Result of SIM4 for
pF1KA1746
seq1 = pF1KA1746.tfa, 3282 bp
seq2 = pF1KA1746/gi568815582f_68743618.tfa (gi568815582f:68743618_69183658), 440041 bp
>pF1KA1746 3282
>gi568815582f:68743618_69183658 (Chr16)
1-94 (100001-100094) 100% ->
95-735 (116267-116907) 100% ->
736-852 (119328-119444) 100% ->
853-994 (123462-123603) 100% ->
995-1131 (131537-131673) 100% ->
1132-1294 (134501-134663) 100% ->
1295-1377 (136931-137013) 100% ->
1378-1490 (156817-156929) 100% ->
1491-1667 (158711-158887) 100% ->
1668-1800 (163826-163958) 100% ->
1801-1992 (165594-165785) 100% ->
1993-2127 (175468-175602) 100% ->
2128-2643 (183951-184466) 100% ->
2644-2701 (186621-186678) 100% ->
2702-2842 (230411-230551) 100% ->
2843-2994 (279211-279362) 100% ->
2995-3108 (296691-296804) 100% ->
3109-3282 (339868-340041) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGGCCCGACAGGCCGTGGGCAGCGGGGCTCAGGAGACATGCGGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCGGCCCGACAGGCCGTGGGCAGCGGGGCTCAGGAGACATGCGGTCT
50 . : . : . : . : . :
51 GGATCGGATTTTGGAGGCATTGAAGCTGCTGCTGAGCCCGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
100051 GGATCGGATTTTGGAGGCATTGAAGCTGCTGCTGAGCCCGGGAGGTG...
100 . : . : . : . : . :
95 GCTCGGGCTCAAGTTCACTACAGGTCACAAAACATGATGTCTTGTTG
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116264 AAGGCTCGGGCTCAAGTTCACTACAGGTCACAAAACATGATGTCTTGTTG
150 . : . : . : . : . :
142 GCTACTTTAAAATCTAACCTGTCTGCTTTGGAGGACAAGTTTCTGAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116314 GCTACTTTAAAATCTAACCTGTCTGCTTTGGAGGACAAGTTTCTGAAGGA
200 . : . : . : . : . :
192 TCCTCAGTGGAAGAATCTGAAACTCCTAAGAGATGAAATTGCTGATAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116364 TCCTCAGTGGAAGAATCTGAAACTCCTAAGAGATGAAATTGCTGATAAGG
250 . : . : . : . : . :
242 CAGAATGGCCACAAAACTCTGTGGATGTCACTTGGAGTTTTACCTCTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116414 CAGAATGGCCACAAAACTCTGTGGATGTCACTTGGAGTTTTACCTCTCAA
300 . : . : . : . : . :
292 ACCTTGTTGTTGCTTTTGTGCTTGAAGGAAACCATGATCCGCCTTGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116464 ACCTTGTTGTTGCTTTTGTGCTTGAAGGAAACCATGATCCGCCTTGCAGC
350 . : . : . : . : . :
342 TAATTTCAATCCAGGTAAACCCAACCCTAGGACTCCGGAAGTTGCTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116514 TAATTTCAATCCAGGTAAACCCAACCCTAGGACTCCGGAAGTTGCTCCTG
400 . : . : . : . : . :
392 CCCTGAGCCCCGATGCACTTAGTATCTCACAACAGAAGACTGTCCAGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116564 CCCTGAGCCCCGATGCACTTAGTATCTCACAACAGAAGACTGTCCAGTTC
450 . : . : . : . : . :
442 GTTTTGCAGTTTGTAGTTACCTTGGGTATCTGCCCCTATCTCATGCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116614 GTTTTGCAGTTTGTAGTTACCTTGGGTATCTGCCCCTATCTCATGCCTGG
500 . : . : . : . : . :
492 TGTTGGAGTCCCTTTGAGATATAGAACTGAATTTGGTGCCGTCGTTCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116664 TGTTGGAGTCCCTTTGAGATATAGAACTGAATTTGGTGCCGTCGTTCAAG
550 . : . : . : . : . :
542 ACGTGGTGTGTTTTGATGCTGCCCCCGATGCAACTCGAAGACTGTACACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116714 ACGTGGTGTGTTTTGATGCTGCCCCCGATGCAACTCGAAGACTGTACACC
600 . : . : . : . : . :
592 AGCTGCAAGGCCCTTCTGAATGTTGCTCAGCACACATCTCTGGGGAGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116764 AGCTGCAAGGCCCTTCTGAATGTTGCTCAGCACACATCTCTGGGGAGCTT
650 . : . : . : . : . :
642 GATCTTCTGCCACCACTTTGGGGATATCGCAGCAGGTCTGTGCCAACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116814 GATCTTCTGCCACCACTTTGGGGATATCGCAGCAGGTCTGTGCCAACTGG
700 . : . : . : . : . :
