Result of SIM4 for
pF1KA1522
seq1 = pF1KA1522.tfa, 3138 bp
seq2 = pF1KA1522/gi568815597f_32654090.tfa (gi568815597f:32654090_32872441), 218352 bp
>pF1KA1522 3138
>gi568815597f:32654090_32872441 (Chr1)
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92-262 (113698-113868) 100% ->
263-318 (113973-114028) 100% ->
319-442 (114563-114686) 100% ->
443-556 (115584-115697) 100% ->
557-3118 (115791-118352) 100% ->
3119-3138 (118776-118795) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGGAACTCACACCACAAGAGGAAGGCCCCCAGCGGTCCCCGGGTCCG
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100001 ATGGGGAACTCACACCACAAGAGGAAGGCCCCCAGCGGTCCCCGGGTCCG
50 . : . : . : . : . :
51 CAGCTTCTGGCGGTTCGGGCGGTCGGCGAAGCGGCCGGCAG
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100051 CAGCTTCTGGCGGTTCGGGCGGTCGGCGAAGCGGCCGGCAGGTA...TAG
100 . : . : . : . : . :
92 GCTCTGCCAAGGCTGAGAATGACAAACATCTAAGTGTAGGGCCTGGCCAG
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113698 GCTCTGCCAAGGCTGAGAATGACAAACATCTAAGTGTAGGGCCTGGCCAG
150 . : . : . : . : . :
142 GGGCCAGGGTCTGCAGTGGATGAGCACCAGGACAACGTCTTCTTTCCCAG
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113748 GGGCCAGGGTCTGCAGTGGATGAGCACCAGGACAACGTCTTCTTTCCCAG
200 . : . : . : . : . :
192 TGGGCGACCCCCCCACCTGGAAGAGCTGCACACTCAGGCCCAGGAGGGGC
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113798 TGGGCGACCCCCCCACCTGGAAGAGCTGCACACTCAGGCCCAGGAGGGGC
250 . : . : . : . : . :
242 TCCGCTCCCTACAACACCAAG AGAAACAGAAACTGAACAAG
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113848 TCCGCTCCCTACAACACCAAGGTA...CAGAGAAACAGAAACTGAACAAG
300 . : . : . : . : . :
283 GGTGGCTGGGACCATGGAGACACCCAGAGTATCCAG TCCTC
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113993 GGTGGCTGGGACCATGGAGACACCCAGAGTATCCAGGTG...TAGTCCTC
350 . : . : . : . : . :
324 CCGGACGGGGCCGGATGAAGACAACATCTCCTTCTGCAGTCAGACCACAT
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114568 CCGGACGGGGCCGGATGAAGACAACATCTCCTTCTGCAGTCAGACCACAT
400 . : . : . : . : . :
374 CCTACGTGGCTGAGAGCTCCACAGCAGAGGACGCGCTCTCCATCCGCTCG
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114618 CCTACGTGGCTGAGAGCTCCACAGCAGAGGACGCGCTCTCCATCCGCTCG
450 . : . : . : . : . :
424 GAGATGATCCAGCGCAAAG GCTCCACCTTCCGACCCCATGA
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
114668 GAGATGATCCAGCGCAAAGGTG...CAGGCTCCACCTTCCGACCCCATGA
500 . : . : . : . : . :
465 CTCATTTCCCAAATCTGGAAAGTCAGGGCGGCGTCGGCGGGAGCGGCGGA
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115606 CTCATTTCCCAAATCTGGAAAGTCAGGGCGGCGTCGGCGGGAGCGGCGGA
550 . : . : . : . : . :
515 GCACTGTGCTGGGACTCCCGCAGCATGTGCAGAAGGAGCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
115656 GCACTGTGCTGGGACTCCCGCAGCATGTGCAGAAGGAGCTTGGTG...CA
600 . : . : . : . : . :
557 GCCTGAGGAATGAGCGTGAGGCACCAGGCACGCCCCGGGCTCCTGGTGC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115790 GGCCTGAGGAATGAGCGTGAGGCACCAGGCACGCCCCGGGCTCCTGGTGC
650 . : . : . : . : . :
606 ACGGGATGCCGTACGCATCCCCACAGTGGACGGCCGCCCCCGAGGCACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115840 ACGGGATGCCGTACGCATCCCCACAGTGGACGGCCGCCCCCGAGGCACCT
700 . : . : . : . : . :
656 CAGGGATGGGGGCCCGGGTGTCCCTGCAGGCGCTGGAGGCGGAGGCGGAG
