seq1 = pF1KA1384.tfa, 1884 bp
seq2 = pF1KA1384/gi568815580r_32574660.tfa (gi568815580r:32574660_32870591), 295932 bp

>pF1KA1384 1884
>gi568815580r:32574660_32870591 (Chr18)

(complement)

1-947  (100001-100947)   100% ->
948-1069  (128543-128664)   100% ->
1070-1159  (175040-175129)   100% ->
1160-1238  (183359-183437)   100% ->
1239-1429  (189993-190183)   100% ->
1430-1588  (190265-190423)   100% ->
1589-1746  (193262-193419)   100% ->
1747-1884  (195795-195932)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAGATCCGGGGACAGGACCTCCACCTTCGACCCCAGCCACAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCAGATCCGGGGACAGGACCTCCACCTTCGACCCCAGCCACAGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACCTGCTGCACGGCCTCAACCTGCTGTGGAGGAAGCAGCTGTTTTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACCTGCTGCACGGCCTCAACCTGCTGTGGAGGAAGCAGCTGTTTTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGTGACCCTGACGGCCCAGGGCCAGCAGTTCCATTGCCACAAGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGTGACCCTGACGGCCCAGGGCCAGCAGTTCCATTGCCACAAGGCCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCCTCCTGCTCGCAGTACTTCCGATCGCTCTTCTCCAGCCACCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCCTCCTGCTCGCAGTACTTCCGATCGCTCTTCTCCAGCCACCCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTCGGGGGAGGGGTCGGCGGCCAGGACGGCCTGGGGGCCCCCAAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTCGGGGGAGGGGTCGGCGGCCAGGACGGCCTGGGGGCCCCCAAGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCAGCAGCCGCCGCAGCAGCAGCCGTCACAGCAGCAGCAGCCGCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCAGCAGCCGCCGCAGCAGCAGCCGTCACAGCAGCAGCAGCCGCCGCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGAGGAGCCCGGGACTCCTTCTTCCTCCCCCGACGACAAGCTGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGAGGAGCCCGGGACTCCTTCTTCCTCCCCCGACGACAAGCTGCTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCCCCCGGGCCATCAACAACCTGGTGCTGCAGGGCTGCTCGTCCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCCCCCGGGCCATCAACAACCTGGTGCTGCAGGGCTGCTCGTCCATCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCTGCGCCTGGTGCTCGAGTACCTCTACACGGCCAACGTGACCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCTGCGCCTGGTGCTCGAGTACCTCTACACGGCCAACGTGACCCTGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGACACGGTGGAGGAGGTGCTGTCGGTCAGCAAGATCCTGCACATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGACACGGTGGAGGAGGTGCTGTCGGTCAGCAAGATCCTGCACATCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCAGGTCACCAAGCTCTGCGTGCAGTTCCTCAACGACCAGATCTCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCAGGTCACCAAGCTCTGCGTGCAGTTCCTCAACGACCAGATCTCGGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGAACTACAAGCAGGTGTGCAAGATCGCCGCGCTGCACGGCCTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGAACTACAAGCAGGTGTGCAAGATCGCCGCGCTGCACGGCCTGGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCAAGAAGCTGGCCAACAAGTACCTGGTGGAGGATGTGCTGCTGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCAAGAAGCTGGCCAACAAGTACCTGGTGGAGGATGTGCTGCTGCTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTCGAGGAGATGCGCGCCCTGCTGGACTCGCTGCCGCCCCCCGTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTCGAGGAGATGCGCGCCCTGCTGGACTCGCTGCCGCCCCCCGTGGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGGAGCTGGCGCTCTTCCAGATGTCCGTGCTGTGGCTGGAGCACGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGGAGCTGGCGCTCTTCCAGATGTCCGTGCTGTGGCTGGAGCACGACCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGACCCGCATGCAGTATGCGCCTGACCTCATGAAGCGCCTCCGCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGACCCGCATGCAGTATGCGCCTGACCTCATGAAGCGCCTCCGCTTCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTCATCCCGGCCCCGGAGCTGGTGGAGCGGGTCCAGTCAGTGGATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTCATCCCGGCCCCGGAGCTGGTGGAGCGGGTCCAGTCAGTGGATTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCGAACCGACCCGGTCTGCCAGAAGCTGCTGCTGGACGCCATGAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCGAACCGACCCGGTCTGCCAGAAGCTGCTGCTGGACGCCATGAACTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACCTGATGCCCTTCAGGCAGCACTGCAGGCAGAGCCTGGCCAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100901 CACCTGATGCCCTTCAGGCAGCACTGCAGGCAGAGCCTGGCCAGCAGGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    