Result of SIM4 for
pF1KA1503
seq1 = pF1KA1503.tfa, 2370 bp
seq2 = pF1KA1503/gi568815581f_7619735.tfa (gi568815581f:7619735_7843383), 223649 bp
>pF1KA1503 2370
>gi568815581f:7619735_7843383 (Chr17)
1-166 (100001-100166) 100% ->
167-228 (103894-103955) 100% ->
229-399 (107388-107558) 100% ->
400-628 (113353-113581) 100% ->
629-739 (114449-114559) 100% ->
740-978 (114736-114974) 100% ->
979-1170 (117333-117524) 100% ->
1171-1376 (119999-120204) 100% ->
1377-1506 (120686-120815) 100% ->
1507-1689 (121076-121258) 100% ->
1690-2370 (123194-123874) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCCAGCAAAGCTGAGAAGAAGCAGCGATTGAGTGGCCGAGGAAGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTCCAGCAAAGCTGAGAAGAAGCAGCGATTGAGTGGCCGAGGAAGCTC
50 . : . : . : . : . :
51 CCAGGCAAGCTGGTCAGGGCGGGCCACTCGGGCTGCTGTGGCCACACAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CCAGGCAAGCTGGTCAGGGCGGGCCACTCGGGCTGCTGTGGCCACACAGG
100 . : . : . : . : . :
101 AGCAGGGGAATGCCCCGGCTGTCAGTGAGCCAGAGCTGCAGGCTGAGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AGCAGGGGAATGCCCCGGCTGTCAGTGAGCCAGAGCTGCAGGCTGAGCTC
150 . : . : . : . : . :
151 CCCAAGGAGGAGCCTG AGCCACGGTTGGAGGGACCTCAAGC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
100151 CCCAAGGAGGAGCCTGGTG...TAGAGCCACGGTTGGAGGGACCTCAAGC
200 . : . : . : . : . :
192 ACAGAGTGAAGAATCAGTGGAGCCCGAGGCAGATGTG AAGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
103919 ACAGAGTGAAGAATCAGTGGAGCCCGAGGCAGATGTGGTA...TAGAAGC
250 . : . : . : . : . :
233 CCCTCTTCCTTTCCCGAGCTGCGCTGACAGGACTGGCGGATGCAGTGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107392 CCCTCTTCCTTTCCCGAGCTGCGCTGACAGGACTGGCGGATGCAGTGTGG
300 . : . : . : . : . :
283 ACACAGGAGCATGATGCCATTCTGGAACACTTTGCCCAGGACCCTACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107442 ACACAGGAGCATGATGCCATTCTGGAACACTTTGCCCAGGACCCTACAGA
350 . : . : . : . : . :
333 ATCCATCCTCACCATCTTCATTGACCCTTGTTTTGGGCTGAAGCTAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107492 ATCCATCCTCACCATCTTCATTGACCCTTGTTTTGGGCTGAAGCTAGAGC
400 . : . : . : . : . :
383 TGGGCATGCCTGTACAG ACCCAGAACCAGCTTGTCTACTTC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
107542 TGGGCATGCCTGTACAGGTG...CAGACCCAGAACCAGCTTGTCTACTTC
450 . : . : . : . : . :
424 ATTCGCCAAGCACCAGTTCCCATCACCTGGGAGAACTTCGAGGCAACTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113377 ATTCGCCAAGCACCAGTTCCCATCACCTGGGAGAACTTCGAGGCAACTGT
500 . : . : . : . : . :
474 GCAGTTTGGGACGGTGCGGGGCCCCTATATCCCGGCCCTGCTTCGGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113427 GCAGTTTGGGACGGTGCGGGGCCCCTATATCCCGGCCCTGCTTCGGCTGC
550 . : . : . : . : . :
524 TCGGTGGAGTCTTTGCCCCTCAGATCTTTGCAAACACAGGCTGGCCTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113477 TCGGTGGAGTCTTTGCCCCTCAGATCTTTGCAAACACAGGCTGGCCTGAG
600 . : . : . : . : . :
574 AGCATTAGAAATCATTTTGCTTCTCATCTGCACAAGTTCTTGGCCTGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113527 AGCATTAGAAATCATTTTGCTTCTCATCTGCACAAGTTCTTGGCCTGCCT
650 . : . : . : . : . :
624 GACAG ACACTCGGTACAAACTGGAGGGGCACACGGTCCTCT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113577 GACAGGTA...TAGACACTCGGTACAAACTGGAGGGGCACACGGTCCTCT
700 . : . : . : . : . :
665 ACATCCCTGCAGAGGCCATGAACATGAAGCCTGAGATGGTGATAAAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114485 ACATCCCTGCAGAGGCCATGAACATGAAGCCTGAGATGGTGATAAAGGAC
