Result of SIM4 for
pF1KA1475
seq1 = pF1KA1475.tfa, 2919 bp
seq2 = pF1KA1475/gi568815583f_40794769.tfa (gi568815583f:40794769_41003338), 208570 bp
>pF1KA1475 2919
>gi568815583f:40794769_41003338 (Chr15)
1-91 (100001-100091) 100% ->
92-233 (101170-101311) 100% ->
234-325 (104139-104230) 100% ->
326-2196 (104376-106246) 100% ->
2197-2919 (107848-108570) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGTCCATCCTGGATGAGTACGAGAACTCGCTGTCCCGCTCGGCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCGTCCATCCTGGATGAGTACGAGAACTCGCTGTCCCGCTCGGCCGT
50 . : . : . : . : . :
51 CTTGCAGCCCGGCTGCCCTAGCGTGGGCATCCCCCACTCGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
100051 CTTGCAGCCCGGCTGCCCTAGCGTGGGCATCCCCCACTCGGGTA...TAG
100 . : . : . : . : . :
92 GGTATGTGAATGCCCAGCTGGAGAAGGAAGTGCCCATCTTCACAAAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101170 GGTATGTGAATGCCCAGCTGGAGAAGGAAGTGCCCATCTTCACAAAGCAG
150 . : . : . : . : . :
142 CGCATTGACTTCACCCCTTCCGAGCGCATTACCAGTCTTGTCGTCTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101220 CGCATTGACTTCACCCCTTCCGAGCGCATTACCAGTCTTGTCGTCTCCAG
200 . : . : . : . : . :
192 CAATCAGCTGTGCATGAGCCTGGGCAAGGATACACTGCTCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
101270 CAATCAGCTGTGCATGAGCCTGGGCAAGGATACACTGCTCCGGTA...CA
250 . : . : . : . : . :
234 CATTGACTTGGGCAAGGCAAATGAGCCCAACCACGTGGAGCTGGGACGT
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104138 GCATTGACTTGGGCAAGGCAAATGAGCCCAACCACGTGGAGCTGGGACGT
300 . : . : . : . : . :
283 AAGGATGACGCAAAAGTTCACAAGATGTTCCTTGACCATACTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
104188 AAGGATGACGCAAAAGTTCACAAGATGTTCCTTGACCATACTGGTA...C
350 . : . : . : . : . :
326 GCTCTCACCTGCTGATTGCCCTGAGCAGCACGGAGGTCCTCTACGTGA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104374 AGGCTCTCACCTGCTGATTGCCCTGAGCAGCACGGAGGTCCTCTACGTGA
400 . : . : . : . : . :
374 ACCGAAATGGACAGAAGGTACGGCCACTAGCACGCTGGAAGGGGCAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104424 ACCGAAATGGACAGAAGGTACGGCCACTAGCACGCTGGAAGGGGCAGCTG
450 . : . : . : . : . :
424 GTGGAGAGTGTGGGTTGGAACAAGGCACTGGGCACGGAGAGCAGCACAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104474 GTGGAGAGTGTGGGTTGGAACAAGGCACTGGGCACGGAGAGCAGCACAGG
500 . : . : . : . : . :
474 CCCCATCCTGGTCGGGACTGCCCAAGGCCACATCTTTGAAGCAGAGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104524 CCCCATCCTGGTCGGGACTGCCCAAGGCCACATCTTTGAAGCAGAGCTCT
550 . : . : . : . : . :
524 CAGCCAGCGAAGGTGGGCTTTTCGGCCCTGCTCCGGATCTCTACTTCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104574 CAGCCAGCGAAGGTGGGCTTTTCGGCCCTGCTCCGGATCTCTACTTCCGC
600 . : . : . : . : . :
574 CCATTGTACGTGCTAAATGAAGAAGGGGGTCCAGCACCTGTGTGCTCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104624 CCATTGTACGTGCTAAATGAAGAAGGGGGTCCAGCACCTGTGTGCTCCCT
650 . : . : . : . : . :
