seq1 = pF1KA1507.tfa, 2766 bp
seq2 = pF1KA1507/gi568815591r_43776670.tfa (gi568815591r:43776670_43987486), 210817 bp

>pF1KA1507 2766
>gi568815591r:43776670_43987486 (Chr7)

(complement)

14-85  (100001-100072)   100% ->
86-136  (105530-105580)   100% ->
137-175  (105790-105828)   100% ->
176-2766  (108227-110817)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     14 GGCATTCAGATTTGGGAGAAGTAGCCCCAGAAATAAAAGCATCAGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GGCATTCAGATTTGGGAGAAGTAGCCCCAGAAATAAAAGCATCAGAGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     64 CGAACAGCTGTGGCCATTGCAG         ATTTGGAATGGAGAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CGAACAGCTGTGGCCATTGCAGGTA...TAGATTTGGAATGGAGAGAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    105 GGAAGGAGATGATTGCGAGTTCCGTTATGGAG         ATGGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105549 GGAAGGAGATGATTGCGAGTTCCGTTATGGAGGTA...TAGATGGTACAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146 ATGAGGCTCAGGACAATGATTTTCCAACAG         TGGAGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105799 ATGAGGCTCAGGACAATGATTTTCCAACAGGTA...CAGTGGAGAGAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    187 AGGCTTCAAGAAATGCTGTCACTTTTGGGCCTAGAGACGTACCAGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108238 AGGCTTCAAGAAATGCTGTCACTTTTGGGCCTAGAGACGTACCAGGTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    237 GAAACTCAGCCTCCAGGACTCTCTGCAGATCAGTTTTGACAGTATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108288 GAAACTCAGCCTCCAGGACTCTCTGCAGATCAGTTTTGACAGTATGAAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287 ACTGGGCCCCTCAGGTTCCCAAAGACTTGCCCTGGAATTTCCTCAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108338 ACTGGGCCCCTCAGGTTCCCAAAGACTTGCCCTGGAATTTCCTCAGGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337 TTGCAGGCCCTCAATGCTGATGCCAGGAATACCACTATGGTGCTGGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108388 TTGCAGGCCCTCAATGCTGATGCCAGGAATACCACTATGGTGCTGGACGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    387 GCTCCCAGACGCCAGGCCTGTGGAGAAGGAGAGCCAGATGGAAGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108438 GCTCCCAGACGCCAGGCCTGTGGAGAAGGAGAGCCAGATGGAAGAGGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    437 TCATCTACTGGGACCCAGCTGATGACCTTGCTGCCGACATTTATTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108488 TCATCTACTGGGACCCAGCTGATGACCTTGCTGCCGACATTTATTCCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    487 TCTGAGCTGCCCACCCCTGATACGCCAGTGAACCCCTTAGACCTTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108538 TCTGAGCTGCCCACCCCTGATACGCCAGTGAACCCCTTAGACCTTCTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    537 TGCCCTGCTGCTCTCCTCAGACAGTTTCCTGCAACAAGAAATAGCGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108588 TGCCCTGCTGCTCTCCTCAGACAGTTTCCTGCAACAAGAAATAGCGTTGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    587 AAATGGCCCTCTGCCAGTTTGCACTCCCACTCGTGTTGCCTGACTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108638 AAATGGCCCTCTGCCAGTTTGCACTCCCACTCGTGTTGCCTGACTCGGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    637 AACCACTACCATACATTTCTGCTGTGGGCCATGCGGGGCATTGTGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108688 AACCACTACCATACATTTCTGCTGTGGGCCATGCGGGGCATTGTGAGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    687 ATGGTGGTCCCAGCCCCCAAGGGGCATGGGGAGCTTCCGGGAAGACAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108738 ATGGTGGTCCCAGCCCCCAAGGGGCATGGGGAGCTTCCGGGAAGACAGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    737 TGGTCTTGTCCAGGGCGCCCGCCTTCGCCTTCGTGCGCATGGACGTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108788 TGGTCTTGTCCAGGGCGCCCGCCTTCGCCTTCGTGCGCATGGACGTCAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    787 AGCAACTCCAAGTCCCAGCTTCTCAACGCCGTCCTCAGCCCGGGCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108838 AGCAACTCCAAGTCCCAGCTTCTCAACGCCGTCCTCAGCCCGGGCCACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    837 GCAGTGGGACTGCTTCTGGCATCGGGACCTCAACTTGGGCACCAATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108888 