seq1 = pF1KA1584.tfa, 2898 bp
seq2 = pF1KA1584/gi568815583r_56531501.tfa (gi568815583r:56531501_56804256), 272756 bp

>pF1KA1584 2898
>gi568815583r:56531501_56804256 (Chr15)

(complement)

1-136  (100001-100136)   100% ->
137-202  (103019-103084)   100% ->
203-342  (103185-103324)   100% ->
343-460  (111042-111159)   100% ->
461-631  (114787-114957)   100% ->
632-741  (115107-115216)   100% ->
742-965  (121780-122003)   100% ->
966-1123  (125436-125593)   100% ->
1124-1224  (126583-126683)   100% ->
1225-1371  (127441-127587)   100% ->
1372-1506  (135300-135434)   100% ->
1507-1814  (137271-137578)   99% ->
1815-1955  (137722-137862)   100% ->
1956-2018  (145771-145833)   100% ->
2019-2137  (149754-149872)   100% ->
2138-2174  (150023-150059)   100% ->
2175-2220  (161260-161305)   100% ->
2221-2276  (169007-169062)   100% ->
2277-2898  (172135-172756)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAACTGTTTATGGAATGTGAAGAAGAGGAGCTGGAACCATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAACTGTTTATGGAATGTGAAGAAGAGGAGCTGGAACCATGGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGAAAGTAAAAGAAGTTGAGGATGACGATGATGATGAGCCAATCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGAAAGTAAAAGAAGTTGAGGATGACGATGATGATGAGCCAATCTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGGCGAGATATCAAGTTCAAAACCAGCAATTTCAA         ATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100101 TTGGCGAGATATCAAGTTCAAAACCAGCAATTTCAAGTA...TAGATATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGAACAGAGTTAACCCCAGCTCATATTCAAGGGGACTAAAGAATGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103024 TTGAACAGAGTTAACCCCAGCTCATATTCAAGGGGACTAAAGAATGGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTCAGTCGAG         GTATTACTGCTGCATTCAAGCCTACAAGTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103074 ACTCAGTCGAGGTA...CAGGTATTACTGCTGCATTCAAGCCTACAAGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACACTACACGAATCCAACATCAAATCCAGTGCCTGCCTCACCAATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103215 AACACTACACGAATCCAACATCAAATCCAGTGCCTGCCTCACCAATAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTCATCCTGAGTCTAGATCTTCAGATAGTTCTGTTATTGTTCAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103265 TTTCATCCTGAGTCTAGATCTTCAGATAGTTCTGTTATTGTTCAGCCTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCTAAACCT         GGTTATATAACAAACTCATCACGAGTTGTGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103315 TTCTAAACCTGTA...CAGGGTTATATAACAAACTCATCACGAGTTGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTAATAAGTCATCAGAGTTACTGTTTGACTTGACCCAGGATACAGGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111073 CTAATAAGTCATCAGAGTTACTGTTTGACTTGACCCAGGATACAGGATTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCACATTACCAAGGGGGACCAACACTTTCTATGGCAG         GTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111123 TCACATTACCAAGGGGGACCAACACTTTCTATGGCAGGTT...TAGGTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGTGAAAGTTCATTTTTATCAAAACGTCCTTCTACTTCTGAAGTAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114791 GAGTGAAAGTTCATTTTTATCAAAACGTCCTTCTACTTCTGAAGTAAATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGTTAATCCAAAGAAGCCTAAACCCAGCGAAAGTGTTTCTGGAGCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114841 ATGTTAATCCAAAGAAGCCTAAACCCAGCGAAAGTGTTTCTGGAGCAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCCTCAGCTGTATTACCTTCAGTTAAATCTCCTTCAGTGACTTCTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114891 TCCTCAGCTGTATTACCTTCAGTTAAATCTCCTTCAGTGACTTCTTCCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGCTATGCTAGCAAAAG         GTACAAATACCTCATCAAATCAGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114941 GGCTATGCTAGCAAAAGGTA...TAGGTACAAATACCTCATCAAATCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTAAAAATGGAACACCTTTTCCAAGAGCTTGTCCAAAGTGCAACATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115131 CTAAAAATGGAACACCTTTTCCAAGAGCTTGTCCAAAGTGCAACATTCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTCAATCTTTTGGATCCTTTGAAAAATCACATGAAG         TATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 115181 TTCAATCTTTTGGATCCTTTGAAAAATCACATGAAGGTA...CAGTATTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TTGTCCAGACATGATAAATAACTTTTTGGGACTGGCTAAAACAGAATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121785 TTGTCCAGACATGATAAATAACTTTTTGGGACTGGCTAAAACAGAATTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CAAGTACAGTAAATAAAAACACAACTATTGATTCAGAGAAAGGAAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121835 CAAGTACAGTAAATAAAAACACAACTATTGATTCAGAGAAAGGAAAATTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATCATGTTAGTTAATGACTTTTATTATGGAAAACATGAAGGAGATGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121885 ATCATGTTAGTTAATGACTTTTATTATGGAAAACATGAAGGAGATGTCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGAGGAACAGAAGACTCACACAACCTTTAAATGCTTCAGTTGCTTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121935 GGAGGAACAGAAGACTCACACAACCTTTAAATGCTTCAGTTGCTTGAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTCTAAAAAATAACATTAG         GTTTATGAACCACATGAAACAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 121985 TTCTAAAAAATAACATTAGGTA...TAGGTTTATGAACCACATGAAACAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CATTTGGAACTTGAGAAGCAGAGCAGTGAGAGCTGGGAAAACCATACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125458 CATTTGGAACTTGAGAAGCAGAGCAGTGAGAGCTGGGAAAACCATACCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTGCCAGCACTGCTACCGTCAGTTTCCCACACCATTTCAGTTGCAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125508 CTGCCAGCACTGCTACCGTCAGTTTCCCACACCATTTCAGTTGCAGTGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACATCGAAAGTACACATACGCCCCATGAATTTTCTA         CTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 125558 ACATCGAAAGTACACATACGCCCCATGAATTTTCTAGTA...TAGCTATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TGTAAAATCTGTGAATTGTCATTTGAAACAGAACATGTTCTTTTACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126588 TGTAAAATCTGTGAATTGTCATTTGAAACAGAACATGTTCTTTTACAACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TATGAAGGACAATCATAAACCTGGTGAAATGCCATATGTCTGCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 126638 TATGAAGGACAATCATAAACCTGGTGAAATGCCATATGTCTGCCAGGTA.

