Result of SIM4 for pF1KA1370

seq1 = pF1KA1370.tfa, 3228 bp
seq2 = pF1KA1370/gi568815583r_52482157.tfa (gi568815583r:52482157_52713859), 231703 bp

>pF1KA1370 3228
>gi568815583r:52482157_52713859 (Chr15)

(complement)

1-16  (35839-35854)   100% ->
17-201  (100003-100187)   100% ->
202-404  (102083-102285)   100% ->
405-530  (102605-102730)   100% ->
531-2346  (103477-105292)   99% ->
2347-2460  (108614-108727)   100% ->
2461-2540  (112695-112774)   100% ->
2541-2649  (113625-113733)   99% ->
2650-2808  (120124-120282)   100% ->
2809-2877  (126641-126709)   100% ->
2878-3077  (128916-129115)   100% ->
3078-3228  (131553-131703)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCCAGACCGAG         ATACTCTGGATGAATATTTTGAATA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  35839 ATGAAGCCAGACCGAGGTA...CAGATACTCTGGATGAATATTTTGAATA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGATGCAGAGGAGTTCTTGGTCTCTTTGGCCTTGCTGATAACAGAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100028 TGATGCAGAGGAGTTCTTGGTCTCTTTGGCCTTGCTGATAACAGAAGGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAACACCTGAATGTTCTGTAAAAGGTCGAACAGAAAGCTTTCATTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 GAACACCTGAATGTTCTGTAAAAGGTCGAACAGAAAGCTTTCATTGCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCAGCACAGTCTTGTTACCCAGTAACTACCAAACATGAATGTAGTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100128 CCAGCACAGTCTTGTTACCCAGTAACTACCAAACATGAATGTAGTGACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGCCCAG         TGCCGCCAAGCCAGACGAACTAGGTCTGAGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100178 GCTGGCCCAGGTG...AAGTGCCGCCAAGCCAGACGAACTAGGTCTGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCACATTGTTGTGGAAGAATAACCTTCCAATCATGGTGGAAATGATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102114 TCACATTGTTGTGGAAGAATAACCTTCCAATCATGGTGGAAATGATGCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTACCAGACTGCTGCTACAGCGATGATGGGCCCACCACAGAGGGAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102164 CTACCAGACTGCTGCTACAGCGATGATGGGCCCACCACAGAGGGAATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTAAATGATCCTGCGATTAAGCAAGATGCATTATTATTAGAAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102214 TCTAAATGATCCTGCGATTAAGCAAGATGCATTATTATTAGAAAGATGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCTTGGAGCCAGTTCCTCGACA         GAATGGTGACCGATTTATT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102264 TCTTGGAGCCAGTTCCTCGACAGTA...TAGGAATGGTGACCGATTTATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGAGAAGACGCTTCTGTTGGCTGTCCGCTCATTTGTGTTTTTTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102624 GAAGAGAAGACGCTTCTGTTGGCTGTCCGCTCATTTGTGTTTTTTTCTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTAAGTGCATGGCTGAGTGTTTCTCATGGTGCTATTCCACGAAATATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102674 GTTAAGTGCATGGCTGAGTGTTTCTCATGGTGCTATTCCACGAAATATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCTACAG         AATCAGTGCTGCTGATGTAGACCTACAGTGGAAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102724 TCTACAGGTA...TAGAATCAGTGCTGCTGATGTAGACCTACAGTGGAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTTTCACAGACTCCAATTGAGCATGTGTTTCCTGTTCCCAATGTTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103511 TTTTCACAGACTCCAATTGAGCATGTGTTTCCTGTTCCCAATGTTTCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAATGTTGCCTTGAAAGTCAGTGTTCAGTCCTTGCCCAGACAATCTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103561 CAATGTTGCCTTGAAAGTCAGTGTTCAGTCCTTGCCCAGACAATCTAATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATCCAGTTTTGACGTGCAGTATTCACACTAATATTGGCCTTTATGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103611 ATCCAGTTTTGACGTGCAGTATTCACACTAATATTGGCCTTTATGAGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGAATTCAACAACATAAACTTAAAACTCATCAGCACCATAACCCAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103661 AGAATTCAACAACATAAACTTAAAACTCATCAGCACCATAACCCAAATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGCAGAACAATGTGGTACAAACAGTTCACAGCGTCTGTGTAGCAAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103711 AGCAGAACAATGTGGTACAAACAGTTCACAGCGTCTGTGTAGCAAACAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTTGGACCATGGCACCTGAAAGTGTGTTACATGCAAAAAGTGGCCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103761 CTTGGACCATGGCACCTGAAAGTGTGTTACATGCAAAAAGTGGCCCAAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCAGAATATACTGCAGCTGTCAAAAATATCAAACTATATCCAGGCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103811 CCAGAATATACTGCAGCTGTCAAAAATATCAAACTATATCCAGGCACTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CAGTAAATCTGACCATGGGACATCTCAAGCCAATATTCTAGGCTTTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103861 CAGTAAATCTGACCATGGGACATCTCAAGCCAATATTCTAGGCTTTAGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GTATAGGTGATATAAAATCACAAGAAACATCAGTGAGAACTTTAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103911 GTATAGGTGATATAAAATCACAAGAAACATCAGTGAGAACTTTAAAATCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TTTTCAATGGTTGATTCCAGTATCTCTAACCGCCAGAGTTTCTGGCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103961 TTTTCAATGGTTGATTCCAGTATCTCTAACCGCCAGAGTTTCTGGCAGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGCTGGTGAGACTAACCCTTTAATAGGCTCTTTAATTCAGGAGCGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104011 AGCTGGTGAGACTAACCCTTTAATAGGCTCTTTAATTCAGGAGCGGCAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AAATCATTGCAAGAATTGCTCAACATTTGATTCATTGTGATCCAAGCACT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 104061 AAATCATTGCAAGAATTGCCCAACATTTGATTCATTGTGATCCAAGCACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TCACATGTTTCTGGACGTCCATTTAATACTCAAGAGTCTAGTTCACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104111 