Result of SIM4 for
pF1KA1779
seq1 = pF1KA1779.tfa, 3630 bp
seq2 = pF1KA1779/gi568815597f_7684878.tfa (gi568815597f:7684878_7942752), 257875 bp
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>gi568815597f:7684878_7942752 (Chr1)
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0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCCCGCGGGGAAGCTCCTGGCCCCGGGAGACGGGGGGCTAAGGACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCCCCGCGGGGAAGCTCCTGGCCCCGGGAGACGGGGGGCTAAGGACGA
50 . : . : . : . : . :
51 GGCCCTGGGCGAAGAATCGGGGGAGCGGTGGAGCCCCGAGTTCCATCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GGCCCTGGGCGAAGAATCGGGGGAGCGGTGGAGCCCCGAGTTCCATCTGC
100 . : . : . : . : . :
101 AGAGGAAATTGGCGGACAGCAGCCACAG TGAACAGCAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
100101 AGAGGAAATTGGCGGACAGCAGCCACAGGTG...CAGTGAACAGCAAGAT
150 . : . : . : . : . :
142 CGAAACAGAGTTTCTGAAGAACTTATCATGGTTGTCCAAGAAATGAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100577 CGAAACAGAGTTTCTGAAGAACTTATCATGGTTGTCCAAGAAATGAAAAA
200 . : . : . : . : . :
192 ATACTTCCCCTCGGAGAGACGCAATAAACCAAGCACTCTAGATGCCCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100627 ATACTTCCCCTCGGAGAGACGCAATAAACCAAGCACTCTAGATGCCCTCA
250 . : . : . : . : . :
242 ACTATGCTCTCCGCTGTGTCCACAGCGTTCAAG CAAACAGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
100677 ACTATGCTCTCCGCTGTGTCCACAGCGTTCAAGGTA...TAGCAAACAGT
300 . : . : . : . : . :
283 GAGTTTTTCCAGATTCTCAGTCAGAATGGAGCACCTCAGGCAGATGTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101852 GAGTTTTTCCAGATTCTCAGTCAGAATGGAGCACCTCAGGCAGATGTGAG
350 . : . : . : . : . :
333 CATGTACAGTCTTGAGGAGCTGGCCACTATCGCTTCAGAACACACTTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101902 CATGTACAGTCTTGAGGAGCTGGCCACTATCGCTTCAGAACACACTTCCA
400 . : . : . : . : . :
383 AAAACACA GATACCTTTGTGGCAGTATTTTCATTTCTGTCT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
101952 AAAACACAGTA...TAGGATACCTTTGTGGCAGTATTTTCATTTCTGTCT
450 . : . : . : . : . :
424 GGAAGGTTAGTGCACATTTCTGAACAGGCTGCTTTGATCCTGAATCGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103201 GGAAGGTTAGTGCACATTTCTGAACAGGCTGCTTTGATCCTGAATCGTAA
500 . : . : . : . : . :
474 GAAAGATGTCCTGGCGTCTTCTCACTTTGTTGACCTGCTTGCACCTCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103251 GAAAGATGTCCTGGCGTCTTCTCACTTTGTTGACCTGCTTGCACCTCAAG
550 . : . : . : . : . :
524 ACATGAGGGTATTCTACGCGCACACTGCCAGAGCTCAGCTTCCTTTCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103301 ACATGAGGGTATTCTACGCGCACACTGCCAGAGCTCAGCTTCCTTTCTGG
600 . : . : . : . : . :
574 AACAACTGGACCCAAAGAG CAGCTGCACGGTATGAATGTGC
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
103351 AACAACTGGACCCAAAGAGGTA...TAGCAGCTGCACGGTATGAATGTGC
650 . : . : . : . : . :
615 TCCGGTGAAACCTTTTTTCTGCAGGATCCG TGGAGGTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
109102 TCCGGTGAAACCTTTTTTCTGCAGGATCCGGTA...CAGTGGAGGTGAAG
700 . : . : . : . : . :
