Result of SIM4 for
pF1KA1525
seq1 = pF1KA1525.tfa, 3396 bp
seq2 = pF1KA1525/gi568815584r_93142276.tfa (gi568815584r:93142276_93396051), 253776 bp
>pF1KA1525 3396
>gi568815584r:93142276_93396051 (Chr14)
(complement)
1-82 (100001-100082) 100% ->
83-1162 (101115-102194) 100% ->
1163-1371 (132059-132267) 100% ->
1372-1447 (134375-134450) 100% ->
1448-1608 (138697-138857) 100% ->
1609-1752 (142262-142405) 100% ->
1753-1942 (144400-144589) 100% ->
1943-2121 (147398-147576) 100% ->
2122-2583 (149766-150227) 100% ->
2584-3396 (152964-153776) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGTGCTAATGCATCTAATTATCCTCATTCATGTTCCCCGAGGGTAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGGTGCTAATGCATCTAATTATCCTCATTCATGTTCCCCGAGGGTAGG
50 . : . : . : . : . :
51 GGGAAATTCACAGGCCCAACAGACTTTTATAG GGACCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
100051 GGGAAATTCACAGGCCCAACAGACTTTTATAGGTA...TAGGGACCTCAT
100 . : . : . : . : . :
92 CCTATTCTCAGCAAGGCTATGGTTGCGAATCAAAGTTGTATAGCCTTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101124 CCTATTCTCAGCAAGGCTATGGTTGCGAATCAAAGTTGTATAGCCTTGAC
150 . : . : . : . : . :
142 CATGGCCATGAGAAACCACAAGACAAAAAAAAGAGAACCTCTGGTCTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101174 CATGGCCATGAGAAACCACAAGACAAAAAAAAGAGAACCTCTGGTCTTGC
200 . : . : . : . : . :
192 CACCCTCAAAAAGAAGTTTATTAAGCGTCGGAAATCTAATAGGTCTGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101224 CACCCTCAAAAAGAAGTTTATTAAGCGTCGGAAATCTAATAGGTCTGCCG
250 . : . : . : . : . :
242 ATCATGCCAAGCAGATGCGAGAACTCCTCTCTGGGTGGGATGTTAGAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101274 ATCATGCCAAGCAGATGCGAGAACTCCTCTCTGGGTGGGATGTTAGAGAT
300 . : . : . : . : . :
292 GTCAATGCATTAGTGGAGGAATATGAGGGAACATCAGCATTAAAGGAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101324 GTCAATGCATTAGTGGAGGAATATGAGGGAACATCAGCATTAAAGGAGCT
350 . : . : . : . : . :
342 TTCTCTACAAGCCAGTTTGGCTAGACCAGAAGCCCGGACATTGCAGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101374 TTCTCTACAAGCCAGTTTGGCTAGACCAGAAGCCCGGACATTGCAGAAAG
400 . : . : . : . : . :
392 ATATGGCTGATCTTTATGAGTACAAGTATTGTACTGATGTAGACTTAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101424 ATATGGCTGATCTTTATGAGTACAAGTATTGTACTGATGTAGACTTAATA
450 . : . : . : . : . :
442 TTTCAAGAAACTTGTTTTCCTGTTCATCGTGCCATTTTGGCAGCAAGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101474 TTTCAAGAAACTTGTTTTCCTGTTCATCGTGCCATTTTGGCAGCAAGGTG
500 . : . : . : . : . :
492 TCCATTTTTTAAAACACTGCTTTCTTCCTCACCAGAGTATGGGGCAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101524 TCCATTTTTTAAAACACTGCTTTCTTCCTCACCAGAGTATGGGGCAGAGA
550 . : . : . : . : . :
542 TAATAATGGACATCAATACAGCTGGTATTGATATGCCCATGTTTTCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101574 TAATAATGGACATCAATACAGCTGGTATTGATATGCCCATGTTTTCTGCT
600 . : . : . : . : . :
592 TTGTTACACTACCTTTATACAGGAGAGTTTGGAATGGAGGACTCAAGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101624 TTGTTACACTACCTTTATACAGGAGAGTTTGGAATGGAGGACTCAAGGTT
650 . : . : . : . : . :
642 TCAAAATGTCGATATCCTTGTTCAGCTTAGTGAAGAATTTGGAACACCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101674 TCAAAATGTCGATATCCTTGTTCAGCTTAGTGAAGAATTTGGAACACCAA
700 . : . : . : . : . :
692 ATTCCCTTGATGTAGATATGCGTGGACTCTTTGATTACATGTGTTATTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101724 ATTCCCTTGATGTAGATATGCGTGGACTCTTTGATTACATGTGTTATTAT