692 GATTCTGCCCAACCAAAAGAAAACTGCTAACACCTGCAGAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
116864 GATTCTGCCCAACCAAAAGAAAACTGCTAACACCTGCAGAAGAGGTA...
750 . : . : . : . : . :
736 GTTCTAACTGAAGAGGAGAGAACCCTATCCAGGGGGGCCTTGAGAGA
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119325 TAGGTTCTAACTGAAGAGGAGAGAACCCTATCCAGGGGGGCCTTGAGAGA
800 . : . : . : . : . :
783 CATGCTGGATCAAGTCTATCAGCCCTTAGCAGTCCGGGAACTGCTTATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119375 CATGCTGGATCAAGTCTATCAGCCCTTAGCAGTCCGGGAACTGCTTATCC
850 . : . : . : . : . :
833 TCCAGGGAGGACCACCCCAG TCCTGCACAGATGTGAAGACA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
119425 TCCAGGGAGGACCACCCCAGGTA...CAGTCCTGCACAGATGTGAAGACA
900 . : . : . : . : . :
874 CAGATGAGGTGTCGGGCCCCAGCTTGGCTTCGGCGTCTATGTGGACAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123483 CAGATGAGGTGTCGGGCCCCAGCTTGGCTTCGGCGTCTATGTGGACAGCT
950 . : . : . : . : . :
924 GCTCTCTGAAAGGTTAATGAGACCTAATGGTGTTCAGGCAGTAGTCCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123533 GCTCTCTGAAAGGTTAATGAGACCTAATGGTGTTCAGGCAGTAGTCCGGG
1000 . : . : . : . : . :
974 GCATTTTGGAAGGAGCAGGTG CGGGAGCAGCTGGTGGAAGT
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
123583 GCATTTTGGAAGGAGCAGGTGGTA...CAGCGGGAGCAGCTGGTGGAAGT
1050 . : . : . : . : . :
1015 GATGCTGAGGTGACGGCTGCTGACTGGAAGAAGTGTGACCTGATCGCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131557 GATGCTGAGGTGACGGCTGCTGACTGGAAGAAGTGTGACCTGATCGCAAA
1100 . : . : . : . : . :
1065 GATTTTGGCCTCTTGTCCCCAGCAGTCTCTTTCACCAGAGAATTACTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131607 GATTTTGGCCTCTTGTCCCCAGCAGTCTCTTTCACCAGAGAATTACTACA
1150 . : . : . : . : . :
1115 GGGACATCTGCCCCCAG GTTCTGGATTTATTTCACTTTCAA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
131657 GGGACATCTGCCCCCAGGTA...TAGGTTCTGGATTTATTTCACTTTCAA
1200 . : . : . : . : . :
1156 GATAAATTGACAGCACGACAATTTCAGAGAGTTGCCACCACTACCTTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134525 GATAAATTGACAGCACGACAATTTCAGAGAGTTGCCACCACTACCTTTAT
1250 . : . : . : . : . :
1206 AACTTTGTCAAGAGAACGCCCACATTTGGCAGCAAAGTATTTGCTCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134575 AACTTTGTCAAGAGAACGCCCACATTTGGCAGCAAAGTATTTGCTCCAGC
1300 . : . : . : . : . :
1256 CAGTGTTAGCTCCTCTTCATCGATGTTTGAATACAGCAG AG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
134625 CAGTGTTAGCTCCTCTTCATCGATGTTTGAATACAGCAGGTA...TAGAG
1350 . : . : . : . : . :
1297 CTTTCAGAGAGTGACATGGTACCAGGAACTATTTTGGTGACAGAAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136933 CTTTCAGAGAGTGACATGGTACCAGGAACTATTTTGGTGACAGAAGAAGA
