seq1 = pF1KA1464.tfa, 1860 bp
seq2 = pF1KA1464/gi568815582r_67626431.tfa (gi568815582r:67626431_67906536), 280106 bp

>pF1KA1464 1860
>gi568815582r:67626431_67906536 (Chr16)

(complement)

1-235  (100001-100235)   100% ->
236-347  (100998-101109)   100% ->
348-400  (134451-134503)   100% ->
401-568  (162082-162249)   100% ->
569-591  (168502-168524)   100% ->
592-776  (171495-171679)   100% ->
777-889  (174953-175065)   100% ->
890-998  (176491-176599)   100% ->
999-1147  (176709-176857)   100% ->
1148-1352  (177053-177257)   100% ->
1353-1474  (178026-178147)   100% ->
1475-1620  (178641-178786)   100% ->
1621-1732  (179099-179210)   100% ->
1733-1860  (179979-180106)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCAGCGACGGCAGACCCGGGAGCTGGGAACCCGCAGCCTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCAGCGACGGCAGACCCGGGAGCTGGGAACCCGCAGCCTGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCTCCGGCGGGGGCGCTGGGGGCGGGCTGCCGTCCCCTGGGGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCTCCGGCGGGGGCGCTGGGGGCGGGCTGCCGTCCCCTGGGGAGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGAGCCGGCGCTTGCAGCGCCTGTATCCCGCGGTCAACCAGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGAGCCGGCGCTTGCAGCGCCTGTATCCCGCGGTCAACCAGCAAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTCCGCTGCCGCGCTCCTGGAGCCCCAAGGACAAATACAACTACATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTCCGCTGCCGCGCTCCTGGAGCCCCAAGGACAAATACAACTACATTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTCTCCCAGGGCAACCTCCGCGTCCACTACAAAG         GTCATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100201 TCTCTCCCAGGGCAACCTCCGCGTCCACTACAAAGGTA...TAGGTCATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAAAAATCACAAAGATGCGGCCTCAGTGCGTGCCACCCACCCCATACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101004 GCAAAAATCACAAAGATGCGGCCTCAGTGCGTGCCACCCACCCCATACCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGCCTGTGGCATTTATTACTTTGAAGTGAAGATTGTCAGCAAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101054 GCTGCCTGTGGCATTTATTACTTTGAAGTGAAGATTGTCAGCAAAGGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGATGG         TTACATGGGAATAGGACTCTCGGCTCAAGGCGTCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101104 AGATGGGTA...AAGTTACATGGGAATAGGACTCTCGGCTCAAGGCGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACATGAACAGACTTCCTG         GTTGGGACAAACATTCCTATGGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 134486 ACATGAACAGACTTCCTGGTG...CAGGTTGGGACAAACATTCCTATGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACCATGGTGATGATGGGCATTCGTTCTGCTCCTCGGGGACTGGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162105 TACCATGGTGATGATGGGCATTCGTTCTGCTCCTCGGGGACTGGCCAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTATGGTCCCACATTCACCACAGGAGACGTGATCGGCTGCTGTGTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162155 CTATGGTCCCACATTCACCACAGGAGACGTGATCGGCTGCTGTGTCAACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCATCAATGGCACCTGCTTCTACACCAAGAATGGCCACAGCCTTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 162205 TCATCAATGGCACCTGCTTCTACACCAAGAATGGCCACAGCCTTGGTG..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    569     GTATAGCCTTCACAGACCTCCCG         GCCAACCTCTACCC
        .>>>|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 162255 .CAGGTATAGCCTTCACAGACCTCCCGGTG...CAGGCCAACCTCTACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CACCGTAGGCCTGCAGACACCTGGGGAGATTGTGGACGCCAACTTTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171509 CACCGTAGGCCTGCAGACACCTGGGGAGATTGTGGACGCCAACTTTGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCAGCCCTTCCTGTTTGACATTGAGGACTACATGCGGGAGTGGCGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171559 AGCAGCCCTTCCTGTTTGACATTGAGGACTACATGCGGGAGTGGCGTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGGTCCAGGGCACGGTCCACTGCTTCCCCATCAGTGCCCGGCTTGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171609 AAGGTCCAGGGCACGGTCCACTGCTTCCCCATCAGTGCCCGGCTTGGCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTGGCAGGCAGTGCTGCAGAA         CATGGTTTCATCTTACCTCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 171659 GTGGCAGGCAGTGCTGCAGAAGTG...TAGCATGGTTTCATCTTACCTCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGCATCATGGGTATTGTGCCACAGCCACGGCTTTTGCTCGAATGACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174973 TGCATCATGGGTATTGTGCCACAGCCACGGCTTTTGCTCGAATGACTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ACCCCGATTCAGGAAGAACAGGCGTCCATAAAGAACAGACAAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 175023 ACCCCGATTCAGGAAGAACAGGCGTCCATAAAGAACAGACAAAGTA...C