624 TGAGGCCGAGCGGGGCCCTGATGGGCGTAGCTTTGTTATTGCCACCACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104674 TGAGGCCGAGCGGGGCCCTGATGGGCGTAGCTTTGTTATTGCCACCACTC
700 . : . : . : . : . :
674 GGCAGCGCCTCTTCCAGTTCATAGGCCGAGCAGCAGAGGGGGCTGAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104724 GGCAGCGCCTCTTCCAGTTCATAGGCCGAGCAGCAGAGGGGGCTGAGGCC
750 . : . : . : . : . :
724 CAGGGTTTCTCAGGGCTCTTTGCAGCTTACACGGACCACCCACCCCCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104774 CAGGGTTTCTCAGGGCTCTTTGCAGCTTACACGGACCACCCACCCCCATT
800 . : . : . : . : . :
774 CCGTGAGTTTCCCAGCAACCTGGGCTACAGTGAGTTGGCCTTCTACACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104824 CCGTGAGTTTCCCAGCAACCTGGGCTACAGTGAGTTGGCCTTCTACACCC
850 . : . : . : . : . :
824 CCAAGCTGCGCTCCGCACCCCGGGCCTTCGCCTGGATGATGGGGGATGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104874 CCAAGCTGCGCTCCGCACCCCGGGCCTTCGCCTGGATGATGGGGGATGGT
900 . : . : . : . : . :
874 GTGTTGTATGGGGCATTGGACTGTGGGCGCCCTGACTCTCTGCTGAGCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104924 GTGTTGTATGGGGCATTGGACTGTGGGCGCCCTGACTCTCTGCTGAGCGA
950 . : . : . : . : . :
924 GGAGCGAGTCTGGGAGTACCCAGAGGGGGTAGGGCCTGGGGCCAGCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104974 GGAGCGAGTCTGGGAGTACCCAGAGGGGGTAGGGCCTGGGGCCAGCCCAC
1000 . : . : . : . : . :
974 CCCTAGCCATCGTCTTGACCCAGTTCCACTTCCTGCTGCTACTGGCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105024 CCCTAGCCATCGTCTTGACCCAGTTCCACTTCCTGCTGCTACTGGCAGAC
1050 . : . : . : . : . :
1024 CGGGTGGAGGCAGTGTGCACACTGACCGGGCAGGTGGTGCTGCGGGATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105074 CGGGTGGAGGCAGTGTGCACACTGACCGGGCAGGTGGTGCTGCGGGATCA
1100 . : . : . : . : . :
1074 CTTCCTGGAGAAATTTGGGCCGCTGAAGCACATGGTGAAGGACTCCTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105124 CTTCCTGGAGAAATTTGGGCCGCTGAAGCACATGGTGAAGGACTCCTCCA
1150 . : . : . : . : . :
1124 CAGGCCAGCTGTGGGCCTACACTGAGCGGGCTGTCTTCCGCTACCACGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105174 CAGGCCAGCTGTGGGCCTACACTGAGCGGGCTGTCTTCCGCTACCACGTG
1200 . : . : . : . : . :
1174 CAACGGGAGGCCCGAGATGTCTGGCGCACCTATCTGGACATGAACCGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105224 CAACGGGAGGCCCGAGATGTCTGGCGCACCTATCTGGACATGAACCGCTT
1250 . : . : . : . : . :
1224 CGATCTGGCCAAAGAGTATTGTCGAGAGCGGCCCGACTGCCTGGACACGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105274 CGATCTGGCCAAAGAGTATTGTCGAGAGCGGCCCGACTGCCTGGACACGG
1300 . : . : . : . : . :
1274 TCCTGGCCCGGGAGGCCGATTTCTGCTTTCGCCAGCGTCGCTACCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105324 TCCTGGCCCGGGAGGCCGATTTCTGCTTTCGCCAGCGTCGCTACCTGGAG
1350 . : . : . : . : . :
1324 AGCGCACGCTGCTATGCCCTGACCCAGAGCTACTTTGAGGAGATTGCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105374 AGCGCACGCTGCTATGCCCTGACCCAGAGCTACTTTGAGGAGATTGCCCT
1400 . : . : . : . : . :
1374 CAAGTTCCTGGAGGCCCGACAGGAGGAGGCTCTGGCTGAGTTCCTGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105424 CAAGTTCCTGGAGGCCCGACAGGAGGAGGCTCTGGCTGAGTTCCTGCAGC