656 ACAGAAAGCAAGAGAAGTGTCACTCCCCATTCCGGATCATCCCCTATCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113659 ACAGAAAGCAAGAGAAGTGTCACTCCCCATTCCGGATCATCCCCTATCTG
750 . : . : . : . : . :
706 ATTCATGTACATCACCCTGCCCAGCCAGAATTGGAATCGGAACCTTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113709 ATTCATGTACATCACCCTGCCCAGCCAGAATTGGAATCGGAACCTTGCTG
800 . : . : . : . : . :
756 TCTCACTGTGGTTGAAAAGATTCACTCTGGTTATGAAG CTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
113759 TCTCACTGTGGTTGAAAAGATTCACTCTGGTTATGAAGGTA...TAGCTC
850 . : . : . : . : . :
797 CTCGGATCCCAGTGAATAAAAGAATCTTCACCACCACACACACCCCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116239 CTCGGATCCCAGTGAATAAAAGAATCTTCACCACCACACACACCCCAGGG
900 . : . : . : . : . :
847 TGTGTTTTTCTTGAAGTAGATGAAAA AGCAGTGCCTTTGCT
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
116289 TGTGTTTTTCTTGAAGTAGATGAAAAGTA...CAGAGCAGTGCCTTTGCT
950 . : . : . : . : . :
888 GGGTTACCTACCTCAGGACCTGATTGGAACATCGATCCTAAGCTACCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118185 GGGTTACCTACCTCAGGACCTGATTGGAACATCGATCCTAAGCTACCTGC
1000 . : . : . : . : . :
938 ACCCTGAAGATCGTTCTCTGATGGTTGCCATACACCAAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
118235 ACCCTGAAGATCGTTCTCTGATGGTTGCCATACACCAAAAAGGTC...TA
1050 . : . : . : . : . :
980 TTTTGAAGTATGCAGGGCATCCTCCCTTTGAACATTCTCCCATTCGATT
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118814 GTTTTGAAGTATGCAGGGCATCCTCCCTTTGAACATTCTCCCATTCGATT
1100 . : . : . : . : . :
1029 TTGTACTCAAAACGGAGACTACATCATACTGGATTCCAGTTGGTCCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118864 TTGTACTCAAAACGGAGACTACATCATACTGGATTCCAGTTGGTCCAGCT
1150 . : . : . : . : . :
1079 TTGTGAATCCCTGGAGCCGGAAGATTTCTTTCATCATTGGTCGGCATAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118914 TTGTGAATCCCTGGAGCCGGAAGATTTCTTTCATCATTGGTCGGCATAAA
1200 . : . : . : . : . :
1129 GTTCGAAC GAGCCCACTAAATGAGGATGTTTTTGCTACCAA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
118964 GTTCGAACGTA...TAGGAGCCCACTAAATGAGGATGTTTTTGCTACCAA
1250 . : . : . : . : . :
1170 AATTAAAAAGATGAACGATAATGACAAAGACATAACAGAATTACAAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124049 AATTAAAAAGATGAACGATAATGACAAAGACATAACAGAATTACAAGAAC
1300 . : . : . : . : . :
1220 AAATTTACAAACTTCTCTTACAG CCAGTTCACGTGAGCGTG
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
124099 AAATTTACAAACTTCTCTTACAGGTA...CAGCCAGTTCACGTGAGCGTG
1350 . : . : . : . : . :
1261 TCCAGCGGCTACGGGAGCCTGGGGAGCAGCGGGTCGCAGGAGCAGCTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125034 TCCAGCGGCTACGGGAGCCTGGGGAGCAGCGGGTCGCAGGAGCAGCTTGT
1400 . : . : . : . : . :
1311 CAGCATCGCCTCCTCCAGTGAGGCCAGCGGGCACCGTGTGGAGGAGACGA
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
125084 CAGCATCGCCTCCTCCAGTGAGGCCAGTGGGCACCGTGTGGAGGAGACGA
1450 . : . : . : . : . :
1361 AGGCGGAGCAG ATGACCTTGCAGCAGGTCTATGCCAGTGTG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
