Result of SIM4 for
pF1KA1450
seq1 = pF1KA1450.tfa, 3342 bp
seq2 = pF1KA1450/gi568815594f_158669213.tfa (gi568815594f:158669213_159004541), 335329 bp
>pF1KA1450 3342
>gi568815594f:158669213_159004541 (Chr4)
1-107 (100001-100107) 100% ->
108-234 (156704-156830) 100% ->
235-381 (159867-160013) 100% ->
382-482 (162649-162749) 100% ->
483-554 (162855-162926) 100% ->
555-655 (164316-164416) 100% ->
656-727 (166193-166264) 100% ->
728-857 (182109-182238) 100% ->
858-1059 (189845-190046) 100% ->
1060-1148 (190366-190454) 100% ->
1149-1295 (192130-192276) 100% ->
1296-1465 (192395-192564) 100% ->
1466-2792 (198890-200216) 100% ->
2793-2949 (201101-201257) 100% ->
2950-3150 (222234-222434) 100% ->
3151-3266 (226538-226653) 100% ->
3267-3342 (235254-235329) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCCCCGACCCTGCTCCAGAAGCTCTTCAACAAAAGGGGCAGCAGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCCCCGACCCTGCTCCAGAAGCTCTTCAACAAAAGGGGCAGCAGCGG
50 . : . : . : . : . :
51 CAGCTCCGCGGCGGCGTCTGCCCAGGGCAGGGCTCCTAAGGAAGGACCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CAGCTCCGCGGCGGCGTCTGCCCAGGGCAGGGCTCCTAAGGAAGGACCCG
100 . : . : . : . : . :
101 CCTTTAG TTGGTCATGTTCGGAGTTTGACCTGAATGAGATT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CCTTTAGGTG...CAGTTGGTCATGTTCGGAGTTTGACCTGAATGAGATT
150 . : . : . : . : . :
142 CGCCTGATAGTTTACCAGGACTGTGACAGGAGAGGCAGACAAGTCTTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156738 CGCCTGATAGTTTACCAGGACTGTGACAGGAGAGGCAGACAAGTCTTGTT
200 . : . : . : . : . :
192 TGACTCTAAAGCTGTTCAAAAGATTGAGGAGGTGACAGCTCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
156788 TGACTCTAAAGCTGTTCAAAAGATTGAGGAGGTGACAGCTCAGGTA...T
250 . : . : . : . : . :
235 AAAACAGAGGATGTTCCTATTAAAATATCAGCCAAGTGCTGCCAGGGA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159865 AGAAAACAGAGGATGTTCCTATTAAAATATCAGCCAAGTGCTGCCAGGGA
300 . : . : . : . : . :
283 AGCAGCAGTGTCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCATCTCTTCCCACAGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159915 AGCAGCAGTGTCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCATCTCTTCCCACAGTTC
350 . : . : . : . : . :
333 TTCTGGGGGATCTTCACATCATGCTAAGGAACAGCTTCCAAAGTACCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
159965 TTCTGGGGGATCTTCACATCATGCTAAGGAACAGCTTCCAAAGTACCAGG
400 . : . : . : . : . :
382 TACACAAGACCAGCTTCCGATGTCAACATGTTAGGGGAAATG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160015 TA...TAGTACACAAGACCAGCTTCCGATGTCAACATGTTAGGGGAAATG
450 . : . : . : . : . :
424 ATGTTTGGCTCAGTTGCCATGAGTTACAAAGGCTCCACCTTAAAGATACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162691 ATGTTTGGCTCAGTTGCCATGAGTTACAAAGGCTCCACCTTAAAGATACA
500 . : . : . : . : . :
474 CTACATACG TTCTCCTCCACAACTGATGATTAGTAAAGTCT
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
