seq1 = pF1KA1386.tfa, 3267 bp
seq2 = pF1KA1386/gi568815591f_92194979.tfa (gi568815591f:92194979_92498946), 303968 bp

>pF1KA1386 3267
>gi568815591f:92194979_92498946 (Chr7)

1-188  (100001-100188)   100% ->
189-486  (112381-112678)   100% ->
487-669  (124352-124534)   100% ->
670-787  (132805-132922)   100% ->
788-996  (148046-148254)   100% ->
997-1085  (150000-150088)   100% ->
1086-1230  (155972-156116)   100% ->
1231-1397  (157498-157664)   100% ->
1398-1486  (167207-167295)   100% ->
1487-1617  (176499-176629)   100% ->
1618-1752  (191531-191665)   100% ->
1753-1839  (192820-192906)   100% ->
1840-1906  (192997-193063)   100% ->
1907-2052  (194993-195138)   100% ->
2053-2231  (196188-196366)   100% ->
2232-2283  (197263-197314)   100% ->
2284-2395  (201387-201498)   100% ->
2396-2532  (202745-202881)   100% ->
2533-3267  (203234-203968)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAATACAACCACCAAATTCCGTAAAGCACTCATCAATGGTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAATACAACCACCAAATTCCGTAAAGCACTCATCAATGGTGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAACCTGGCCTGCCAAATATATGAAAACAATCCTCAGCTAAAAGAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAACCTGGCCTGCCAAATATATGAAAACAATCCTCAGCTAAAAGAATCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGATCCAAATACATCTTATGGGGAGCCCTACCAGCACAATACTCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGATCCAAATACATCTTATGGGGAGCCCTACCAGCACAATACTCCATTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATTATGCTGCTAGACATGGAATGAATAAAATATTAGG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100151 CATTATGCTGCTAGACATGGAATGAATAAAATATTAGGGTA...TAGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTTCTTGGTAGAGATGGAAATCCAAATAAACGGAATGTGCACAATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112384 TTTTCTTGGTAGAGATGGAAATCCAAATAAACGGAATGTGCACAATGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATCTATGCATTTGTTGTGTATGGGACCTCAAATTATGATATCTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112434 CATCTATGCATTTGTTGTGTATGGGACCTCAAATTATGATATCTGAAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCCTTCATCCTCGCTTGGCACGCCCCACAGAAGATGATTTCAGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112484 GCCCTTCATCCTCGCTTGGCACGCCCCACAGAAGATGATTTCAGAAGAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGATTGTCTGCAGATGATCTTAAAATGGAAAGGAGCAAAACTTGACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112534 AGATTGTCTGCAGATGATCTTAAAATGGAAAGGAGCAAAACTTGACCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTGAATATGAGAGAGCAGCTATTGATGCTGTTGATAACAAAAAAAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112584 GTGAATATGAGAGAGCAGCTATTGATGCTGTTGATAACAAAAAAAACACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCTTGCACTATGCTGCTGCCTCAGGGATGAAAGCCTGTGTAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 112634 CCCTTGCACTATGCTGCTGCCTCAGGGATGAAAGCCTGTGTAGAGGTA..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    487     CTTTTAGTAAAACATGGAGGAGACTTGTTTGCTGAGAATGAAAATA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112684 .TAGCTTTTAGTAAAACATGGAGGAGACTTGTTTGCTGAGAATGAAAATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAGATACTCCTTGTGATTGTGCTGAAAAGCAACACCACAAAGATTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124398 AAGATACTCCTTGTGATTGTGCTGAAAAGCAACACCACAAAGATTTGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCAATCTGGAATCTCAAATGGTATTCTCACGGGATCCCGAGGCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124448 CTCAATCTGGAATCTCAAATGGTATTCTCACGGGATCCCGAGGCTGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AATAGAAGCTGAATATGCTGCATTAGACAAACGAGAG         CCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 124498 AATAGAAGCTGAATATGCTGCATTAGACAAACGAGAGGTC...AAGCCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATGAAGGATTAAGGCCTCAGGATCTTCGTAGACTAAAAGATATGCTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132809 