Result of SIM4 for
pF1KA1738
seq1 = pF1KA1738.tfa, 3381 bp
seq2 = pF1KA1738/gi568815581r_64048972.tfa (gi568815581r:64048972_64314217), 265246 bp
>pF1KA1738 3381
>gi568815581r:64048972_64314217 (Chr17)
(complement)
1-1644 (100001-101644) 99% ->
1645-1845 (119123-119323) 100% ->
1846-2176 (120329-120659) 100% ->
2177-2424 (125803-126050) 100% ->
2425-2571 (136747-136893) 100% ->
2572-2671 (143019-143118) 100% ->
2672-2804 (153285-153417) 100% ->
2805-2930 (159251-159376) 100% ->
2931-3140 (161064-161273) 100% ->
3141-3261 (163257-163377) 100% ->
3262-3381 (165127-165246) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGACAAGTCTGTATGGTCGCCATGCCGAGAAAACCACTGACATGCCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGACAAGTCTGTATGGTCGCCATGCCGAGAAAACCACTGACATGCCAAA
50 . : . : . : . : . :
51 ACCATCAGCCCCTAAAGTGCACGTGCAGAGGTCCGTGTCCCGAGATACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ACCATCAGCCCCTAAAGTGCACGTGCAGAGGTCCGTGTCCCGAGATACCA
100 . : . : . : . : . :
101 TCGCCATTCACTTCTCGGCATCCGGCGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TCGCCATTCACTTCTCGGCATCCGGCGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAG
150 . : . : . : . : . :
151 GAGTTCAGGGAGTACTTTGAGGAGGGGCTGGATGACCAAAGCATTGTAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GAGTTCAGGGAGTACTTTGAGGAGGGGCTGGATGACCAAAGCATTGTAAC
200 . : . : . : . : . :
201 AGGGCTGGAAGCCAAGGAAGACCTCTATCTTGAACCCCAAGTTGGCCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 AGGGCTGGAAGCCAAGGAAGACCTCTATCTTGAACCCCAAGTTGGCCATG
250 . : . : . : . : . :
251 ACCCCGCCGGCCCTGCTGCCTCGCCTGTCCTGGCAGATGGACTGTCCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 ACCCCGCCGGCCCTGCTGCCTCGCCTGTCCTGGCAGATGGACTGTCCGTG
300 . : . : . : . : . :
301 TCCCAGGCCCCTGCCATTTTGCCCGTCTCCAAGAACACTGTAAAGCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 TCCCAGGCCCCTGCCATTTTGCCCGTCTCCAAGAACACTGTAAAGCTGTT
350 . : . : . : . : . :
351 GGAGTCCCCTGTTCCAGCAGCACAAGTATTAAGTACAGTGCCATTGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 GGAGTCCCCTGTTCCAGCAGCACAAGTATTAAGTACAGTGCCATTGGCTG
400 . : . : . : . : . :
401 TGTCCCCAGGGTCGTCTTCGTCGGGGCCCTTAGCTAGCTCTCCCAGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 TGTCCCCAGGGTCGTCTTCGTCGGGGCCCTTAGCTAGCTCTCCCAGTGTG
450 . : . : . : . : . :
451 TCATCCCTTTCTGAGCAGAAAACCAGTTCTTCCTCCCCATTGTCCTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 TCATCCCTTTCTGAGCAGAAAACCAGTTCTTCCTCCCCATTGTCCTCTCC
500 . : . : . : . : . :
501 TTCTAAGTCTCCCATCCTCTCATCCAGTGCCTCAACCTCCACCCTTTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 TTCTAAGTCTCCCATCCTCTCATCCAGTGCCTCAACCTCCACCCTTTCCA
550 . : . : . : . : . :
551 GTGCAAAACCCTTCATGAGCCTTGTGAAGTCCCTGTCGACCGAGGTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 GTGCAAAACCCTTCATGAGCCTTGTGAAGTCCCTGTCGACCGAGGTGGAG
600 . : . : . : . : . :
