seq1 = pF1KA1451.tfa, 2667 bp
seq2 = pF1KA1451/gi568815586r_76255892.tfa (gi568815586r:76255892_76587551), 331660 bp

>pF1KA1451 2667
>gi568815586r:76255892_76587551 (Chr12)

(complement)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-79  (127657-127693)   100% ->
80-217  (136564-136701)   100% ->
218-288  (176918-176988)   100% ->
289-366  (184786-184863)   100% ->
367-468  (187578-187679)   100% ->
469-672  (189655-189858)   100% ->
673-757  (192823-192907)   100% ->
758-929  (194800-194971)   100% ->
930-1167  (196895-197132)   100% ->
1168-1352  (197723-197907)   100% ->
1353-1434  (200892-200973)   100% ->
1435-1533  (201286-201384)   100% ->
1534-1630  (203202-203298)   100% ->
1631-1729  (209002-209100)   100% ->
1730-1827  (212182-212279)   100% ->
1828-1917  (214119-214208)   100% ->
1918-2054  (215968-216104)   100% ->
2055-2240  (217730-217915)   100% ->
2241-2328  (218251-218338)   100% ->
2329-2434  (228741-228846)   100% ->
2435-2537  (230824-230926)   100% ->
2538-2667  (231531-231660)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGGAGGTTTGGCAGATGGAGAACCTGATCGAACTTCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGGAGGGAGGTTTGGCAGATGGAGAACCTGATCGAACTTCGGTG...AA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  CTTCTTGGTGATAGCAAAGATGTCCTTGGGCCATCAA         CTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 127656 GCTTCTTGGTGATAGCAAAGATGTCCTTGGGCCATCAAGTA...GAGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 TTGTAGCAAACAGTGACGAATCTCAGCTTCTGACACCAGGAAAGATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136567 TTGTAGCAAACAGTGACGAATCTCAGCTTCTGACACCAGGAAAGATGAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CAGCGCCAAGGAAAAGAAGCTTATCCAACGCCAACCAAAGATTTGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136617 CAGCGCCAAGGAAAAGAAGCTTATCCAACGCCAACCAAAGATTTGCATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCCATCTCTTAGTCCAGCAAGTCCTCATAGCCAGG         GTTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 136667 GCCATCTCTTAGTCCAGCAAGTCCTCATAGCCAGGGTA...AAGGTTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AAAGAGGGAAGGAAGATATTTCTCAAAATAAAGATGAATCTTCACTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176924 AAAGAGGGAAGGAAGATATTTCTCAAAATAAAGATGAATCTTCACTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATGTCAAAGAGCAAG         TCTGAATCTAAACTTTATAATGGCTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 176974 ATGTCAAAGAGCAAGGTA...CAGTCTGAATCTAAACTTTATAATGGCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AGAGAAGGACAGTTCAACTTCAAGCAAACTCACAAAAAAAGAATCTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184812 AGAGAAGGACAGTTCAACTTCAAGCAAACTCACAAAAAAAGAATCTCTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AG         GTACAAAAGAAAAATTACCGAGAAGAAAAGAAAAGAGCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184862 AGGTT...TAGGTACAAAAGAAAAATTACCGAGAAGAAAAGAAAAGAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 ACAAAGGAGCTGCTCAGTACAATCACAGATCCTTCTGTTATTGTTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187617 ACAAAGGAGCTGCTCAGTACAATCACAGATCCTTCTGTTATTGTTATGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGATTGGTTAAAG         ATTCGTGGTACTCTAAAGAGCTGGACCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 187667 TGATTGGTTAAAGGTC...TAGATTCGTGGTACTCTAAAGAGCTGGACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AGTTATGGTGTGTGTTGAAACCTGGGGTGCTACTGATCTATAAAACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189683 AGTTATGGTGTGTGTTGAAACCTGGGGTGCTACTGATCTATAAAACCCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAAAATGGTCAGTGGGTAGGAACAGTTCTTCTGAATGCCTGTGAAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189733 AAAAATGGTCAGTGGGTAGGAACAGTTCTTCTGAATGCCTGTGAAATCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGAACGTCCATCAAAAAAGGATGGCTTTTGTTTCAAACTTTTCCATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189783 TGAACGTCCATCAAAAAAGGATGGCTTTTGTTTCAAACTTTTCCATCCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGGAGCAATCTATTTGGGCAGTGAAG         GGTCCAAAAGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 189833 TGGAGCAATCTATTTGGGCAGTGAAGGTA...AAGGGTCCAAAAGGTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GCGGTTGGATCCATTACTCAACCCTTACCTAGCAGTTATTTGATCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192838 