Result of SIM4 for
pF1KA1370
seq1 = pF1KA1370.tfa, 3228 bp
seq2 = pF1KA1370/gi568815583r_52482157.tfa (gi568815583r:52482157_52713859), 231703 bp
>pF1KA1370 3228
>gi568815583r:52482157_52713859 (Chr15)
(complement)
1-16 (35839-35854) 100% ->
17-201 (100003-100187) 100% ->
202-404 (102083-102285) 100% ->
405-530 (102605-102730) 100% ->
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2461-2540 (112695-112774) 100% ->
2541-2649 (113625-113733) 99% ->
2650-2808 (120124-120282) 100% ->
2809-2877 (126641-126709) 100% ->
2878-3077 (128916-129115) 100% ->
3078-3228 (131553-131703) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAAGCCAGACCGAG ATACTCTGGATGAATATTTTGAATA
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35839 ATGAAGCCAGACCGAGGTA...CAGATACTCTGGATGAATATTTTGAATA
50 . : . : . : . : . :
42 TGATGCAGAGGAGTTCTTGGTCTCTTTGGCCTTGCTGATAACAGAAGGAC
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100028 TGATGCAGAGGAGTTCTTGGTCTCTTTGGCCTTGCTGATAACAGAAGGAC
100 . : . : . : . : . :
92 GAACACCTGAATGTTCTGTAAAAGGTCGAACAGAAAGCTTTCATTGCCCT
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100078 GAACACCTGAATGTTCTGTAAAAGGTCGAACAGAAAGCTTTCATTGCCCT
150 . : . : . : . : . :
142 CCAGCACAGTCTTGTTACCCAGTAACTACCAAACATGAATGTAGTGACAA
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100128 CCAGCACAGTCTTGTTACCCAGTAACTACCAAACATGAATGTAGTGACAA
200 . : . : . : . : . :
192 GCTGGCCCAG TGCCGCCAAGCCAGACGAACTAGGTCTGAGG
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100178 GCTGGCCCAGGTG...AAGTGCCGCCAAGCCAGACGAACTAGGTCTGAGG
250 . : . : . : . : . :
233 TCACATTGTTGTGGAAGAATAACCTTCCAATCATGGTGGAAATGATGCTA
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102114 TCACATTGTTGTGGAAGAATAACCTTCCAATCATGGTGGAAATGATGCTA
300 . : . : . : . : . :
283 CTACCAGACTGCTGCTACAGCGATGATGGGCCCACCACAGAGGGAATTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102164 CTACCAGACTGCTGCTACAGCGATGATGGGCCCACCACAGAGGGAATTGA
350 . : . : . : . : . :
333 TCTAAATGATCCTGCGATTAAGCAAGATGCATTATTATTAGAAAGATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102214 TCTAAATGATCCTGCGATTAAGCAAGATGCATTATTATTAGAAAGATGGA
400 . : . : . : . : . :
383 TCTTGGAGCCAGTTCCTCGACA GAATGGTGACCGATTTATT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
102264 TCTTGGAGCCAGTTCCTCGACAGTA...TAGGAATGGTGACCGATTTATT
450 . : . : . : . : . :
424 GAAGAGAAGACGCTTCTGTTGGCTGTCCGCTCATTTGTGTTTTTTTCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102624 GAAGAGAAGACGCTTCTGTTGGCTGTCCGCTCATTTGTGTTTTTTTCTCA
500 . : . : . : . : . :
474 GTTAAGTGCATGGCTGAGTGTTTCTCATGGTGCTATTCCACGAAATATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102674 GTTAAGTGCATGGCTGAGTGTTTCTCATGGTGCTATTCCACGAAATATTC
550 . : . : . : . : . :
524 TCTACAG AATCAGTGCTGCTGATGTAGACCTACAGTGGAAT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
102724 TCTACAGGTA...TAGAATCAGTGCTGCTGATGTAGACCTACAGTGGAAT
600 . : . : . : . : . :
565 TTTTCACAGACTCCAATTGAGCATGTGTTTCCTGTTCCCAATGTTTCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103511 TTTTCACAGACTCCAATTGAGCATGTGTTTCCTGTTCCCAATGTTTCTCA
650 . : . : . : . : . :
615 CAATGTTGCCTTGAAAGTCAGTGTTCAGTCCTTGCCCAGACAATCTAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103561 CAATGTTGCCTTGAAAGTCAGTGTTCAGTCCTTGCCCAGACAATCTAATT
700 . : . : . : . : . :
665 ATCCAGTTTTGACGTGCAGTATTCACACTAATATTGGCCTTTATGAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103611 ATCCAGTTTTGACGTGCAGTATTCACACTAATATTGGCCTTTATGAGAAA