1450 . : . : . : . : . :
1424 GAAAACTGGCCAGTTTGAAGCCAGCCGAACGTACCCAGGCCACACTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105474 GAAAACTGGCCAGTTTGAAGCCAGCCGAACGTACCCAGGCCACACTGCTG
1500 . : . : . : . : . :
1474 ACCACCTGGCTGACAGAGCTCTACCTGAGCCGGCTTGGGGCTCTGCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105524 ACCACCTGGCTGACAGAGCTCTACCTGAGCCGGCTTGGGGCTCTGCAGGG
1550 . : . : . : . : . :
1524 CGACCCAGAGGCCCTGACTCTCTACCGAGAAACCAAGGAATGCTTTCGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105574 CGACCCAGAGGCCCTGACTCTCTACCGAGAAACCAAGGAATGCTTTCGAA
1600 . : . : . : . : . :
1574 CCTTCCTCAGCAGCCCCCGCCACAAAGAGTGGCTCTTTGCCAGCCGGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105624 CCTTCCTCAGCAGCCCCCGCCACAAAGAGTGGCTCTTTGCCAGCCGGGCC
1650 . : . : . : . : . :
1624 TCTATCCATGAGCTGCTCGCCAGTCATGGGGACACAGAACACATGGTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105674 TCTATCCATGAGCTGCTCGCCAGTCATGGGGACACAGAACACATGGTGTA
1700 . : . : . : . : . :
1674 CTTTGCAGTGATCATGCAGGACTATGAGCGGGTGGTGGCTTACCACTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105724 CTTTGCAGTGATCATGCAGGACTATGAGCGGGTGGTGGCTTACCACTGTC
1750 . : . : . : . : . :
1724 AGCACGAGGCCTACGAGGAGGCCCTGGCCGTGCTCGCCCGCCACCGTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105774 AGCACGAGGCCTACGAGGAGGCCCTGGCCGTGCTCGCCCGCCACCGTGAC
1800 . : . : . : . : . :
1774 CCCCAGCTCTTCTACAAGTTCTCACCCATCCTCATCCGTCACATCCCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105824 CCCCAGCTCTTCTACAAGTTCTCACCCATCCTCATCCGTCACATCCCCCG
1850 . : . : . : . : . :
1824 CCAGCTTGTAGATGCCTGGATTGAGATGGGCAGCCGGCTGGATGCTCGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105874 CCAGCTTGTAGATGCCTGGATTGAGATGGGCAGCCGGCTGGATGCTCGTC
1900 . : . : . : . : . :
1874 AGCTCATTCCTGCCCTGGTGAACTACAGCCAGGGTGGTGAGGTCCAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105924 AGCTCATTCCTGCCCTGGTGAACTACAGCCAGGGTGGTGAGGTCCAGCAG
1950 . : . : . : . : . :
1924 GTGAGCCAGGCCATCCGCTACATGGAGTTCTGCGTGAACGTGCTGGGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105974 GTGAGCCAGGCCATCCGCTACATGGAGTTCTGCGTGAACGTGCTGGGGGA
2000 . : . : . : . : . :
1974 GACTGAGCAGGCCATCCACAACTACCTGCTGTCACTGTATGCCCGTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106024 GACTGAGCAGGCCATCCACAACTACCTGCTGTCACTGTATGCCCGTGGCC
2050 . : . : . : . : . :
2024 GGCCGGACTCACTACTGGCCTATCTGGAGCAGGCTGGGGCCAGCCCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106074 GGCCGGACTCACTACTGGCCTATCTGGAGCAGGCTGGGGCCAGCCCCCAC
2100 . : . : . : . : . :
2074 CGGGTGCATTACGACCTCAAGTATGCGCTGCGGCTCTGCGCCGAGCATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106124 CGGGTGCATTACGACCTCAAGTATGCGCTGCGGCTCTGCGCCGAGCATGG
2150 . : . : . : . : . :
2124 CCACCACCGCGCTTGTGTCCATGTCTACAAGGTCCTAGAGCTGTATGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106174 CCACCACCGCGCTTGTGTCCATGTCTACAAGGTCCTAGAGCTGTATGAGG
