Result of SIM4 for
pF1KA1282
seq1 = pF1KA1282.tfa, 3249 bp
seq2 = pF1KA1282/gi568815586f_49439417.tfa (gi568815586f:49439417_49657950), 218534 bp
>pF1KA1282 3249
>gi568815586f:49439417_49657950 (Chr12)
1-76 (100001-100076) 100% ->
77-310 (101483-101716) 100% ->
311-445 (102214-102348) 100% ->
446-579 (103290-103423) 100% ->
580-823 (103859-104102) 100% ->
824-981 (104499-104656) 100% ->
982-1189 (104759-104966) 100% ->
1190-1468 (109479-109757) 100% ->
1469-1668 (110025-110224) 100% ->
1669-1918 (110664-110913) 100% ->
1919-2136 (114921-115138) 100% ->
2137-2468 (116204-116535) 100% ->
2469-2575 (116954-117060) 100% ->
2576-2652 (117767-117843) 100% ->
2653-3249 (117938-118534) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCGGCCATGCGGGGCCTCCTGGCGCCGCAGAACACCTTCCTGGACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCCGGCCATGCGGGGCCTCCTGGCGCCGCAGAACACCTTCCTGGACAC
50 . : . : . : . : . :
51 CATCGCTACGCGCTTCGACGGCACGC ACAGTAACTTCGTGC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
100051 CATCGCTACGCGCTTCGACGGCACGCGTG...CAGACAGTAACTTCGTGC
100 . : . : . : . : . :
92 TGGGCAACGCCCAGGTGGCGGGGCTCTTCCCCGTGGTCTACTGCTCTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101498 TGGGCAACGCCCAGGTGGCGGGGCTCTTCCCCGTGGTCTACTGCTCTGAT
150 . : . : . : . : . :
142 GGCTTCTGTGACCTCACGGGCTTCTCCCGGGCTGAGGTCATGCAGCGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101548 GGCTTCTGTGACCTCACGGGCTTCTCCCGGGCTGAGGTCATGCAGCGGGG
200 . : . : . : . : . :
192 CTGTGCCTGCTCCTTCCTTTATGGGCCAGACACCAGTGAGCTCGTCCGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101598 CTGTGCCTGCTCCTTCCTTTATGGGCCAGACACCAGTGAGCTCGTCCGCC
250 . : . : . : . : . :
242 AACAGATCCGCAAGGCCCTGGACGAGCACAAGGAGTTCAAGGCTGAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101648 AACAGATCCGCAAGGCCCTGGACGAGCACAAGGAGTTCAAGGCTGAGCTG
300 . : . : . : . : . :
292 ATCCTGTACCGGAAGAGCG GGCTCCCGTTCTGGTGTCTCCT
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
101698 ATCCTGTACCGGAAGAGCGGTG...CAGGGCTCCCGTTCTGGTGTCTCCT
350 . : . : . : . : . :
333 GGATGTGATACCCATAAAGAATGAGAAAGGGGAGGTGGCTCTCTTCCTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102236 GGATGTGATACCCATAAAGAATGAGAAAGGGGAGGTGGCTCTCTTCCTAG
400 . : . : . : . : . :
383 TCTCTCACAAGGACATCAGCGAAACCAAGAACCGAGGGGGCCCCGACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102286 TCTCTCACAAGGACATCAGCGAAACCAAGAACCGAGGGGGCCCCGACAGA
450 . : . : . : . : . :
433 TGGAAGGAGACAG GTGGTGGCCGGCGCCGATATGGCCGGGC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
102336 TGGAAGGAGACAGGTA...CAGGTGGTGGCCGGCGCCGATATGGCCGGGC
500 . : . : . : . : . :
474 ACGATCCAAAGGCTTCAATGCCAACCGGCGGCGGAGCCGGGCCGTGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103318 ACGATCCAAAGGCTTCAATGCCAACCGGCGGCGGAGCCGGGCCGTGCTCT
550 . : . : . : . : . :