1400 . : . : . : . : . :
1347 ACTTAGTAGATGCATTGAGGATGTGTTTAAG GTGTACGTGG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
136983 ACTTAGTAGATGCATTGAGGATGTGTTTAAGGTT...TAGGTGTACGTGG
1450 . : . : . : . : . :
1388 TTGGGAATGAACCTTTAACAGTTTTGATGGATTCCCTGCTTCCAGTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156827 TTGGGAATGAACCTTTAACAGTTTTGATGGATTCCCTGCTTCCAGTCCTG
1500 . : . : . : . : . :
1438 GGAGTGCTTTTTCTTCTCTACTGTTTTACTAAGCAGAGTGTGTCTCACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156877 GGAGTGCTTTTTCTTCTCTACTGTTTTACTAAGCAGAGTGTGTCTCACAT
1550 . : . : . : . : . :
1488 AAG GTCACTTTGCCAAGAAATCTTATTATGGATTCTGGGGA
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156927 AAGGTA...CAGGTCACTTTGCCAAGAAATCTTATTATGGATTCTGGGGA
1600 . : . : . : . : . :
1529 AGCTGGAAAGGAAGAAGGCAATTGCCAGCCTGAAAGGATTTGCAGGGTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158749 AGCTGGAAAGGAAGAAGGCAATTGCCAGCCTGAAAGGATTTGCAGGGTTG
1650 . : . : . : . : . :
1579 GACAAAGCTGTGCCCTCTCTCCATTCTCTGTGTCAGTTTAGAGTTGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158799 GACAAAGCTGTGCCCTCTCTCCATTCTCTGTGTCAGTTTAGAGTTGCCAC
1700 . : . : . : . : . :
1629 TCAAGGTGGCATTATGATTACCATCAAAGAGGCCATTAG TG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
158849 TCAAGGTGGCATTATGATTACCATCAAAGAGGCCATTAGGTG...CAGTG
1750 . : . : . : . : . :
1670 ATGAAGATGAAGATGAAGCCCTGTACCAGAAGGTATCCTCTGAGCAGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163828 ATGAAGATGAAGATGAAGCCCTGTACCAGAAGGTATCCTCTGAGCAGGGC
1800 . : . : . : . : . :
1720 CGGGTGGAGCATCTCGGGGACTTGCTGTCCCACTGCCAGGAATGCGGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163878 CGGGTGGAGCATCTCGGGGACTTGCTGTCCCACTGCCAGGAATGCGGTTT
1850 . : . : . : . : . :
1770 GGCAGGAGACTTCTTCATCTTCTGTTTGAAA GAGTTGACTC
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
163928 GGCAGGAGACTTCTTCATCTTCTGTTTGAAAGTA...TAGGAGTTGACTC
1900 . : . : . : . : . :
1811 ATGTGGCCTCGGAAAATGAAACAGAGTTAAAAACTGAGCCCTTCTCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165604 ATGTGGCCTCGGAAAATGAAACAGAGTTAAAAACTGAGCCCTTCTCCAGC
1950 . : . : . : . : . :
1861 AAGAGCCTCTTGGAATTAGAGCAACATCAGACTCTTCTTGTGGAAGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165654 AAGAGCCTCTTGGAATTAGAGCAACATCAGACTCTTCTTGTGGAAGGCCA
2000 . : . : . : . : . :
1911 AGAGCGGAAGCTGCTTGTCCTGCAGCTGATGGCTGTTCTGTGCGAGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165704 AGAGCGGAAGCTGCTTGTCCTGCAGCTGATGGCTGTTCTGTGCGAGAGAA
2050 . : . : . : . : . :
1961 TGTCTGAGCAGATATTCACAAACGTCACTCAG GTGGTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