ATGAAGGATTAAGGCCTCAGGATCTTCGTAGACTAAAAGATATGCTTATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTGGAAACTGCAGACATGCTTCAGGCTCCTCTCTTTACTGCTGAAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132859 GTGGAAACTGCAGACATGCTTCAGGCTCCTCTCTTTACTGCTGAAGCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACTTCGAGCTCATG         ACTGGGACAGGGAGAAATTACTTGAAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 132909 ACTTCGAGCTCATGGTA...AAGACTGGGACAGGGAGAAATTACTTGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTTGGATGTCCAACCCGGAGAACTGCTGCCAACGATCAGGTGTTCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148073 CTTGGATGTCCAACCCGGAGAACTGCTGCCAACGATCAGGTGTTCAAATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCAACTCCACCACCAAGTGGGTATAATGCCTGGGACACGCTCCCATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148123 CCAACTCCACCACCAAGTGGGTATAATGCCTGGGACACGCTCCCATCTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AAGAACTCCAAGGACTACACGCTCTTCTGTCACCTCCCCAGATGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148173 AAGAACTCCAAGGACTACACGCTCTTCTGTCACCTCCCCAGATGAAATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GCTTATCTCCTGGGGATTTAGACACCAGTTTG         TGTGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 148223 GCTTATCTCCTGGGGATTTAGACACCAGTTTGGTA...CAGTGTGACATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TGTATGTGCAGTATCTCTGTATTTGAAGACCCTGTGGATATGCCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150009 TGTATGTGCAGTATCTCTGTATTTGAAGACCCTGTGGATATGCCCTGTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 ACATGACTTTTGTAGAGGATGTTGGGAGTC         GTTTTTGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 150059 ACATGACTTTTGTAGAGGATGTTGGGAGTCGTG...TAGGTTTTTGAATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGAAAATTCAAGAAGGTGAAGCTCACAACATTTTTTGCCCTGCATATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155983 TGAAAATTCAAGAAGGTGAAGCTCACAACATTTTTTGCCCTGCATATGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TGCTTCCAACTTGTACCTGTGGATATCATAGAAAGTGTAGTTTCAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156033 TGCTTCCAACTTGTACCTGTGGATATCATAGAAAGTGTAGTTTCAAAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GATGGACAAACGATACCTACAGTTTGATATTAAG         GCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 156083 GATGGACAAACGATACCTACAGTTTGATATTAAGGTA...CAGGCCTTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTGAAAATAATCCTGCCATTAAATGGTGTCCTACTCCAGGCTGTGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157505 TTGAAAATAATCCTGCCATTAAATGGTGTCCTACTCCAGGCTGTGACAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GCAGTAAGACTAACGAAACAAGGGTCAAATACATCTGGATCTGATACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157555 GCAGTAAGACTAACGAAACAAGGGTCAAATACATCTGGATCTGATACACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CAGCTTCCCATTGCTGAGAGCTCCTGCTGTTGATTGTGGAAAAGGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157605 CAGCTTCCCATTGCTGAGAGCTCCTGCTGTTGATTGTGGAAAAGGACACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TCTTCTGCTG         GGAGTGCCTTGGTGAAGCACATGAGCCTTGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 157655 TCTTCTGCTGGTT...TAGGGAGTGCCTTGGTGAAGCACATGAGCCTTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GACTGCCAAACATGGAAGAATTGGCTGCAAAAAATAACCGAAATGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167238 GACTGCCAAACATGGAAGAATTGGCTGCAAAAAATAACCGAAATGAAACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 AGAAGAAC         TTGTGGGAGTTAGTGAAGCCTACGAGGATGCCG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 167288 AGAAGAACGTA...AAGTTGTGGGAGTTAGTGAAGCCTACGAGGATGCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCAATTGTCTCTGGTTATTAACTAACTCCAAGCCTTGTGCCAACTGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176532 