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    890   AGATCCAGAAGCTGGTGCTGGAGGGCCGTGTGGGCGAGGCCATCGAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176489 AGAGATCCAGAAGCTGGTGCTGGAGGGCCGTGTGGGCGAGGCCATCGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCACCCAGCGCTTCTACCCAGGGCTGCTGGAGCACAACCCCAACCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176539 CCACCCAGCGCTTCTACCCAGGGCTGCTGGAGCACAACCCCAACCTCCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTCATGCTCAA         GTGCCGGCAGTTTGTGGAGATGGTGAATGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 176589 TTCATGCTCAAGTA...CAGGTGCCGGCAGTTTGTGGAGATGGTGAATGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GACGGACAGTGAGGTCCGAAGTTTGAGCTCCCGAAGCCCCAAGTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176739 GACGGACAGTGAGGTCCGAAGTTTGAGCTCCCGAAGCCCCAAGTCCCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACAGCTACCCTGGCTCCCCCAGCCTCAGTCCCCGACATGGCCCCAGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176789 ACAGCTACCCTGGCTCCCCCAGCCTCAGTCCCCGACATGGCCCCAGTAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TCCCACATGCACAACACAG         GAGCAGACAGTCCCAGCTGTAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 176839 TCCCACATGCACAACACAGGTC...TAGGAGCAGACAGTCCCAGCTGTAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CAATGGCGTCGCGTCCACCAAGAGCAAACAGAACCACAGTAAATACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177075 CAATGGCGTCGCGTCCACCAAGAGCAAACAGAACCACAGTAAATACCCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CACCCAGCTCCTCATCCTCGTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCTTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177125 CACCCAGCTCCTCATCCTCGTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCTTCCCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TCCTCCGTCAATTACTCCGAGTCCAACTCAACAGACTCCACCAAGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177175 TCCTCCGTCAATTACTCCGAGTCCAACTCAACAGACTCCACCAAGTCCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCACCACAGCAGTACCAGTAACCAGGAGACCAG         CGACAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 177225 GCACCACAGCAGTACCAGTAACCAGGAGACCAGGTG...CAGCGACAGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AGATGGAGATGGAGGCAGAGCACTACCCCAACGGTGTGCTAGGAAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178034 AGATGGAGATGGAGGCAGAGCACTACCCCAACGGTGTGCTAGGAAGCATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TCCACACGCATTGTTAATGGTGCCTACAAGCATGAGGACCTGCAGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178084 TCCACACGCATTGTTAATGGTGCCTACAAGCATGAGGACCTGCAGACGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TGAGTCCAGCATGG         ATGACAGGCATCCTCGGCGGCAGCTCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 178134 TGAGTCCAGCATGGGTG...CAGATGACAGGCATCCTCGGCGGCAGCTCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GCGGGGGCAACCAGGCTGCCACAGAAAGGATCATTCTGTTTGGCCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178668 GCGGGGGCAACCAGGCTGCCACAGAAAGGATCATTCTGTTTGGCCGCGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 TTGCAGGCATTGAGTGAGCAGTTGGGCCGGGAGTACGGCAAGAATTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178718 TTGCAGGCATTGAGTGAGCAGTTGGGCCGGGAGTACGGCAAGAATTTGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CCACACAGAGATGCTGCAG         GATGCCTTCAGCCTGCTGGCAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 178768 CCACACAGAGATGCTGCAGGTA...TAGGATGCCTTCAGCCTGCTGGCAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 ACTCAGACCCCTGGAGCTGCCCAGTTGGCCAGCAGCTTGACCCCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179121 ACTCAGACCCCTGGAGCTGCCCAGTTGGCCAGCAGCTTGACCCCATCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AGGGAACCTGTGTGTGCTGCCCTCAACAGCGCCATTTTAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 179171 AGGGAACCTGTGTGTGCTGCCCTCAACAGCGCCATTTTAGGTG...CAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GTCCCAGAACCTGCCAAAGCAGCCCCCTCTGATGCTCGCCCTGGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179980 GTCCCAGAACCTGCCAAAGCAGCCCCCTCTGATGCTCGCCCTGGGCCAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CATCTGAGTGTCTCCGGCTCATGGCCCGAGCAGGCCTGGGTTCTTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180030 CATCTGAGTGTCTCCGGCTCATGGCCCGAGCAGGCCTGGGTTCTTGCTCC

   1950     .    :    .    :    .
   1834 TTTGCCAGAGTTGATGACTACTTGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||
 180080 TTTGCCAGAGTTGATGACTACTTGCAC