seq1 = pF1KA1560.tfa, 2484 bp
seq2 = pF1KA1560/gi568815588r_112053553.tfa (gi568815588r:112053553_112281784), 228232 bp

>pF1KA1560 2484
>gi568815588r:112053553_112281784 (Chr10)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-225  (101190-101312)   100% ->
226-299  (103728-103801)   100% ->
300-413  (106072-106185)   100% ->
414-560  (107940-108086)   100% ->
561-657  (108719-108815)   98% ->
658-794  (109467-109603)   100% ->
795-894  (112833-112932)   100% ->
895-1107  (113261-113473)   100% ->
1108-1221  (115270-115383)   100% ->
1222-1307  (117175-117260)   100% ->
1308-1423  (117969-118084)   100% ->
1424-1494  (120048-120118)   100% ->
1495-1759  (120917-121181)   100% ->
1760-1902  (121732-121874)   100% ->
1903-1980  (123392-123469)   98% ->
1981-2121  (124396-124536)   100% ->
2122-2311  (125732-125921)   100% ->
2312-2370  (127098-127156)   100% ->
2371-2484  (128119-128232)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGAATCTGCACTGACCCTTGGTACAATAGATGTTTCTTATCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGAATCTGCACTGACCCTTGGTACAATAGATGTTTCTTATCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACATTCATCAGAATACAGTGTTGGTCGATGTAAGCACACAAGTGAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACATTCATCAGAATACAGTGTTGGTCGATGTAAGCACACAAGTGAGGAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GG         GGTGAGTGTGGCTTTAGACCCACCATCTTCAGATCTGCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTA...CAGGGTGAGTGTGGCTTTAGACCCACCATCTTCAGATCTGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTTTAAAATGGAAAGAAAGCCTAATGAGTCGGAAAAGGCCATTTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101229 ACTTTAAAATGGAAAGAAAGCCTAATGAGTCGGAAAAGGCCATTTGTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAGATGTTGTTACTCCTGCACTCCCCAGAGCTGG         GACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101279 AAGATGTTGTTACTCCTGCACTCCCCAGAGCTGGGTA...TAGGACAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTTTCAACCCCAGTATCCCGTCTTTGGGTTTGCGGAATGTTATTTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103735 TTTTCAACCCCAGTATCCCGTCTTTGGGTTTGCGGAATGTTATTTATATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATGAAACTCACACAAG         ACACCGCGGATGGCTTGCAAGACG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103785 AATGAAACTCACACAAGGTA...CAGACACCGCGGATGGCTTGCAAGACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTTTCTTACGTTCTTTTTATTCAAGAGCGAGATGTGCATAAGGGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106096 CCTTTCTTACGTTCTTTTTATTCAAGAGCGAGATGTGCATAAGGGCATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGCCACCAATGTGACTGAAAATGTGCTGAACAGCAGTAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106146 TTGCCACCAATGTGACTGAAAATGTGCTGAACAGCAGTAGGTA...CAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTACAAGAGGCAATTGCAGAAGTGGCTGCTGAATTAAACCCTGATGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107941 GTACAAGAGGCAATTGCAGAAGTGGCTGCTGAATTAAACCCTGATGGTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGCCCAGCAGCAATCAAAAGCCGTTAACAAAGTGAAAAAGAAAGCTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107991 TGCCCAGCAGCAATCAAAAGCCGTTAACAAAGTGAAAAAGAAAGCTAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGATTCTTCAAGAAATGGTTGCCACTGTCTCACCGGCAATGATCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 108041 GGATTCTTCAAGAAATGGTTGCCACTGTCTCACCGGCAATGATCAGGTA.