524 ACCACCTGTCCGGGCACCTGCAGAAGCAGCCCAAGGGCAAGCACAAGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103368 ACCACCTGTCCGGGCACCTGCAGAAGCAGCCCAAGGGCAAGCACAAGCTC
600 . : . : . : . : . :
574 AATAAG GGGGTGTTTGGGGAGAAACCAAACTTGCCTGAGTA
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
103418 AATAAGGTG...CAGGGGGTGTTTGGGGAGAAACCAAACTTGCCTGAGTA
650 . : . : . : . : . :
615 CAAAGTAGCCGCCATCCGGAAGTCGCCCTTCATCCTGTTGCACTGTGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103894 CAAAGTAGCCGCCATCCGGAAGTCGCCCTTCATCCTGTTGCACTGTGGGG
700 . : . : . : . : . :
665 CACTGAGAGCCACCTGGGATGGCTTCATCCTGCTCGCCACACTCTATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103944 CACTGAGAGCCACCTGGGATGGCTTCATCCTGCTCGCCACACTCTATGTG
750 . : . : . : . : . :
715 GCTGTCACTGTGCCCTACAGCGTGTGTGTGAGCACAGCACGGGAGCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103994 GCTGTCACTGTGCCCTACAGCGTGTGTGTGAGCACAGCACGGGAGCCCAG
800 . : . : . : . : . :
765 TGCCGCCCGCGGCCCGCCCAGCGTCTGTGACCTGGCCGTGGAGGTCCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104044 TGCCGCCCGCGGCCCGCCCAGCGTCTGTGACCTGGCCGTGGAGGTCCTCT
850 . : . : . : . : . :
815 TCATCCTTG ACATTGTGCTGAATTTCCGTACCACATTCGTG
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
104094 TCATCCTTGGTG...CAGACATTGTGCTGAATTTCCGTACCACATTCGTG
900 . : . : . : . : . :
856 TCCAAGTCGGGCCAGGTGGTGTTTGCCCCAAAGTCCATTTGCCTCCACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104531 TCCAAGTCGGGCCAGGTGGTGTTTGCCCCAAAGTCCATTTGCCTCCACTA
950 . : . : . : . : . :
906 CGTCACCACCTGGTTCCTGCTGGATGTCATCGCAGCGCTGCCCTTTGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104581 CGTCACCACCTGGTTCCTGCTGGATGTCATCGCAGCGCTGCCCTTTGACC
1000 . : . : . : . : . :
956 TGCTACATGCCTTCAAGGTCAACGTG TACTTCGGGGCCCAT
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
104631 TGCTACATGCCTTCAAGGTCAACGTGGTC...CAGTACTTCGGGGCCCAT
1050 . : . : . : . : . :
997 CTGCTGAAGACGGTGCGCCTGCTGCGCCTGCTGCGCCTGCTTCCGCGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104774 CTGCTGAAGACGGTGCGCCTGCTGCGCCTGCTGCGCCTGCTTCCGCGGCT
1100 . : . : . : . : . :
1047 GGACCGGTACTCGCAGTACAGCGCCGTGGTGCTGACACTGCTCATGGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104824 GGACCGGTACTCGCAGTACAGCGCCGTGGTGCTGACACTGCTCATGGCCG
1150 . : . : . : . : . :
1097 TGTTCGCCCTGCTCGCGCACTGGGTCGCCTGCGTCTGGTTTTACATTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104874 TGTTCGCCCTGCTCGCGCACTGGGTCGCCTGCGTCTGGTTTTACATTGGC
1200 . : . : . : . : . :
1147 CAGCGGGAGATCGAGAGCAGCGAATCCGAGCTGCCTGAGATTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
104924 CAGCGGGAGATCGAGAGCAGCGAATCCGAGCTGCCTGAGATTGGTA...C
1250 . : . : . : . : . :
1190 GCTGGCTGCAGGAGCTGGCCCGCCGACTGGAGACTCCCTACTACCTGG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109477 AGGCTGGCTGCAGGAGCTGGCCCGCCGACTGGAGACTCCCTACTACCTGG
1300 . : . : . : . : . :
