seq1 = pF1KA1604.tfa, 2724 bp
seq2 = pF1KA1604/gi568815596r_179845132.tfa (gi568815596r:179845132_180088649), 243518 bp

>pF1KA1604 2724
>gi568815596r:179845132_180088649 (Chr2)

(complement)

1-27  (95309-95335)   100% ->
28-95  (100006-100073)   100% ->
96-206  (101845-101955)   100% ->
207-452  (106653-106898)   100% ->
453-581  (110332-110460)   100% ->
582-750  (114848-115016)   100% ->
751-804  (115404-115457)   100% ->
805-940  (117574-117709)   100% ->
941-1147  (117794-118000)   100% ->
1148-1210  (118087-118149)   100% ->
1211-1315  (122668-122772)   100% ->
1316-1397  (124022-124103)   100% ->
1398-1458  (129568-129628)   100% ->
1459-1536  (133616-133693)   100% ->
1537-1689  (134293-134445)   100% ->
1690-1817  (136052-136179)   100% ->
1818-1919  (137724-137825)   100% ->
1920-2140  (137918-138138)   100% ->
2141-2724  (142935-143518)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAAGTAGTGTGGCACAGATAAAA         CCTTCTTCTGGTCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  95309 ATGAAAAGTAGTGTGGCACAGATAAAAGTA...AAGCCTTCTTCTGGTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGACAGAAGGGAAAACCTTAATTCATATCAGAGGAACTCCTCTCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100020 TGACAGAAGGGAAAACCTTAATTCATATCAGAGGAACTCCTCTCCAGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACAG         ATATGAAGAACAAGAACGATCCCCCCGGGATAGAGAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100070 ACAGGTA...TAGATATGAAGAACAAGAACGATCCCCCCGGGATAGAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TACTTTGATTACAGCAGATCAGACTATGAGCATTCAAGAAGAGGACGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101882 TACTTTGATTACAGCAGATCAGACTATGAGCATTCAAGAAGAGGACGTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTATGATAGTAGCATGGAGTCACG         AAACAGGGACCGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101932 TTATGATAGTAGCATGGAGTCACGGTT...CAGAAACAGGGACCGAGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AACGCAGAGAAAGAGAAAGAGATACGGATCGGAAAAGGTCTCGGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106670 AACGCAGAGAAAGAGAAAGAGATACGGATCGGAAAAGGTCTCGGAAATCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCATCTCCTGGGAGGAGAAACCCAGAAACATCAGTAACTCAGAGTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106720 CCATCTCCTGGGAGGAGAAACCCAGAAACATCAGTAACTCAGAGTTCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGCTCAGGATGAACCTGCTACAAAGAAAAAGAAAGATGAGCTGGATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106770 TGCTCAGGATGAACCTGCTACAAAGAAAAAGAAAGATGAGCTGGATCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCTTACTCGCACTGGTGGAGCATATATTCCCCCTGCAAAGCTCAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106820 TTCTTACTCGCACTGGTGGAGCATATATTCCCCCTGCAAAGCTCAGGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATGCAGGAACAGATTACAGATAAAAACAG         CTTAGCATACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 106870 ATGCAGGAACAGATTACAGATAAAAACAGGCA...TAGCTTAGCATACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGGATGAGTTGGGAGGCCCTGAAGAAGTCAATTAATGGCCTTATCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110344 GAGGATGAGTTGGGAGGCCCTGAAGAAGTCAATTAATGGCCTTATCAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGTCAACATTTCCAACATAAGTATTATTATTCAAGAGCTTCTTCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110394 AAGTCAACATTTCCAACATAAGTATTATTATTCAAGAGCTTCTTCAAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AATATAGTTAGAGGAAG         AGGACTGCTGTCCAGGTCTGTTTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 110444 AATATAGTTAGAGGAAGGTA...CAGAGGACTGCTGTCCAGGTCTGTTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCAAGCACAGAGTGCTTCTCCAATCTTCACCCATGTTTATGCAGCATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114872 GCAAGCACAGAGTGCTTCTCCAATCTTCACCCATGTTTATGCAGCATTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGCAATTATCAACTCAAAATTTCCACAAATTGGAGAATTAATCCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114922 TGGCAATTATCAACTCAAAATTTCCACAAATTGGAGAATTAATCCTCAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGGTTAATTCTTAATTTTCGAAAAGGCTATCGAAGAAATGACAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 114972 AGGTTAATTCTTAATTTTCGAAAAGGCTATCGAAGAAATGACAAGGTA..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751     CAACTTTGCCTGACTGCTTCAAAATTTGTGGCGCATCTTATTAACC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115022 .CAGCAACTTTGCCTGACTGCTTCAAAATTTGTGGCGCATCTTATTAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAAATGTG         GCACACGAAGTATTATGCTTAGAGATGCTCACT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 115450 AAAATGTGGTA...AAGGCACACGAAGTATTATGCTTAGAGATGCTCACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTGCTCCTGGAAAGACCAACAGATGATAGCGTTGAAGTAGCTATTGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117607 TTGCTCCTGGAAAGACCAACAGATGATAGCGTTGAAGTAGCTATTGGTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCTTAAGGAATGTGGCCTCAAATTAACACAAGTGTCACCAAGAGGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117657 TCTTAAGGAATGTGGCCTCAAATTAACACAAGTGTCACCAAGAGGAATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATG         CTATATTTGAACGCCTTCGAAACATTCTGCATGAGTCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117707 ATGGTA...TAGCTATATTTGAACGCCTTCGAAACATTCTGCATGAGTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAAATTGACAAAAGAGTTCAATATATGATTGAAGTGATGTTTGCTGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117832 GAAATTGACAAAAGAGTTCAATATATGATTGAAGTGATGTTTGCTGTACG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GAAAGATGGATTCAAGGACCACCCCATTATCCTAGAAGGTCTTGATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117882 GAAAGATGGATTCAAGGACCACCCCATTATCCTAGAAGGTCTTGATTTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGAAGAAGATGATCAATTCACTCATATGCTCCCTCTGGAGGATGACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117932 TGGAAGAAGATGATCAATTCACTCATATGCTCCCTCTGGAGGATGACTAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AATCCAGAAGATGTTCTTA         ATGTTTTCAAGATGGATCCTAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 117982 AATCCAGAAGATGTTCTTAGTA...TAGATGTTTTCAAGATGGATCCTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TTTTATGGAGAATGAAGAGAAGTACAAAGCTATTAAGAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 118109 TTTTATGGAGAATGAAGAGAAGTACAAAGCTATTAAGAAAGGTA...CAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AAATTCTTGATGAGGGAGATACTGACTCGAACACAGACCAGGATGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122668 AAATTCTTGATGAGGGAGATACTGACTCGAACACAGACCAGGATGCTGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AGTAGTGAAGAGGACGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGGAGAAGAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122718 AGTAGTGAAGAGGACGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGGAGAAGAAGATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AGAAG         GACAAAAAGTAACTATTCATGACAAAACAGAAATTA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122768 AGAAGGTA...CAGGACAAAAAGTAACTATTCATGACAAAACAGAAATTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ACCTGGTCTCATTTCGTCGTACAATTTATCTTGCTATTCAGTCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 124058 ACCTGGTCTCATTTCGTCGTACAATTTATCTTGCTATTCAGTCAAGGTA.

