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seq2 = pF1KA1534/gi568815587r_2988208.tfa (gi568815587r:2988208_3229148), 240941 bp

>pF1KA1534 2433
>gi568815587r:2988208_3229148 (Chr11)

(complement)

1-136  (100001-100136)   100% ->
137-219  (102594-102676)   100% ->
220-300  (106721-106801)   100% ->
301-402  (107051-107152)   100% ->
403-487  (109518-109602)   100% ->
488-662  (121204-121378)   100% ->
663-855  (121694-121886)   100% ->
856-1040  (124772-124956)   100% ->
1041-1122  (125829-125910)   100% ->
1123-1221  (126868-126966)   100% ->
1222-1318  (127450-127546)   100% ->
1319-1417  (128893-128991)   100% ->
1418-1515  (134815-134912)   100% ->
1516-1605  (135314-135403)   100% ->
1606-1742  (135486-135622)   100% ->
1743-1928  (136097-136282)   100% ->
1929-2055  (136591-136717)   100% ->
2056-2194  (138453-138591)   100% ->
2195-2297  (139201-139303)   100% ->
2298-2433  (140806-140941)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGAGGAGGCCTTCCTCCGGCGCCGCTTCTCCCTGTGTCCACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGAGGAGGCCTTCCTCCGGCGCCGCTTCTCCCTGTGTCCACCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCACCCCTCAGAAAGTCGACCCCCGGAAGCTCACCCGGAACTTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCACCCCTCAGAAAGTCGACCCCCGGAAGCTCACCCGGAACTTGCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAGCGGAGACAATGAGCTCTACCCACTCAGCCCAG         GGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100101 TCAGCGGAGACAATGAGCTCTACCCACTCAGCCCAGGTA...CAGGGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACATGGAGCCCAACGGCCCGTCGCTGCCCAGGGATGAAGGGCCCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102599 GACATGGAGCCCAACGGCCCGTCGCTGCCCAGGGATGAAGGGCCCCCGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCAAGCTCTGCCACGAAGGTGCCACCG         GCAGAGTACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102649 CCCAAGCTCTGCCACGAAGGTGCCACCGGTA...CAGGCAGAGTACAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTGCAACGGGTCAGACAAGGAATGTGTGTCCCCCACCGCCAGGGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106734 TGTGCAACGGGTCAGACAAGGAATGTGTGTCCCCCACCGCCAGGGTCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGAAGGAGACTCTCAAG         GCGCAGAAGGAGAACTACCGGCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106784 AAGAAGGAGACTCTCAAGGTG...CAGGCGCAGAAGGAGAACTACCGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGAGAAGAAGCGCGCCACACGGCAGCTGCTCAGCGCTCTGACAGACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107074 GGAGAAGAAGCGCGCCACACGGCAGCTGCTCAGCGCTCTGACAGACCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCGTGGTCATCATGGCTGACAGCCTGAAG         GGCCCCAAAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 107124 GCGTGGTCATCATGGCTGACAGCCTGAAGGTA...CAGGGCCCCAAAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGAGCGTGGGCTCCATCACACAGCCCCTGCCCAGCAGCTACCTGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109530 GAGAGCGTGGGCTCCATCACACAGCCCCTGCCCAGCAGCTACCTGATCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAGGGCCGCCTCCGAGTCAGATG         GTCGCTGCTGGCTGGACG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109580 CAGGGCCGCCTCCGAGTCAGATGGTG...CAGGTCGCTGCTGGCTGGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCCTGGAGCTGGCCCTGCGCTGCTCTAGCCTACTGAGACTGGGCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121222 CCCTGGAGCTGGCCCTGCGCTGCTCTAGCCTACTGAGACTGGGCACCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAGCCGGGCCGAGACGGGGAGCCAGGGACCTCGCCAGACGCATCACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121272 AAGCCGGGCCGAGACGGGGAGCCAGGGACCTCGCCAGACGCATCACCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATCGCTCTGTGGGCTGCCAGCCTCAGCCACCGTCCACCCAGACCAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121322 ATCGCTCTGTGGGCTGCCAGCCTCAGCCACCGTCCACCCAGACCAAGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGTTCCC         ACTGAACGGGTCTTCCCTGGAGAACGATGCATTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121372 