165754 TGTCTGAGCAGATATTCACAAACGTCACTCAGGTC...TAGGTGGTGGAC
2100 . : . : . : . : . :
2002 TTTGTAGCAGCAACATTGCAGAGAGCCTGTGCAAGCCTGGCCCATCAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175477 TTTGTAGCAGCAACATTGCAGAGAGCCTGTGCAAGCCTGGCCCATCAGGC
2150 . : . : . : . : . :
2052 AGAGAGCACCGTGGAATCACAGACGCTGAGCATGTCCATGGGGCTGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175527 AGAGAGCACCGTGGAATCACAGACGCTGAGCATGTCCATGGGGCTGGTGG
2200 . : . : . : . : . :
2102 CTGTCATGCTAGGAGGAGCTGTTCAG TTGAAGTCAAGTGAT
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
175577 CTGTCATGCTAGGAGGAGCTGTTCAGGTG...TAGTTGAAGTCAAGTGAT
2250 . : . : . : . : . :
2143 TTTGCTGTTCTGAAGCAGTTGTTGCCTCTGTTGGAGAAGGTATCCAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183966 TTTGCTGTTCTGAAGCAGTTGTTGCCTCTGTTGGAGAAGGTATCCAACAC
2300 . : . : . : . : . :
2193 ATACCCTGATCCGGTCATCCAAGAACTCGCTGTTGATCTCCGCATCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184016 ATACCCTGATCCGGTCATCCAAGAACTCGCTGTTGATCTCCGCATCACCA
2350 . : . : . : . : . :
2243 TCTCTACCCATGGAGCCTTTGCCACTGAGGCCGTCAGCATGGCTGCCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184066 TCTCTACCCATGGAGCCTTTGCCACTGAGGCCGTCAGCATGGCTGCCCAA
2400 . : . : . : . : . :
2293 AGTACACTGAACAGAAAAGATCTGGAAGGGAAAATAGAAGAGCAGCAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184116 AGTACACTGAACAGAAAAGATCTGGAAGGGAAAATAGAAGAGCAGCAACA
2450 . : . : . : . : . :
2343 AACCAGTCATGAAAGACCCACTGATGTAGCTCATAGCCACCTTGAACAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184166 AACCAGTCATGAAAGACCCACTGATGTAGCTCATAGCCACCTTGAACAAC
2500 . : . : . : . : . :
2393 AGCAGAGCCATGAGACAGCCCCCCAGACAGGCCTGCAGTCAAATGCTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184216 AGCAGAGCCATGAGACAGCCCCCCAGACAGGCCTGCAGTCAAATGCTCCA
2550 . : . : . : . : . :
2443 ATCATTCCTCAAGGAGTCAATGAGCCCAGCACTACTACAAGTCAGAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184266 ATCATTCCTCAAGGAGTCAATGAGCCCAGCACTACTACAAGTCAGAAATC
2600 . : . : . : . : . :
2493 TGGAAGCGTAACCACAGAACAGCTCCAAGAGGTTCTTTTGTCAGCTTATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184316 TGGAAGCGTAACCACAGAACAGCTCCAAGAGGTTCTTTTGTCAGCTTATG
2650 . : . : . : . : . :
2543 ACCCTCAAATTCCAACACGGGCTGCTGCCCTGCGTACTCTTTCCCACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184366 ACCCTCAAATTCCAACACGGGCTGCTGCCCTGCGTACTCTTTCCCACTGG
2700 . : . : . : . : . :
2593 ATAGAGCAGAGAGAAGCAAAAGCCCTTGAGATGCAAGAGAAGCTTCTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184416 ATAGAGCAGAGAGAAGCAAAAGCCCTTGAGATGCAAGAGAAGCTTCTCAA
2750 . : . : . : . : . :
