Result of SIM4 for
pF1KA1432
seq1 = pF1KA1432.tfa, 2373 bp
seq2 = pF1KA1432/gi568815589f_5657356.tfa (gi568815589f:5657356_5874243), 216888 bp
>pF1KA1432 2373
>gi568815589f:5657356_5874243 (Chr9)
1-96 (100001-100096) 100% ->
97-216 (105186-105305) 100% ->
217-945 (105785-106513) 100% ->
946-1104 (108059-108217) 100% ->
1105-1241 (108307-108443) 100% ->
1242-1528 (111615-111901) 100% ->
1529-1720 (112732-112923) 100% ->
1721-1898 (115209-115386) 100% ->
1899-2087 (115537-115725) 100% ->
2088-2373 (116603-116888) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCACGCTACATTCCTCACCCTTTCCTGGTGGTATCTGTCACTCTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTCACGCTACATTCCTCACCCTTTCCTGGTGGTATCTGTCACTCTGAC
50 . : . : . : . : . :
51 ATCAGTGAGTACAGAGAATGGAATCACCTTGAAAATGCCACAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
100051 ATCAGTGAGTACAGAGAATGGAATCACCTTGAAAATGCCACAGCAGGTA.
100 . : . : . : . : . :
97 GCTCGTGGTGCAGAGAGCATTATGTTAAACCTGGCAGGACAGCTC
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ..CAGGCTCGTGGTGCAGAGAGCATTATGTTAAACCTGGCAGGACAGCTC
150 . : . : . : . : . :
142 ATCATGATGCAGAGGGACAGGTCAGGCCCACAGATCCGGGAGAAGGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105231 ATCATGATGCAGAGGGACAGGTCAGGCCCACAGATCCGGGAGAAGGACAG
200 . : . : . : . : . :
192 TAACCCTAATAACCAAAGGAAACTT CTGCCATTCTGTCCTC
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
105281 TAACCCTAATAACCAAAGGAAACTTGTG...CAGCTGCCATTCTGTCCTC
250 . : . : . : . : . :
233 CTGTTGTACTAGCCCAGTCTGTTGAAAATGTCTGGACAACGTGTCGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105801 CTGTTGTACTAGCCCAGTCTGTTGAAAATGTCTGGACAACGTGTCGAGCA
300 . : . : . : . : . :
283 AATAAACAGAAACGTCACCTTCTGGAGGCCCTCTGGCTGAGCTGTGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105851 AATAAACAGAAACGTCACCTTCTGGAGGCCCTCTGGCTGAGCTGTGGTGG
350 . : . : . : . : . :
333 TGCAGGGATGAAAGTTTGGCTCCCTCTCTTCCCTAGGGATCACCGCAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105901 TGCAGGGATGAAAGTTTGGCTCCCTCTCTTCCCTAGGGATCACCGCAAGC
400 . : . : . : . : . :
383 CCCATTCCTTCTTGTCCCAGCGGATCATGCTGCCTTTCCACATCAACATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105951 CCCATTCCTTCTTGTCCCAGCGGATCATGCTGCCTTTCCACATCAACATT
450 . : . : . : . : . :
433 TACCCGCTAGCTGTTCTGTTTGAAGATGCTTTAGTCCTTGGTGCTGTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106001 TACCCGCTAGCTGTTCTGTTTGAAGATGCTTTAGTCCTTGGTGCTGTCAA
500 . : . : . : . : . :
483 TGACACTTTGCTCTATGATTCTTTATATACTCGGAACAATGCTAGAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106051 TGACACTTTGCTCTATGATTCTTTATATACTCGGAACAATGCTAGAGAAC
550 . : . : . : . : . :
533 AGCTGGAGGTGCTCTTCCCTTTCTGTGTTGTGGAGAGAACCTCTCAGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106101 AGCTGGAGGTGCTCTTCCCTTTCTGTGTTGTGGAGAGAACCTCTCAGATC
600 . : . : . : . : . :
583 TACCTCCACCACATTCTACGTCAACTTCTGGTCAGAAACCTTGGGGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106151 TACCTCCACCACATTCTACGTCAACTTCTGGTCAGAAACCTTGGGGAGCA
650 . : . : . : . : . :
633 AGCCTTGCTCTTGGCCCAGTCCTGTGCCACATTACCTTACTTCCCTCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106201 AGCCTTGCTCTTGGCCCAGTCCTGTGCCACATTACCTTACTTCCCTCATG
700 . : . : . : . : . :
683 TGCTGGAGCTCATGCTCCATGAAGTACTGGAAGAAGAAGCTACCTCACGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106251 TGCTGGAGCTCATGCTCCATGAAGTACTGGAAGAAGAAGCTACCTCACGG