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115890 CAGGGATGGGGGCCCGGGTGTCCCTGCAGGCGCTGGAGGCGGAGGCGGAG
750 . : . : . : . : . :
706 GCTGGCGCTGAGACAGAGGCCATGCTGCAGCGCCACATTGACCGTGTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115940 GCTGGCGCTGAGACAGAGGCCATGCTGCAGCGCCACATTGACCGTGTCTA
800 . : . : . : . : . :
756 CCGGGATGACACCTTTGTTGGCCGGTCCACGGGTACCCGGGCCCCACCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115990 CCGGGATGACACCTTTGTTGGCCGGTCCACGGGTACCCGGGCCCCACCAT
850 . : . : . : . : . :
806 TGACCCGGCCCATGTCCCTAGCAGTGCCTGGATTGACAGGAGGGGCAGGG
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116040 TGACCCGGCCCATGTCCCTAGCAGTGCCTGGATTGACAGGAGGGGCAGGG
900 . : . : . : . : . :
856 CCTGCAGAGCCCCTGAGCCCGGCCATGTCCATCTCCCCCCAGGCCACCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116090 CCTGCAGAGCCCCTGAGCCCGGCCATGTCCATCTCCCCCCAGGCCACCTA
950 . : . : . : . : . :
906 CCTGTCGAAGTTGATTCCACATGCTGTGCTGCCGCCTACAGTGGACGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116140 CCTGTCGAAGTTGATTCCACATGCTGTGCTGCCGCCTACAGTGGACGTGG
1000 . : . : . : . : . :
956 TGGCCCTAGGCCGCTGCAGCCTGCGCACACTAAGCCGCTGCAGCCTGCAC
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116190 TGGCCCTAGGCCGCTGCAGCCTGCGCACACTAAGCCGCTGCAGCCTGCAC
1050 . : . : . : . : . :
1006 TCGGCCAGCCCAGCCTCAGTCCGCTCGCTGGGGCGCTTCTCCTCCGTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116240 TCGGCCAGCCCAGCCTCAGTCCGCTCGCTGGGGCGCTTCTCCTCCGTCTC
1100 . : . : . : . : . :
1056 CAGCCCACAGCCCCGCAGCCGCCACCCATCCTCCTCCAGTGACACCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116290 CAGCCCACAGCCCCGCAGCCGCCACCCATCCTCCTCCAGTGACACCTGGA
1150 . : . : . : . : . :
1106 GCCACTCTCAATCCTCCGACACCATTGTGTCTGACGGTTCCACCCTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116340 GCCACTCTCAATCCTCCGACACCATTGTGTCTGACGGTTCCACCCTCTCC
1200 . : . : . : . : . :
1156 TCTAAGGGTGGCTCTGAGGGCCAGCCGGAGAGCTCTACGGCTAGCAATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116390 TCTAAGGGTGGCTCTGAGGGCCAGCCGGAGAGCTCTACGGCTAGCAATAG
1250 . : . : . : . : . :
1206 CGTGGTACCCCCTCCCCAGGGAGGCAGTGGGAGGGGCTCTCCCAGTGGGG
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116440 CGTGGTACCCCCTCCCCAGGGAGGCAGTGGGAGGGGCTCTCCCAGTGGGG
1300 . : . : . : . : . :
1256 GCAGCACTGCTGAGGCCTCAGACACACTCAGCATTCGGAGCAGTGGGCAG
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116490 GCAGCACTGCTGAGGCCTCAGACACACTCAGCATTCGGAGCAGTGGGCAG
1350 . : . : . : . : . :
1306 TTGTCTGGCCGGAGTGTGTCCCTGCGTAAGCTGAAGCGGCCTCCACCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116540 TTGTCTGGCCGGAGTGTGTCCCTGCGTAAGCTGAAGCGGCCTCCACCCCC
1400 . : . : . : . : . :
1356 TCCCCGCCGGACCCACTCCCTCCATCAGCGGGGCTTAGCAGTGCCTGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116590 TCCCCGCCGGACCCACTCCCTCCATCAGCGGGGCTTAGCAGTGCCTGATG
1450 . : . : . : . : . :
1406 GGCCATTAGGGTTGCCCCCTAAGCCTGAGCGTAAGCAGCAGCCCCAGCTG
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116640 GGCCATTAGGGTTGCCCCCTAAGCCTGAGCGTAAGCAGCAGCCCCAGCTG
1500 . : . : . : . : . :
1456 CCTCGGCCACCCACCACTGGTGGCTCAGAAGGGGCGGGGGCAGCACCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116690 CCTCGGCCACCCACCACTGGTGGCTCAGAAGGGGCGGGGGCAGCACCCTG