750 . : . : . : . : . :
715 AAAGAGCTGGTGCAACGGCTAGAGA CCTCCATGATCCACTG
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
114535 AAAGAGCTGGTGCAACGGCTAGAGAGTG...CAGCCTCCATGATCCACTG
800 . : . : . : . : . :
756 GACCCGGCAGATAAAGGAGATGCTCAGTGCCCAGGAGACTGTGGAGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114752 GACCCGGCAGATAAAGGAGATGCTCAGTGCCCAGGAGACTGTGGAGACAG
850 . : . : . : . : . :
806 GAGAAAATTTAGGTCCTCTGGAGGAGATTGAGTTCTGGCGCAACCGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114802 GAGAAAATTTAGGTCCTCTGGAGGAGATTGAGTTCTGGCGCAACCGATGC
900 . : . : . : . : . :
856 ATGGACCTGTCTGGCATCAGTAAGCAGCTGGTGAAGAAGGGAGTGAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114852 ATGGACCTGTCTGGCATCAGTAAGCAGCTGGTGAAGAAGGGAGTGAAGCA
950 . : . : . : . : . :
906 CGTTGAATCCATCCTGCACCTTGCCAAGTCGTCCTACTTGGCGCCCTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114902 CGTTGAATCCATCCTGCACCTTGCCAAGTCGTCCTACTTGGCGCCCTTTA
1000 . : . : . : . : . :
956 TGAAACTGGCACAGCAGATCCAG GATGGCTCTCGTCAAGCA
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
114952 TGAAACTGGCACAGCAGATCCAGGTT...CAGGATGGCTCTCGTCAAGCA
1050 . : . : . : . : . :
997 CAGTCAAACCTGACCTTTTTGTCAATCCTGAAGGAACCTTACCAGGAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117351 CAGTCAAACCTGACCTTTTTGTCAATCCTGAAGGAACCTTACCAGGAGTT
1100 . : . : . : . : . :
1047 GGCTTTCATGAAGCCCAAGGACATCTCTAGCAAGCTCCCTAAGCTGATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117401 GGCTTTCATGAAGCCCAAGGACATCTCTAGCAAGCTCCCTAAGCTGATCA
1150 . : . : . : . : . :
1097 GTCTCATCCGCATCATCTGGGTCAACTCTCCCCACTACAACACTCGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117451 GTCTCATCCGCATCATCTGGGTCAACTCTCCCCACTACAACACTCGGGAG
1200 . : . : . : . : . :
1147 AGACTGACCTCGCTCTTCCGAAAG GTATGTGACTGTCAGTA
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
117501 AGACTGACCTCGCTCTTCCGAAAGGTG...TAGGTATGTGACTGTCAGTA
1250 . : . : . : . : . :
1188 TCACTTCGCCCGCTGGGAAGATGGCAAGCAGGGTCCCCTTCCTTGCTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120016 TCACTTCGCCCGCTGGGAAGATGGCAAGCAGGGTCCCCTTCCTTGCTTCT
1300 . : . : . : . : . :
1238 TTGGTGCCCAGGGGCCACAGATAACACGGAACTTGCTGGAGATTGAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120066 TTGGTGCCCAGGGGCCACAGATAACACGGAACTTGCTGGAGATTGAGGAC
1350 . : . : . : . : . :
1288 ATCTTTCATAAAAATCTGCACACGCTGCGAGCCGTTCGCGGGGGTATCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120116 ATCTTTCATAAAAATCTGCACACGCTGCGAGCCGTTCGCGGGGGTATCCT
1400 . : . : . : . : . :
1338 GGATGTCAAGAACACCTGTTGGCATGAAGACTACAATAA GT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
120166 GGATGTCAAGAACACCTGTTGGCATGAAGACTACAATAAGTG...CAGGT
1450 . : . : . : . : . :
1379 TCCGTGCCGGAATCAAGGACCTGGAGGTGATGACCCAGAACCTGATCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120688 TCCGTGCCGGAATCAAGGACCTGGAGGTGATGACCCAGAACCTGATCACC
1500 . : . : . : . : . :
1429 TCAGCCTTCGAGTTGGTGCGGGACGTGCCGCACGGCGTGCTTCTGCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120738 TCAGCCTTCGAGTTGGTGCGGGACGTGCCGCACGGCGTGCTTCTGCTGGA
1550 . : . : . : . : . :
1479 CACCTTCCACAGGCTTGCCTCCCGCGAG GCTATCAAGCGGA
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
120788 CACCTTCCACAGGCTTGCCTCCCGCGAGGTG...TAGGCTATCAAGCGGA
1600 . : . : . : . : . :
1520 CTTATGACAAGAAGGCGGTGGATCTCTACATGCTGTTCAATAGCGAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121089 CTTATGACAAGAAGGCGGTGGATCTCTACATGCTGTTCAATAGCGAGCTG