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1398      TTTAGATTTTGAAGAATGTGCTCACAAATTGCTGAAAATGGAGTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124108 ..CAGTTTAGATTTTGAAGAATGTGCTCACAAATTGCTGAAAATGGAGTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TCCTGAAAGCCAAACA         AAAGAACTCTGCAACATGATACTTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 129613 TCCTGAAAGCCAAACAGTA...TAGAAAGAACTCTGCAACATGATACTTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 ATTGCTGTGCCCAACAGAGGACATACGAAAAATTTTTTGGCTTATTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133641 ATTGCTGTGCCCAACAGAGGACATACGAAAAATTTTTTGGCTTATTAGCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GGG         CGATTTTGCATGCTAAAGAAAGAGTACATGGAATCCTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133691 GGGGTG...TAGCGATTTTGCATGCTAAAGAAAGAGTACATGGAATCCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TGAAGGTATATTCAAAGAACAGTATGATACCATCCATCGCTTGGAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134331 TGAAGGTATATTCAAAGAACAGTATGATACCATCCATCGCTTGGAAACAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 ACAAGTTGCGAAATGTTGCTAAGATGTTTGCTCACCTTTTATACACTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134381 ACAAGTTGCGAAATGTTGCTAAGATGTTTGCTCACCTTTTATACACTGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TCACTTCCATGGAGT         GTTCTTGAATGTATAAAACTGAGTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 134431 TCACTTCCATGGAGTGTA...CAGGTTCTTGAATGTATAAAACTGAGTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 AGAAACCACTACATCATCCAGTAGAATTTTTGTCAAAATATTTTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136078 AGAAACCACTACATCATCCAGTAGAATTTTTGTCAAAATATTTTTCCAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 AACTGTGTGAATACATGGGTCTTCCTAAACTTAATGCAAGATTAAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136128 AACTGTGTGAATACATGGGTCTTCCTAAACTTAATGCAAGATTAAAGGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GA         AACTCTGCAGCCATTCTTTGAAGGATTATTACCCCGAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136178 GAGTA...TAGAACTCTGCAGCCATTCTTTGAAGGATTATTACCCCGAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 TAATCCAAGAAACACTCGGTTTGCCATCAACTTCTTTACTTCTATAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137763 TAATCCAAGAAACACTCGGTTTGCCATCAACTTCTTTACTTCTATAGGTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TTGGAGGTTTAAC         GGATGAACTGCGGGAGCATCTCAAAAAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 137813 TTGGAGGTTTAACGTA...TAGGGATGAACTGCGGGAGCATCTCAAAAAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 ACACCAAAGGTCATTGTGGCGCAGAAACCAGATGTTGAGCAAAATAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137946 ACACCAAAGGTCATTGTGGCGCAGAAACCAGATGTTGAGCAAAATAAATC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 CTCCCCATCCTCTTCCTCTTCAGCGTCCTCCTCTTCAGAGTCTGACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137996 CTCCCCATCCTCTTCCTCTTCAGCGTCCTCCTCTTCAGAGTCTGACTCAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 CCGACTCTGATTCTGACAGCAGTGATAGCAGTTCAGAGTCTTCCAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138046 CCGACTCTGATTCTGACAGCAGTGATAGCAGTTCAGAGTCTTCCAGTGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GAGAGCGACTCTTCATCCATCAGTAGTCATAGCTCTGCCTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 138096 GAGAGCGACTCTTCATCCATCAGTAGTCATAGCTCTGCCTCAGGTA...C

