Result of SIM4 for
pF1KA1531
seq1 = pF1KA1531.tfa, 3363 bp
seq2 = pF1KA1531/gi568815590f_37697355.tfa (gi568815590f:37697355_37942352), 244998 bp
>pF1KA1531 3363
>gi568815590f:37697355_37942352 (Chr8)
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267-338 (117542-117613) 100% ->
339-410 (131534-131605) 100% ->
411-482 (131907-131978) 100% ->
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2097-3363 (143732-144998) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGCGCCGGGGGACGCAGGATGCGGGGGGCGCCCGCGCGCCTGCTGCT
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99915 ATGGGCGCCGGGGGACGCAGGATGCGGGGGGCGCCCGCGCGCCTGCTGCT
50 . : . : . : . : . :
51 GCCGCTGCTGCCGTGGCTCCTGCTGCTCCTGGCGCCCGAGGCTCGGGGCG
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99965 GCCGCTGCTGCCGTGGCTCCTGCTGCTCCTGGCGCCCGAGGCTCGGGGCG
100 . : . : . : . : . :
101 CGCCCGGCTGCCCGCTATCCATCCGCAGCTGCAAGTGCTCGGGGGAGCGG
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100015 CGCCCGGCTGCCCGCTATCCATCCGCAGCTGCAAGTGCTCGGGGGAGCGG
150 . : . : . : . : . :
151 CCCAAGGGGCTGAGCGGCGGCGTCCCTGGCCCGGCTCGGCGGAGGGTGGT
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100065 CCCAAGGGGCTGAGCGGCGGCGTCCCTGGCCCGGCTCGGCGGAGGGTGGT
200 . : . : . : . : . :
201 GTGCAGCGGCGGGGACCTCCCGGAGCCTCCCGAGCCCGGCCTTCTGCCTA
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100115 GTGCAGCGGCGGGGACCTCCCGGAGCCTCCCGAGCCCGGCCTTCTGCCTA
250 . : . : . : . : . :
251 ACGGCACCGTTACCCT GCTCTTGAGCAATAACAAGATCACG
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100165 ACGGCACCGTTACCCTGTG...CAGGCTCTTGAGCAATAACAAGATCACG
300 . : . : . : . : . :
292 GGGCTCCGCAATGGCTCCTTCCTGGGACTGTCACTGCTGGAGAAGCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
117567 GGGCTCCGCAATGGCTCCTTCCTGGGACTGTCACTGCTGGAGAAGCTGTA
350 . : . : . : . : . :
339 GGACCTGAGGAACAACATCATCAGCACAGTGCAGCCGGGCGCCT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117617 ...CAGGGACCTGAGGAACAACATCATCAGCACAGTGCAGCCGGGCGCCT
400 . : . : . : . : . :
383 TCCTGGGCCTGGGGGAGCTGAAGCGTTT AGATCTCTCCAAC
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131578 TCCTGGGCCTGGGGGAGCTGAAGCGTTTGTG...TAGAGATCTCTCCAAC
450 . : . : . : . : . :
424 AACCGGATTGGCTGTCTCACCTCCGAGACCTTCCAGGGCCTCCCCAGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131920 AACCGGATTGGCTGTCTCACCTCCGAGACCTTCCAGGGCCTCCCCAGGCT
500 . : . : . : . : . :
474 TCTCCGACT AAACATATCTGGAAACATCTTCTCCAGTCTGC
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131970 TCTCCGACTGTA...CAGAAACATATCTGGAAACATCTTCTCCAGTCTGC
550 . : . : . : . : . :
515 AACCTGGGGTCTTTGATGAGCTGCCAGCCCTTAAGGTTGT G
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
132166 AACCTGGGGTCTTTGATGAGCTGCCAGCCCTTAAGGTTGTGTG...CAGG
600 . : . : . : . : . :