1550 . : . : . : . : . :
1506 TCCACCCAACCCAGCCAACAGCTGGGTACCTGGCTTGTCTCCGGGTGGTT
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116740 TCCACCCAACCCAGCCAACAGCTGGGTACCTGGCTTGTCTCCGGGTGGTT
1600 . : . : . : . : . :
1556 CCCGGCGCCCCCCACGGTCCCCAGAACGGACACTTTCGCCCTCCAGTGGA
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116790 CCCGGCGCCCCCCACGGTCCCCAGAACGGACACTTTCGCCCTCCAGTGGA
1650 . : . : . : . : . :
1606 TACTCGAGCCAAAGTGGTACTCCCACCCTCCCTCCCAAGGGCCTGGCAGG
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116840 TACTCGAGCCAAAGTGGTACTCCCACCCTCCCTCCCAAGGGCCTGGCAGG
1700 . : . : . : . : . :
1656 TCCCCCTGCTTCCCCAGGCAAGGCCCAGCCCCCTAAACCAGAGCGTGTCA
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116890 TCCCCCTGCTTCCCCAGGCAAGGCCCAGCCCCCTAAACCAGAGCGTGTCA
1750 . : . : . : . : . :
1706 CGTCTCTTCGCTCCCCTGGGGCCTCCGTCTCCTCTTCCCTCACGTCTTTA
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116940 CGTCTCTTCGCTCCCCTGGGGCCTCCGTCTCCTCTTCCCTCACGTCTTTA
1800 . : . : . : . : . :
1756 TGTTCCTCCTCCTCTGACCCAGCCCCCTCAGACCGCTCTGGGCCACAGAT
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116990 TGTTCCTCCTCCTCTGACCCAGCCCCCTCAGACCGCTCTGGGCCACAGAT
1850 . : . : . : . : . :
1806 ATTGACCCCCCTGGGTGACAGGTTTGTCATACCTCCTCACCCCAAGGTGC
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117040 ATTGACCCCCCTGGGTGACAGGTTTGTCATACCTCCTCACCCCAAGGTGC
1900 . : . : . : . : . :
1856 CTGCCCCCTTCTCCCCACCTCCCTCCAAGCCCAGGAGCCCTAACCCAGCT
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117090 CTGCCCCCTTCTCCCCACCTCCCTCCAAGCCCAGGAGCCCTAACCCAGCT
1950 . : . : . : . : . :
1906 GCCCCTGCTCTAGCCGCCCCTGCTGTGGTTCCTGGGCCTGTTTCTACCAC
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117140 GCCCCTGCTCTAGCCGCCCCTGCTGTGGTTCCTGGGCCTGTTTCTACCAC
2000 . : . : . : . : . :
1956 TGACGCCAGTCCTCAGTCCCCTCCCACTCCCCAGACAACCTTGACTCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117190 TGACGCCAGTCCTCAGTCCCCTCCCACTCCCCAGACAACCTTGACTCCAC
2050 . : . : . : . : . :
2006 TGCAGGAGTCTCCTGTCATCTCCAAAGACCAGTCACCCCCACCTTCCCCA
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117240 TGCAGGAGTCTCCTGTCATCTCCAAAGACCAGTCACCCCCACCTTCCCCA
2100 . : . : . : . : . :
2056 CCCCCATCTTATCATCCACCCCCACCACCCACTAAGAAGCCAGAGGTGGT
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117290 CCCCCATCTTATCATCCACCCCCACCACCCACTAAGAAGCCAGAGGTGGT
2150 . : . : . : . : . :
2106 TGTGGAGGCACCATCTGCCTCAGAGACTGCTGAGGAGCCCCTCCAAGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117340 TGTGGAGGCACCATCTGCCTCAGAGACTGCTGAGGAGCCCCTCCAAGATC
2200 . : . : . : . : . :
2156 CCAACTGGCCCCCTCCCCCACCCCCTGCCCCTGAGGAGCAGGACCTGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117390 CCAACTGGCCCCCTCCCCCACCCCCTGCCCCTGAGGAGCAGGACCTGTCC
2250 . : . : . : . : . :
2206 ATGGCTGACTTCCCCCCACCAGAGGAGGCTTTTTTCTCTGTGGCCAGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117440 ATGGCTGACTTCCCCCCACCAGAGGAGGCTTTTTTCTCTGTGGCCAGCCC
2300 . : . : . : . : . :
2256 TGAGCCTGCAGGCCCTTCAGGCTCCCCAGAGCTTGTCAGCTCCCCGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117490 TGAGCCTGCAGGCCCTTCAGGCTCCCCAGAGCTTGTCAGCTCCCCGGCTG
2350 . : . : . : . : . :