GCGGTTGGATCCATTACTCAACCCTTACCTAGCAGTTATTTGATCATCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGCTACTTCAGAGTCAGATG         GAAGGTGCTGGATGGATGCTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 192888 AGCTACTTCAGAGTCAGATGGTA...TAGGAAGGTGCTGGATGGATGCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGGAGTTGGCTTTGAAATGTTCTAGTCTTCTTAAACGTACAATGATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194821 TGGAGTTGGCTTTGAAATGTTCTAGTCTTCTTAAACGTACAATGATCAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GAAGGAAAGGAACATGACCTGAGCGTTTCATCAGATAGCACACATGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194871 GAAGGAAAGGAACATGACCTGAGCGTTTCATCAGATAGCACACATGTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TTTCTATGGCTTACTACGTGCTAACAATCTCCACAGTGGTGATAACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194921 TTTCTATGGCTTACTACGTGCTAACAATCTCCACAGTGGTGATAACTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 A         GTTAAATGATAGTGAAATTGAACGACAACATTTTAAGGAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194971 AGTA...AAGGTTAAATGATAGTGAAATTGAACGACAACATTTTAAGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CAAGATATGTATTCTGATAAATCTGATAAAGAAAATGATCAAGAACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196935 CAAGATATGTATTCTGATAAATCTGATAAAGAAAATGATCAAGAACATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGAGTCTGATAATGAGGTGATGGGGAAAAGTGAAGAAAGTGACACAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196985 TGAGTCTGATAATGAGGTGATGGGGAAAAGTGAAGAAAGTGACACAGATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CATCAGAAAGACAAGATGACTCATATATCGAACCTGAGCCTGTTGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197035 CATCAGAAAGACAAGATGACTCATATATCGAACCTGAGCCTGTTGAGCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TTAAAGGAGACTACCTACACTGAACAGAGCCATGAAGAACTTGGAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 197085 TTAAAGGAGACTACCTACACTGAACAGAGCCATGAAGAACTTGGAGAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1168        GCAGGTGAGGCTTCTCAAACAGAAACTGTATCTGAAGAAAACA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197135 A...AAGGCAGGTGAGGCTTCTCAAACAGAAACTGTATCTGAAGAAAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AAAGCCTTATCTGGACACTATTGAAACAAGTCCGTCCTGGCATGGACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197766 AAAGCCTTATCTGGACACTATTGAAACAAGTCCGTCCTGGCATGGACCTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TCCAAGGTGGTTCTGCCTACATTTATTTTGGAACCCCGTTCTTTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197816 TCCAAGGTGGTTCTGCCTACATTTATTTTGGAACCCCGTTCTTTCCTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TAAACTTTCAGATTACTACTATCATGCAGATTTCCTATCTGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 197866 TAAACTTTCAGATTACTACTATCATGCAGATTTCCTATCTGAGTA...TA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1353  GGCAGCTCTTGAAGAAAATCCTTATTTCCGTTTGAAGAAAGTAGTGAAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200891 GGGCAGCTCTTGAAGAAAATCCTTATTTCCGTTTGAAGAAAGTAGTGAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TGGTATTTGTCAGGATTCTATAAAAAGCCAAAG         GGACTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 200941 TGGTATTTGTCAGGATTCTATAAAAAGCCAAAGGTA...CAGGGACTGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GAAACCTTATAATCCTATACTTGGCGAGACTTTCCGTTGTTTATGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201294 GAAACCTTATAATCCTATACTTGGCGAGACTTTCCGTTGTTTATGGATTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 ATCCCAGAACAAACAGCAAAACTTTTTATATTGCTGAACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 201344 ATCCCAGAACAAACAGCAAAACTTTTTATATTGCTGAACAGGTA...TAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GTGTCCCATCATCCACCAATATCTGCCTTTTATGTTAGTAATCGAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203202 GTGTCCCATCATCCACCAATATCTGCCTTTTATGTTAGTAATCGAAAAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TGGATTTTGCCTTAGCGGTAGTATCCTGGCTAAGTCTAAGTTTTATG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 203252 TGGATTTTGCCTTAGCGGTAGTATCCTGGCTAAGTCTAAGTTTTATGGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1631       GAAACTCATTATCTGCAATATTAGAGGGAGAAGCACGGTTAACT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203302 ...CAGGAAACTCATTATCTGCAATATTAGAGGGAGAAGCACGGTTAACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TTCTTGAATAGAGGTGAAGATTATGTAATGACAATGCCATACGCTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209046 