601 CCAAAAGAATCCCCACACCCCGCAAGGCACAGGCACTTGATGAAGACATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 CCAAAAGAATCCCCACACCCCGCAAGGCACAGGCACTTGATGAAGACATT
650 . : . : . : . : . :
651 AGTCAAGTCTCTGTCCACGGACACTTCCCGGCAGGAGTCGGATACAGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 AGTCAAGTCTCTGTCCACGGACACTTCCCGGCAGGAGTCGGATACAGTGT
700 . : . : . : . : . :
701 CCTATAAGCCACCTGATTCCAAACTGAACTTACACCTGTTCAAGCAGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 CCTATAAGCCACCTGATTCCAAACTGAACTTACACCTGTTCAAGCAGTTC
750 . : . : . : . : . :
751 ACACAGCCCCGAAACACAGGTGGAGATTCCAAAACCGCACCTTCTTCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
100751 ACACAGCCCCGAAACACAGGTGGAGATTCCAAAACTGCACCTTCTTCCCC
800 . : . : . : . : . :
801 ACTGACTTCTCCCTCTGATACTCGTTCCTTTTTTAAAGTGCCCGAAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 ACTGACTTCTCCCTCTGATACTCGTTCCTTTTTTAAAGTGCCCGAAATGG
850 . : . : . : . : . :
851 AGGCTAAAATTGAAGATACTAAACGACGCCTTTCAGAAGTCATCTATGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 AGGCTAAAATTGAAGATACTAAACGACGCCTTTCAGAAGTCATCTATGAG
900 . : . : . : . : . :
901 CCTTTTCAGCTCCTTAGTAAAATTATAGGGGAAGAAAGTGGCAGCCATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 CCTTTTCAGCTCCTTAGTAAAATTATAGGGGAAGAAAGTGGCAGCCATAG
950 . : . : . : . : . :
951 GCCCAAAGCCTTATCTTCAAGTGCTTCAGAACTCTCCAATCTGTCCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 GCCCAAAGCCTTATCTTCAAGTGCTTCAGAACTCTCCAATCTGTCCAGCT
1000 . : . : . : . : . :
1001 TGAATGGGCACTTGGAAAGCAATAACAACTACAGCATCAAGGAGGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 TGAATGGGCACTTGGAAAGCAATAACAACTACAGCATCAAGGAGGAGGAG
1050 . : . : . : . : . :
1051 TGTGATTCTGAGGGGGATGGCTACGGAAGTGATTCCAACATCCCCAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 TGTGATTCTGAGGGGGATGGCTACGGAAGTGATTCCAACATCCCCAGAAG
1100 . : . : . : . : . :
1101 TGACCACCCAAAGTCCACTGGTGAGCCCACAAGAGAGATAGAACTGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 TGACCACCCAAAGTCCACTGGTGAGCCCACAAGAGAGATAGAACTGAAAA
1150 . : . : . : . : . :
1151 GTTCCCAGGGGAGCAGTCTGAAGGATTTAGGCCTGAAGACAAGTTCTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 GTTCCCAGGGGAGCAGTCTGAAGGATTTAGGCCTGAAGACAAGTTCTCTA
1200 . : . : . : . : . :
1201 GTTCTGGAGAAATGTTCTTTGTCTGCCTTAGTGAGCAAAGAAGATGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 GTTCTGGAGAAATGTTCTTTGTCTGCCTTAGTGAGCAAAGAAGATGAAGA
1250 . : . : . : . : . :
1251 GTTTTGTGAACTGTACACTGAGGACTTCGATTTGGAAACGGAGGGGGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 GTTTTGTGAACTGTACACTGAGGACTTCGATTTGGAAACGGAGGGGGAGA
1300 . : . : . : . : . :
1301 GTAAAGTTGATAAGCTCTCAGATATTCCTCTCAAGCCAGAGGTGCTCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101301 GTAAAGTTGATAAGCTCTCAGATATTCCTCTCAAGCCAGAGGTGCTCGCG
1350 . : . : . : . : . :
1351 GAAGATGGTGTGGTCCTTGACAGTGAGGACGAGGTGGACTCGGCCGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 GAAGATGGTGTGGTCCTTGACAGTGAGGACGAGGTGGACTCGGCCGTGCA