162741 CTACATACGGTG...CAGTTCTCCTCCACAACTGATGATTAGTAAAGTCT
550 . : . : . : . : . :
515 TCTCTGCTAGAATGGGCAGCTTCTGTGGAAGTACAAATAA C
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
162887 TCTCTGCTAGAATGGGCAGCTTCTGTGGAAGTACAAATAAGTA...TAGC
600 . : . : . : . : . :
556 TTGCAAGACAGCTTTGAGTACATCAACCAAGATCCTAATTTGGGAAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
164317 TTGCAAGACAGCTTTGAGTACATCAACCAAGATCCTAATTTGGGAAAACT
650 . : . : . : . : . :
606 GAACACAAATCAAAATAGTTTGGGTCCTTGTCGTACTGGAAGTAACCTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
164367 GAACACAAATCAAAATAGTTTGGGTCCTTGTCGTACTGGAAGTAACCTAG
700 . : . : . : . : . :
656 CACACAGCACACCAGTTGATATGCCAAGCAGAGGACAGAAT
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
164417 GTA...TAGCACACAGCACACCAGTTGATATGCCAAGCAGAGGACAGAAT
750 . : . : . : . : . :
697 GAAGACAGGGACAGTGGCATTGCTCGATCAG CCTCACTAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
166234 GAAGACAGGGACAGTGGCATTGCTCGATCAGGTA...CAGCCTCACTAAG
800 . : . : . : . : . :
738 CAGTCTTTTGATCACACCTTTCCCATCTCCAAGCTCCTCTACATCTTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182119 CAGTCTTTTGATCACACCTTTCCCATCTCCAAGCTCCTCTACATCTTCTT
850 . : . : . : . : . :
788 CCAGCAGTTACCAGCGCCGCTGGCTTCGAAGTCAGACAACAAGTTTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182169 CCAGCAGTTACCAGCGCCGCTGGCTTCGAAGTCAGACAACAAGTTTGGAA
900 . : . : . : . : . :
838 AATGGCATCATCCCAAGAAG GTCAACTGATGAGACATTCAG
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
182219 AATGGCATCATCCCAAGAAGGTG...CAGGTCAACTGATGAGACATTCAG
950 . : . : . : . : . :
879 CTTGGCTGAAGAAACCTGTAGCTCTAATCCAGCTATGGTTAGGAGGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189866 CTTGGCTGAAGAAACCTGTAGCTCTAATCCAGCTATGGTTAGGAGGAAGA
1000 . : . : . : . : . :
929 AAATTGCCATAAGCATCATCTTTTCCCTATGTGAGAAAGAAGAAGCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189916 AAATTGCCATAAGCATCATCTTTTCCCTATGTGAGAAAGAAGAAGCACAA
1050 . : . : . : . : . :
979 AGGAATTTCCAGGACTTCTTCTTTTCTCATTTTCCCCTGTTTGAATCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189966 AGGAATTTCCAGGACTTCTTCTTTTCTCATTTTCCCCTGTTTGAATCTCA
1100 . : . : . : . : . :
1029 CATGAACAGGCTGAAGAGTGCAATTGAAAAG GCTATGATCT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
190016 CATGAACAGGCTGAAGAGTGCAATTGAAAAGGTA...AAGGCTATGATCT
1150 . : . : . : . : . :
1070 CCTGTAGGAAAATAGCAGAATCAAGTCTCCGAGTCCAGTTTTATGTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
190376 CCTGTAGGAAAATAGCAGAATCAAGTCTCCGAGTCCAGTTTTATGTCAGC
1200 . : . : . : . : . :
1120 CGTTTGATGGAAGCTCTGGGAGAATTCAG AGGAACTATCTG
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
190426 CGTTTGATGGAAGCTCTGGGAGAATTCAGGTA...TAGAGGAACTATCTG
1250 . : . : . : . : . :