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1225      GTTTGTAATTATAGATCATCATCATTTTCTGATGTAGAAACTCAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126688 ..TAGGTTTGTAATTATAGATCATCATCATTTTCTGATGTAGAAACTCAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TTTAGAACATCCCATGAAAACACTAAGAACTTGCTATGCCCGTTTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127486 TTTAGAACATCCCATGAAAACACTAAGAACTTGCTATGCCCGTTTTGCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CAAAGTTATTAAAATTGCAACACCATATATGCATCATTATATGAAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127536 CAAAGTTATTAAAATTGCAACACCATATATGCATCATTATATGAAGCATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AG         AAAAAAGGAATACATCGTTGTACAAAATGCAGGCTGCAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127586 AGGTG...CAGAAAAAAGGAATACATCGTTGTACAAAATGCAGGCTGCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TTTTTGACATGCAAGGAGAAAATGGATCATAAGACTCAACACCATCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135339 TTTTTGACATGCAAGGAGAAAATGGATCATAAGACTCAACACCATCGAAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 ATTTATAAAACCTAAACAACTAGAAGGATTGCCTCCTGGAACAAAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 135389 ATTTATAAAACCTAAACAACTAGAAGGATTGCCTCCTGGAACAAAAGTG.

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507      GTTACTATTCGAGCTTCAGTTGGACCTCTGCAATCAGGAGCTTCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135439 ..TAGGTTACTATTCGAGCTTCAGTTGGACCTCTGCAATCAGGAGCTTCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CCTACACCTTCCATTAGTGCAAGTGCTTCTACCCTTCAGCTCTCACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137316 CCTACACCTTCCATTAGTGCAAGTGCTTCTACCCTTCAGCTCTCACCTCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AAGGACTAAAAATATAACTGCTAAAAATCCTGCAAAATCTAATACAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137366 AAGGACTAAAAATATAACTGCTAAAAATCCTGCAAAATCTAATACAAGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AACCTAATACAATCAAATCCAACGCAAGTAAACCTAATACAAGTAAGCCT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137416 AACCTAATACAGTCAAATCCAACGCAAGTAAACCTAATACAAGTAAGCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AATGGAAGTAAATCTAAATACAAACCAAAAATCTCTAATATGCAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137466 AATGGAAGTAAATCTAAATACAAACCAAAAATCTCTAATATGCAAAAGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 ACAAAGCACATTGGCTAGTAGCAATAAAAAAAGTAAAGTCAATACAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137516 ACAAAGCACATTGGCTAGTAGCAATAAAAAAAGTAAAGTCAATACAGCAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TGAGGAATTTAAG         GTATCGTCGGGGCATTCACAAATGCATT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 137566 TGAGGAATTTAAGGTA...AAGGTATCGTCGGGGCATTCACAAATGCATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GAGTGTTGTTCCGAAATAAAAGATTTTGCAAACCACTTTCCTACGTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137750 GAGTGTTGTTCCGAAATAAAAGATTTTGCAAACCACTTTCCTACGTACGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CCACTGTAGTTTTTGCAGATACAACACTAGCTGTAGCAAAGCCTATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137800 CCACTGTAGTTTTTGCAGATACAACACTAGCTGTAGCAAAGCCTATGTAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 ATCATATGATGAG         CTTTCATAGTAACCGTCCAAGCAAAAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 137850 ATCATATGATGAGGTA...CAGCTTTCATAGTAACCGTCCAAGCAAAAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 TTTTGTATTTTTAAGAAGCATTCAGAAAATCTCCG         GGGCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 145799 TTTTGTATTTTTAAGAAGCATTCAGAAAATCTCCGGTA...TAGGGGCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TACTCTAGTGTGCCTTAATTGTGATTTCCTAAGTGATGTTTCTGGCTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149760 