TCACATGTTTCTGGACGTCCATTTAATACTCAAGAGTCTAGTTCACTCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TTCAAAACTTTTCCGGGTTTCACAAGAAAATGAGAACGTGGGAAAAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104161 TTCAAAACTTTTCCGGGTTTCACAAGAAAATGAGAACGTGGGAAAAGGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AAGAAGCTTTCTCCATGACTTTTGGTAGTCCAGAGTTTAGTTCCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104211 AAGAAGCTTTCTCCATGACTTTTGGTAGTCCAGAGTTTAGTTCCCCAGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GACACCAATGAGGGGAAAATTCGACTAAAACCAGAAACTCCTCGAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104261 GACACCAATGAGGGGAAAATTCGACTAAAACCAGAAACTCCTCGAAGTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 AACTTGTATTTCTAATGACTTTTATTCTCATATGCCTGTTGGAGAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104311 AACTTGTATTTCTAATGACTTTTATTCTCATATGCCTGTTGGAGAGACTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 ATCCTTTGATAGGCTCTTTACTCCAGGAGCGGCAAGATGTTATTGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104361 ATCCTTTGATAGGCTCTTTACTCCAGGAGCGGCAAGATGTTATTGCAAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 ATTGCTCAGCACTTGGAGCACATTGATCCAACAGCATCACATATCCCCCG
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104411 ATTGCTCAACACTTGGAGCACATTGATCCAACAGCATCACATATCCCCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 GCAGTCATTCAACATGCATGACTCCAGTTCGGTTGCATCTAAAGTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104461 GCAGTCATTCAACATGCATGACTCCAGTTCGGTTGCATCTAAAGTGTTTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 GGAGTTCATATGAAGACAAAAATTTGTTGAAGAAAAATAAGGATGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104511 GGAGTTCATATGAAGACAAAAATTTGTTGAAGAAAAATAAGGATGAGTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 TCAGTTTCCATTTCTCACACAAAATGTTCCTTGTTAGGAGACATCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104561 TCAGTTTCCATTTCTCACACAAAATGTTCCTTGTTAGGAGACATCAGTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 TGGGAAAAACTTAATACCTAATAAATGTTTTACTTCTTTTAAAAATAATA
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104611 TGGGAAAAACTTAGTACCTAATAAATGTTTTACTTCTTTTAAAAATAATA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 GTAAAGAAAAGTGTTCTTTGAAACATCAAACAAGAAATCAGTGTCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104661 GTAAAGAAAAGTGTTCTTTGAAACATCAAACAAGAAATCAGTGTCAGAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 AATCCTAGTGAAATCATCCAAAGTACGTATCAGGAGACACAGAACAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104711 AATCCTAGTGAAATCATCCAAAGTACGTATCAGGAGACACAGAACAAAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 TTCTAGTTTATCAACTTCCTCAATTTTGTCTCAGCACAAAGAAAATAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104761 TTCTAGTTTATCAACTTCCTCAATTTTGTCTCAGCACAAAGAAAATAACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 TAGATTTGACAAGCAGATTCAAGGAGCAAGAAATGAGCAATGGAATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104811 TAGATTTGACAAGCAGATTCAAGGAGCAAGAAATGAGCAATGGAATTGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 AAACAGTATTCAAATTGCACCACTATTGACAAACAGATTTGTACAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104861 AAACAGTATTCAAATTGCACCACTATTGACAAACAGATTTGTACAAATAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 GTATAAGGAAAAAATAATAAATGAGAACTATAATCCAAAATTCTTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104911 GTATAAGGAAAAAATAATAAATGAGAACTATAATCCAAAATTCTTTGGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2015 ATCTTCAGTCTGATGATTCCAAAAAAAATGACTCAAAAATAAAAGTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104961 ATCTTCAGTCTGATGATTCCAAAAAAAATGACTCAAAAATAAAAGTTACT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2065 GTGTTGGAAATGTCTGAATATTTGAACAAATATGAAAGCATGTCCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105011 GTGTTGGAAATGTCTGAATATTTGAACAAATATGAAAGCATGTCCTCAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2115 TAAAGACTCAAAAAGGCCTAAGACATGTGAGCAAAATACTCAACTTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105061 TAAAGACTCAAAAAGGCCTAAGACATGTGAGCAAAATACTCAACTTAATA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2165 GCATAGAGAATTATCTCAATAAAGATAATGAAGGTTTCAAATGTAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105111 GCATAGAGAATTATCTCAATAAAGATAATGAAGGTTTCAAATGTAAAAAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2215 TCAGACCAATTAAAAAATGAACAAGATAAGCAAGAAGATCCAACTAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105161 TCAGACCAATTAAAAAATGAACAAGATAAGCAAGAAGATCCAACTAATGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2265 AAAATCCCAAAACTATTCTCAGAGAAGAAGTATAAAAGACTGTTTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105211 AAAATCCCAAAACTATTCTCAGAGAAGAAGTATAAAAGACTGTTTGTCTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2315 CATGTGAGCAACCAAAAAATACAGAGGTATTG         AGGACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105261 CATGTGAGCAACCAAAAAATACAGAGGTATTGGTA...CAGAGGACTACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2356 CTGAAACATTCAAATGTGTGGCGAAAACATAATTTTCATTCCTTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108623 CTGAAACATTCAAATGTGTGGCGAAAACATAATTTTCATTCCTTGGATGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2406 AACTTCAACCAGAGCCTTTCATCCTCAAACTGGATTGCCTCTTCTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108673 AACTTCAACCAGAGCCTTTCATCCTCAAACTGGATTGCCTCTTCTTTCAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2456 GCCCT         GTTCCTCAAAGAAAAACACAATCAGGTTGCTTTGAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108723 GCCCTGTA...TAGGTTCCTCAAAGAAAAACACAATCAGGTTGCTTTGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2497 CTGGATTCTTCATTACTACATCTGAAAAGCTTCTCATCTAGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 112731 CTGGATTCTTCATTACTACATCTGAAAAGCTTCTCATCTAGAAGGTA...