750 . : . : . : . : . :
715 AGAATTCAACAACATAAACTTAAAACTCATCAGCACCATAACCCAAATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103661 AGAATTCAACAACATAAACTTAAAACTCATCAGCACCATAACCCAAATGA
800 . : . : . : . : . :
765 AGCAGAACAATGTGGTACAAACAGTTCACAGCGTCTGTGTAGCAAACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103711 AGCAGAACAATGTGGTACAAACAGTTCACAGCGTCTGTGTAGCAAACAAA
850 . : . : . : . : . :
815 CTTGGACCATGGCACCTGAAAGTGTGTTACATGCAAAAAGTGGCCCAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103761 CTTGGACCATGGCACCTGAAAGTGTGTTACATGCAAAAAGTGGCCCAAGT
900 . : . : . : . : . :
865 CCAGAATATACTGCAGCTGTCAAAAATATCAAACTATATCCAGGCACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103811 CCAGAATATACTGCAGCTGTCAAAAATATCAAACTATATCCAGGCACTGG
950 . : . : . : . : . :
915 CAGTAAATCTGACCATGGGACATCTCAAGCCAATATTCTAGGCTTTAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103861 CAGTAAATCTGACCATGGGACATCTCAAGCCAATATTCTAGGCTTTAGTG
1000 . : . : . : . : . :
965 GTATAGGTGATATAAAATCACAAGAAACATCAGTGAGAACTTTAAAATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103911 GTATAGGTGATATAAAATCACAAGAAACATCAGTGAGAACTTTAAAATCA
1050 . : . : . : . : . :
1015 TTTTCAATGGTTGATTCCAGTATCTCTAACCGCCAGAGTTTCTGGCAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103961 TTTTCAATGGTTGATTCCAGTATCTCTAACCGCCAGAGTTTCTGGCAGTC
1100 . : . : . : . : . :
1065 AGCTGGTGAGACTAACCCTTTAATAGGCTCTTTAATTCAGGAGCGGCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104011 AGCTGGTGAGACTAACCCTTTAATAGGCTCTTTAATTCAGGAGCGGCAAG
1150 . : . : . : . : . :
1115 AAATCATTGCAAGAATTGCTCAACATTTGATTCATTGTGATCCAAGCACT
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
104061 AAATCATTGCAAGAATTGCCCAACATTTGATTCATTGTGATCCAAGCACT
1200 . : . : . : . : . :
1165 TCACATGTTTCTGGACGTCCATTTAATACTCAAGAGTCTAGTTCACTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104111 TCACATGTTTCTGGACGTCCATTTAATACTCAAGAGTCTAGTTCACTCCA
1250 . : . : . : . : . :
1215 TTCAAAACTTTTCCGGGTTTCACAAGAAAATGAGAACGTGGGAAAAGGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104161 TTCAAAACTTTTCCGGGTTTCACAAGAAAATGAGAACGTGGGAAAAGGTA
1300 . : . : . : . : . :
1265 AAGAAGCTTTCTCCATGACTTTTGGTAGTCCAGAGTTTAGTTCCCCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104211 AAGAAGCTTTCTCCATGACTTTTGGTAGTCCAGAGTTTAGTTCCCCAGAA
1350 . : . : . : . : . :
1315 GACACCAATGAGGGGAAAATTCGACTAAAACCAGAAACTCCTCGAAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104261 GACACCAATGAGGGGAAAATTCGACTAAAACCAGAAACTCCTCGAAGTGA
1400 . : . : . : . : . :
1365 AACTTGTATTTCTAATGACTTTTATTCTCATATGCCTGTTGGAGAGACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104311 AACTTGTATTTCTAATGACTTTTATTCTCATATGCCTGTTGGAGAGACTA
1450 . : . : . : . : . :
1415 ATCCTTTGATAGGCTCTTTACTCCAGGAGCGGCAAGATGTTATTGCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104361 ATCCTTTGATAGGCTCTTTACTCCAGGAGCGGCAAGATGTTATTGCAAGG
1500 . : . : . : . : . :
1465 ATTGCTCAGCACTTGGAGCACATTGATCCAACAGCATCACATATCCCCCG
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104411 ATTGCTCAACACTTGGAGCACATTGATCCAACAGCATCACATATCCCCCG
1550 . : . : . : . : . :
1515 GCAGTCATTCAACATGCATGACTCCAGTTCGGTTGCATCTAAAGTGTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104461 GCAGTCATTCAACATGCATGACTCCAGTTCGGTTGCATCTAAAGTGTTTA
1600 . : . : . : . : . :
1565 GGAGTTCATATGAAGACAAAAATTTGTTGAAGAAAAATAAGGATGAGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104511 GGAGTTCATATGAAGACAAAAATTTGTTGAAGAAAAATAAGGATGAGTCC