556 GACTTGGGCACCGAGTTCCTGACCTGTGACTGCCACCTGCGCTGGCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132498 GACTTGGGCACCGAGTTCCTGACCTGTGACTGCCACCTGCGCTGGCTGCT
650 . : . : . : . : . :
606 GCCCTGGGCCCAGAATCGCTCCCTGCAGCTGTCGGAACACACGCTCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132548 GCCCTGGGCCCAGAATCGCTCCCTGCAGCTGTCGGAACACACGCTCTGTG
700 . : . : . : . : . :
656 CTTACCCCAGTGCCCTGCATGCTCAGGCCCTGGGCAGCCTCCAGGAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132598 CTTACCCCAGTGCCCTGCATGCTCAGGCCCTGGGCAGCCTCCAGGAGGCC
750 . : . : . : . : . :
706 CAGCTCTGCTGCG AGGGGGCCCTGGAGCTGCACACACACCA
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132648 CAGCTCTGCTGCGGTG...CAGAGGGGGCCCTGGAGCTGCACACACACCA
800 . : . : . : . : . :
747 CCTCATCCCGTCCCTACGCCAAGTGGTGTTCCAGGGGGATCGGCTGCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133384 CCTCATCCCGTCCCTACGCCAAGTGGTGTTCCAGGGGGATCGGCTGCCCT
850 . : . : . : . : . :
797 TCCAGTGCTCTGCCAGCTACCTGGGCAACGACACCCGCATCCGCTGGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133434 TCCAGTGCTCTGCCAGCTACCTGGGCAACGACACCCGCATCCGCTGGTAC
900 . : . : . : . : . :
847 CACAACCGAGCCCCTGTGGAGGGTGATGAGCAGGCGGGCATCCTCCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133484 CACAACCGAGCCCCTGTGGAGGGTGATGAGCAGGCGGGCATCCTCCTGGC
950 . : . : . : . : . :
897 CGAGAGCCTCATCCACGACTGCACCTTCATCACCAG TGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
133534 CGAGAGCCTCATCCACGACTGCACCTTCATCACCAGGTA...CAGTGAGC
1000 . : . : . : . : . :
938 TGACGCTGTCTCACATCGGCGTGTGGGCCTCAGGCGAGTGGGAGTGCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134074 TGACGCTGTCTCACATCGGCGTGTGGGCCTCAGGCGAGTGGGAGTGCACC
1050 . : . : . : . : . :
988 GTGTCCATGGCCCAAGGCAACGCCAGCAAGAAGGTGGAGATCGTGGTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134124 GTGTCCATGGCCCAAGGCAACGCCAGCAAGAAGGTGGAGATCGTGGTGCT
1100 . : . : . : . : . :
1038 GGAGACCTCTGCCTCCTACTGCCCCGCCGAGCGTGTTGCCAACAACCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134174 GGAGACCTCTGCCTCCTACTGCCCCGCCGAGCGTGTTGCCAACAACCGCG
1150 . : . : . : . : . :
1088 GGGACTTCAG GTGGCCCCGAACTCTGGCTGGCATCACAGCC
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
134224 GGGACTTCAGGTT...CAGGTGGCCCCGAACTCTGGCTGGCATCACAGCC
1200 . : . : . : . : . :
1129 TACCAGTCCTGCCTGCAGTATCCCTTCACCTCAGTGCCCCTGGGCGGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135687 TACCAGTCCTGCCTGCAGTATCCCTTCACCTCAGTGCCCCTGGGCGGGGG
1250 . : . : . : . : . :
1179 TGCCCCGGGCACCCGAGCCTCCCGCCGGTGTGACCGTGCCGGCCGCTGGG
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135737 TGCCCCGGGCACCCGAGCCTCCCGCCGGTGTGACCGTGCCGGCCGCTGGG
1300 . : . : . : . : . :
1229 AGCCAGGGGACTACTCCCACTGTCTCTACACCAACGACATCACCAGGGTG
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135787 AGCCAGGGGACTACTCCCACTGTCTCTACACCAACGACATCACCAGGGTG