750 . : . : . : . : . :
742 GATGTCGTCCTTAGTTTTTCTTCAGACTCTGAACTGGTTGAAGCTTTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101774 GATGTCGTCCTTAGTTTTTCTTCAGACTCTGAACTGGTTGAAGCTTTTGG
800 . : . : . : . : . :
792 TGGAAATCAGAACTGTTTAGATGAAGAGCTCAAAGCCCACAAGGCTGTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101824 TGGAAATCAGAACTGTTTAGATGAAGAGCTCAAAGCCCACAAGGCTGTTA
850 . : . : . : . : . :
842 TTTCTGCACGGTCCCCATTTTTTCGAAATTTATTACAAAGGAGGATACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101874 TTTCTGCACGGTCCCCATTTTTTCGAAATTTATTACAAAGGAGGATACGA
900 . : . : . : . : . :
892 ACTGGTGAAGAAATCACAGACCGAACTTTGAGGACTCCCACAAGAATTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101924 ACTGGTGAAGAAATCACAGACCGAACTTTGAGGACTCCCACAAGAATTAT
950 . : . : . : . : . :
942 ATTAGATGAGTCCATTATACCAAAAAAATATGCAACAGTGATATTACACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101974 ATTAGATGAGTCCATTATACCAAAAAAATATGCAACAGTGATATTACACT
1000 . : . : . : . : . :
992 GTATGTATACCGACGTGGTGGACCTCTCTGTTTTGCACTGTAGCCCCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102024 GTATGTATACCGACGTGGTGGACCTCTCTGTTTTGCACTGTAGCCCCTCT
1050 . : . : . : . : . :
1042 GTGGGGAGTCTCAGTGAAGTTCAGGCTCTCGTCGCAGGGAAGCCAAACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102074 GTGGGGAGTCTCAGTGAAGTTCAGGCTCTCGTCGCAGGGAAGCCAAACAT
1100 . : . : . : . : . :
1092 GACCAGGGCAGAAGAAGCCATGGAACTTTACCACATAGCACTGTTCTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102124 GACCAGGGCAGAAGAAGCCATGGAACTTTACCACATAGCACTGTTCTTGG
1150 . : . : . : . : . :
1142 AATTTAACATGCTTGCACAAG GCTGTGAGGATATCATTGCT
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
102174 AATTTAACATGCTTGCACAAGGTA...TAGGCTGTGAGGATATCATTGCT
1200 . : . : . : . : . :
1183 GAGAGCATCTCATTAGATACCTTAATTGCCATCCTCAAGTGGAGTTCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132079 GAGAGCATCTCATTAGATACCTTAATTGCCATCCTCAAGTGGAGTTCTCA
1250 . : . : . : . : . :
1233 TCCATATGGCTCTAAATGGGTGCACCGACAAGCTTTACATTTCCTCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132129 TCCATATGGCTCTAAATGGGTGCACCGACAAGCTTTACATTTCCTCTGTG
1300 . : . : . : . : . :
1283 AGGAATTTTCCCAGGTCATGACTTCGGATGTTTTTTATGAACTCAGCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132179 AGGAATTTTCCCAGGTCATGACTTCGGATGTTTTTTATGAACTCAGCAAA
1350 . : . : . : . : . :
1333 GACCATCTGCTTACTGCTATCCAGTCTGACTACCTACAG GC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
132229 GACCATCTGCTTACTGCTATCCAGTCTGACTACCTACAGGTA...TAGGC
1400 . : . : . : . : . :
1374 AAGTGAACAAGATATCCTTAAATATCTGATTAAATGGGGAGAGCATCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134377 AAGTGAACAAGATATCCTTAAATATCTGATTAAATGGGGAGAGCATCAGT
1450 . : . : . : . : . :
1424 TGATGAAAAGAATAGCAGATAGAG AGCCAAACTTACTGAGT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
134427 TGATGAAAAGAATAGCAGATAGAGGTA...TAGAGCCAAACTTACTGAGT
1500 . : . : . : . : . :
1465 GGCACTGCCCATAGTGTGAACAAAAGAGGTGTAAAAAGACGGGACCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138714 GGCACTGCCCATAGTGTGAACAAAAGAGGTGTAAAAAGACGGGACCTGGA
1550 . : . : . : . : . :
1515 CATGGAAGAGCTCAGAGAGATCCTTTCTTCTCTCTTACCTTTTGTGCGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138764 CATGGAAGAGCTCAGAGAGATCCTTTCTTCTCTCTTACCTTTTGTGCGAA
1600 . : . : . : . : . :
