756 GCGACGCCTGCCCCCTGTGCTCTATGACATCCATTCCCGCCTGCCTGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161182 GCGACGCCTGCCCCCTGTGCTCTATGACATCCATTCCCGCCTGCCTGTGT
850 . : . : . : . : . :
806 TTCAGTTTGACAATCAGGGTTACTTCAACTCATGCACCATGAAAAGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161232 TTCAGTTTGACAATCAGGGTTACTTCAACTCATGCACCATGAAAAGCTGC
900 . : . : . : . : . :
856 TGTTTTGCAGGAGATCGTGACCAG TATATCCTTTCGGGCTC
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
161282 TGTTTTGCAGGAGATCGTGACCAGGTA...CAGTATATCCTTTCGGGCTC
950 . : . : . : . : . :
897 TGATGACTTCAACCTGTACATGTGGAGAATTCCTGCAGATCCAGAAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177585 TGATGACTTCAACCTGTACATGTGGAGAATTCCTGCAGATCCAGAAGCAG
1000 . : . : . : . : . :
947 GTGGCATTGGTAGGGTGGTCAACGGAGCCTTCATGGTGCTG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177635 GCA...CAGGTGGCATTGGTAGGGTGGTCAACGGAGCCTTCATGGTGCTG
1050 . : . : . : . : . :
988 AAAGGGCATCGATCTATTGTTAACCAAGTCCGATTTAATCCCCACACCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
190509 AAAGGGCATCGATCTATTGTTAACCAAGTCCGATTTAATCCCCACACCTA
1100 . : . : . : . : . :
1038 CATGATCTGCTCTTCTGGTGTAGAAAAGATTATCAAG ATCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
190559 CATGATCTGCTCTTCTGGTGTAGAAAAGATTATCAAGGTG...CAGATCT
1150 . : . : . : . : . :
1079 GGAGCCCATACAAGCAGCCAGGATGTACTGGAGACCTCGACGGTCGGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197372 GGAGCCCATACAAGCAGCCAGGATGTACTGGAGACCTCGACGGTCGGATT
1200 . : . : . : . : . :
1129 GAGGACGATTCCCGCTGCCTCTATACCCATGAAGAGTACATCAGCCTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197422 GAGGACGATTCCCGCTGCCTCTATACCCATGAAGAGTACATCAGCCTTGT
1250 . : . : . : . : . :
1179 GCTGAACAGTGGGAGTGGCCTGTCGCATGACTACGCCAACCAGTCGGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197472 GCTGAACAGTGGGAGTGGCCTGTCGCATGACTACGCCAACCAGTCGGTCC
1300 . : . : . : . : . :
1229 AGGAAGACCCCCGGATGATGGCCTTCTTTGACTCACTGGTACGCCGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197522 AGGAAGACCCCCGGATGATGGCCTTCTTTGACTCACTGGTACGCCGAGAG
1350 . : . : . : . : . :
1279 ATCGAGGGCTGGAGCTCTGACTCAGACAGTGACCTCAGTGAGAGTACTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197572 ATCGAGGGCTGGAGCTCTGACTCAGACAGTGACCTCAGTGAGAGTACTAT
1400 . : . : . : . : . :
1329 CCTCCAACTGCACGCTGGGGTCAGCGAGCGCTCAGGCTACACTGACTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197622 CCTCCAACTGCACGCTGGGGTCAGCGAGCGCTCAGGCTACACTGACTCAG
1450 . : . : . : . : . :
1379 AGTCTTCGGCCTCATTGCCTCGCTCCCCGCCTCCCACAGTAGATGAGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197672 AGTCTTCGGCCTCATTGCCTCGCTCCCCGCCTCCCACAGTAGATGAGTCT
1500 . : . : . : . : . :
1429 GCCGACAACGCCTTCCACCTGGGGCCCCTGCGGGTCACCACCACAAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197722 GCCGACAACGCCTTCCACCTGGGGCCCCTGCGGGTCACCACCACAAACAC
1550 . : . : . : . : . :
1479 AGTAGCCTCAACTCCACCAACACCCACGTGTGAGGATGCAGCCTCTCGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197772 AGTAGCCTCAACTCCACCAACACCCACGTGTGAGGATGCAGCCTCTCGCC
1600 . : . : . : . : . :
1529 AGCAGCGTCTGTCTGCTCTGCGGCGCTACCAAGACAAACGCCTCCTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197822 AGCAGCGTCTGTCTGCTCTGCGGCGCTACCAAGACAAACGCCTCCTGGCC
1650 . : . : . : . : . :
1579 CTTTCCAATGAGTCCGATTCTGAGGAGAATGTCTGTGAGGTGGAACTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197872 CTTTCCAATGAGTCCGATTCTGAGGAGAATGTCTGTGAGGTGGAACTAGA
1700 . : . : . : . : . :
1629 CACAGATCTCTTTCCCCGGCCACGGTCACCCAGCCCCGAAGATGAATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197922 CACAGATCTCTTTCCCCGGCCACGGTCACCCAGCCCCGAAGATGAATCCA
1750 . : . : . : . : . :
1679 GCAGTTCCAGCAGCTCTAGCAGCTCTGAGGATGAGGAGGAGCTGAATGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197972 GCAGTTCCAGCAGCTCTAGCAGCTCTGAGGATGAGGAGGAGCTGAATGAA
1800 . : . : . : . : . :
1729 CGCCGAGCCTCTACCTGGCAGCGGAATGCCATGCGGCGCCGACAGAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198022 CGCCGAGCCTCTACCTGGCAGCGGAATGCCATGCGGCGCCGACAGAAGAC
1850 . : . : . : . : . :