GCAGTGGGACTGCTTCTGGCATCGGGACCTCAACTTGGGCACCAATGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    887 GGGAGATTTCGGATGGGTTGGTAGAAATTTCCTGGTTTTTTCCCAGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108938 GGGAGATTTCGGATGGGTTGGTAGAAATTTCCTGGTTTTTTCCCAGCGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    937 AGGGAGGACTTGGACATTTTCCCAGAACCTGTGGCCTTTCTGAACCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108988 AGGGAGGACTTGGACATTTTCCCAGAACCTGTGGCCTTTCTGAACCTGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    987 AGGTGACATCGGGTCTCACTGGCTGCAGTTTAAGCTCTTGACAGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109038 AGGTGACATCGGGTCTCACTGGCTGCAGTTTAAGCTCTTGACAGAAATCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1037 CCTCCGCTGTGTTTATATTGACTGACAATATCAGTAAGAAGGAATACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109088 CCTCCGCTGTGTTTATATTGACTGACAATATCAGTAAGAAGGAATACAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1087 TTGCTGTACTCCATGAAGGAGTCAACCACAAAATACTACTTCATCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109138 TTGCTGTACTCCATGAAGGAGTCAACCACAAAATACTACTTCATCCTGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1137 TCCCTACCGTGGGAAGCGCAACACAAACCTGAGATTTCTGAATAAGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109188 TCCCTACCGTGGGAAGCGCAACACAAACCTGAGATTTCTGAATAAGTTAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1187 TTCCTGTGCTGAAAATAGACCACTCACATGTCCTGGTAAAGGTCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109238 TTCCTGTGCTGAAAATAGACCACTCACATGTCCTGGTAAAGGTCAGCAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1237 ACTGACAGCGACAGCTTCGTGAAGAGGATCCGGGCCATCGTTGGGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109288 ACTGACAGCGACAGCTTCGTGAAGAGGATCCGGGCCATCGTTGGGAATGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1287 GCTGCGGGCACCCTGCAGGCGGGTATCTGTGGAGGACATGGCGCACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109338 GCTGCGGGCACCCTGCAGGCGGGTATCTGTGGAGGACATGGCGCACGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1337 CCCGCAAACTGGGCCTAAAGGTCGACGAGGACTGTGAGGAGTGTCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109388 CCCGCAAACTGGGCCTAAAGGTCGACGAGGACTGTGAGGAGTGTCAGAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1387 GCGAAAGACCGGATGGAGAGGATTACCAGGAAAATCAAAGACTCGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109438 GCGAAAGACCGGATGGAGAGGATTACCAGGAAAATCAAAGACTCGGATGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1437 CTACAGAAGGGACGAGCTGAGGCTGCAGGGGGACCCCTGGAGAAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109488 CTACAGAAGGGACGAGCTGAGGCTGCAGGGGGACCCCTGGAGAAAGGCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1487 CCCAAGTGGAGAAGGAGTTCTGCCAGCTCCAGTGGGCCGTGGACCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109538 CCCAAGTGGAGAAGGAGTTCTGCCAGCTCCAGTGGGCCGTGGACCCCCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1537 GAGAAGCACAGGGCTGAGCTGAGGCGGCGGCTGCTAGAACTTCGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109588 GAGAAGCACAGGGCTGAGCTGAGGCGGCGGCTGCTAGAACTTCGAATGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1587 GCAGAACGGCCATGATCCCTCCTCGGGGGTGCAGGAGTTCATCTCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109638 GCAGAACGGCCATGATCCCTCCTCGGGGGTGCAGGAGTTCATCTCGGGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1637 TCAGCAGCCCCTCCTTGAGTGAGAAGCAGTACTTCCTGAGGTGGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109688 TCAGCAGCCCCTCCTTGAGTGAGAAGCAGTACTTCCTGAGGTGGATGGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1687 TGGGGCCTGGCACGGGTGGCCCAGCCGCGACTGAGACAGCCTCCGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109738 TGGGGCCTGGCACGGGTGGCCCAGCCGCGACTGAGACAGCCTCCGGAGAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1737 GCTTCTCACCCTGAGACCAAAGCACGGGGGCACCACAGACGTGGGGGAGC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 109788 GCTTCTCACCCTGAGACCAAAGCATGGGGGCACCACAGACGTGGGGGAGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1787 CGCTCTGGCCTGAGCCCCTAGGGGTGGAACACTTCTTGCGGGAGATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109838 