1161 GAACTTATATTCTGTTCCAAGGATAGCTGAACCTGTATGGCTTACTATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192142 GAACTTATATTCTGTTCCAAGGATAGCTGAACCTGTATGGCTTACTATGA
1300 . : . : . : . : . :
1211 TGTCCGGCACTTTGGAAAAAAACCAGCTCTGCCAGCGCTTTCTCAAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192192 TGTCCGGCACTTTGGAAAAAAACCAGCTCTGCCAGCGCTTTCTCAAGGAG
1350 . : . : . : . : . :
1261 TTTACACTTCTGATAGAACAGATAAATAAAAACCA GTTTTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
192242 TTTACACTTCTGATAGAACAGATAAATAAAAACCAGTA...AAGGTTTTT
1400 . : . : . : . : . :
1302 TGCTGCCTTACTGACTGCGGTGTTAACCTACCACCTGGCCTGGGTCCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192401 TGCTGCCTTACTGACTGCGGTGTTAACCTACCACCTGGCCTGGGTCCCAA
1450 . : . : . : . : . :
1352 CTGTCATGCCTGTGGATCACCCTCCCATCAAAGCCTTCTCAGAGAAACGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192451 CTGTCATGCCTGTGGATCACCCTCCCATCAAAGCCTTCTCAGAGAAACGT
1500 . : . : . : . : . :
1402 ACCTCCCAGTCAGTGAACATGCTGGCCAAAACACATCCGTATAATCCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192501 ACCTCCCAGTCAGTGAACATGCTGGCCAAAACACATCCGTATAATCCTCT
1550 . : . : . : . : . :
1452 TTGGGCACAGCTGG GTGATCTTTACGGAGCCATAGGCTCTC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
192551 TTGGGCACAGCTGGGTT...TAGGTGATCTTTACGGAGCCATAGGCTCTC
1600 . : . : . : . : . :
1493 CAGTGAGACTGACTCGCACCGTAGTGGTAGGGAAGCAGAAGGACTTAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198917 CAGTGAGACTGACTCGCACCGTAGTGGTAGGGAAGCAGAAGGACTTAGTC
1650 . : . : . : . : . :
1543 CAGCGAATACTTTATGTCCTGACCTACTTTCTCCGTTGCTCTGAGCTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198967 CAGCGAATACTTTATGTCCTGACCTACTTTCTCCGTTGCTCTGAGCTACA
1700 . : . : . : . : . :
1593 AGAGAACCAGCTGACCTGGAGTGGCAATCATGGTGAAGGTGACCAAGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199017 AGAGAACCAGCTGACCTGGAGTGGCAATCATGGTGAAGGTGACCAAGTTT
1750 . : . : . : . : . :
1643 TAAATGGGAGCAAGATCATAACAGCCTTGGAGAAAGGAGAGGTGGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199067 TAAATGGGAGCAAGATCATAACAGCCTTGGAGAAAGGAGAGGTGGAGGAG
1800 . : . : . : . : . :
1693 TCTGAGTATGTGGTCATTACGGTGAGGAACGAGCCCGCTCTTGTACCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199117 TCTGAGTATGTGGTCATTACGGTGAGGAACGAGCCCGCTCTTGTACCCCC
1850 . : . : . : . : . :
1743 CATCCTACCACCAACAGCAGCAGAGAGACACAACCCCTGGCCGACAGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199167 CATCCTACCACCAACAGCAGCAGAGAGACACAACCCCTGGCCGACAGGGT
1900 . : . : . : . : . :
1793 TTCCTGAGTGCCCAGAGGGCACTGACAGTAGAGACCTGGGTCTTAAACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199217 TTCCTGAGTGCCCAGAGGGCACTGACAGTAGAGACCTGGGTCTTAAACCT
1950 . : . : . : . : . :
1843 GACAAAGAAGCTAACAGGAGGCCAGAGCAGGGTTCTGAGGCTTGCAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199267 GACAAAGAAGCTAACAGGAGGCCAGAGCAGGGTTCTGAGGCTTGCAGCGC
2000 . : . : . : . : . :