1565 TTGAACACATCTTACCTATAAACAGTGAAGTCTTAAGTGATGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
138814 TTGAACACATCTTACCTATAAACAGTGAAGTCTTAAGTGATGCAGTA...
1650 . : . : . : . : . :
1609 ATGAAAAGAGGCTTGATTAGTACTCCTCCATCAGATATGCTTCCTAC
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142259 TAGATGAAAAGAGGCTTGATTAGTACTCCTCCATCAGATATGCTTCCTAC
1700 . : . : . : . : . :
1656 AACAGAAGGTGGGAAGTCAAATGCCTGGTTACGGCAAAAAAATGCTGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142309 AACAGAAGGTGGGAAGTCAAATGCCTGGTTACGGCAAAAAAATGCTGGCA
1750 . : . : . : . : . :
1706 TCTATGTTCGTCCTCGACTCTTCTCTCCCTATGTGGAAGAAGCAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
142359 TCTATGTTCGTCCTCGACTCTTCTCTCCCTATGTGGAAGAAGCAAAGGTA
1800 . : . : . : . : . :
1753 TCAGTGCTAGATGAGATGATGGTGGAACAAACGGATCTTGTGCG
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142409 ...CAGTCAGTGCTAGATGAGATGATGGTGGAACAAACGGATCTTGTGCG
1850 . : . : . : . : . :
1797 CTTGCGAATGGTTAGAATGTCCAATGTGCCAGACACGCTCTACATGGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144444 CTTGCGAATGGTTAGAATGTCCAATGTGCCAGACACGCTCTACATGGTCA
1900 . : . : . : . : . :
1847 ATAATGCCGTGCCACAGTGTTGTCACATGATCAGCCACCAGCAGATCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144494 ATAATGCCGTGCCACAGTGTTGTCACATGATCAGCCACCAGCAGATCAGC
1950 . : . : . : . : . :
1897 AGCAACCAGTCAAGCCCTCCTTCAGTTGTAGCCAACGAAATTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
144544 AGCAACCAGTCAAGCCCTCCTTCAGTTGTAGCCAACGAAATTCCAGGTA.
2000 . : . : . : . : . :
1943 TTCCTCGTCTCCTCATTATGAAAGACATGGTCAGACGACTGCAGG
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144594 ..CAGTTCCTCGTCTCCTCATTATGAAAGACATGGTCAGACGACTGCAGG
2050 . : . : . : . : . :
1988 AACTGCGGCACACGGAGCAGGTGCAGAGGGCCTATGCCCTGAACTGCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147443 AACTGCGGCACACGGAGCAGGTGCAGAGGGCCTATGCCCTGAACTGCGGG
2100 . : . : . : . : . :
2038 GAAGGCGCCACTGTCAGCTATGAAATTCAGATTCGAGTGCTAAGAGAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147493 GAAGGCGCCACTGTCAGCTATGAAATTCAGATTCGAGTGCTAAGAGAGTT
2150 . : . : . : . : . :
2088 TGGTCTTGCAGATGCTGCTGCAGAGCTGTTGCAG AATCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
147543 TGGTCTTGCAGATGCTGCTGCAGAGCTGTTGCAGGTA...TAGAATCCTC
2200 . : . : . : . : . :
2129 ACAAATTCTTTCCTGATGAACGTTTTGGGGATGAAAGTCCACTCTTGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149773 ACAAATTCTTTCCTGATGAACGTTTTGGGGATGAAAGTCCACTCTTGACA
2250 . : . : . : . : . :
2179 ATGAGACAGCCTGGGAGATGTCGCGTAAACAGTACACCTCCTGCAGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149823 ATGAGACAGCCTGGGAGATGTCGCGTAAACAGTACACCTCCTGCAGAAAC
2300 . : . : . : . : . :
2229 CATGTTTACAGATCTGGACTCTTTTGTGGCCTTCCATCCACCCTTGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149873 CATGTTTACAGATCTGGACTCTTTTGTGGCCTTCCATCCACCCTTGCCCC
2350 . : . : . : . : . :
2279 CTCCACCACCTCCCTACCACCCCCCAGCTACCCCAATCCATAACCAACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149923 CTCCACCACCTCCCTACCACCCCCCAGCTACCCCAATCCATAACCAACTC
2400 . : . : . : . : . :
2329 AAAGCAGGCTGGAAGCAAAGACCTCCCAGTCAGCACCCTTCACGTTCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149973 AAAGCAGGCTGGAAGCAAAGACCTCCCAGTCAGCACCCTTCACGTTCATT
2450 . : . : . : . : . :
2379 TTCTTATCCCTGTAATCATTCGCTGTTCCACTCCAGAACAGCTCCTAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150023 TTCTTATCCCTGTAATCATTCGCTGTTCCACTCCAGAACAGCTCCTAAAG
2500 . : . : . : . : . :
2429 CTGGCCCTCCCCCAGTCTACTTGCCGAGTGTGAAAGCTGCACCGCCTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150073 CTGGCCCTCCCCCAGTCTACTTGCCGAGTGTGAAAGCTGCACCGCCTGAT