1400 . : . : . : . : . :
1401 GCACCCGGAATTGCCAGTGAAGACGTTGGGCTTCTTTATAATGTGTGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101401 GCACCCGGAATTGCCAGTGAAGACGTTGGGCTTCTTTATAATGTGTGTCT
1450 . : . : . : . : . :
1451 ATGTGTACCTCATCCTCCCCCTCCCCCACTATGTGAGTGGACTCTTTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101451 ATGTGTACCTCATCCTCCCCCTCCCCCACTATGTGAGTGGACTCTTTCTG
1500 . : . : . : . : . :
1501 GGAATTGGCCTTGGATTCATGACTGCAGTTTGCGTGATTTGGTTTTTTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101501 GGAATTGGCCTTGGATTCATGACTGCAGTTTGCGTGATTTGGTTTTTTAC
1550 . : . : . : . : . :
1551 ACCACCAAGTGCTCATAAATATCACAAGTTACACAAAAATCTGCGACACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101551 ACCACCAAGTGCTCATAAATATCACAAGTTACACAAAAATCTGCGACACT
1600 . : . : . : . : . :
1601 GGAACACAAGATCTCTGGATATCAAAGAACCTGAAATACTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
101601 GGAACACAAGATCTCTGGATATCAAAGAACCTGAAATACTGAAGGTA...
1650 . : . : . : . : . :
1645 GGATGGATGAATGAGATTTACAACTATGATCCAGAAACCTACCATGC
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119120 CAGGGATGGATGAATGAGATTTACAACTATGATCCAGAAACCTACCATGC
1700 . : . : . : . : . :
1692 GACTTTGACACATTCAGTCTTTGTTCGACTTGAGGGTGGAACCTTAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119170 GACTTTGACACATTCAGTCTTTGTTCGACTTGAGGGTGGAACCTTAAGAC
1750 . : . : . : . : . :
1742 TTTCAAAGCCCAATAAAAATATATCCAGGAGGGCCAGCTACAATGAACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119220 TTTCAAAGCCCAATAAAAATATATCCAGGAGGGCCAGCTACAATGAACCC
1800 . : . : . : . : . :
1792 AAGCCAGAGGTCACCTACATCAGCCAGAAAATCTATGACCTCTCAGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119270 AAGCCAGAGGTCACCTACATCAGCCAGAAAATCTATGACCTCTCAGACAG
1850 . : . : . : . : . :
1842 CAAG ATTTATCTTGTACCTAAAACTTTGGCTCGAAAGCGAA
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119320 CAAGGTG...TAGATTTATCTTGTACCTAAAACTTTGGCTCGAAAGCGAA
1900 . : . : . : . : . :
1883 TCTGGAATAAAAAGTACCCCATTTGTATCGAGCTTGGTCAGCAAGATGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120366 TCTGGAATAAAAAGTACCCCATTTGTATCGAGCTTGGTCAGCAAGATGAC
1950 . : . : . : . : . :
1933 TTTATGTCTAAAGCTCAGACTGATAAGGAGACTTCAGAAGAGAAGCCGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120416 TTTATGTCTAAAGCTCAGACTGATAAGGAGACTTCAGAAGAGAAGCCGCC
2000 . : . : . : . : . :
1983 AGCTGAGGGAAGTGAGGACCCTAAGAAGCCACCCCGCCCTCAGGAGGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120466 AGCTGAGGGAAGTGAGGACCCTAAGAAGCCACCCCGCCCTCAGGAGGGAA
2050 . : . : . : . : . :
2033 CAAGATCTAGCCAGCGAGATCAGATACTCTATCTCTTTGGGAGAACTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120516 CAAGATCTAGCCAGCGAGATCAGATACTCTATCTCTTTGGGAGAACTGGC
2100 . : . : . : . : . :
2083 CGAGAAAAAGAGGAATGGTTTAGGAGATTTATTCTGGCATCTAAGCTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120566 CGAGAAAAAGAGGAATGGTTTAGGAGATTTATTCTGGCATCTAAGCTAAA
2150 . : . : . : . : . :