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2141   CTAATGATGTAAGAAAGAAGGGACATGGGAAGACCAGAAGTAAAGAGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142933 AGCTAATGATGTAAGAAAGAAGGGACATGGGAAGACCAGAAGTAAAGAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 TAGATAAATTGATCAGAAACCAGCAAACAAATGATAGGAAACAAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142983 TAGATAAATTGATCAGAAACCAGCAAACAAATGATAGGAAACAAAAAGAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 AGAAGACAAGAACACGGGCACCAGGAAACAAGGACTGAGAGAGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143033 AGAAGACAAGAACACGGGCACCAGGAAACAAGGACTGAGAGAGAAAGAAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GTCAGAAAAACACAGAGATCAAAATTCAAGTGGTTCAAATTGGAGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143083 GTCAGAAAAACACAGAGATCAAAATTCAAGTGGTTCAAATTGGAGAGATC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 CTATAACAAAGTACACATCAGACAAAGATGTTCCTTCTGAACGAAATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143133 CTATAACAAAGTACACATCAGACAAAGATGTTCCTTCTGAACGAAATAAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 TACAGTAGAGTTGCGAATGACAGAGACCAAGAAATGCATATAGATTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143183 TACAGTAGAGTTGCGAATGACAGAGACCAAGAAATGCATATAGATTTGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 AAATAAGCATGGTGATCCCAAAAAGAAGAGAGGAGAGAGAAGAAATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143233 AAATAAGCATGGTGATCCCAAAAAGAAGAGAGGAGAGAGAAGAAATTCTT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 TTTCTGAAAATGAGAAGCATACACACCGAATTAAAGACAGTGAAAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143283 TTTCTGAAAATGAGAAGCATACACACCGAATTAAAGACAGTGAAAATTTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 AGAAGAAAAGATAGATCAAAGTCAAAGGAAATGAATAGAAAGCACTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143333 AGAAGAAAAGATAGATCAAAGTCAAAGGAAATGAATAGAAAGCACTCAGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 CTCAAGAAGTGATGAAGATAGATATCAAAATGGTGCCGAGAGACGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143383 CTCAAGAAGTGATGAAGATAGATATCAAAATGGTGCCGAGAGACGATGGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 AAAAATCTAGCAGATACTCTGAACAATCCAGAGAATCAAAGAAAAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143433 AAAAATCTAGCAGATACTCTGAACAATCCAGAGAATCAAAGAAAAATCAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .
   2689 GACCGGCGAAGAGAAAAGTCTCCAGCAAAACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143483 GACCGGCGAAGAGAAAAGTCTCCAGCAAAACAAAAA