2306 CTTCGTCCTCCTCAGCTACTGCTTTGCAGATTCAGCCCCCGGGTAGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117540 CTTCGTCCTCCTCAGCTACTGCTTTGCAGATTCAGCCCCCGGGTAGCCCA
2400 . : . : . : . : . :
2356 GACCCTCCTCCAGCTCCGCCAGCCCCAGCTCCTGCTAGTTCCGCCCCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117590 GACCCTCCTCCAGCTCCGCCAGCCCCAGCTCCTGCTAGTTCCGCCCCAGG
2450 . : . : . : . : . :
2406 GCATGTGGCCAAGCTCCCTCAGAAGGAACCGGTGGGCTGTAGCAAGGGTG
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117640 GCATGTGGCCAAGCTCCCTCAGAAGGAACCGGTGGGCTGTAGCAAGGGTG
2500 . : . : . : . : . :
2456 GTGGGCCTCCCAGGGAGGACGTAGGTGCGCCCCTGGTCACGCCCTCGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117690 GTGGGCCTCCCAGGGAGGACGTAGGTGCGCCCCTGGTCACGCCCTCGCTC
2550 . : . : . : . : . :
2506 CTGCAGATGGTGCGGCTGCGCTCCGTGGGTGCTCCAGGAGGGGCTCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117740 CTGCAGATGGTGCGGCTGCGCTCCGTGGGTGCTCCAGGAGGGGCTCCCAC
2600 . : . : . : . : . :
2556 CCCAGCACTGGGGCCATCGGCCCCCCAGAAACCACTGCGAAGGGCCCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117790 CCCAGCACTGGGGCCATCGGCCCCCCAGAAACCACTGCGAAGGGCCCTGT
2650 . : . : . : . : . :
2606 CAGGGCGGGCCAGCCCAGTGCCTGCCCCCTCCTCAGGGCTCCATGCTGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117840 CAGGGCGGGCCAGCCCAGTGCCTGCCCCCTCCTCAGGGCTCCATGCTGCG
2700 . : . : . : . : . :
2656 GTCCGACTCAAGGCCTGCAGCCTGGCCGCCAGTGAAGGCCTCTCAAGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117890 GTCCGACTCAAGGCCTGCAGCCTGGCCGCCAGTGAAGGCCTCTCAAGTGC
2750 . : . : . : . : . :
2706 TCAGCCCAACGGACCGCCTGAGGCAGAGCCACGGCCTCCCCAGTCCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117940 TCAGCCCAACGGACCGCCTGAGGCAGAGCCACGGCCTCCCCAGTCCCCTG
2800 . : . : . : . : . :
2756 CCTCAACGGCCAGTTTCATCTTCTCCAAGGGCTCTAGGAAGCTGCAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117990 CCTCAACGGCCAGTTTCATCTTCTCCAAGGGCTCTAGGAAGCTGCAGCTG
2850 . : . : . : . : . :
2806 GAGCGGCCCGTGTCCCCTGAGACCCAGGCTGACCTCCAGCGGAATCTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118040 GAGCGGCCCGTGTCCCCTGAGACCCAGGCTGACCTCCAGCGGAATCTGGT
2900 . : . : . : . : . :
2856 GGCAGAACTCCGGAGCATCTCAGAGCAGCGGCCACCCCAGGCCCCAAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118090 GGCAGAACTCCGGAGCATCTCAGAGCAGCGGCCACCCCAGGCCCCAAAGA
2950 . : . : . : . : . :
2906 AGTCACCTAAGGCTCCCCCACCTGTGGCCCGCAAGCCGTCTGTGGGAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118140 AGTCACCTAAGGCTCCCCCACCTGTGGCCCGCAAGCCGTCTGTGGGAGTC
3000 . : . : . : . : . :
2956 CCCCCACCCGCCTCCCCCAGTTACCCTCGAGCTGAGCCCCTTACTGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118190 CCCCCACCCGCCTCCCCCAGTTACCCTCGAGCTGAGCCCCTTACTGCTCC
3050 . : . : . : . : . :
3006 TCCCACCAATGGGCTCCCTCACACCCAGGACAGGACTAAGAGGGAGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118240 TCCCACCAATGGGCTCCCTCACACCCAGGACAGGACTAAGAGGGAGCTGG
3100 . : . : . : . : . :
3056 CGGAGAATGGAGGTGTCCTGCAGCTGGTGGGCCCAGAGGAGAAGATGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118290 CGGAGAATGGAGGTGTCCTGCAGCTGGTGGGCCCAGAGGAGAAGATGGGC
3150 . : . : . : . :
3106 CTCCCGGGCTCAG ACTCACAGAAAGAGCTGGCC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
118340 CTCCCGGGCTCAGGTA...CAGACTCACAGAAAGAGCTGGCC