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    561      ACTGACTGGGTGGGTGCTGCTAAAACTGTTCAACAGCTTCTTTTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108091 ..CAGACTGACTGGGTGGGTGCTGCTAAAACTGTTCAACAGCTTCTTTTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAACTTTCAAATTCACAAAGGTCAACTTGAGATGGTTAAAGCTGCAACTG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108764 GAACATTCAAATTCACAAAGGTCAACTTGAGATGGTTAAAGCTGCAACTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AG         ACGAATTTGCCGCTTCTGTTTCTACCAGTTCATAGATCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108814 AGGCA...TAGACGAATTTGCCGCTTCTGTTTCTACCAGTTCATAGATCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CATATTGACTATCTGCTGCTCACTTTCATTCTCTTCTGCCATAACATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109506 CATATTGACTATCTGCTGCTCACTTTCATTCTCTTCTGCCATAACATCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGCACCATACATTGCTTCAGGCAATAATCTCAACATCCCAATCTTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 109556 AGCACCATACATTGCTTCAGGCAATAATCTCAACATCCCAATCTTCAGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    795        TACCTTGATCCATAAGCTTGGGGGCTTCTTCATACGACGAAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109606 A...TAGTACCTTGATCCATAAGCTTGGGGGCTTCTTCATACGACGAAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTCGATGAAACACCAGATGGACGGAAAGATGTTCTCTATAGAGCTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112876 CTCGATGAAACACCAGATGGACGGAAAGATGTTCTCTATAGAGCTTTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCATGGG         CATATAGTTGAATTACTTCGACAGCAGCAATTCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112926 CCATGGGGTA...CAGCATATAGTTGAATTACTTCGACAGCAGCAATTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGGAGATCTTCCTGGAAGGCACACGTTCTAGGAGTGGAAAAACCTCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113295 TGGAGATCTTCCTGGAAGGCACACGTTCTAGGAGTGGAAAAACCTCTTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCTCGGGCAGGACTTTTGTCAGTTGTGGTAGATACTCTGTCTACCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113345 GCTCGGGCAGGACTTTTGTCAGTTGTGGTAGATACTCTGTCTACCAATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CATCCCAGACATCTTGATAATACCTGTTGGAATCTCCTATGATCGCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113395 CATCCCAGACATCTTGATAATACCTGTTGGAATCTCCTATGATCGCATTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCGAAGGTCACTACAATGGTGAACAACTG         GGCAAACCTAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 113445 TCGAAGGTCACTACAATGGTGAACAACTGGTA...TAGGGCAAACCTAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AAGAATGAGAGCCTGTGGAGTGTAGCAAGAGGTGTTATTAGAATGTTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115282 AAGAATGAGAGCCTGTGGAGTGTAGCAAGAGGTGTTATTAGAATGTTACG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AAAAAACTATGGTTGTGTCCGAGTGGATTTTGCACAGCCATTTTCCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115332 AAAAAACTATGGTTGTGTCCGAGTGGATTTTGCACAGCCATTTTCCTTAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AG         GAATATTTAGAAAGCCAAAGTCAGAAACCGGTGTCTGCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115382 AGGTG...CAGGAATATTTAGAAAGCCAAAGTCAGAAACCGGTGTCTGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CTACTTTCCCTGGAGCAAGCGTTGTTACCAGCTATACTTCCTTCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 117214 CTACTTTCCCTGGAGCAAGCGTTGTTACCAGCTATACTTCCTTCAAGGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1308       ACCCAGTGATGCTGCTGATGAAGGTAGAGACACGTCCATTAATG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117264 ...TAGACCCAGTGATGCTGCTGATGAAGGTAGAGACACGTCCATTAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGTCCAGAAATGCAACAGATGAATCCCTACGAAGGAGGTTGATTGCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118013 AGTCCAGAAATGCAACAGATGAATCCCTACGAAGGAGGTTGATTGCAAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CTGGCTGAGCATATTCTATTCA         CTGCTAGCAAGTCCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 118063 CTGGCTGAGCATATTCTATTCAGTA...CAGCTGCTAGCAAGTCCTGTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CATTATGTCCACACACATTGTGGCTTGCCTGCTCCTCTACAGACACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120067 CATTATGTCCACACACATTGTGGCTTGCCTGCTCCTCTACAGACACAGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AG         GGAATTGATCTCTCCACATTGGTCGAAGACTTCTTTGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120117 