seq1 = pF1KA1667.tfa, 2124 bp
seq2 = pF1KA1667/gi568815576r_26353236.tfa (gi568815576r:26353236_26581762), 228527 bp

>pF1KA1667 2124
>gi568815576r:26353236_26581762 (Chr22)

(complement)

1-41  (100001-100041)   100% ->
42-132  (102408-102498)   100% ->
133-276  (104627-104770)   100% ->
277-384  (108824-108931)   100% ->
385-501  (109345-109461)   100% ->
502-596  (110950-111044)   100% ->
597-669  (113140-113212)   100% ->
670-706  (115501-115537)   97% ->
707-803  (116212-116308)   100% ->
804-1713  (116937-117846)   99% ->
1714-1846  (123186-123318)   99% ->
1847-1955  (123796-123904)   99% ->
1956-2124  (128359-128527)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCTCTACCTCCACAGAGGCAAAGTCAGCCTCGTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100001 ATGGCCACCTCTACCTCCACAGAGGCAAAGTCAGCCTCGTGGTG...CAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTGGAATTATTTTTTTCTTTATGATGGTTCCAAGGTAAAGGAAGAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102408 GTGGAATTATTTTTTTCTTTATGATGGTTCCAAGGTAAAGGAAGAAGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCCAACAAGAGCTGGCATTTGTTACTTTTATCCTTCCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102458 ATCCAACAAGAGCTGGCATTTGTTACTTTTATCCTTCCCAGGTA...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACCCTGCTAGACCAACAGGAGTTGCTTTGTGGACAGATTGCTGGAGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104627 ACCCTGCTAGACCAACAGGAGTTGCTTTGTGGACAGATTGCTGGAGTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCGCTGTGTTTCTGACATTTCTGACTCTCCTCCTACTCTTGTTCGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104677 CCGCTGTGTTTCTGACATTTCTGACTCTCCTCCTACTCTTGTTCGTCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAAAACTGAAGTTTGCCATAAAAGTTGATGGAGATTACCTTTGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104727 GAAAACTGAAGTTTGCCATAAAAGTTGATGGAGATTACCTTTGGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    277    GTGCTGGGCTGTGCTGTGGAGCTCCCTGATGTCAGCTGCAAGCGGTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108821 CAGGTGCTGGGCTGTGCTGTGGAGCTCCCTGATGTCAGCTGCAAGCGGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCTGGATCAGCTAGTTGGATTCTTTAATTTTTACAATGGACCTGTTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108871 TCTGGATCAGCTAGTTGGATTCTTTAATTTTTACAATGGACCTGTTTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TAGCTTATGAG         AACTGTTCTCAGGAAGAACTGAGCACGGAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 108921 TAGCTTATGAGGTA...TAGAACTGTTCTCAGGAAGAACTGAGCACGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGGGACACCTTCATCGAGCAAATTCTGAAAAACACCAGTGATCTGCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109375 TGGGACACCTTCATCGAGCAAATTCTGAAAAACACCAGTGATCTGCATAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GATTTTCAATTCCCTCTGGAACTTGGACCAAACTAAA         GTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 109425 GATTTTCAATTCCCTCTGGAACTTGGACCAAACTAAAGTA...CAGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGCCCCTGTTGTTGCTGAAGGCAGCCCGCATTCTGCAGACCTGCCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110954 AGCCCCTGTTGTTGCTGAAGGCAGCCCGCATTCTGCAGACCTGCCAGCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCGCCTCACATTCTCGCTGGCTGCATCCTCTATAAAGGACT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111004 TCGCCTCACATTCTCGCTGGCTGCATCCTCTATAAAGGACTGTG...TAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GATTGTCAGCACCCAACTCCCGCCCTCCCTCACCGCCAAGGTCCTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113140 GATTGTCAGCACCCAACTCCCGCCCTCCCTCACCGCCAAGGTCCTGCTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACCGAACAGCACCTCAGGAGCAG         AGACTCCCTACGGGAGGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| |
 113190 ACCGAACAGCACCTCAGGAGCAGGTA...CAGAGACTCCCTACGGGAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GATGCCCCGCAGGAACATG         GAGCGGCATTGCCCCCGAATGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 115519 GATGCCCCGCAGGAACATGGTA...CAGGAGCGGCATTGCCCCCGAATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CCAGATTATCCCTGTTTTTGTGACCAAAGAGGAAGCCATTAGTCTCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116234 CCAGATTATCCCTGTTTTTGTGACCAAAGAGGAAGCCATTAGTCTCCACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AGTTCCCGGTGGAACAGATGACAAG         GTCTCTAGCATCTCCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 116284 AGTTCCCGGTGGAACAGATGACAAGGTA...CAGGTCTCTAGCATCTCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GCAGGACTCCAGGATGGTTCAGCCCAGCACCATCCAAAGGGTGGGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116953 GCAGGACTCCAGGATGGTTCAGCCCAGCACCATCCAAAGGGTGGGAGCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 ATCTGCCCTGAAAGAAAACGCCACTGGCCATGTGGAATCCATGGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117003 ATCTGCCCTGAAAGAAAACGCCACTGGCCATGTGGAATCCATGGCCTGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CCACCCCAGATCCCACATCCCCTGACGAAGCTTGTCCAGATGGCAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117053 