1650 . : . : . : . : . :
1570 GCCCTGGTGAACCGTGAACGGAACAAGAAATGGCCAGACCTGGAGCCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121139 GCCCTGGTGAACCGTGAACGGAACAAGAAATGGCCAGACCTGGAGCCCTA
1700 . : . : . : . : . :
1620 CGTGGCCCAGTATTCCGGAAAGGCGCGCTGGGTGCACATCCTCCGGCGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121189 CGTGGCCCAGTATTCCGGAAAGGCGCGCTGGGTGCACATCCTCCGGCGTC
1750 . : . : . : . : . :
1670 GCATCGACAGAGTCATGACC TGCCTTGCTGGTGCTCATTTC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
121239 GCATCGACAGAGTCATGACCGTA...CAGTGCCTTGCTGGTGCTCATTTC
1800 . : . : . : . : . :
1711 CTGCCCCGTATTGGGACTGGAAAGGAGAGTGTGCACACCTATCAGCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123215 CTGCCCCGTATTGGGACTGGAAAGGAGAGTGTGCACACCTATCAGCAGAT
1850 . : . : . : . : . :
1761 GGTCCAGGCCATTGATGAGCTGGTTCGAAAAACCTTCCAAGAGTGGACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123265 GGTCCAGGCCATTGATGAGCTGGTTCGAAAAACCTTCCAAGAGTGGACAT
1900 . : . : . : . : . :
1811 CAAGTCTGGACAAGGATTGCATTCGGCGGTTGGATACCCCATTGCTGCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123315 CAAGTCTGGACAAGGATTGCATTCGGCGGTTGGATACCCCATTGCTGCGA
1950 . : . : . : . : . :
1861 ATCAGCCAGGAGAAGGCGGGCATGCTGGATGTCAACTTTGACAAGTACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123365 ATCAGCCAGGAGAAGGCGGGCATGCTGGATGTCAACTTTGACAAGTACAG
2000 . : . : . : . : . :
1911 GAGCCACCTGGCCCCTTTTCCCTATACTCCCCTTCTGCAGCTCTCCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123415 GAGCCACCTGGCCCCTTTTCCCTATACTCCCCTTCTGCAGCTCTCCCAAG
2050 . : . : . : . : . :
1961 AATTTCACTCCCATCTTTTGACTCCTCTCTTCATTATTCTCTCTCTTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123465 AATTTCACTCCCATCTTTTGACTCCTCTCTTCATTATTCTCTCTCTTTCT
2100 . : . : . : . : . :
2011 CATACAATATGTTTGCTATCGTCATTTTACTTTTTTTTTTCTTCTTTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123515 CATACAATATGTTTGCTATCGTCATTTTACTTTTTTTTTTCTTCTTTTAT
2150 . : . : . : . : . :
2061 TTTTGTCTCTCCCCACCTCCCACCCTGCTATCAACATTTTAATTTTACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123565 TTTTGTCTCTCCCCACCTCCCACCCTGCTATCAACATTTTAATTTTACAA
2200 . : . : . : . : . :
2111 CTTATCTTAAAACACAACAAAACAAAACAATGATCGGCCAGGCACGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123615 CTTATCTTAAAACACAACAAAACAAAACAATGATCGGCCAGGCACGGTGG
2250 . : . : . : . : . :
2161 CTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGGGGTGGGCGCATCGCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
123665 CTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGCATCGCT
2300 . : . : . : . : . :
2211 TGAGCCCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGGCAACATGGCAAAACCCAGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123715 TGAGCCCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGGCAACATGGCAAAACCCAGTCT
2350 . : . : . : . : . :
2261 CTGCAAAAAATACAAAGATTAGCTGGGCGTGGTGGCACAAGCCTGTGGTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
123765 CTGCAAAAAATACAAAGATTAGCTGGGCGTGGTGGCACAAGCCTGTAGTC
2400 . : . : . : . : . :
2311 TCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGTGGGAGGATCGCCTGAGCCCGGGAGGCG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123815 TCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGTGGGAGGATCGCCTGAGCCCGGGAGGCA
2450 . :
2361 GAGGCTGCAG
||||||||||
123865 GAGGCTGCAG