2643 G ATATTCTTGGAAAACTTGGAACATGAAGACACTTTTGTAT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184466 GGTG...CAGATATTCTTGGAAAACTTGGAACATGAAGACACTTTTGTAT
2800 . : . : . : . : . :
2684 ATCTATCTGCAATTCAGG GGGTTGCCCTGCTGTCAGACGTC
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
186661 ATCTATCTGCAATTCAGGGTA...CAGGGGTTGCCCTGCTGTCAGACGTC
2850 . : . : . : . : . :
2725 TATCCTGAGAAAATCTTGCCGGACTTGTTGGCTCAATATGACAGCAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
230434 TATCCTGAGAAAATCTTGCCGGACTTGTTGGCTCAATATGACAGCAGCAA
2900 . : . : . : . : . :
2775 AGACAAGCACACACCAGAGACCAGAATGAAAGTCGGGGAAGTCCTTATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
230484 AGACAAGCACACACCAGAGACCAGAATGAAAGTCGGGGAAGTCCTTATGC
2950 . : . : . : . : . :
2825 GAATCGTCAGGGCATTAG GAGACATGGTCTCAAAGTACCGA
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
230534 GAATCGTCAGGGCATTAGGTG...TAGGAGACATGGTCTCAAAGTACCGA
3000 . : . : . : . : . :
2866 GAACCTTTGATCCATACCTTCCTGAGGGGAGTGAGAGATCCTGATGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
279234 GAACCTTTGATCCATACCTTCCTGAGGGGAGTGAGAGATCCTGATGGTGC
3050 . : . : . : . : . :
2916 TCACAGGGCCAGCAGCTTGGCCAACCTTGGGGAGCTGTGCCAGAGGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
279284 TCACAGGGCCAGCAGCTTGGCCAACCTTGGGGAGCTGTGCCAGAGGCTGG
3100 . : . : . : . : . :
2966 ACTTTCTGCTGGGCTCCGTGGTCCATGAG GTAACAGCTTGC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
279334 ACTTTCTGCTGGGCTCCGTGGTCCATGAGGTA...TAGGTAACAGCTTGC
3150 . : . : . : . : . :
3007 CTGATTGCTGTGGCCAAAACAGATGGTGAAGTTCAAGTACGCAGAGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
296703 CTGATTGCTGTGGCCAAAACAGATGGTGAAGTTCAAGTACGCAGAGCTGC
3200 . : . : . : . : . :
3057 CATACATGTGGTTGTGCTGCTGCTTCGGGGACTCAGCCAGAAAGCTACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
296753 CATACATGTGGTTGTGCTGCTGCTTCGGGGACTCAGCCAGAAAGCTACTG
3250 . : . : . : . : . :
3107 AG GTGCTGAGCGCCGTCCTCAAGGATCTCTACCACCTGCTG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
296803 AGGTC...CAGGTGCTGAGCGCCGTCCTCAAGGATCTCTACCACCTGCTG
3300 . : . : . : . : . :
3148 AAGCACGTAGTGTGTCTGGAGCCCGATGACGTGGCCAAGCTTCATGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
339907 AAGCACGTAGTGTGTCTGGAGCCCGATGACGTGGCCAAGCTCCATGCCCA
3350 . : . : . : . : . :
3198 GTTGGCCCTAGAAGAGCTGGATGACATCATGAAAAACTTCCTGTTCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
339957 GTTGGCCCTAGAAGAGCTGGATGACATCATGAAAAACTTCCTGTTCCCTC
3400 . : . : . : .
3248 CACAGAAGCTGGAGAAGAAGATCATGGTCCTGCCG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
340007 CACAGAAGCTGGAGAAGAAGATCATGGTCCTGCCG