1350 . : . : . : . : . :
1279 CTGTACACCTTCGTGCTG ATGCCCATCAATGCCTCCAATGC
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135837 CTGTACACCTTCGTGCTGGTG...CAGATGCCCATCAATGCCTCCAATGC
1400 . : . : . : . : . :
1320 GCTGACCCTGGCTCACCAGCTGCGCGTGTACACAGCCGAGGCCGCTAGCT
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136357 GCTGACCCTGGCTCACCAGCTGCGCGTGTACACAGCCGAGGCCGCTAGCT
1450 . : . : . : . : . :
1370 TTTCAGACATGATGGATGTAGTCTATGTGGCTCAGATGATCCAGAAATTT
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136407 TTTCAGACATGATGGATGTAGTCTATGTGGCTCAGATGATCCAGAAATTT
1500 . : . : . : . : . :
1420 TTGGGTTATGTCGACCAGATCAAAGAG CTGGTAGAGGTGAT
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136457 TTGGGTTATGTCGACCAGATCAAAGAGGTG...CAGCTGGTAGAGGTGAT
1550 . : . : . : . : . :
1461 GGTGGACATGGCCAGCAACCTGATGCTGGTGGACGAGCACCTGCTGTGGC
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136627 GGTGGACATGGCCAGCAACCTGATGCTGGTGGACGAGCACCTGCTGTGGC
1600 . : . : . : . : . :
1511 TGGCCCAGCGCGAGGACAAGGCCTGCAGCCGCATCGTGGGTGCCCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136677 TGGCCCAGCGCGAGGACAAGGCCTGCAGCCGCATCGTGGGTGCCCTGGAG
1650 . : . : . : . : . :
1561 CGCATTGGGGGGGCCGCCCTCAGCCCCCATGCCCAGCACATCTCAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
136727 CGCATTGGGGGGGCCGCCCTCAGCCCCCATGCCCAGCACATCTCAGTGGT
1700 . : . : . : . : . :
1609 GAGCTGAGCGCCTTTCCCAGGGAGGTGGGGGGCGCCGGGGCAG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136777 A...CAGGAGCTGAGCGCCTTTCCCAGGGAGGTGGGGGGCGCCGGGGCAG
1750 . : . : . : . : . :
1652 GGCTGCACCCCGTGGTATACCCCTGCACGGCCTTGCTGCTGCTCTGCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141645 GGCTGCACCCCGTGGTATACCCCTGCACGGCCTTGCTGCTGCTCTGCCTC
1800 . : . : . : . : . :
1702 TTCGCCACCATCATCACCTACATCCTCAACCACAG CTCCAT
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141695 TTCGCCACCATCATCACCTACATCCTCAACCACAGGTG...CAGCTCCAT
1850 . : . : . : . : . :
1743 CCGTGTGTCCCGGAAAGGCTGGCACATGCTGCTGAACTTGTGCTTCCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142151 CCGTGTGTCCCGGAAAGGCTGGCACATGCTGCTGAACTTGTGCTTCCACA
1900 . : . : . : . : . :
1793 TAGCCATGACCTCTGCTGTCTTTGCGGGGGGCATCACACTCACCAACTAC
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142201 TAGCCATGACCTCTGCTGTCTTTGCGGGGGGCATCACACTCACCAACTAC
1950 . : . : . : . : . :
1843 CAGATGGTCTGCCAGGCG GTGGGCATCACCCTGCACTACTC
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142251 CAGATGGTCTGCCAGGCGGTA...CAGGTGGGCATCACCCTGCACTACTC
2000 . : . : . : . : . :
1884 CTCCCTATCCACGCTGCTCTGGATGGGCGTGAAGGCGCGAGTGCTCCATA
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142790 CTCCCTATCCACGCTGCTCTGGATGGGCGTGAAGGCGCGAGTGCTCCATA
2050 . : . : . : . : . :