TGTTCCCGTG...CAGACTGAACGGGTCTTCCCTGGAGAACGATGCATTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCAGACAAGTCGGAGAGAGAGAACCCTGAGGAGTCAGATACCGAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121728 TCAGACAAGTCGGAGAGAGAGAACCCTGAGGAGTCAGATACCGAGACCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGACCATAGCCGGAAGACGGAGAGTGGCAGCGACCAGTCAGAGACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121778 GGACCATAGCCGGAAGACGGAGAGTGGCAGCGACCAGTCAGAGACCCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGGCCCCGGTGCGGAGAGGGACCACCTATGTGGAGCAGGTCCAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121828 GGGCCCCGGTGCGGAGAGGGACCACCTATGTGGAGCAGGTCCAGGAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTGGGGGAG         CTGGGCGAGGCGTCCCAGGTGGAGACAGTGTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 121878 CTGGGGGAGGTG...CAGCTGGGCGAGGCGTCCCAGGTGGAGACAGTGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGAGGAGAACAAGAGTCTGATGTGGACCCTGCTGAAGCAGCTACGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124804 AGAGGAGAACAAGAGTCTGATGTGGACCCTGCTGAAGCAGCTACGGCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCATGGACCTGTCCCGCGTGGTGCTACCCACGTTCGTACTGGAGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124854 GCATGGACCTGTCCCGCGTGGTGCTACCCACGTTCGTACTGGAGCCGCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCCTTCCTGAACAAGCTCTCCGACTACTACTACCACGCAGACCTGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124904 TCCTTCCTGAACAAGCTCTCCGACTACTACTACCACGCAGACCTGCTCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAG         GGCTGCGGTGGAGGAGGATGCCTACAGCCGCATGAAGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124954 CAGGTG...CAGGGCTGCGGTGGAGGAGGATGCCTACAGCCGCATGAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGTGCTGCGGTGGTACCTGTCTGGCTTCTACAAGAAGCCCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 125867 TGGTGCTGCGGTGGTACCTGTCTGGCTTCTACAAGAAGCCCAAGGTG...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1123    GGAATCAAGAAGCCGTACAACCCCATCCTGGGGGAGACCTTCCGCTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126865 CAGGGAATCAAGAAGCCGTACAACCCCATCCTGGGGGAGACCTTCCGCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTGCTGGTTCCACCCGCAGACTGACAGCCGCACATTCTACATAGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126915 CTGCTGGTTCCACCCGCAGACTGACAGCCGCACATTCTACATAGCAGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AG         GTGTCCCACCACCCGCCCGTGTCTGCCTTCCACGTCAGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126965 AGGCA...CAGGTGTCCCACCACCCGCCCGTGTCTGCCTTCCACGTCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AACCGGAAGGACGGCTTCTGCATCAGTGGCAGCATCACAGCCAAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127489 AACCGGAAGGACGGCTTCTGCATCAGTGGCAGCATCACAGCCAAGTCCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GTTTTATG         GGAACTCGCTGTCGGCGCTGCTGGACGGCAAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 127539 GTTTTATGGTG...CAGGGAACTCGCTGTCGGCGCTGCTGGACGGCAAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CCACGCTCACCTTCCTGAACCGAGCCGAGGATTACACCCTTACCATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128926 CCACGCTCACCTTCCTGAACCGAGCCGAGGATTACACCCTTACCATGCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TACGCCCACTGCAAAG         GAATCCTGTATGGCACGATGACCCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 128976 TACGCCCACTGCAAAGGTG...CAGGAATCCTGTATGGCACGATGACCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGAGCTGGGTGGGAAGGTCACCATCGAGTGTGCGAAGAACAACTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134840 GGAGCTGGGTGGGAAGGTCACCATCGAGTGTGCGAAGAACAACTTCCAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CCCAGCTGGAATTCAAACTCAAG         CCCTTCTTCGGGGGTAGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 134890 CCCAGCTGGAATTCAAACTCAAGGTA...CAGCCCTTCTTCGGGGGTAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 ACCAGCATCAACCAGATCTCGGGAAAGATCACGTCGGGAGAGGAAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135332 