1893 AGGGTGCCTGGGGCCAGCATCAGACGCTTCCTGGAAACCTCAGAATGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199317 AGGGTGCCTGGGGCCAGCATCAGACGCTTCCTGGAAACCTCAGAATGCAT
2050 . : . : . : . : . :
1943 TTTGTGGGGATGAGAAAAATAAAGAGGCACCGCAAGATGGCTCTTCAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199367 TTTGTGGGGATGAGAAAAATAAAGAGGCACCGCAAGATGGCTCTTCAAGA
2100 . : . : . : . : . :
1993 CTTCCCAGCTGTGAAGTTTTGGGGGCAGGAATGAAGATGGACCAGCAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199417 CTTCCCAGCTGTGAAGTTTTGGGGGCAGGAATGAAGATGGACCAGCAAGC
2150 . : . : . : . : . :
2043 TGTCTGTGAGCTGTTGAAAGTGGAGATGCCTACAAGACTGCCAGACCGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199467 TGTCTGTGAGCTGTTGAAAGTGGAGATGCCTACAAGACTGCCAGACCGGT
2200 . : . : . : . : . :
2093 CAGTGGCCTGGCCTTGCCCTGACAGACATCTCCGGGAGAAACCTTCCTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199517 CAGTGGCCTGGCCTTGCCCTGACAGACATCTCCGGGAGAAACCTTCCTTA
2250 . : . : . : . : . :
2143 GAAAAGGTCACTTTCCAGATTGGAAGCTTTGCATCTCCAGAGTCTGACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199567 GAAAAGGTCACTTTCCAGATTGGAAGCTTTGCATCTCCAGAGTCTGACTT
2300 . : . : . : . : . :
2193 TGAAAGCCGCATGAAAAAAATGGAGGAACGGGTGAAGGCCTGTGGCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199617 TGAAAGCCGCATGAAAAAAATGGAGGAACGGGTGAAGGCCTGTGGCCCCT
2350 . : . : . : . : . :
2243 CCTTGGAGGCCAGTGAGGCTGCTGATGTGGCTCAGGACCCGCAGGTTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199667 CCTTGGAGGCCAGTGAGGCTGCTGATGTGGCTCAGGACCCGCAGGTTTCT
2400 . : . : . : . : . :
2293 AGGAGCCCTTTTAAACCTGGCTTTCAGGAGAATGTTTGCTGTCCTCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199717 AGGAGCCCTTTTAAACCTGGCTTTCAGGAGAATGTTTGCTGTCCTCAGAA
2450 . : . : . : . : . :
2343 TCGGCTTTCAGAGGGGGATGAAGGCGAGTCTGACAAGGGTTTTGCAGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199767 TCGGCTTTCAGAGGGGGATGAAGGCGAGTCTGACAAGGGTTTTGCAGAGG
2500 . : . : . : . : . :
2393 ACAGAGGCAGCAGAAACGACATGGCAGCAGATATTGCTGGGCAGCTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199817 ACAGAGGCAGCAGAAACGACATGGCAGCAGATATTGCTGGGCAGCTCAGC
2550 . : . : . : . : . :
2443 CACGCTGCTGACTTGGGCACAGCCTCCCACGGTGCAGGAGGAACGGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199867 CACGCTGCTGACTTGGGCACAGCCTCCCACGGTGCAGGAGGAACGGGAGG
2600 . : . : . : . : . :
2493 GAGGAGGCTGGAGGCCACTAGAGGTTTGTATGTGAAGGCTGCGGAAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199917 GAGGAGGCTGGAGGCCACTAGAGGTTTGTATGTGAAGGCTGCGGAAGGAC
2650 . : . : . : . : . :
2543 CTGTGCTGGAGCCTGTTGCCCCCAGGTGTGTCCAGCGGGGCCCTGGCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199967 CTGTGCTGGAGCCTGTTGCCCCCAGGTGTGTCCAGCGGGGCCCTGGCCTC
2700 . : . : . : . : . :
2593 GTGGCTGGTGCGAATATCCCCTGTGGGGATGACAACAAGAAGGCCAACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200017 GTGGCTGGTGCGAATATCCCCTGTGGGGATGACAACAAGAAGGCCAACTT