2133 GTCGGAAATCAAGAAGTCATCGGGTGTCTCTGGAGGTAAACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
120616 GTCGGAAATCAAGAAGTCATCGGGTGTCTCTGGAGGTAAACCAGGTA...
2200 . : . : . : . : . :
2177 GGCTTTTGCCTGCACACAGCAGACACAACAGTCCGTCCGGGCACCTG
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125800 CAGGGCTTTTGCCTGCACACAGCAGACACAACAGTCCGTCCGGGCACCTG
2250 . : . : . : . : . :
2224 ACCCACAGCCGCAGCAGCAGCAAAGGCAGTGTGGAGGAGATCATGTCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125850 ACCCACAGCCGCAGCAGCAGCAAAGGCAGTGTGGAGGAGATCATGTCACA
2300 . : . : . : . : . :
2274 GCCAAAGCAGAAGGAGCTGGCAGGCAGCGTGCGGCAGAAGATGCTTCTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125900 GCCAAAGCAGAAGGAGCTGGCAGGCAGCGTGCGGCAGAAGATGCTTCTCG
2350 . : . : . : . : . :
2324 ACTACAGCGTGTACATGGGCAGGTGTGTCCCCCAGGAAAGCCGAAGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125950 ACTACAGCGTGTACATGGGCAGGTGTGTCCCCCAGGAAAGCCGAAGCCCC
2400 . : . : . : . : . :
2374 CAGAGGAGCCCCCTGCAGAGTGCGGAGAGCAGCCCCACAGCTGGGAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126000 CAGAGGAGCCCCCTGCAGAGTGCGGAGAGCAGCCCCACAGCTGGGAAGAA
2450 . : . : . : . : . :
2424 G TTGCCAGAGGTTCCACCCTCTGAGGAGGAAGAACAGGAAG
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126050 GGTA...CAGTTGCCAGAGGTTCCACCCTCTGAGGAGGAAGAACAGGAAG
2500 . : . : . : . : . :
2465 CCTGGGTGAATGCCTTGCTTGGAAGAATATTTTGGGACTTCTTAGGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136787 CCTGGGTGAATGCCTTGCTTGGAAGAATATTTTGGGACTTCTTAGGAGAG
2550 . : . : . : . : . :
2515 AAATACTGGTCTGATCTGGTGTCTAAGAAGATCCAAATGAAACTCAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136837 AAATACTGGTCTGATCTGGTGTCTAAGAAGATCCAAATGAAACTCAGCAA
2600 . : . : . : . : . :
2565 AATAAAG CTCCCCTACTTTATGAATGAGCTCACTCTGACGG
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
136887 AATAAAGGTA...TAGCTCCCCTACTTTATGAATGAGCTCACTCTGACGG
2650 . : . : . : . : . :
2606 AACTTGACATGGGCGTGGCTGTGCCAAAAATCCTCCAGGCCTTCAAGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143053 AACTTGACATGGGCGTGGCTGTGCCAAAAATCCTCCAGGCCTTCAAGCCT
2700 . : . : . : . : . :
2656 TACGTTGATCACCAAG GACTCTGGATTGATTTGGAAATGTC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
143103 TACGTTGATCACCAAGGTA...CAGGACTCTGGATTGATTTGGAAATGTC
2750 . : . : . : . : . :
2697 CTACAATGGGTCCTTTCTGATGACTCTCGAGACCAAAATGAATTTGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153310 CTACAATGGGTCCTTTCTGATGACTCTCGAGACCAAAATGAATTTGACCA
2800 . : . : . : . : . :
