seq1 = pF1KA1354.tfa, 1851 bp
seq2 = pF1KA1354/gi568815589r_21233009.tfa (gi568815589r:21233009_21434859), 201851 bp

>pF1KA1354 1851
>gi568815589r:21233009_21434859 (Chr9)

(complement)

1-1851  (100001-101851)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGTGTCCCTTGGTAACGGCGAAATGGGCGTCTCTGCCCATTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGTGTCCCTTGGTAACGGCGAAATGGGCGTCTCTGCCCATTTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTTGTAAGGCAGGAACCACACGCTTTTTTACCAGCAATACTCACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCTTGTAAGGCAGGAACCACACGCTTTTTTACCAGCAATACTCACAGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGTGGTATTGCAAGGCTTTGATCAGCTTAGAATAGAAGGATTGCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGTGGTATTGCAAGGCTTTGATCAGCTTAGAATAGAAGGATTGCTTTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGTGACCCTGGTACCAGGTGATGGAGATGAAATCTTCCCTGTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGTGACCCTGGTACCAGGTGATGGAGATGAAATCTTCCCTGTTCACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCTATGATGGCGTCTGCTAGTGATTATTTCAAAGCCATGTTCACAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCTATGATGGCGTCTGCTAGTGATTATTTCAAAGCCATGTTCACAGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAATGAAAGAACAAGATTTGATGTGCATTAAGCTTCATGGGGTGAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAATGAAAGAACAAGATTTGATGTGCATTAAGCTTCATGGGGTGAACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTTGGTCTGAAGAAAATCATTGATTTTATTTATACTGCAAAACTTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTTGGTCTGAAGAAAATCATTGATTTTATTTATACTGCAAAACTTTCTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAATATGGACAATCTTCAGGACACACTTGAAGCTGCTAGCTTTTTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAATATGGACAATCTTCAGGACACACTTGAAGCTGCTAGCTTTTTACAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TATTACCCGTTTTGGATTTCTGTAAAGTATTTCTTATATCAGGAGTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TATTACCCGTTTTGGATTTCTGTAAAGTATTTCTTATATCAGGAGTCTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGGATAACTGTGTTGAGGTTGGACGAATTGCTAACACCTACAATCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGGATAACTGTGTTGAGGTTGGACGAATTGCTAACACCTACAATCTTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAAGTGGATAAATATGTTAATAATTTCATCCTGAAGAACTTTCCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAAGTGGATAAATATGTTAATAATTTCATCCTGAAGAACTTTCCTGCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TATTGAGTACTGGGGAGTTTCTAAAACTCCCTTTTGAACGACTTGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TATTGAGTACTGGGGAGTTTCTAAAACTCCCTTTTGAACGACTTGCATTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGCTTTCCAGTAATAGTCTTAAGCACTGTACCGAACTTGAACTCTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGCTTTCCAGTAATAGTCTTAAGCACTGTACCGAACTTGAACTCTTTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCAGCCTGTCGCTGGCTAAGGTTGGAAGACCCTCGGATGGATTATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCAGCCTGTCGCTGGCTAAGGTTGGAAGACCCTCGGATGGATTATGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAAAGTTAATGAAGAATATTCGATTTCCACTGATGACACCACAGGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAAAGTTAATGAAGAATATTCGATTTCCACTGATGACACCACAGGATCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCAATTACGTGCAGACAGTAGATTTCATGAGAACAGACAATACCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCAATTACGTGCAGACAGTAGATTTCATGAGAACAGACAATACCTGCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAATTTGCTTTTGGAAGCTAGCAATTACCAAATGATGCCATATATGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAATTTGCTTTTGGAAGCTAGCAATTACCAAATGATGCCATATATGCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CAGTGATGCAGTCAGATAGAACTGCCATTCGATCTGACTCCACTCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CAGTGATGCAGTCAGATAGAACTGCCATTCGATCTGACTCCACTCACTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTTACATTAGGAGGAGTTTTGAGGCAGCAGCTGGTTGTCAGTAAAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTTACATTAGGAGGAGTTTTGAGGCAGCAGCTGGTTGTCAGTAAAGAATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACGGATGTATGATGAAAGGGCACAAGAATGGAGATCTTTAGCCCCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACGGATGTATGATGAAAGGGCACAAGAATGGAGATCTTTAGCCCCAATGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGCTCCCCGTTACCAGCATGGTATTGCTGTCATTGGAAACTTTCTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATGCTCCCCGTTACCAGCATGGTATTGCTGTCATTGGAAACTTTCTTTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTAGTTGGTGGTCAGAGTAATTATGATACAAAAGGAAAAACTGCTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTAGTTGGTGGTCAGAGTAATTATGATACAAAAGGAAAAACTGCTGTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TACAGTTTTCAGATTTGATCCTCGGTATAATAAATGGATGCAGGTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TACAGTTTTCAGATTTGATCCTCGGTATAATAAATGGATGCAGGTTGCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CATTAAATGAAAAGCGCACATTCTTTCACTTGAGTGCCCTCAAAGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CATTAAATGAAAAGCGCACATTCTTTCACTTGAGTGCCCTCAAAGGACAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTGTATGCAGTTGGTGGGCGCAGTGCAGCTGGTGAACTGGCCACAGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TTGTATGCAGTTGGTGGGCGCAGTGCAGCTGGTGAACTGGCCACAGTAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ATGTTACAACCCAAGAATGAATGAGTGGAGCTATGTTGCAAAAATGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ATGTTACAACCCAAGAATGAATGAGTGGAGCTATGTTGCAAAAATGAGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AACCCCACTATGGTCATGCTGGAACAGTATATGGAGGCTTAATGTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AACCCCACTATGGTCATGCTGGAACAGTATATGGAGGCTTAATGTATATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCAGGAGGAATTACCCATGACACTTTCCAAAATGAGCTCATGTGTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCAGGAGGAATTACCCATGACACTTTCCAAAATGAGCTCATGTGTTTTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CCCAGATACAGATAAATGGATGCAAAAGGCTCCAATGACTACAGTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CCCAGATACAGATAAATGGATGCAAAAGGCTCCAATGACTACAGTCAGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GTCTGCATTGCATGTGTACAGTTGGAGATAAGCTCTATGTCATTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GTCTGCATTGCATGTGTACAGTTGGAGATAAGCTCTATGTCATTGGTGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AATCACTTCAGAGGAACAAGTGATTATGATGATGTTCTAAGCTGTGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AATCACTTCAGAGGAACAAGTGATTATGATGATGTTCTAAGCTGTGAATA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CTATTCACCAACCCTTGACCAGTGGACCCCAATTGCCGCCATGTTAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CTATTCACCAACCCTTGACCAGTGGACCCCAATTGCCGCCATGTTAAGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GCCAAAGTGATGTTGGAGTTGCCGTCTTTGAAAATAAAATCTATGTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GCCAAAGTGATGTTGGAGTTGCCGTCTTTGAAAATAAAATCTATGTTGTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GGTGGATATTCTTGGAATAATCGTTGTATGGTAGAAATTGTCCAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GGTGGATATTCTTGGAATAATCGTTGTATGGTAGAAATTGTCCAGAAATA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TGACCCAGAAAAAGATGAGTGGCATAAAGTTTTTGATCTTCCAGAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TGACCCAGAAAAAGATGAGTGGCATAAAGTTTTTGATCTTCCAGAGTCAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TTGGTGGCATTCGAGCCTGTACACTCACAGTTTTTCCACCTGAAGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TTGGTGGCATTCGAGCCTGTACACTCACAGTTTTTCCACCTGAAGAAAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CCTGGGTCACCTTCTAGAGAATCACCTCTTTCAGCACCTTCAGATCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CCTGGGTCACCTTCTAGAGAATCACCTCTTTCAGCACCTTCAGATCATTC

   1850 
   1851 T
        |
 101851 T