1238 TGGGCCGGAGGCCAGCTGGAGGGAACAGCTCCGGCCAGAGTGACAACTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109527 TGGGCCGGAGGCCAGCTGGAGGGAACAGCTCCGGCCAGAGTGACAACTGC
1350 . : . : . : . : . :
1288 AGCAGCAGCAGCGAGGCCAACGGGACGGGGCTGGAGCTGCTGGGCGGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109577 AGCAGCAGCAGCGAGGCCAACGGGACGGGGCTGGAGCTGCTGGGCGGCCC
1400 . : . : . : . : . :
1338 GTCGCTGCGCAGCGCCTACATCACCTCCCTCTACTTCGCACTCAGCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109627 GTCGCTGCGCAGCGCCTACATCACCTCCCTCTACTTCGCACTCAGCAGCC
1450 . : . : . : . : . :
1388 TCACCAGCGTGGGCTTCGGCAACGTGTCCGCCAACACGGACACCGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109677 TCACCAGCGTGGGCTTCGGCAACGTGTCCGCCAACACGGACACCGAGAAG
1500 . : . : . : . : . :
1438 ATCTTCTCCATCTGCACCATGCTCATCGGCG CCCTGATGCA
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
109727 ATCTTCTCCATCTGCACCATGCTCATCGGCGGTG...CAGCCCTGATGCA
1550 . : . : . : . : . :
1479 CGCGGTGGTGTTTGGGAACGTGACGGCCATCATCCAGCGCATGTACGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110035 CGCGGTGGTGTTTGGGAACGTGACGGCCATCATCCAGCGCATGTACGCCC
1600 . : . : . : . : . :
1529 GCCGCTTTCTGTACCACAGCCGCACGCGCGACCTGCGCGACTACATCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110085 GCCGCTTTCTGTACCACAGCCGCACGCGCGACCTGCGCGACTACATCCGC
1650 . : . : . : . : . :
1579 ATCCACCGTATCCCCAAGCCCCTCAAGCAGCGCATGCTGGAGTACTTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110135 ATCCACCGTATCCCCAAGCCCCTCAAGCAGCGCATGCTGGAGTACTTCCA
1700 . : . : . : . : . :
1629 GGCCACCTGGGCGGTGAACAATGGCATCGACACCACCGAG C
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
110185 GGCCACCTGGGCGGTGAACAATGGCATCGACACCACCGAGGTG...CAGC
1750 . : . : . : . : . :
1670 TGCTGCAGAGCCTCCCTGACGAGCTGCGCGCAGACATCGCCATGCACCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110665 TGCTGCAGAGCCTCCCTGACGAGCTGCGCGCAGACATCGCCATGCACCTG
1800 . : . : . : . : . :
1720 CACAAGGAGGTCCTGCAGCTGCCACTGTTTGAGGCGGCCAGCCGCGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110715 CACAAGGAGGTCCTGCAGCTGCCACTGTTTGAGGCGGCCAGCCGCGGCTG
1850 . : . : . : . : . :
1770 CCTGCGGGCACTGTCTCTGGCCCTGCGGCCCGCCTTCTGCACGCCGGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110765 CCTGCGGGCACTGTCTCTGGCCCTGCGGCCCGCCTTCTGCACGCCGGGCG
1900 . : . : . : . : . :
1820 AGTACCTCATCCACCAAGGCGATGCCCTGCAGGCCCTCTACTTTGTCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110815 AGTACCTCATCCACCAAGGCGATGCCCTGCAGGCCCTCTACTTTGTCTGC
1950 . : . : . : . : . :
1870 TCTGGCTCCATGGAGGTGCTCAAGGGTGGCACCGTGCTCGCCATCCTAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
110865 TCTGGCTCCATGGAGGTGCTCAAGGGTGGCACCGTGCTCGCCATCCTAGG
2000 . : . : . : . : . :
1919 GGAAGGGCGACCTGATCGGCTGTGAGCTGCCCCGGCGGGAGC
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110915 TT...CAGGGAAGGGCGACCTGATCGGCTGTGAGCTGCCCCGGCGGGAGC