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2541    TCCTCGACCATGTTTGAACATTGAAGATGATCCAGATATTCATGAAA
        >>>||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 113622 TAGTCCTCGACCATGTTTAAACATTGAAGATGATCCAGATATTCATGAAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2588 AACCATTTTTGAGTTCTAGTGCTCCACCTATAACAAGTCTTAGTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113672 AACCATTTTTGAGTTCTAGTGCTCCACCTATAACAAGTCTTAGTCTCCTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2638 GGAAATTTTGAG         GAATCTGTCTTGAACTATCGTTTCGATCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113722 GGAAATTTTGAGGTA...CAGGAATCTGTCTTGAACTATCGTTTCGATCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2679 TCTCGGCATTGTTGATGGTTTTACTGCCGAGGTAGGGGCAAGTGGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120153 TCTCGGCATTGTTGATGGTTTTACTGCCGAGGTAGGGGCAAGTGGTGCTT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2729 TCTGCCCCACACATTTGACTCTTCCAGTTGAAGTGTCATTCTACAGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120203 TCTGCCCCACACATTTGACTCTTCCAGTTGAAGTGTCATTCTACAGTGTT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2779 TCAGATGACAATGCTCCCTCTCCTTATATG         GGTGTGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 120253 TCAGATGACAATGCTCCCTCTCCTTATATGGCA...AAGGGTGTGATTAC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2820 TTTAGAGTCCCTTGGTAAAAGGGGTTATCGAGTACCTCCTTCAGGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126652 TTTAGAGTCCCTTGGTAAAAGGGGTTATCGAGTACCTCCTTCAGGAACAA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2870 TACAAGTG         ACCTTATTTAATCCTAATAAGACTGTGGTGAAG
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 126702 TACAAGTGGTA...CAGACCTTATTTAATCCTAATAAGACTGTGGTGAAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2911 ATGTTTGTTGTGATATATGATTTACGAGATATGCCAGCCAATCATCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128949 ATGTTTGTTGTGATATATGATTTACGAGATATGCCAGCCAATCATCAGAC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2961 ATTCCTACGACAAAGAACTTTTTCTGTACCTGTTAAACAAGAAGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128999 ATTCCTACGACAAAGAACTTTTTCTGTACCTGTTAAACAAGAAGTGAAGA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3011 GAAGTGTTAATAAAGAGAACATCCGACACACAGAAGAACGGTTATTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3061 TACCTCATACATCTGAG         GTTCCAGAGTTCTAAATCTGGAAA
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 129099 TACCTCATACATCTGAGGTA...TAGGTTCCAGAGTTCTAAATCTGGAAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3102 GATCTACCTCCATAGAGACGTACGGCTCCTGTTCTCTAGAAAGTCAATGG
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   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3152 AGGTTGATAGCGGTGCTGCATATGAACTCAAATCTTACACTGAATCACCA
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 131627 AGGTTGATAGCGGTGCTGCATATGAACTCAAATCTTACACTGAATCACCA

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   3202 ACAAACCCTCAGTTTTCACCAAGATGT
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 131677 ACAAACCCTCAGTTTTCACCAAGATGT

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