125134 AGGCGGAGCAGGTG...AAGATGACCTTGCAGCAGGTCTATGCCAGTGTG
1500 . : . : . : . : . :
1402 AACAAAATTAAAAATCTGGGTCAGCAGCTCTACATTGAGTCAATGACCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125591 AACAAAATTAAAAATCTGGGTCAGCAGCTCTACATTGAGTCAATGACCAA
1550 . : . : . : . : . :
1452 ATCATCATTCAAGCCAGTGACGGGGACACGCACAGAACCGAATGGTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125641 ATCATCATTCAAGCCAGTGACGGGGACACGCACAGAACCGAATGGTGGTG
1600 . : . : . : . : . :
1502 GTGAGTCAGCGAATGGTGGTG GTGAATGTAAGACCTTTACT
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
125691 GTGAGTCAGCGAATGGTGGTGGTG...CAGGTGAATGTAAGACCTTTACT
1650 . : . : . : . : . :
1543 TCCTTCCACCAAACACTGAAAAACAATAGTGTGTACACTGAGCCCTGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134428 TCCTTCCACCAAACACTGAAAAACAATAGTGTGTACACTGAGCCCTGTGA
1700 . : . : . : . : . :
1593 GGATTTGAGGAACGATGAGCACAGCCCATCCTATCAACAGATCAACTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134478 GGATTTGAGGAACGATGAGCACAGCCCATCCTATCAACAGATCAACTGTA
1750 . : . : . : . : . :
1643 TCGACAGTGTCATCAG ATACCTGAAGAGCTACAACATTCCA
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
134528 TCGACAGTGTCATCAGGTA...CAGATACCTGAAGAGCTACAACATTCCA
1800 . : . : . : . : . :
1684 GCTTTGAAAAGAAAGTGTATCTCCTGTACAAATACAACTTCTTCCTCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135263 GCTTTGAAAAGAAAGTGTATCTCCTGTACAAATACAACTTCTTCCTCCTC
1850 . : . : . : . : . :
1734 AGAAGAAGACAAACAGAACCACAAGGCAGATGATGTCCAAGCCTTACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135313 AGAAGAAGACAAACAGAACCACAAGGCAGATGATGTCCAAGCCTTACAAG
1900 . : . : . : . : . :
1784 CTGGTTTGCAAATCCCAGCCATACCTAAATCAGAAATGCCA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135363 GTA...CAGCTGGTTTGCAAATCCCAGCCATACCTAAATCAGAAATGCCA
1950 . : . : . : . : . :
1825 ACAAATGGACGGTCCATAGACACAGGAGGAGGAGCTCCACAGATCCTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135631 ACAAATGGACGGTCCATAGACACAGGAGGAGGAGCTCCACAGATCCTGTC
2000 . : . : . : . : . :
1875 CACGGCGATGCTGAGCTTGGGGTCGGGCATAAGCCAATGCGGTTACAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135681 CACGGCGATGCTGAGCTTGGGGTCGGGCATAAGCCAATGCGGTTACAGCA
2050 . : . : . : . : . :
1925 GCACCATTGTCCATGTCCCACCCCCAGAGACAG CCAGGGAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
135731 GCACCATTGTCCATGTCCCACCCCCAGAGACAGGTA...CAGCCAGGGAT
2100 . : . : . : . : . :
1966 GCTACCCTCTTCTGTGAGCCCTGGACCCTGAACATGCAGCCAGCCCCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141611 GCTACCCTCTTCTGTGAGCCCTGGACCCTGAACATGCAGCCAGCCCCTTT
2150 . : . : . : . : . :
2016 GACCTCGGAAGAATTTAAACACGTGGGGCTCACAGCGGCTGTTCTGTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141661 GACCTCGGAAGAATTTAAACACGTGGGGCTCACAGCGGCTGTTCTGTCAG
2200 . : . : . : . : . :
2066 CGCACACCCAGAAGGAAGAGCAGAATTATGTTGATAAATTCCGAGAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141711 CGCACACCCAGAAGGAAGAGCAGAATTATGTTGATAAATTCCGAGAAAAG
2250 . : . : . : . : . :