2550 . : . : . : . : . :
2479 TGTACCAGCACTGCAGGACTGGGCAGACAGACGGTGGCTGCTGCTGCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150123 TGTACCAGCACTGCAGGACTGGGCAGACAGACGGTGGCTGCTGCTGCCGC
2600 . : . : . : . : . :
2529 CACCACCACCTCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCTGAGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150173 CACCACCACCTCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCTGAGAAGC
2650 . : . : . : . : . :
2579 AAGTG CGAACACAACCTGTGCTGAATGATCTGATGCCAGAC
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150223 AAGTGGTA...CAGCGAACACAACCTGTGCTGAATGATCTGATGCCAGAC
2700 . : . : . : . : . :
2620 ATCGCGGTGGGTGTGTCCACACTGTCACTCAAGGACAGGAGGCTTCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153000 ATCGCGGTGGGTGTGTCCACACTGTCACTCAAGGACAGGAGGCTTCCAGA
2750 . : . : . : . : . :
2670 GCTTGCTGTAGACACAGAATTAAGCCAGTCAGTTTCTGAAGCAGGACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153050 GCTTGCTGTAGACACAGAATTAAGCCAGTCAGTTTCTGAAGCAGGACCAG
2800 . : . : . : . : . :
2720 GGCCTCCCCAGCATCTGTCGTGTATTCCACAGAGACATACACACACTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153100 GGCCTCCCCAGCATCTGTCGTGTATTCCACAGAGACATACACACACTTCT
2850 . : . : . : . : . :
2770 CGGAAAAAACACACACTAGAGCAAAAAACAGACACCAGAGAAAATCCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153150 CGGAAAAAACACACACTAGAGCAAAAAACAGACACCAGAGAAAATCCACA
2900 . : . : . : . : . :
2820 GGAATATCCGGATTTCTATGACTTCTCAAATGCTGCTTGCAGACCTTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153200 GGAATATCCGGATTTCTATGACTTCTCAAATGCTGCTTGCAGACCTTCTA
2950 . : . : . : . : . :
2870 CTCCTGCTCTCAGCAGACGCACCCCTTCCCCTTCGCAAGGTGGATATTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153250 CTCCTGCTCTCAGCAGACGCACCCCTTCCCCTTCGCAAGGTGGATATTTT
3000 . : . : . : . : . :
2920 GGTCCCGATCTGTACAGCCACAATAAGGCATCACCAAGTGGCTTAAAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153300 GGTCCCGATCTGTACAGCCACAATAAGGCATCACCAAGTGGCTTAAAGTC
3050 . : . : . : . : . :
2970 AGCCTACCTACCTGGTCAGACGTCTCCTAAAAAACAGGAAGAAGCTAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153350 AGCCTACCTACCTGGTCAGACGTCTCCTAAAAAACAGGAAGAAGCTAGGA
3100 . : . : . : . : . :
3020 GAGAATATCCACTTTCCCCTGACGGGCATCTACACAGACAAAAGAATGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153400 GAGAATATCCACTTTCCCCTGACGGGCATCTACACAGACAAAAGAATGAG
3150 . : . : . : . : . :
3070 CCGATACACCTGGATGTCGTTGAGCAACCTCCCCAGCGGTCAGACTTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153450 CCGATACACCTGGATGTCGTTGAGCAACCTCCCCAGCGGTCAGACTTTCC
3200 . : . : . : . : . :
3120 TTTGGCAGCCCCAGAAAATGCTAGTACCGGTCCAGCCCATGTCAGGGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153500 TTTGGCAGCCCCAGAAAATGCTAGTACCGGTCCAGCCCATGTCAGGGGAC
3250 . : . : . : . : . :
3170 GAACTGCAGTAGAAACTGACTTGACTTTTGGGCTGACTCCTAACAGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153550 GAACTGCAGTAGAAACTGACTTGACTTTTGGGCTGACTCCTAACAGACCT
3300 . : . : . : . : . :
3220 TCACTTTCTGCATGTAGCTCTGAAGCTCCCGAAGAGAGATCCGGTAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153600 TCACTTTCTGCATGTAGCTCTGAAGCTCCCGAAGAGAGATCCGGTAGAAG
3350 . : . : . : . : . :
3270 ACTGGCAGACAGTGAGTCCCTGGGCCATGGAGCTCAGAGAAATACAGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153650 ACTGGCAGACAGTGAGTCCCTGGGCCATGGAGCTCAGAGAAATACAGATT
3400 . : . : . : . : . :
3320 TGGAAAGGGAAGATTCAATAAGCAGAGGAAGGAGGTCACCAAGCAAGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153700 TGGAAAGGGAAGATTCAATAAGCAGAGGAAGGAGGTCACCAAGCAAGCCG
3450 . : . : .
3370 GACTTCCTCTACAAAAAGTCTGCCCTC
|||||||||||||||||||||||||||
153750 GACTTCCTCTACAAAAAGTCTGCCCTC