CCAATTGTCTCTGGTTATTAACTAACTCCAAGCCTTGTGCCAACTGTAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TCTCCAATACAGAAGAATGAAGGCTGCAATCACATGCAGTGTGCTAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 176582 TCTCCAATACAGAAGAATGAAGGCTGCAATCACATGCAGTGTGCTAAGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1618        TGCAAGTATGACTTTTGCTGGATTTGCCTTGAAGAGTGGAAAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176632 A...AAGTGCAAGTATGACTTTTGCTGGATTTGCCTTGAAGAGTGGAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AACATAGTTCGTCCACTGGAGGTTATTACAGATGTACTCGCTATGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191574 AACATAGTTCGTCCACTGGAGGTTATTACAGATGTACTCGCTATGAAGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 ATTCAACACGTGGAGGAGCAATCCAAGGAAATGACTGTGGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 191624 ATTCAACACGTGGAGGAGCAATCCAAGGAAATGACTGTGGAGGTA...TA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1753  GCTGAGAAAAAACACAAACGATTTCAGGAACTTGACAGATTTATGCACT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192819 GGCTGAGAAAAAACACAAACGATTTCAGGAACTTGACAGATTTATGCACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ATTATACAAGATTTAAAAACCATGAGCATAGTTATCAG         CTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 192869 ATTATACAAGATTTAAAAACCATGAGCATAGTTATCAGGTA...TAGCTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GAACAACGCCTTCTTAAAACAGCCAAAGAAAAGATGGAGCAATTGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193000 GAACAACGCCTTCTTAAAACAGCCAAAGAAAAGATGGAGCAATTGAGCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 AGCTCTCAAAGAAA         CTGAAGGAGGCTGTCCAGATACCACTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 193050 AGCTCTCAAAGAAAGTA...TAGCTGAAGGAGGCTGTCCAGATACCACTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TCATTGAAGATGCAGTTCATGTGCTCTTAAAAACTCGGCGCATTCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195020 TCATTGAAGATGCAGTTCATGTGCTCTTAAAAACTCGGCGCATTCTCAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 TGTTCTTATCCATATGGATTTTTCTTGGAACCTAAAAGCACAAAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195070 TGTTCTTATCCATATGGATTTTTCTTGGAACCTAAAAGCACAAAGAAAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 AATTTTTGAACTAATGCAA         ACAGACCTAGAAATGGTCACTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 195120 AATTTTTGAACTAATGCAAGTA...TAGACAGACCTAGAAATGGTCACTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 AAGACCTTGCCCAGAAAGTCAATAGGCCTTACCTTCGCACACCCCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196210 AAGACCTTGCCCAGAAAGTCAATAGGCCTTACCTTCGCACACCCCGCCAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 AAGATCATCAAAGCAGCATGCCTTGTACAGCAGAAGAGGCAAGAATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196260 AAGATCATCAAAGCAGCATGCCTTGTACAGCAGAAGAGGCAAGAATTCCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GGCATCTGTGGCTCGGGGAGTAGCTCCTGCAGACTCACCAGAAGCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196310 GGCATCTGTGGCTCGGGGAGTAGCTCCTGCAGACTCACCAGAAGCTCCAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 GGCGCAG         CTTTGCTGGTGGAACATGGGATTGGGAATATTTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196360 GGCGCAGGTA...TAGCTTTGCTGGTGGAACATGGGATTGGGAATATTTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GGATTTGCATCACCAGAG         GAATATGCTGAATTTCAGTATCG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 197297 GGATTTGCATCACCAGAGGTA...CAGGAATATGCTGAATTTCAGTATCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 GAGGAGGCACAGACAACGTCGTCGAGGAGATGTTCACAGTCTACTCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201410 GAGGAGGCACAGACAACGTCGTCGAGGAGATGTTCACAGTCTACTCAGTA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 ATCCTCCAGACCCTGATGAGCCAAGTGAAAGCACTTTAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 201460 