2200 . : . : . : . : . :
2174 AGGCCGTGGACCTGGCCCTGCAG GTGGATGTGGACCTGGCC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
106224 AGGCCGTGGACCTGGCCCTGCAGGTA...CAGGTGGATGTGGACCTGGCC
2250 . : . : . : . : . :
2215 AAGCAGTGTGCAGACCTGCCTGAGGAGGATGAGGAATTGCGCAAGAAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107866 AAGCAGTGTGCAGACCTGCCTGAGGAGGATGAGGAATTGCGCAAGAAGCT
2300 . : . : . : . : . :
2265 GTGGCTGAAGATCGCACGGCACGTGGTGCAGGAAGAGGAAGATGTACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107916 GTGGCTGAAGATCGCACGGCACGTGGTGCAGGAAGAGGAAGATGTACAGA
2350 . : . : . : . : . :
2315 CAGCCATGGCTTGCCTGGCTAGCTGCCCCTTGCTCAAGATTGAGGATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107966 CAGCCATGGCTTGCCTGGCTAGCTGCCCCTTGCTCAAGATTGAGGATGTG
2400 . : . : . : . : . :
2365 CTGCCCTTCTTTCCTGATTTCGTCACCATCGACCACTTCAAGGAGGCGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108016 CTGCCCTTCTTTCCTGATTTCGTCACCATCGACCACTTCAAGGAGGCGAT
2450 . : . : . : . : . :
2415 CTGCAGCTCACTTAAGGCCTACAACCACCACATCCAGGAGCTGCAGCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108066 CTGCAGCTCACTTAAGGCCTACAACCACCACATCCAGGAGCTGCAGCGGG
2500 . : . : . : . : . :
2465 AGATGGAAGAGGCTACAGCCAGTGCCCAGCGCATCCGGCGAGACCTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108116 AGATGGAAGAGGCTACAGCCAGTGCCCAGCGCATCCGGCGAGACCTGCAG
2550 . : . : . : . : . :
2515 GAGCTGCGGGGCCGCTACGGCACTGTGGAGCCCCAGGACAAATGTGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108166 GAGCTGCGGGGCCGCTACGGCACTGTGGAGCCCCAGGACAAATGTGCCAC
2600 . : . : . : . : . :
2565 CTGCGACTTCCCCCTGCTCAACCGCCCTTTTTACCTCTTCCTCTGTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108216 CTGCGACTTCCCCCTGCTCAACCGCCCTTTTTACCTCTTCCTCTGTGGCC
2650 . : . : . : . : . :
2615 ATATGTTCCATGCTGACTGCCTGCTGCAGGCTGTGCGACCTGGCCTGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108266 ATATGTTCCATGCTGACTGCCTGCTGCAGGCTGTGCGACCTGGCCTGCCA
2700 . : . : . : . : . :
2665 GCCTACAAGCAGGCCCGGCTGGAGGAGCTGCAGAGGAAGCTGGGGGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108316 GCCTACAAGCAGGCCCGGCTGGAGGAGCTGCAGAGGAAGCTGGGGGCTGC
2750 . : . : . : . : . :
2715 TCCACCCCCAGCCAAGGGCTCTGCCCGGGCCAAGGAGGCCGAGGGTGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108366 TCCACCCCCAGCCAAGGGCTCTGCCCGGGCCAAGGAGGCCGAGGGTGGGG
2800 . : . : . : . : . :
2765 CTGCCACGGCAGGGCCCAGCCGGGAACAGCTCAAGGCTGACCTGGATGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108416 CTGCCACGGCAGGGCCCAGCCGGGAACAGCTCAAGGCTGACCTGGATGAG
2850 . : . : . : . : . :
2815 TTGGTGGCCGCTGAGTGTGTGTACTGTGGGGAGCTGATGATCCGCTCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108466 TTGGTGGCCGCTGAGTGTGTGTACTGTGGGGAGCTGATGATCCGCTCTAT
2900 . : . : . : . : . :
2865 CGACCGGCCGTTCATCGACCCCCAGCGCTACGAGGAGGAGCAGCTCAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108516 CGACCGGCCGTTCATCGACCCCCAGCGCTACGAGGAGGAGCAGCTCAGTT
2950 .
2915 GGCTG
|||||
108566 GGCTG