2116 ATCCTGTCATCACCCTACAGCTCCTATCTTCAGCAAGAAAGCAGGAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141761 ATCCTGTCATCACCCTACAGCTCCTATCTTCAGCAAGAAAGCAGGAGCAA
2300 . : . : . : . : . :
2166 AGCTAAATATTCATATTTTCAAG GAGATTCTACTTCCAAGC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
141811 AGCTAAATATTCATATTTTCAAGGTA...CAGGAGATTCTACTTCCAAGC
2350 . : . : . : . : . :
2207 AGACGCGGTCGGCCGGCTGCAGGAAAGGGAAGCACAAGCGGAAGAAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142259 AGACGCGGTCGGCCGGCTGCAGGAAAGGGAAGCACAAGCGGAAGAAGCTG
2400 . : . : . : . : . :
2257 CCGGAGCCGCCAGACAGCAGCAGCTCGAACACCGGCTCTGGTCCCCGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142309 CCGGAGCCGCCAGACAGCAGCAGCTCGAACACCGGCTCTGGTCCCCGCAG
2450 . : . : . : . : . :
2307 GGGAGCGCATCAGAACGCACAGCCCTGCTGCCCCTCCGCGGCCTCCTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142359 GGGAGCGCATCAGAACGCACAGCCCTGCTGCCCCTCCGCGGCCTCCTCTC
2500 . : . : . : . : . :
2357 CGCACACCTCGAGCCCGACCTTCCCACCTGCCGCCATGGTGCCCAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142409 CGCACACCTCGAGCCCGACCTTCCCACCTGCCGCCATGGTGCCCAGCCAG
2550 . : . : . : . : . :
2407 GCCCCTTACCTCGTCCCAGCTTTTCCCCTCCCAGCCGCGACCTCACCCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142459 GCCCCTTACCTCGTCCCAGCTTTTCCCCTCCCAGCCGCGACCTCACCCGG
2600 . : . : . : . : . :
2457 AAGAGAATACGCAGCCCCCGGAACTGCACCGGAAGGCCTGCATGGGCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
142509 AAGAGAATACGCAGCCCCCGGAACTGCACCGGAAGGCCTGCATGGGCTGC
2650 . : . : . : . : . :
2507 CCTTGTCCGAGGGCTTGCAGCCTTACCCAGCTTTCCCTTTTCCTTACTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142559 CCTTGTCCGAGGGCTTGCAGCCTTACCCAGCTTTCCCTTTTCCTTACTTG
2700 . : . : . : . : . :
2557 GATACTTTTATGACCGTTTTCCTGCCTGACCCCCCTGTCTGTCCTCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142609 GATACTTTTATGACCGTTTTCCTGCCTGACCCCCCTGTCTGTCCTCTGTT
2750 . : . : . : . : . :
2607 GTCGCCATCGTTTTTGCCATGTCCATTCCTGGGGGCGACAGCCTCTTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142659 GTCGCCATCGTTTTTGCCATGTCCATTCCTGGGGGCGACAGCCTCTTCTG
2800 . : . : . : . : . :
2657 CGATATCACCCTCAATGTCGTCAGCAATGAGTCCAACTCTGGACCCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142709 CGATATCACCCTCAATGTCGTCAGCAATGAGTCCAACTCTGGACCCACCC
2850 . : . : . : . : . :
2707 CCTTCAGTCACCAGCCAAAGGAGAGAGGAGGAAAAGTGGGAGGCACAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142759 CCTTCAGTCACCAGCCAAAGGAGAGAGGAGGAAAAGTGGGAGGCACAAAG
2900 . : . : . : . : . :
2757 CGAGGGGCACCCGTTCATTACTTCGAGAAGCAGCTCACCCTTGCAGTTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142809 CGAGGGGCACCCGTTCATTACTTCGAGAAGCAGCTCACCCTTGCAGTTAA
2950 . : . : . : . : . :
2807 ACTTACTTCAGGAAGAGATGCCCAGACCCTCTGAATCTCCAGATCGGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
142859 ACTTACTTCAGGAAGAGATGCCCAGACCCTCTGAATCTCCAGATCAGATG
3000 . : . : . : . : . :
2857 AGAAGGAACACGTGCCCACAAACTGAGTAT CAGTGTGTTAC
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