750 . : . : . : . : . :
733 GAGCCCATTCCCGACCCTCTGCTTCCCACTGTGGCAAAATTTATCACTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106301 GAGCCCATTCCCGACCCTCTGCTTCCCACTGTGGCAAAATTTATCACTGA
800 . : . : . : . : . :
783 GTTCCCCCTCTTCCTGCAGACAGTTGTCCATTGTGCCAGGAAGACCGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106351 GTTCCCCCTCTTCCTGCAGACAGTTGTCCATTGTGCCAGGAAGACCGAAT
850 . : . : . : . : . :
833 ATGCCCTGTGGAATTACCTTTTTGCAGCTGTTGGAAACCCTAAGGACTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106401 ATGCCCTGTGGAATTACCTTTTTGCAGCTGTTGGAAACCCTAAGGACTTG
900 . : . : . : . : . :
883 TTTGAGGAGTGTTTGATGGCTCAGGATTTGGACACAGCTGCCTCTTACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106451 TTTGAGGAGTGTTTGATGGCTCAGGATTTGGACACAGCTGCCTCTTACCT
950 . : . : . : . : . :
933 TATTATCTTACAG AATATGGAAGTCCCTGCAGTAAGTAGGC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
106501 TATTATCTTACAGGTA...TAGAATATGGAAGTCCCTGCAGTAAGTAGGC
1000 . : . : . : . : . :
974 AACATGCTACCCTTCTATTCAACACAGCACTAGAACAAGGCAAGTGGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108087 AACATGCTACCCTTCTATTCAACACAGCACTAGAACAAGGCAAGTGGGAC
1050 . : . : . : . : . :
1024 CTTTGTCGACACATGATTCGATTTCTTAAAGCCATTGGCTCTGGAGAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108137 CTTTGTCGACACATGATTCGATTTCTTAAAGCCATTGGCTCTGGAGAATC
1100 . : . : . : . : . :
1074 TGAGACACCTCCATCCACACCCACAGCTCAG GAACCCAGTT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
108187 TGAGACACCTCCATCCACACCCACAGCTCAGGTT...TAGGAACCCAGTT
1150 . : . : . : . : . :
1115 CAAGTGGTGGATTTGAGTTCTTCAGGAATCGAAGCATCAGTTTATCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108317 CAAGTGGTGGATTTGAGTTCTTCAGGAATCGAAGCATCAGTTTATCCCAG
1200 . : . : . : . : . :
1165 TCAGCTGAAAATGTTCCTGCCAGTAAATTCAGTTTACAGAAAACACTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108367 TCAGCTGAAAATGTTCCTGCCAGTAAATTCAGTTTACAGAAAACACTAAG
1250 . : . : . : . : . :
1215 TATGCCATCTGGTCCCTCTGGAAAAAG ATGGAGCAAAGACA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
108417 TATGCCATCTGGTCCCTCTGGAAAAAGGTA...CAGATGGAGCAAAGACA
1300 . : . : . : . : . :
1256 GTGACTGTGCTGAGAACATGTATATTGACATGATGCTCTGGAGACATGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111629 GTGACTGTGCTGAGAACATGTATATTGACATGATGCTCTGGAGACATGCT
1350 . : . : . : . : . :
1306 CGGCGCCTCTTAGAAGATGTGAGGTTAAAGGACCTTGGCTGCTTTGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111679 CGGCGCCTCTTAGAAGATGTGAGGTTAAAGGACCTTGGCTGCTTTGCAGC
1400 . : . : . : . : . :
1356 CCAGCTGGGCTTTGAACTAATTAGTTGGCTATGCAAGGAACGTACCCGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111729 CCAGCTGGGCTTTGAACTAATTAGTTGGCTATGCAAGGAACGTACCCGAG
1450 . : . : . : . : . :
1406 CCGCCCGGGTAGACAACTTTGTAATAGCCCTGAAGAGACTCCACAAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111779 CCGCCCGGGTAGACAACTTTGTAATAGCCCTGAAGAGACTCCACAAAGAT
1500 . : . : . : . : . :
1456 TTCCTGTGGCCACTTCCAATCATCCCAGCCTCTTCTATCAGTTCTCCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111829 TTCCTGTGGCCACTTCCAATCATCCCAGCCTCTTCTATCAGTTCTCCTTT
1550 . : . : . : . : . :
1506 CAAAAATGGAAAATACCGAACTG TGGGAGAGCAGCTGTTAA
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
111879 CAAAAATGGAAAATACCGAACTGGTA...CAGTGGGAGAGCAGCTGTTAA