TTCTTGAATAGAGGTGAAGATTATGTAATGACAATGCCATACGCTCATTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TAAAG         GAATTCTTTATGGTACAATGACACTGGAGCTTGGTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209096 TAAAGGTA...TAGGAATTCTTTATGGTACAATGACACTGGAGCTTGGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 GAACAGTCAATATTACATGTCAAAAAACTGGATACAGTGCAATACTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212218 GAACAGTCAATATTACATGTCAAAAAACTGGATACAGTGCAATACTTGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 TTTAAACTAAAG         CCATTCCTAGGGAGTAGTGACTGTGTTAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 212268 TTTAAACTAAAGGTT...AAGCCATTCCTAGGGAGTAGTGACTGTGTTAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 TCAAATATCAGGGAAACTTAAACTGGGAAAAGAAGTCCTAGCTACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214148 TCAAATATCAGGGAAACTTAAACTGGGAAAAGAAGTCCTAGCTACTTTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 AAGGTCATTGG         GATAGTGAAGTTTTTATTACTGATAAAAAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 214198 AAGGTCATTGGGTA...TAGGATAGTGAAGTTTTTATTACTGATAAAAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 ACTGATAATTCAGAGGTTTTCTGGAATCCAACACCTGACATTAAGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215998 ACTGATAATTCAGAGGTTTTCTGGAATCCAACACCTGACATTAAGCAATG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 GAGATTAATAAGGCACACTGTAAAATTTGAAGAACAGGGAGATTTTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216048 GAGATTAATAAGGCACACTGTAAAATTTGAAGAACAGGGAGATTTTGAAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 CAGAGAA         ACTCTGGCAACGGGTAACTCGAGCCATAAATGCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216098 CAGAGAAGTA...TAGACTCTGGCAACGGGTAACTCGAGCCATAAATGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 AAAGACCAAACTGAAGCTACCCAAGAGAAGTATGTTTTGGAAGAAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217764 AAAGACCAAACTGAAGCTACCCAAGAGAAGTATGTTTTGGAAGAAGCTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 AAGACAAGCTGCCAGGGATCGGAAAACAAAAAATGAAGAGTGGTCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217814 AAGACAAGCTGCCAGGGATCGGAAAACAAAAAATGAAGAGTGGTCTTGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 AATTATTTGAACTTGATCCACTCACAGGAGAATGGCATTACAAGTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217864 AATTATTTGAACTTGATCCACTCACAGGAGAATGGCATTACAAGTTTGCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GA         TACCCGACCATGGGACCCACTTAATGATATGATACAGTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217914 GAGTA...TAGTACCCGACCATGGGACCCACTTAATGATATGATACAGTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 TGAAAAAGATGGTGTTATTCAGACCAAAGTGAAACATCGTACTCCAATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 218290 TGAAAAAGATGGTGTTATTCAGACCAAAGTGAAACATCGTACTCCAATGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329         GTTAGCGTCCCCAAAATGAAACATAAGCCAACCAGGCAACAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218340 TA...TAGGTTAGCGTCCCCAAAATGAAACATAAGCCAACCAGGCAACAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2371 AAGAAAGTAGCAAAAGGCTATTCCTCCCCAGAACCTGACATTCAAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228783 AAGAAAGTAGCAAAAGGCTATTCCTCCCCAGAACCTGACATTCAAGACTC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 CTCTGGAAGTGAAG         CTCAATCAGTAAAACCAAGTACAAGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 228833 CTCTGGAAGTGAAGGTA...TAGCTCAATCAGTAAAACCAAGTACAAGAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2462 GAAAGAAAGGAATAGAACTGGGAGACATTCAGAGTTCCATCGAATCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230851 GAAAGAAAGGAATAGAACTGGGAGACATTCAGAGTTCCATCGAATCTATA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2512 AAACAAACACAGGAAGAAATTAAAAG         AAATATTATGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 230901 AAACAAACACAGGAAGAAATTAAAAGGTA...TAGAAATATTATGGCTCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2553 TCGAAATCATTTAGTTTCAAGCACACCGGCCACGGATTATTTTCTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231546 TCGAAATCATTTAGTTTCAAGCACACCGGCCACGGATTATTTTCTGCAAC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2603 AAAAAGACTACTTCATCATTTTCCTCCTGATTTTGCTTCAAGTCATAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231596 AAAAAGACTACTTCATCATTTTCCTCCTGATTTTGCTTCAAGTCATAATA

   2850     .    :    .
   2653 AACTTCATGTTCAAG
        |||||||||||||||
 231646 AACTTCATGTTCAAG