1934 AGGAGCTCACCTGGAGGGCACCCCCTCCGCAAGAAGGGGACCCCGCTCTG
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142840 AGGAGCTCACCTGGAGGGCACCCCCTCCGCAAGAAGGGGACCCCGCTCTG
2100 . : . : . : . : . :
1984 CCTACTCCCAGTCCTATGCTCCG GTTCTATTTGATCGCTGG
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142890 CCTACTCCCAGTCCTATGCTCCGGTA...CAGGTTCTATTTGATCGCTGG
2150 . : . : . : . : . :
2025 AGGGATTCCACTCATTATCTGTGGCATCACAGCTGCAGTCAACATCCACA
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143424 AGGGATTCCACTCATTATCTGTGGCATCACAGCTGCAGTCAACATCCACA
2200 . : . : . : . : . :
2075 ACTACCGGGACCACAGCCCCTA CTGCTGGCTGGTGTGGCGT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
143474 ACTACCGGGACCACAGCCCCTAGTG...CAGCTGCTGGCTGGTGTGGCGT
2250 . : . : . : . : . :
2116 CCAAGCCTTGGCGCCTTCTACATCCCTGTGGCTTTGATTCTGCTCATCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143751 CCAAGCCTTGGCGCCTTCTACATCCCTGTGGCTTTGATTCTGCTCATCAC
2300 . : . : . : . : . :
2166 CTGGATCTATTTCCTGTGCGCCGGGCTACGCTTACGGGGTCCTCTGGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143801 CTGGATCTATTTCCTGTGCGCCGGGCTACGCTTACGGGGTCCTCTGGCAC
2350 . : . : . : . : . :
2216 AGAACCCCAAGGCGGGCAACAGCAGGGCCTCCCTGGAGGCAGGGGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143851 AGAACCCCAAGGCGGGCAACAGCAGGGCCTCCCTGGAGGCAGGGGAGGAG
2400 . : . : . : . : . :
2266 CTGAGGGGTTCCACCAGGCTCAGGGGCAGCGGCCCCCTCCTGAGTGACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143901 CTGAGGGGTTCCACCAGGCTCAGGGGCAGCGGCCCCCTCCTGAGTGACTC
2450 . : . : . : . : . :
2316 AGGTTCCCTTCTTGCTACTGGGAGCGCGCGAGTGGGGACGCCCGGGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143951 AGGTTCCCTTCTTGCTACTGGGAGCGCGCGAGTGGGGACGCCCGGGCCCC
2500 . : . : . : . : . :
2366 CGGAGGATGGTGACAGCCTCTATTCTCCGGGAGTCCAGCTAGGGGCGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144001 CGGAGGATGGTGACAGCCTCTATTCTCCGGGAGTCCAGCTAGGGGCGCTG
2550 . : . : . : . : . :
2416 GTGACCACGCACTTCCTGTACTTGGCCATGTGGGCCTGCGGGGCTCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144051 GTGACCACGCACTTCCTGTACTTGGCCATGTGGGCCTGCGGGGCTCTGGC
2600 . : . : . : . : . :
2466 AGTGTCCCAGCGCTGGCTGCCCCGGGTGGTGTGCAGCTGCTTGTACGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144101 AGTGTCCCAGCGCTGGCTGCCCCGGGTGGTGTGCAGCTGCTTGTACGGGG
2650 . : . : . : . : . :
2516 TGGCAGCCTCCGCCCTGGGCCTCTTCGTCTTCACTCACCACTGTGCCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144151 TGGCAGCCTCCGCCCTGGGCCTCTTCGTCTTCACTCACCACTGTGCCAGG
2700 . : . : . : . : . :
2566 CGGAGGGACGTGAGAGCCTCGTGGCGCGCCTGCTGCCCCCCTGCCTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144201 CGGAGGGACGTGAGAGCCTCGTGGCGCGCCTGCTGCCCCCCTGCCTCTCC
2750 . : . : . : . : . :
2616 CGCGGCCCCCCATGCCCCGCCCCGGGCCCTGCCCGCCGCCGCAGAGGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144251 CGCGGCCCCCCATGCCCCGCCCCGGGCCCTGCCCGCCGCCGCAGAGGACG