CCACCCCAGATCCCACATCCCCTGACGAAGCTTGTCCAGATGGCAGGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAGAACGGATGCTTGTCTGGCCATGATCTGGAGAGCATCAGGCCCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117103 GAGAACGGATGCTTGTCTGGCCATGATCTGGAGAGCATCAGGCCCGCAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 ACTGCACAACTCTGCCAGGGGTGAGGTTCTTGGCCTCAGCTCCTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117153 ACTGCACAACTCTGCCAGGGGTGAGGTTCTTGGCCTCAGCTCCTCCCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GGAAGGAACTAGTCTTTCTCCAAGAAGAACTCGACTTGTCTGAAATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117203 GGAAGGAACTAGTCTTTCTCCAAGAAGAACTCGACTTGTCTGAAATCCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ATTCCAGAGGCTCAGGAAGTGGAAATGGCCTCAGGTCATTTTGCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117253 ATTCCAGAGGCTCAGGAAGTGGAAATGGCCTCAGGTCATTTTGCCTTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 ACATGTGCCTGTTCCAGATGGCAGGGCTCCTTACTGCAAGGCATCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117303 ACATGTGCCTGTTCCAGATGGCAGGGCTCCTTACTGCAAGGCATCTCTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCGCCTCCAGCAGCCTGGAACCCACGCCTCCTGAGGACACAGCCATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117353 GCGCCTCCAGCAGCCTGGAACCCACGCCTCCTGAGGACACAGCCATCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AGCTTGCGCCCTCCCTCTGCTCCTGAGATGCTGACCCAGCATGGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117403 AGCTTGCGCCCTCCCTCTGCTCCTGAGATGCTGACCCAGCATGGAGCCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGAGCAGGTCGAAGACCATCCTGGCCATAGCAGCCAAGCCCCCATTCCCA
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117453 AGAGCAGCTCGAAGACCATCCTGGCCATAGCAGCCAAGCCCCCATTCCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GAGCAGACCCTCTCCCCAGAAGGACCCGCAGGCCCTTGTTATTGCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117503 GAGCAGACCCTCTCCCCAGAAGGACCCGCAGGCCCTTGTTATTGCCTCGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TTAGATCCAGGACAGAGAGGAAACAAGCTTCCCACGGGGGAACAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117553 TTAGATCCAGGACAGAGAGGAAACAAGCTTCCCACGGGGGAACAAGGCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGATGAGGATGTTGATGGGGTCTGTGAAAGCCACGCAGCCCCTGGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117603 GGATGAGGATGTTGATGGGGTCTGTGAAAGCCACGCAGCCCCTGGTCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AATGCAGTTCAGGCTCAGCAAACTGTCAGGGTGCTGGCCCCTCTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117653 AATGCAGTTCAGGCTCAGCAAACTGTCAGGGTGCTGGCCCCTCTGCAGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GGAATCAGCTCCAGGCTGACACCAGCAGAGTCCTGCATGGGGCTCGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117703 GGAATCAGCTCCAGGCTGACACCAGCAGAGTCCTGCATGGGGCTCGTGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GATGAATCTCTACACTCACTGCGTCAAAGGGCTGATGCTGTCCCTGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 117753 GATGAATCTCTACACTCACTGCGTCAAAGGGCTGGTGCTGTCCCTGCTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 CTGAGGAGCCGCTGCTGGGAGACAGCGCAGCCATAGAGGAAGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 117803 CTGAGGAGCCGCTGCTGGGAGACAGCGCAGCCATAGAGGAAGTGGTG...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1714    TACCACAGCAGCCTGGCTTCACTGAATGGGCTGGAAGTCCACCTGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123183 CAGTACCACAGCAGCCTGGCTTCACTGAATGGGCTGGAAGTCCACCTGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 AGAGACGCTGCCCAGGGATGAGGCAGCCTCCACGAGCAGCACCTACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123233 AGAGACGCTGCCCAGGGATGAGGCAGCCTCCACGAGCAGCACCTACAACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TCACATATTACGACCGCATTCAGAGCTTGCTGATGG         CAAAC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123283 TCACACATTACGACCGCATTCAGAGCTTGCTGATGGGTA...AAGCAAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CTGCCGCAGGTGGCCACCCCGCATGATCGCCGCTTCCTCCAGGCCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 123801 CTGCCGCAGGTGGCCACCCCGCAGGATCGCCGCTTCCTCCAGGCCGTCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CCTGATGCATAGCGAATTTGCCCAGCTGCCCGCGCTTTATGAAATGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123851 CCTGATGCATAGCGAATTTGCCCAGCTGCCCGCGCTTTATGAAATGACTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 TCAG         AAATGCCTCCACGGCTGTGTACGCCTGTTGCAACCCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123901 TCAGGTG...CAGAAATGCCTCCACGGCTGTGTACGCCTGTTGCAACCCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 ATCCAGGAGACATATTTCCAGCAGCTGGCACCTGCAGCACGGAGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128396 ATCCAGGAGACATATTTCCAGCAGCTGGCACCTGCAGCACGGAGCTCCGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 CTTCCCAAACCCTCAGGATGGCGCCTTCAGCCTCTCCGGCAAAGCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128446 CTTCCCAAACCCTCAGGATGGCGCCTTCAGCCTCTCCGGCAAAGCAAAGC

   2200     .    :    .    :    .    :
   2093 AGAAGCTGCTGAAGCACGGGGTGAACTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 128496 AGAAGCTGCTGAAGCACGGGGTGAACTTGCTC