TACTCTAGTGTGCCTTAATTGTGATTTCCTAAGTGATGTTTCTGGCTTAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ATAATATGGCTACACACTTAAGTCAACATAAAACTCATACTTGCCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149810 ATAATATGGCTACACACTTAAGTCAACATAAAACTCATACTTGCCAAGTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GTAATGCAGAAAG         TTTCTGTTTGTATCCCAACTTCTGAGCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 149860 GTAATGCAGAAAGGTA...CAGTTTCTGTTTGTATCCCAACTTCTGAGCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CCTTTCTGA         ATTAAAAAAAGAAGCTCCCGCAAAGGAACAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 150051 CCTTTCTGAGTA...AAGATTAAAAAAAGAAGCTCCCGCAAAGGAACAAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 AACCTGTGTCTAAG         GAAATTGCAAGACCTAACATGGCTGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 161292 AACCTGTGTCTAAGGTA...CAGGAAATTGCAAGACCTAACATGGCTGAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 AGAGAAACAGAAACATCAAATTCTGAAAG         TAAACAAGATAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 169034 AGAGAAACAGAAACATCAAATTCTGAAAGGTA...CAGTAAACAAGATAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 AGCTGCTTCTTCAAAAGAAAAAAATGGATGTAATGCAAATTCATTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172147 AGCTGCTTCTTCAAAAGAAAAAAATGGATGTAATGCAAATTCATTTGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 GCTCATCAACAACAAAAAGTGAAGAAAGCATAACAGTTTCAGATAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172197 GCTCATCAACAACAAAAAGTGAAGAAAGCATAACAGTTTCAGATAAGGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 AATGAAACCTGTCTTGCAGACCAGGAAACTGGCTCAAAAAACATCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172247 AATGAAACCTGTCTTGCAGACCAGGAAACTGGCTCAAAAAACATCGTCAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 TTGTGATTCAAATATTGGTGCAGATAAAGTGGAAAAGAAAAAACAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172297 TTGTGATTCAAATATTGGTGCAGATAAAGTGGAAAAGAAAAAACAAATAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 AACACGTTTGTCAGGAAATGGAGTTGAAGATGTGCCAAAGTTCAGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172347 AACACGTTTGTCAGGAAATGGAGTTGAAGATGTGCCAAAGTTCAGAAAAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 ATAATCTTATCTGATCAGATTAAAGATCACAACTCCAGTGAAGCCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172397 ATAATCTTATCTGATCAGATTAAAGATCACAACTCCAGTGAAGCCAGATT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 TTCTTCAAAGAATATTAAGGATTTGCGATTAGCATCAGATAATGTAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172447 TTCTTCAAAGAATATTAAGGATTTGCGATTAGCATCAGATAATGTAAGCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TTGATCAGTTTTTGAGAAAAAGACATGAACCTGAATCTGTTAGTTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172497 TTGATCAGTTTTTGAGAAAAAGACATGAACCTGAATCTGTTAGTTCTGAT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 GTTAGCGAGCAAGGCAGTATTCATTTGGAACCTCTGACTCCATCCGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172547 GTTAGCGAGCAAGGCAGTATTCATTTGGAACCTCTGACTCCATCCGAGGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 ACTTGAGTATGAAGCCACAGAGATTCTTCAGAAAGGTAGTGGTGATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172597 ACTTGAGTATGAAGCCACAGAGATTCTTCAGAAAGGTAGTGGTGATCCTT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 CAGCCAAGACTGATGAAGTAGTGTCTGATCAAACAGATGACATTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172647 CAGCCAAGACTGATGAAGTAGTGTCTGATCAAACAGATGACATTCCTGGA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 GGAAATAACCCTAGCACAACAGAGGCAACAGTAGACCTGGAAGATGAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 172697 GGAAATAACCCTAGCACAACAGAGGCAACAGTAGACCTGGAAGACGAAAA

   3050     .    :
   2889 AGAAAGAAGT
        ||||||||||
 172747 AGAAAGAAGT