2800 . : . : . : . : . :
2666 GTTCCCCGGTGTTCGGGGAGGGGCCCCCCTCCCTCAAGTCCTCCCCAAGC
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
144301 GTTCCCCGGTGTTCGGGGAGGGCCCCCCCTCCCTCAAGTCCTCCCCAAGC
2850 . : . : . : . : . :
2716 GGCAGCAGCGGCCATCCGCTGGCTCTGGGCCCCTGCAAGCTCACCAACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144351 GGCAGCAGCGGCCATCCGCTGGCTCTGGGCCCCTGCAAGCTCACCAACCT
2900 . : . : . : . : . :
2766 GCAGCTGGCCCAGAGTCAGGTGTGCGAGGCGGGGGCGGCGGCCGGCGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144401 GCAGCTGGCCCAGAGTCAGGTGTGCGAGGCGGGGGCGGCGGCCGGCGGGG
2950 . : . : . : . : . :
2816 AAGGAGAGCCGGAGCCGGCGGGCACCCGGGGAAACCTCGCCCACCGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144451 AAGGAGAGCCGGAGCCGGCGGGCACCCGGGGAAACCTCGCCCACCGCCAC
3000 . : . : . : . : . :
2866 CCCAACAACGTGCACCACGGGCGTCGGGCGCACAAGAGCCGGGCCAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144501 CCCAACAACGTGCACCACGGGCGTCGGGCGCACAAGAGCCGGGCCAAGGG
3050 . : . : . : . : . :
2916 ACACCGCGCGGGGGAGGCCTGCGGCAAGAACCGGCTCAAGGCCCTGCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144551 ACACCGCGCGGGGGAGGCCTGCGGCAAGAACCGGCTCAAGGCCCTGCGCG
3100 . : . : . : . : . :
2966 GGGGCGCGGCGGGGGCGCTGGAGCTGCTGTCCAGCGAGAGCGGTGGTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
144601 GGGGCGCGGCGGGGGCGCTGGAGCTGCTGTCCAGCGAGAGCGGCAGTCTG
3150 . : . : . : . : . :
3016 CACAACAGCCCCACCGACAGCTACCTGGGCAGCAGCCGCAACAGCCCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144651 CACAACAGCCCCACCGACAGCTACCTGGGCAGCAGCCGCAACAGCCCGGG
3200 . : . : . : . : . :
3066 CGCCGGCCTGCAGCTGGAAGGCGAGCCCATGCTCACGCCGTCCGAGGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144701 CGCCGGCCTGCAGCTGGAAGGCGAGCCCATGCTCACGCCGTCCGAGGGCA
3250 . : . : . : . : . :
3116 GCGACACCAGCGCCGCGCCGCTTTCTGAGGCGGGCCGGGCAGGCCAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144751 GCGACACCAGCGCCGCGCCGCTTTCTGAGGCGGGCCGGGCAGGCCAGCGC
3300 . : . : . : . : . :
3166 CGCAGCGCCAGCCGCGACAGTCTCAAGGGCGGCGGCGCGCTGGAGAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144801 CGCAGCGCCAGCCGCGACAGTCTCAAGGGCGGCGGCGCGCTGGAGAAGGA
3350 . : . : . : . : . :
3216 GAGCCATCGCCGCTCGTACCCGCTCAACGCCGCCAGCCTAAACGGCGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144851 GAGCCATCGCCGCTCGTACCCGCTCAACGCCGCCAGCCTAAACGGCGCCC
3400 . : . : . : . : . :
3266 CCAAGGGGGGCAAGTACGACGACGTCACCCTGATGGGCGCGGAGGTAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144901 CCAAGGGGGGCAAGTACGACGACGTCACCCTGATGGGCGCGGAGGTAGCC
3450 . : . : . : . : .
3316 AGCGGCGGCTGCATGAAGACCGGACTCTGGAAGAGCGAAACTACCGTC
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144951 AGCGGCGGCTGCATGAAGACCGGACTCTGGAAGAGCGAAACTACCGTC