ACCAGCATCAACCAGATCTCGGGAAAGATCACGTCGGGAGAGGAAGTCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GGCGAGCCTCAGTGGCCACTGG         GACAGGGACGTGTTTATCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 135382 GGCGAGCCTCAGTGGCCACTGGGTA...CAGGACAGGGACGTGTTTATCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 AGGAGGAAGGGAGCGGAAGCAGTGCGCTTTTCTGGACCCCGAGCGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135505 AGGAGGAAGGGAGCGGAAGCAGTGCGCTTTTCTGGACCCCGAGCGGGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GTCCGCAGACAGAGGCTGAGGCAGCACACGGTGCCGCTGGAGGAGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135555 GTCCGCAGACAGAGGCTGAGGCAGCACACGGTGCCGCTGGAGGAGCAGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GGAGCTGGAGTCCGAGAG         GCTCTGGCAGCACGTCACCAGGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 135605 GGAGCTGGAGTCCGAGAGGTG...CAGGCTCTGGCAGCACGTCACCAGGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 CCATCAGCAAGGGCGACCAGCACAGGGCCACACAGGAGAAGTTTGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136120 CCATCAGCAAGGGCGACCAGCACAGGGCCACACAGGAGAAGTTTGCACTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GAGGAGGCACAGCGGCAGCGGGCCCGTGAGCGGCAGGAGAGCCTCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136170 GAGGAGGCACAGCGGCAGCGGGCCCGTGAGCGGCAGGAGAGCCTCATGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CTGGAAGCCGCAGCTGTTCCACCTGGACCCCATCACCCAGGAGTGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136220 CTGGAAGCCGCAGCTGTTCCACCTGGACCCCATCACCCAGGAGTGGCACT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ACCGATACGAGGA         CCACAGCCCCTGGGACCCCCTGAAGGAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 136270 ACCGATACGAGGAGTG...CAGCCACAGCCCCTGGGACCCCCTGAAGGAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 ATCGCCCAGTTTGAGCAAGACGGGATCCTGCGGACCTTGCAGCAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136619 ATCGCCCAGTTTGAGCAAGACGGGATCCTGCGGACCTTGCAGCAGGAGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CGTGGCCCGCCAGACCACCTTCCTGGGCAGCCCAGGGCCCAGGCACGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 136669 CGTGGCCCGCCAGACCACCTTCCTGGGCAGCCCAGGGCCCAGGCACGAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056         AGGTCTGGCCCAGACCAGCGGCTTCGCAAGGCCAGCGACCAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136719 TC...CAGAGGTCTGGCCCAGACCAGCGGCTTCGCAAGGCCAGCGACCAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CCCTCCGGCCACAGCCAGGCCACGGAGAGCAGCGGATCCACGCCTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138495 CCCTCCGGCCACAGCCAGGCCACGGAGAGCAGCGGATCCACGCCTGAGTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CTGCCCAGAGCTCTCAGACGAGGAGCAGGATGGTGACTTTGTCCCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 138545 CTGCCCAGAGCTCTCAGACGAGGAGCAGGATGGTGACTTTGTCCCTGGTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2195       GCGGTGAGAGCCCATGCCCTCGGTGCAGGAAGGAGGCGCGGCGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138595 ...CAGGCGGTGAGAGCCCATGCCCTCGGTGCAGGAAGGAGGCGCGGCGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 CTGCAGGCCCTGCACGAGGCCATCCTCTCCATCCGAGAGGCCCAGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139245 CTGCAGGCCCTGCACGAGGCCATCCTCTCCATCCGAGAGGCCCAGCAGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GCTGCACAG         GCACCTCTCGGCCATGCTGAGCTCCACGGCAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 139295 GCTGCACAGGTG...CAGGCACCTCTCGGCCATGCTGAGCTCCACGGCAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 GGGCAGCACAGGCACCGACCCCAGGCCTCCTGCAGAGCCCCCGATCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140838 GGGCAGCACAGGCACCGACCCCAGGCCTCCTGCAGAGCCCCCGATCCTGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 TTCCTGCTCTGCGTGTTCCTGGCGTGTCAGCTGTTCATTAACCACATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140888 TTCCTGCTCTGCGTGTTCCTGGCGTGTCAGCTGTTCATTAACCACATCCT

   2600 
   2430 CAAA
        ||||
 140938 CAAA