1779 AACCCGAGAAGACAAGCCCAGTGCCCCAATCAAGCCCACCAACACTTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198072 AACCCGAGAAGACAAGCCCAGTGCCCCAATCAAGCCCACCAACACTTACA
1900 . : . : . : . : . :
1829 TTGGAGAAGACAACTATGATTACCCCCAGATCAAAGTGGATGACCTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198122 TTGGAGAAGACAACTATGATTACCCCCAGATCAAAGTGGATGACCTCTCC
1950 . : . : . : . : . :
1879 TCCTCCCCAACCTCGTCCCCTGAGCGGAGCACTTCCACGCTAGAGATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198172 TCCTCCCCAACCTCGTCCCCTGAGCGGAGCACTTCCACGCTAGAGATTCA
2000 . : . : . : . : . :
1929 ACCAAGCCGGGCATCACCAACTTCTGACATAGAATCAGTTGAGCGAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198222 ACCAAGCCGGGCATCACCAACTTCTGACATAGAATCAGTTGAGCGAAAAA
2050 . : . : . : . : . :
1979 TTTATAAAGCTTACAAGTGGCTCCGCTACTCTTATATCTCCTACTCAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198272 TTTATAAAGCTTACAAGTGGCTCCGCTACTCTTATATCTCCTACTCAAAT
2100 . : . : . : . : . :
2029 AACAAAGATGGAGAGACCTCCTTGGTGACTGGGGAGGCAGATGAAGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
198322 AACAAAGATGGAGAGACCTCCTTGGTGACCGGGGAGGCAGATGAAGGGAG
2150 . : . : . : . : . :
2079 AGCAGGAACCAGCCACAAAGACAACCCAGCCCCTTCTTCCAGTAAGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198372 AGCAGGAACCAGCCACAAAGACAACCCAGCCCCTTCTTCCAGTAAGGAAG
2200 . : . : . : . : . :
2129 CCTGTCTAAACATAGCAATGGCCCAGAGGAACCAGGACCTGCCACCTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198422 CCTGTCTAAACATAGCAATGGCCCAGAGGAACCAGGACCTGCCACCTGAA
2250 . : . : . : . : . :
2179 GGCTGCAGCAAGGACACTTTTAAAGAAGAGACTCCTAGAACTCCCAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198472 GGCTGCAGCAAGGACACTTTTAAAGAAGAGACTCCTAGAACTCCCAGCAA
2300 . : . : . : . : . :
2229 TGGCCCAGGCCATGAGCACAGCAGCCATGCTTGGGCAGAGGTGCCAGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198522 TGGCCCAGGCCATGAGCACAGCAGCCATGCTTGGGCAGAGGTGCCAGAGG
2350 . : . : . : . : . :
2279 GTACCTCTCAGGACACTGGCAATAGCGGCTCTGTAGAGCACCCTTTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198572 GTACCTCTCAGGACACTGGCAATAGCGGCTCTGTAGAGCACCCTTTTGAA
2400 . : . : . : . : . :
2329 ACCAAGAAGCTCAATGGAAAGGCCCTGAGCAGTCGGGCTGAGGAGCCGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198622 ACCAAGAAGCTCAATGGAAAGGCCCTGAGCAGTCGGGCTGAGGAGCCGCC
2450 . : . : . : . : . :
2379 TTCTCCTCCTGTCCCCAAGGCATCTGGCTCCACTCTCAACAGCGGGTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198672 TTCTCCTCCTGTCCCCAAGGCATCTGGCTCCACTCTCAACAGCGGGTCTG
2500 . : . : . : . : . :
2429 GCAACTGTCCCAGGACCCAGTCTGATGACAGTGAGGAGAGGAGCCTCGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198722 GCAACTGTCCCAGGACCCAGTCTGATGACAGTGAGGAGAGGAGCCTCGAA
2550 . : . : . : . : . :
2479 ACCATCTGTGCCAACCACAACAATGGACGCTTACACCCTCGTCCCCCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198772 ACCATCTGTGCCAACCACAACAATGGACGCTTACACCCTCGTCCCCCTCA
2600 . : . : . : . : . :
2529 CCCTCACAATAACGGGCAGAACTTGGGGGAGCTGGAGGTGGTGGCCTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198822 CCCTCACAATAACGGGCAGAACTTGGGGGAGCTGGAGGTGGTGGCCTACT
2650 . : . : . : . : . :
2579 CTTCCCCAGGACACTCAGACACTGACCGTGATAACTCGTCCCTGACAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198872 CTTCCCCAGGACACTCAGACACTGACCGTGATAACTCGTCCCTGACAGGG
2700 . : . : . : . : . :
2629 ACACTCCTACACAAAGATTGTTGCGGGTCTGAAATGGCCTGTGAGACCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198922 ACACTCCTACACAAAGATTGTTGCGGGTCTGAAATGGCCTGTGAGACCCC
2750 . : . : . : . : . :
2679 CAATGCTGGAACAAGAGAGGACCCCACTGACACCCCAGCCACAGATAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198972 CAATGCTGGAACAAGAGAGGACCCCACTGACACCCCAGCCACAGATAGTA
2800 . : . : . : . : . :
2729 GCAGGGCTGTTCATGGCCACAGTGGCCTCAAAAGGCAACGAATTGAATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199022 GCAGGGCTGTTCATGGCCACAGTGGCCTCAAAAGGCAACGAATTGAATTG
2850 . : . : . : . : .
2779 GAAGATACAGATTCAGAGAATTCCTCCTCAGAGAAGAAATTAAAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199072 GAAGATACAGATTCAGAGAATTCCTCCTCAGAGAAGAAATTAAAAACA