CGCTCTGGCCTGAGCCCCTAGGGGTGGAACACTTCTTGCGGGAGATGGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1837 CAGTTTTATGAGGCTGAGAGCTGTCTTGTGGAGGCAGGGAGGCTGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109888 CAGTTTTATGAGGCTGAGAGCTGTCTTGTGGAGGCAGGGAGGCTGCCGGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1887 AGGCCAGAGGCGTTTTGCCCACTTCCCAGGCTTGGCCTCGGAGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109938 AGGCCAGAGGCGTTTTGCCCACTTCCCAGGCTTGGCCTCGGAGCTGCTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1937 TGACAGGGCTGCCTCTGGAGCTAATCGATGGGAGCACGCTGAGCATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109988 TGACAGGGCTGCCTCTGGAGCTAATCGATGGGAGCACGCTGAGCATGCCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1987 GTCCGCTGGGTCACAGGGCTCCTGAAGGAGCTGCACGTCCGACTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110038 GTCCGCTGGGTCACAGGGCTCCTGAAGGAGCTGCACGTCCGACTGGAGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2037 ACGGTCAAGGCTGGTGGTTCTGTCAACCGTCGGGGTGCCAGGCACGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110088 ACGGTCAAGGCTGGTGGTTCTGTCAACCGTCGGGGTGCCAGGCACGGGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2087 AGTCCACACTCCTCAACACCATGTTTGGGCTGCGGTTTGCCACAGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110138 AGTCCACACTCCTCAACACCATGTTTGGGCTGCGGTTTGCCACAGGGAAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2137 AGCTGCGGTCCTCGAGGGGCCTTCATGCAGCTCATCACAGTGGCTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110188 AGCTGCGGTCCTCGAGGGGCCTTCATGCAGCTCATCACAGTGGCTGAGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2187 CTTCAGCCAGGACCTGGGCTGTGACCACATCCTGGTGATAGACTCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110238 CTTCAGCCAGGACCTGGGCTGTGACCACATCCTGGTGATAGACTCCGGGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2237 GCTTGATAGGTGGGGCCTTGACGTCAGCTGGGGACAGATTTGAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110288 GCTTGATAGGTGGGGCCTTGACGTCAGCTGGGGACAGATTTGAGCTGGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2287 GCTTCCTTGGCCACTCTGCTCATGGGACTGAGCAATGTCACCGTGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110338 GCTTCCTTGGCCACTCTGCTCATGGGACTGAGCAATGTCACCGTGATCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2337 TCTAGCTGAAACCAAGGACATTCCAGCAGCTATTCTGCATGCATTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110388 TCTAGCTGAAACCAAGGACATTCCAGCAGCTATTCTGCATGCATTTCTGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2387 GGTTAGAAAAAACGGGGCACATGCCCAACTACCAGTTTGTATACCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110438 GGTTAGAAAAAACGGGGCACATGCCCAACTACCAGTTTGTATACCAGAAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2437 CTTCATGATGTATCTGTTCCCGGCCCTAGGCCCAGAGACAAGAGACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110488 CTTCATGATGTATCTGTTCCCGGCCCTAGGCCCAGAGACAAGAGACAGCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2487 CCTGGATCCACCTGGTGACCTGAGCAGGGCTGCAGCCCAGATGGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110538 CCTGGATCCACCTGGTGACCTGAGCAGGGCTGCAGCCCAGATGGAGAAAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2537 AGGGCGATGGCTTCCGGGCACTGGCAGGCCTGGCCTTCTGCGACCCTGAG
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110588 AGGGCGACGGCTTCCGGGCACTGGCAGGCCTGGCCTTCTGCGACCCTGAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2587 AAGCAGCACATCTGGCACATCCCAGGCCTGTGGCACGGAGCACCTCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110638 AAGCAGCACATCTGGCACATCCCAGGCCTGTGGCACGGAGCACCTCCCAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2637 GGCCGCAGTGAGCTTGGCCTACAGTGAAGCCATATTTGAATTGAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110688 GGCCGCAGTGAGCTTGGCCTACAGTGAAGCCATATTTGAATTGAAGAGAT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2687 GCCTACTCGAAAACATCAGGAACGGCTTGTCGAACCAAAACAAAAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110738 GCCTACTCGAAAACATCAGGAACGGCTTGTCGAACCAAAACAAAAACATC

   2750     .    :    .    :    .    :
   2737 CAGCAGCTCATTGAGCTGGTGAGACGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 110788 CAGCAGCTCATTGAGCTGGTGAGACGGCTG