ATCCTCCAGACCCTGATGAGCCAAGTGAAAGCACTTTAGGTA...CAGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 ATTCCAGAAGGCGGCAGCAGCAGCCGCAGGCCTGGCACATCCGTGGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202747 ATTCCAGAAGGCGGCAGCAGCAGCCGCAGGCCTGGCACATCCGTGGTAAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TTCTGCATCTATGAGTGTGCTGCACAGCTCTTCCCTGCGTGACTACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202797 TTCTGCATCTATGAGTGTGCTGCACAGCTCTTCCCTGCGTGACTACACCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 CTGCCAGTCGCTCTGAAAACCAGGACTCTCTTCAG         GCTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 202847 CTGCCAGTCGCTCTGAAAACCAGGACTCTCTTCAGGTA...CAGGCTCTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 AGTTCCTTGGATGAAGACGATCCCAATATACTTCTTGCAATACAGTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203240 AGTTCCTTGGATGAAGACGATCCCAATATACTTCTTGCAATACAGTTATC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 ACTGCAAGAGTCTGGGCTGGCCCTCGATGAAGAAACTAGAGACTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203290 ACTGCAAGAGTCTGGGCTGGCCCTCGATGAAGAAACTAGAGACTTCCTCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 GTAATGAAGCATCCTTAGGTGCGATAGGCACTTCTTTACCTTCCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203340 GTAATGAAGCATCCTTAGGTGCGATAGGCACTTCTTTACCTTCCAGGCTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 GACTCTGTCCCCAGAAATACAGATAGCCCTCGGGCTGCATTGAGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203390 GACTCTGTCCCCAGAAATACAGATAGCCCTCGGGCTGCATTGAGCAGCTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 TGAGCTTTTGGAACTTGGTGACAGCCTCATGAGACTAGGAGCAGAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203440 TGAGCTTTTGGAACTTGGTGACAGCCTCATGAGACTAGGAGCAGAGAATG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 ACCCATTTTCAACTGACACCCTGAGCTCACACCCTCTCAGTGAGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203490 ACCCATTTTCAACTGACACCCTGAGCTCACACCCTCTCAGTGAGGCAAGA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 AGTGATTTCTGTCCCTCATCTAGTGATCCTGACTCAGCTGGCCAGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203540 AGTGATTTCTGTCCCTCATCTAGTGATCCTGACTCAGCTGGCCAGGACCC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 CAACATCAATGACAATCTTCTCGGCAACATCATGGCTTGGTTTCATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203590 CAACATCAATGACAATCTTCTCGGCAACATCATGGCTTGGTTTCATGACA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 TGAACCCTCAGAGTATTGCCCTGATTCCTCCAGCAACTACAGAAATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203640 TGAACCCTCAGAGTATTGCCCTGATTCCTCCAGCAACTACAGAAATCAGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2989 GCAGATTCCCAGCTCCCCTGTATCAAAGATGGGTCAGAAGGTGTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203690 GCAGATTCCCAGCTCCCCTGTATCAAAGATGGGTCAGAAGGTGTGAAGGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3039 TGTGGAAATGGTGCTGCCAGAAGATTCAATGTTTGAAGATGCCAGTGTCA
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203740 TGTGGAACTGGTGCTGCCAGAAGATTCAATGTTTGAAGATGCCAGTGTCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3089 GTGAAGGTAGAGGAACCCAGATAGAAGAAAATCCTTTGGAAGAAAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203790 GTGAAGGTAGAGGAACCCAGATAGAAGAAAATCCTTTGGAAGAAAATATT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3139 CTGGCGGGGGAAGCAGCATCTCAAGCTGGTGACAGTGGTAACGAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203840 CTGGCGGGGGAAGCAGCATCTCAAGCTGGTGACAGTGGTAACGAGGCAGC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3189 CAACAGAGGAGATGGTTCAGATGTTTCAAGTCAAACACCTCAAACCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203890 CAACAGAGGAGATGGTTCAGATGTTTCAAGTCAAACACCTCAAACCTCAA

   3400     .    :    .    :    .
   3239 GTGACTGGCTTGAACAAGTACATTTAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||
 203940 GTGACTGGCTTGAACAAGTACATTTAGTG