AGGTA...TAGGGAATTGATCTCTCCACATTGGTCGAAGACTTCTTTGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 ATGAAAGAGGAAGTCCTGGCTCGTGATTTTGACCTGGGGTTCTCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120956 ATGAAAGAGGAAGTCCTGGCTCGTGATTTTGACCTGGGGTTCTCAGGAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TTCAGAAGATGTAGTAATGCATGCCATACAGCTGCTGGGAAATTGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121006 TTCAGAAGATGTAGTAATGCATGCCATACAGCTGCTGGGAAATTGTGTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CAATCACCCACACTAGCAGGAACGATGAGTTTTTTATCACCCCCAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121056 CAATCACCCACACTAGCAGGAACGATGAGTTTTTTATCACCCCCAGCACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ACTGTCCCATCAGTCTTCGAACTCAACTTCTACAGCAATGGGGTACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121106 ACTGTCCCATCAGTCTTCGAACTCAACTTCTACAGCAATGGGGTACTTCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TGTCTTTATCATGGAGGCCATCATAG         CTTGCAGCCTTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 121156 TGTCTTTATCATGGAGGCCATCATAGGTA...TAGCTTGCAGCCTTTATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 CAGTTCTGAACAAGAGGGGACTGGGGGGTCCCACTAGCACCCCACCTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121747 CAGTTCTGAACAAGAGGGGACTGGGGGGTCCCACTAGCACCCCACCTAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CTGATCAGCCAGGAGCAGCTGGTGCGGAAGGCGGCCAGCCTGTGCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121797 CTGATCAGCCAGGAGCAGCTGGTGCGGAAGGCGGCCAGCCTGTGCTACCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TCTCTCCAATGAAGGCACCATCTCACTG         CCTTGCCAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 121847 TCTCTCCAATGAAGGCACCATCTCACTGGTG...CAGCCTTGCCAGACAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TTTACCAAGTCTGCCATGAAACAGTAGGAAAGTTTATCCGGTATGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 123405 TTTACCAAGTCTGCCATGAAACAGTAGGAAAGTTTATCCAGTATGGCATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CTTACAGTGGCAGAG         CACGATGACCAGGAAGATATCAGTCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123455 CTTACAGTGGCAGAGGTA...TAGCACGATGACCAGGAAGATATCAGTCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TAGTCTTGCTGAGCAGCAGTGGGACAAGAAGCTTCCAGAACCTTTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124422 TAGTCTTGCTGAGCAGCAGTGGGACAAGAAGCTTCCAGAACCTTTGTCTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 GGAGAAGTGATGAAGAAGATGAAGACAGTGACTTTGGGGAGGAACAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124472 GGAGAAGTGATGAAGAAGATGAAGACAGTGACTTTGGGGAGGAACAGCGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GATTGCTACCTGAAG         GTGAGCCAATCCAAGGAGCACCAGCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 124522 GATTGCTACCTGAAGGTA...CAGGTGAGCCAATCCAAGGAGCACCAGCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 GTTTATCACCTTCTTACAGAGACTCCTTGGGCCTTTGCTGGAGGCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125758 GTTTATCACCTTCTTACAGAGACTCCTTGGGCCTTTGCTGGAGGCCTACA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 GCTCTGCTGCCATCTTTGTTCACAACTTCAGTGGTCCTGTTCCAGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125808 GCTCTGCTGCCATCTTTGTTCACAACTTCAGTGGTCCTGTTCCAGAACCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GAGTATCTGCAAAAGTTGCACAAATACCTAATAACCAGAACAGAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125858 GAGTATCTGCAAAAGTTGCACAAATACCTAATAACCAGAACAGAAAGAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 TGTTGCAGTATATG         CTGAGAGTGCCACATATTGTCTTGTGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 125908 TGTTGCAGTATATGGTA...CAGCTGAGAGTGCCACATATTGTCTTGTGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 AGAATGCTGTGAAAATGTTTAAGGATATTGGG         GTTTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 127125 AGAATGCTGTGAAAATGTTTAAGGATATTGGGGTA...TAGGTTTTCAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GAGACCAAACAAAAGAGAGTGTCTGTTTTAGAACTGAGCAGCACTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128128 GAGACCAAACAAAAGAGAGTGTCTGTTTTAGAACTGAGCAGCACTTTTCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 ACCTCAATGCAACCGACAAAAACTTCTAGAATATATTCTGAGTTTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128178 ACCTCAATGCAACCGACAAAAACTTCTAGAATATATTCTGAGTTTTGTGG

   2650     .
   2480 TGCTG
        |||||
 128228 TGCTG