2750 . : . : . : . : . :
2643 CAGGACTGAAGGAGACATTCCCCGAAATGAAAGCTCAGATAGCGCCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200067 CAGGACTGAAGGAGACATTCCCCGAAATGAAAGCTCAGATAGCGCCCTGG
2800 . : . : . : . : . :
2693 GAGACAGTGACGACGAAGCCTGCGCTTCAGCCATGCTAGATCTGGGTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200117 GAGACAGTGACGACGAAGCCTGCGCTTCAGCCATGCTAGATCTGGGTCAC
2850 . : . : . : . : . :
2743 GGTGGTGACAGGACTGGAGGGTCCTTGGAAGTGGAGCTGCCTCTGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200167 GGTGGTGACAGGACTGGAGGGTCCTTGGAAGTGGAGCTGCCTCTGCCAAG
2900 . : . : . : . : . :
2793 GTCTCAGAGCATCAGCACCCAGAATGTAAGGAACTTTGGCC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200217 GTA...TAGGTCTCAGAGCATCAGCACCCAGAATGTAAGGAACTTTGGCC
2950 . : . : . : . : . :
2834 GCTCACTTCTGGCGGGCTACTGCCCCACATACATGCCTGATCTTGTGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201142 GCTCACTTCTGGCGGGCTACTGCCCCACATACATGCCTGATCTTGTGCTT
3000 . : . : . : . : . :
2884 CATGGGACCGGCAGTGATGAGAAGCTGAAGCAGTGCCTGGTGGCCGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201192 CATGGGACCGGCAGTGATGAGAAGCTGAAGCAGTGCCTGGTGGCCGACCT
3050 . : . : . : . : . :
2934 TGTCCACACAGTCCAT CATCCAGTCCTGGATGAGCCAATAG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
201242 TGTCCACACAGTCCATGTA...CAGCATCCAGTCCTGGATGAGCCAATAG
3100 . : . : . : . : . :
2975 CTGAAGCTGTCTGTATTATCGCAGACACGGATAAATGGAGTGTGCAGGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
222259 CTGAAGCTGTCTGTATTATCGCAGACACGGATAAATGGAGTGTGCAGGTA
3150 . : . : . : . : . :
3025 GCTACAAGTCAGAGGAAAGTGACGGACAACATGAAACTAGGCCAGGATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
222309 GCTACAAGTCAGAGGAAAGTGACGGACAACATGAAACTAGGCCAGGATGT
3200 . : . : . : . : . :
3075 CCTGGTCTCTAGTCAGGTGTCCAGTTTGCTTCAGTCCATTTTACAGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
222359 CCTGGTCTCTAGTCAGGTGTCCAGTTTGCTTCAGTCCATTTTACAGCTCT
3250 . : . : . : . : . :
3125 ATAAGCTTCACCTCCCTGCTGATTTT TGCATCATGCATCTT
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
222409 ATAAGCTTCACCTCCCTGCTGATTTTGTA...CAGTGCATCATGCATCTT
3300 . : . : . : . : . :
3166 GAAGATAGACTACAGGAGATGTACCTTAAAAGTAAAATGCTATCTGAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
226553 GAAGATAGACTACAGGAGATGTACCTTAAAAGTAAAATGCTATCTGAATA
3350 . : . : . : . : . :
3216 TCTCCGGGGACACACACGAGTCCATGTGAAAGAATTAGGTGTCGTACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
226603 TCTCCGGGGACACACACGAGTCCATGTGAAAGAATTAGGTGTCGTACTGG
3400 . : . : . : . : . :
3266 G GATTGAATCCAACGACCTGCCTCTGTTGACTGCTATTGCC
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
226653 GGTG...CAGGATTGAATCCAACGACCTGCCTCTGTTGACTGCTATTGCC
3450 . : . : . : .
3307 AGTACTCATTCTCCTTATGTGGCTCAAATACTCTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
235294 AGTACTCATTCTCCTTATGTGGCTCAAATACTCTTA