142909 AGAAGGAACACGTGCCCACAAACTGAGTATGTA...TAGCAGTGTGTTAC
3050 . : . : . : . : . :
2898 AGGCAACAATGGCAGTGAGAGCAGTCCTGCTACTACCGGTGCACTGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144968 AGGCAACAATGGCAGTGAGAGCAGTCCTGCTACTACCGGTGCACTGTCCA
3100 . : . : . : . : . :
2948 CGGGGTCACCTCCCAGGGAGAATCCATCCCATCCTACTGCCAGCGCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145018 CGGGGTCACCTCCCAGGGAGAATCCATCCCATCCTACTGCCAGCGCTCTG
3150 . : . : . : . : . :
2998 TCCACAGGATCGCCTCCCATGAAGAATCCATCCCATCCTACTGCCAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145068 TCCACAGGATCGCCTCCCATGAAGAATCCATCCCATCCTACTGCCAGCGC
3200 . : . : . : . : . :
3048 TCTGTCCACGGGATCGCCTCCCATGAAGAATCCATCCCATCCTACTGCCA
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145118 TCTGTCCACAGGATCGCCTCCCATGAAGAATCCATCCCATCCTACTGCCA
3250 . : . : . : . : . :
3098 GCACACTGTCCATGGGATTGCCTCCCAGCAGGACTCCATCCCATCCTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145168 GCACACTGTCCATGGGATTGCCTCCCAGCAGGACTCCATCCCATCCTACT
3300 . : . : . : . : . :
3148 GCCACTGTTCTGTCCACGGGGTCACCTCCCAGCGAATCCCCATCCAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145218 GCCACTGTTCTGTCCACGGGGTCACCTCCCAGCGAATCCCCATCCAGAAC
3350 . : . : . : . : . :
3198 TGGTTCAGCAGCATCAG GAAGCAGCGACAGCAGTATATACC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
145268 TGGTTCAGCAGCATCAGGTA...CAGGAAGCAGCGACAGCAGTATATACC
3400 . : . : . : . : . :
3239 TTACTAGTAGTGTTTATTCTTCTAAAATCTCCCAAAATGGGCAGCAATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150909 TTACTAGTAGTGTTTATTCTTCTAAAATCTCCCAAAATGGGCAGCAATCT
3450 . : . : . : . : . :
3289 CAGGACGTACAGAAAAAAGAAACATTTCCTAATGTCGCCGAAGAGCCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150959 CAGGACGTACAGAAAAAAGAAACATTTCCTAATGTCGCCGAAGAGCCCAT
3500 . : . : . : . : . :
3339 CTGGAGAATGATACGGCAGACACCTGAGCGCATTCTCATGACATACCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151009 CTGGAGAATGATACGGCAGACACCTGAGCGCATTCTCATGACATACCAGG
3550 . : . : . : . : . :
3389 TACCTGAGAG GGTTAAAGAAGTTGTACTAAAAGAAGACCTG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
151059 TACCTGAGAGGTA...CAGGGTTAAAGAAGTTGTACTAAAAGAAGACCTG
3600 . : . : . : . : . :
3430 GAAAAGCTAGAAAGTATGAGGCAGCAGCAGCCCCAGTTTTCTCATGGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152153 GAAAAGCTAGAAAGTATGAGGCAGCAGCAGCCCCAGTTTTCTCATGGGCA
3650 . : . : . : . : . :
3480 AAAGGAGGAGCTGGCTAAGGTGTATAATTGGATTCAAAGCCAGACTGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152203 AAAGGAGGAGCTGGCTAAGGTGTATAATTGGATTCAAAGCCAGACTGTCA
3700 . : . : . : . : . :
3530 CTCAAGAAATCGACATTCAA GCCTGTGTCACTTGTGAAAAT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
152253 CTCAAGAAATCGACATTCAAGTA...GAGGCCTGTGTCACTTGTGAAAAT
3750 . : . : . : . : . :
3571 GAAGATTCAGCTGATGGTGCGGCCACATCCTGTGGTCAGGTTCTGGTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157816 GAAGATTCAGCTGATGGTGCGGCCACATCCTGTGGTCAGGTTCTGGTAGA
3800 . :
3621 AGACAGCTGT
||||||||||
157866 AGACAGCTGT