948       AATTCGCTCTAACAAGAAAATGCTGTTATTGGTTGGAGGGCTGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ...AAGAATTCGCTCTAACAAGAAAATGCTGTTATTGGTTGGAGGGCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CTCCTGGACCGGACCGGCTCCCCAGCAATTTGGTTCAGTATTACGACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128587 CTCCTGGACCGGACCGGCTCCCCAGCAATTTGGTTCAGTATTACGACGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GAAAAGAAGACATGGAAAATACTCACAA         TTATGCCATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 128637 GAAAAGAAGACATGGAAAATACTCACAAGTG...CAGTTATGCCATACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CAGTGCCCACCACTGCGTTGTGGAGGTGGAAAACTTCTTGTTCGTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175053 CAGTGCCCACCACTGCGTTGTGGAGGTGGAAAACTTCTTGTTCGTGTTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GTGGAGAGGACCAGTGGAATCCGAATG         GAAAACACAGTACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 175103 GTGGAGAGGACCAGTGGAATCCGAATGGTA...CAGGAAAACACAGTACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AATTTTGTCAGCCGATATGATCCTCGATTTAATAGCTGGATTCAACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183373 AATTTTGTCAGCCGATATGATCCTCGATTTAATAGCTGGATTCAACTTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 ACCCATGCAGGAAAG         AAGAGCCAGTTTCTATGCATGTCGGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 183423 ACCCATGCAGGAAAGGTA...TAGAAGAGCCAGTTTCTATGCATGTCGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TGGACAAGCATTTATACGTAATTGGTGGAAGGAATGAAACTGGCTACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190019 TGGACAAGCATTTATACGTAATTGGTGGAAGGAATGAAACTGGCTACTTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 TCCAGCGTGGAGTGCTATAACCTAGAAACGAATGAATGGCGCTATGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190069 TCCAGCGTGGAGTGCTATAACCTAGAAACGAATGAATGGCGCTATGTGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CTCTTTGCCACAGCCTCTGGCGGCTCATGCGGGAGCAGTGCACAATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190119 CTCTTTGCCACAGCCTCTGGCGGCTCATGCGGGAGCAGTGCACAATGGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 AAATATACATTTCAG         GGGGTGTACACAATGGAGAATATGTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 190169 AAATATACATTTCAGGCA...CAGGGGGTGTACACAATGGAGAATATGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CCATGGCTATATTGCTATGACCCAGTAATGGATGTCTGGGCTCGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190291 CCATGGCTATATTGCTATGACCCAGTAATGGATGTCTGGGCTCGAAAACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 AGATATGAACACAAAACGTGCAATTCACACTTTGGCTGTAATGAATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190341 AGATATGAACACAAAACGTGCAATTCACACTTTGGCTGTAATGAATGATC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 GCTTGTATGCAATTGGAGGAAATCATTTGAAAG         GTTTCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 190391 GCTTGTATGCAATTGGAGGAAATCATTTGAAAGGTC...TAGGTTTCTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CACCTTGATGTAATGCTTGTGGAATGCTATGACCCAAAAGGTGACCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193270 CACCTTGATGTAATGCTTGTGGAATGCTATGACCCAAAAGGTGACCAGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GAATATACTCCAAACTCCCATTTTGGAGGGTCGAAGTGGCCCTGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193320 GAATATACTCCAAACTCCCATTTTGGAGGGTCGAAGTGGCCCTGGCTGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 CAGTGCTTGATGACAGCATTTACCTTGTGGGAGGCTACAGCTGGAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193370 CAGTGCTTGATGACAGCATTTACCTTGTGGGAGGCTACAGCTGGAGTATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747          GGGGCCTACAAGTCATCTACAATATGCTATTGTCCAGAGAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193420 GTA...CAGGGGGCCTACAAGTCATCTACAATATGCTATTGTCCAGAGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 AGGAACCTGGACAGAACTCGAAGGAGATGTAGCAGAACCGTTGGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195836 AGGAACCTGGACAGAACTCGAAGGAGATGTAGCAGAACCGTTGGCAGGCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1838 CTGCCTGTGTGACAGTTATTCTGCCCTCTTGTGTACCATACAACAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195886 CTGCCTGTGTGACAGTTATTCTGCCCTCTTGTGTACCATACAACAAA