1650 . : . : . : . : . :
1615 TCAGTTTCCATTTCTCACACAAAATGTTCCTTGTTAGGAGACATCAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104561 TCAGTTTCCATTTCTCACACAAAATGTTCCTTGTTAGGAGACATCAGTGA
1700 . : . : . : . : . :
1665 TGGGAAAAACTTAATACCTAATAAATGTTTTACTTCTTTTAAAAATAATA
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104611 TGGGAAAAACTTAGTACCTAATAAATGTTTTACTTCTTTTAAAAATAATA
1750 . : . : . : . : . :
1715 GTAAAGAAAAGTGTTCTTTGAAACATCAAACAAGAAATCAGTGTCAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104661 GTAAAGAAAAGTGTTCTTTGAAACATCAAACAAGAAATCAGTGTCAGAAC
1800 . : . : . : . : . :
1765 AATCCTAGTGAAATCATCCAAAGTACGTATCAGGAGACACAGAACAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104711 AATCCTAGTGAAATCATCCAAAGTACGTATCAGGAGACACAGAACAAAAG
1850 . : . : . : . : . :
1815 TTCTAGTTTATCAACTTCCTCAATTTTGTCTCAGCACAAAGAAAATAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104761 TTCTAGTTTATCAACTTCCTCAATTTTGTCTCAGCACAAAGAAAATAACT
1900 . : . : . : . : . :
1865 TAGATTTGACAAGCAGATTCAAGGAGCAAGAAATGAGCAATGGAATTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104811 TAGATTTGACAAGCAGATTCAAGGAGCAAGAAATGAGCAATGGAATTGAT
1950 . : . : . : . : . :
1915 AAACAGTATTCAAATTGCACCACTATTGACAAACAGATTTGTACAAATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104861 AAACAGTATTCAAATTGCACCACTATTGACAAACAGATTTGTACAAATAA
2000 . : . : . : . : . :
1965 GTATAAGGAAAAAATAATAAATGAGAACTATAATCCAAAATTCTTTGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104911 GTATAAGGAAAAAATAATAAATGAGAACTATAATCCAAAATTCTTTGGCA
2050 . : . : . : . : . :
2015 ATCTTCAGTCTGATGATTCCAAAAAAAATGACTCAAAAATAAAAGTTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104961 ATCTTCAGTCTGATGATTCCAAAAAAAATGACTCAAAAATAAAAGTTACT
2100 . : . : . : . : . :
2065 GTGTTGGAAATGTCTGAATATTTGAACAAATATGAAAGCATGTCCTCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105011 GTGTTGGAAATGTCTGAATATTTGAACAAATATGAAAGCATGTCCTCAAA
2150 . : . : . : . : . :
2115 TAAAGACTCAAAAAGGCCTAAGACATGTGAGCAAAATACTCAACTTAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105061 TAAAGACTCAAAAAGGCCTAAGACATGTGAGCAAAATACTCAACTTAATA
2200 . : . : . : . : . :
2165 GCATAGAGAATTATCTCAATAAAGATAATGAAGGTTTCAAATGTAAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105111 GCATAGAGAATTATCTCAATAAAGATAATGAAGGTTTCAAATGTAAAAAG
2250 . : . : . : . : . :
2215 TCAGACCAATTAAAAAATGAACAAGATAAGCAAGAAGATCCAACTAATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105161 TCAGACCAATTAAAAAATGAACAAGATAAGCAAGAAGATCCAACTAATGA
2300 . : . : . : . : . :
2265 AAAATCCCAAAACTATTCTCAGAGAAGAAGTATAAAAGACTGTTTGTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105211 AAAATCCCAAAACTATTCTCAGAGAAGAAGTATAAAAGACTGTTTGTCTA
2350 . : . : . : . : . :
2315 CATGTGAGCAACCAAAAAATACAGAGGTATTG AGGACTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
105261 CATGTGAGCAACCAAAAAATACAGAGGTATTGGTA...CAGAGGACTACA
2400 . : . : . : . : . :
2356 CTGAAACATTCAAATGTGTGGCGAAAACATAATTTTCATTCCTTGGATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108623 CTGAAACATTCAAATGTGTGGCGAAAACATAATTTTCATTCCTTGGATGG
2450 . : . : . : . : . :
2406 AACTTCAACCAGAGCCTTTCATCCTCAAACTGGATTGCCTCTTCTTTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108673 AACTTCAACCAGAGCCTTTCATCCTCAAACTGGATTGCCTCTTCTTTCAA
2500 . : . : . : . : . :
2456 GCCCT GTTCCTCAAAGAAAAACACAATCAGGTTGCTTTGAT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108723 GCCCTGTA...TAGGTTCCTCAAAGAAAAACACAATCAGGTTGCTTTGAT
2550 . : . : . : . : . :