1600 . : . : . : . : . :
1547 AGTCTCAATCAGCTGACCCATTTTTGAACCTTGAGATGGATGCTGGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112750 AGTCTCAATCAGCTGACCCATTTTTGAACCTTGAGATGGATGCTGGCATC
1650 . : . : . : . : . :
1597 TCCAACATCCAGCGAAGTCAGAGCTGGCTCAGCAACATTGGCCCCACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112800 TCCAACATCCAGCGAAGTCAGAGCTGGCTCAGCAACATTGGCCCCACCCA
1700 . : . : . : . : . :
1647 TCATGAGATAGACACAGCTTCATCCCATGGACCACAAATGCAAGATGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112850 TCATGAGATAGACACAGCTTCATCCCATGGACCACAAATGCAAGATGCCT
1750 . : . : . : . : . :
1697 TCTTGTCACCTTTATCTAATAAAG GTGATGAATGCAGTATT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
112900 TCTTGTCACCTTTATCTAATAAAGGTA...CAGGTGATGAATGCAGTATT
1800 . : . : . : . : . :
1738 GGTTCAGCCACAGACTTGACTGAAAGTAGCTCCATGGTGGATGGCGACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115226 GGTTCAGCCACAGACTTGACTGAAAGTAGCTCCATGGTGGATGGCGACTG
1850 . : . : . : . : . :
1788 GACAATGGTGGATGAAAATTTCTCTACACTCAGTTTAACTCAGTCAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115276 GACAATGGTGGATGAAAATTTCTCTACACTCAGTTTAACTCAGTCAGAGC
1900 . : . : . : . : . :
1838 TGGAGCACATTTCCATGGAGTTGGCCAGTAAAGGGCCTCATAAATCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115326 TGGAGCACATTTCCATGGAGTTGGCCAGTAAAGGGCCTCATAAATCCCAG
1950 . : . : . : . : . :
1888 GTCCAGCTTCG GTATTTGCTACACATTTTCATGGAGGCAGG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
115376 GTCCAGCTTCGGTG...TAGGTATTTGCTACACATTTTCATGGAGGCAGG
2000 . : . : . : . : . :
1929 GTGCCTAGACTGGTGCATCGTTATAGGCCTGATTCTTAGAGAATCCTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115567 GTGCCTAGACTGGTGCATCGTTATAGGCCTGATTCTTAGAGAATCCTCAA
2050 . : . : . : . : . :
1979 TAATCAATCAGATTTTGGTTATTACACAGTCTTCAGAGGTAGATGGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115617 TAATCAATCAGATTTTGGTTATTACACAGTCTTCAGAGGTAGATGGAGAG
2100 . : . : . : . : . :
2029 ATGTTACAGAACATAAAGACAGGGCTCCATGCAGTGGACCGATGGGCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115667 ATGTTACAGAACATAAAGACAGGGCTCCATGCAGTGGACCGATGGGCCTC
2150 . : . : . : . : . :
2079 TACAGACTG TCCTGGATATAAGCCATTTTTAAACATCATTA
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
115717 TACAGACTGGTA...TAGTCCTGGATATAAGCCATTTTTAAACATCATTA
2200 . : . : . : . : . :
2120 AGCCACAACTGCAGAAGCTCAGTGAGATAACAGAAGAGCAGGTCCAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116635 AGCCACAACTGCAGAAGCTCAGTGAGATAACAGAAGAGCAGGTCCAGCCA
2250 . : . : . : . : . :
2170 GATGCCTTCCAACCAATAACTATGGGTAAGACTCCAGAACAGACTAGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116685 GATGCCTTCCAACCAATAACTATGGGTAAGACTCCAGAACAGACTAGCCC
2300 . : . : . : . : . :
2220 CCGGGCAGAGGAGAGCAGGGGCTCCTCCAGCCATGGAAGCATCCCCCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116735 CCGGGCAGAGGAGAGCAGGGGCTCCTCCAGCCATGGAAGCATCCCCCAGG
2350 . : . : . : . : . :
2270 GTGAAGTTGGAAGCAGCAATATGGTCAGCCGGAAAGAGGAGGACACAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116785 GTGAAGTTGGAAGCAGCAATATGGTCAGCCGGAAAGAGGAGGACACAGCC
2400 . : . : . : . : . :
2320 CAAGCAGAGGAGGAAGAACCTTTTCAGGATGGGACTTACGACTGTTCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116835 CAAGCAGAGGAGGAAGAACCTTTTCAGGATGGGACTTACGACTGTTCTGT
2450
2370 GTCC
||||
116885 GTCC