2747 AACTAGGTAAAGAGCCTCTTGTTGAAGCCCTGAAGGTTGGAGAAATTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153360 AACTAGGTAAAGAGCCTCTTGTTGAAGCCCTGAAGGTTGGAGAAATTGGC
2850 . : . : . : . : . :
2797 AAAGAAGG TTGCAGGCCCCGGGCATTCTGTCTGGCGGACAG
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
153410 AAAGAAGGGTA...CAGTTGCAGGCCCCGGGCATTCTGTCTGGCGGACAG
2900 . : . : . : . : . :
2838 CGATGAGGAATCCTCCAGCGCTGGCTCCTCCGAGGAAGACGATGCCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159284 CGATGAGGAATCCTCCAGCGCTGGCTCCTCCGAGGAAGACGATGCCCCAG
2950 . : . : . : . : . :
2888 AGCCCAGCGGGGGAGACAAACAGCTCCTCCCAGGGGCTGAAGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
159334 AGCCCAGCGGGGGAGACAAACAGCTCCTCCCAGGGGCTGAAGGGTG...A
3000 . : . : . : . : . :
2931 GTACGTTGGAGGTCATCGAACAAGTAAGATTATGAGGTTTGTTGATAA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161062 AGGTACGTTGGAGGTCATCGAACAAGTAAGATTATGAGGTTTGTTGATAA
3050 . : . : . : . : . :
2979 AATTACCAAGTCAAAATATTTCCAAAAAGCAACAGAGACAGAGTTTATTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161112 AATTACCAAGTCAAAATATTTCCAAAAAGCAACAGAGACAGAGTTTATTA
3100 . : . : . : . : . :
3029 AAAAGAAGATCGAAGAAGTCTCCAACACACCCCTGCTGCTCACTGTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161162 AAAAGAAGATCGAAGAAGTCTCCAACACACCCCTGCTGCTCACTGTTGAA
3150 . : . : . : . : . :
3079 GTACAAGAATGTAGAGGAACCTTGGCGGTCAACATTCCACCACCCCCGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161212 GTACAAGAATGTAGAGGAACCTTGGCGGTCAACATTCCACCACCCCCGAC
3200 . : . : . : . : . :
3129 TGACCGAGTATG GTATGGTTTCCGAAAGCCACCACATGTGG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
161262 TGACCGAGTATGGTG...AAGGTATGGTTTCCGAAAGCCACCACATGTGG
3250 . : . : . : . : . :
3170 AGCTGAAAGCTCGGCCAAAACTTGGAGAGAGAGAAGTGACTTTAGTTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163286 AGCTGAAAGCTCGGCCAAAACTTGGAGAGAGAGAAGTGACTTTAGTTCAT
3300 . : . : . : . : . :
3220 GTGACAGACTGGATAGAGAAGAAACTGGAGCAAGAGTTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
163336 GTGACAGACTGGATAGAGAAGAAACTGGAGCAAGAGTTTCAGGTA...CA
3350 . : . : . : . : . :
3262 AAAGTTTTTGTCATGCCAAACATGGATGATGTTTATATCACTATAATGC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165126 GAAAGTTTTTGTCATGCCAAACATGGATGATGTTTATATCACTATAATGC
3400 . : . : . : . : . :
3311 ACTCAGCCATGGACCCTCGCTCTACTTCCTGCCTCCTGAAAGACCCACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165176 ACTCAGCCATGGACCCTCGCTCTACTTCCTGCCTCCTGAAAGACCCACCT
3450 . : . :
3361 GTGGAGGCTGCTGATCAGCCA
|||||||||||||||||||||
165226 GTGGAGGCTGCTGATCAGCCA