2497 CTGGATTCTTCATTACTACATCTGAAAAGCTTCTCATCTAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
112731 CTGGATTCTTCATTACTACATCTGAAAAGCTTCTCATCTAGAAGGTA...
2600 . : . : . : . : . :
2541 TCCTCGACCATGTTTGAACATTGAAGATGATCCAGATATTCATGAAA
>>>||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
113622 TAGTCCTCGACCATGTTTAAACATTGAAGATGATCCAGATATTCATGAAA
2650 . : . : . : . : . :
2588 AACCATTTTTGAGTTCTAGTGCTCCACCTATAACAAGTCTTAGTCTCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113672 AACCATTTTTGAGTTCTAGTGCTCCACCTATAACAAGTCTTAGTCTCCTA
2700 . : . : . : . : . :
2638 GGAAATTTTGAG GAATCTGTCTTGAACTATCGTTTCGATCC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
113722 GGAAATTTTGAGGTA...CAGGAATCTGTCTTGAACTATCGTTTCGATCC
2750 . : . : . : . : . :
2679 TCTCGGCATTGTTGATGGTTTTACTGCCGAGGTAGGGGCAAGTGGTGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120153 TCTCGGCATTGTTGATGGTTTTACTGCCGAGGTAGGGGCAAGTGGTGCTT
2800 . : . : . : . : . :
2729 TCTGCCCCACACATTTGACTCTTCCAGTTGAAGTGTCATTCTACAGTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120203 TCTGCCCCACACATTTGACTCTTCCAGTTGAAGTGTCATTCTACAGTGTT
2850 . : . : . : . : . :
2779 TCAGATGACAATGCTCCCTCTCCTTATATG GGTGTGATTAC
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
120253 TCAGATGACAATGCTCCCTCTCCTTATATGGCA...AAGGGTGTGATTAC
2900 . : . : . : . : . :
2820 TTTAGAGTCCCTTGGTAAAAGGGGTTATCGAGTACCTCCTTCAGGAACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126652 TTTAGAGTCCCTTGGTAAAAGGGGTTATCGAGTACCTCCTTCAGGAACAA
2950 . : . : . : . : . :
2870 TACAAGTG ACCTTATTTAATCCTAATAAGACTGTGGTGAAG
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
126702 TACAAGTGGTA...CAGACCTTATTTAATCCTAATAAGACTGTGGTGAAG
3000 . : . : . : . : . :
2911 ATGTTTGTTGTGATATATGATTTACGAGATATGCCAGCCAATCATCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128949 ATGTTTGTTGTGATATATGATTTACGAGATATGCCAGCCAATCATCAGAC
3050 . : . : . : . : . :
2961 ATTCCTACGACAAAGAACTTTTTCTGTACCTGTTAAACAAGAAGTGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128999 ATTCCTACGACAAAGAACTTTTTCTGTACCTGTTAAACAAGAAGTGAAGA
3100 . : . : . : . : . :
3011 GAAGTGTTAATAAAGAGAACATCCGACACACAGAAGAACGGTTATTACGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129049 GAAGTGTTAATAAAGAGAACATCCGACACACAGAAGAACGGTTATTACGC
3150 . : . : . : . : . :
3061 TACCTCATACATCTGAG GTTCCAGAGTTCTAAATCTGGAAA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
129099 TACCTCATACATCTGAGGTA...TAGGTTCCAGAGTTCTAAATCTGGAAA
3200 . : . : . : . : . :
3102 GATCTACCTCCATAGAGACGTACGGCTCCTGTTCTCTAGAAAGTCAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131577 GATCTACCTCCATAGAGACGTACGGCTCCTGTTCTCTAGAAAGTCAATGG
3250 . : . : . : . : . :
3152 AGGTTGATAGCGGTGCTGCATATGAACTCAAATCTTACACTGAATCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131627 AGGTTGATAGCGGTGCTGCATATGAACTCAAATCTTACACTGAATCACCA
3300 . : . : .
3202 ACAAACCCTCAGTTTTCACCAAGATGT
|||||||||||||||||||||||||||
131677 ACAAACCCTCAGTTTTCACCAAGATGT