2050 . : . : . : . : . :
1961 AGGTGGTAAAGGCCAATGCCGACGTGAAGGGGCTGACGTACTGCGTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114963 AGGTGGTAAAGGCCAATGCCGACGTGAAGGGGCTGACGTACTGCGTCCTG
2100 . : . : . : . : . :
2011 CAGTGTCTGCAGCTGGCTGGCCTGCACGACAGCCTTGCGCTGTACCCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115013 CAGTGTCTGCAGCTGGCTGGCCTGCACGACAGCCTTGCGCTGTACCCCGA
2150 . : . : . : . : . :
2061 GTTTGCCCCGCGCTTCAGTCGTGGCCTCCGAGGGGAGCTCAGCTACAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115063 GTTTGCCCCGCGCTTCAGTCGTGGCCTCCGAGGGGAGCTCAGCTACAACC
2200 . : . : . : . : . :
2111 TGGGTGCTGGGGGAGGCTCTGCAGAG GTGGACACCAGCTCC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
115113 TGGGTGCTGGGGGAGGCTCTGCAGAGGTG...TAGGTGGACACCAGCTCC
2250 . : . : . : . : . :
2152 CTGAGCGGCGACAATACCCTTATGTCCACGCTGGAGGAGAAGGAGACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116219 CTGAGCGGCGACAATACCCTTATGTCCACGCTGGAGGAGAAGGAGACAGA
2300 . : . : . : . : . :
2202 TGGGGAGCAGGGCCCCACGGTCTCCCCAGCCCCAGCTGATGAGCCCTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116269 TGGGGAGCAGGGCCCCACGGTCTCCCCAGCCCCAGCTGATGAGCCCTCCA
2350 . : . : . : . : . :
2252 GCCCCCTGCTGTCCCCTGGCTGCACCTCCTCATCCTCAGCTGCCAAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116319 GCCCCCTGCTGTCCCCTGGCTGCACCTCCTCATCCTCAGCTGCCAAGCTG
2400 . : . : . : . : . :
2302 CTATCCCCACGTCGAACAGCACCCCGGCCTCGTCTAGGTGGCAGAGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116369 CTATCCCCACGTCGAACAGCACCCCGGCCTCGTCTAGGTGGCAGAGGGAG
2450 . : . : . : . : . :
2352 GCCAGGCAGGGCAGGGGCTTTGAAGGCTGAGGCTGGCCCCTCTGCTCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116419 GCCAGGCAGGGCAGGGGCTTTGAAGGCTGAGGCTGGCCCCTCTGCTCCCC
2500 . : . : . : . : . :
2402 CACGGGCCCTAGAGGGGCTACGGCTGCCCCCCATGCCATGGAATGTGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116469 CACGGGCCCTAGAGGGGCTACGGCTGCCCCCCATGCCATGGAATGTGCCC
2550 . : . : . : . : . :
2452 CCAGATCTGAGCCCCAG GGTAGTAGATGGCATTGAAGACGG
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
116519 CCAGATCTGAGCCCCAGGTG...CAGGGTAGTAGATGGCATTGAAGACGG
2600 . : . : . : . : . :
2493 CTGTGGCTCGGACCAGCCCAAGTTCTCTTTCCGCGTGGGCCAGTCTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116978 CTGTGGCTCGGACCAGCCCAAGTTCTCTTTCCGCGTGGGCCAGTCTGGCC
2650 . : . : . : . : . :
2543 CGGAATGTAGCAGCAGCCCCTCCCCTGGACCAG AGAGCGGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
117028 CGGAATGTAGCAGCAGCCCCTCCCCTGGACCAGGTA...CAGAGAGCGGC
2700 . : . : . : . : . :
2584 CTGCTCACTGTTCCCCATGGGCCCAGCGAGGCAAGGAACACAGACACACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117775 CTGCTCACTGTTCCCCATGGGCCCAGCGAGGCAAGGAACACAGACACACT
2750 . : . : . : . : . :
2634 GGACAAGCTTCGGCAGGCG GTGACAGAGCTGTCAGAGCAGG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
117825 GGACAAGCTTCGGCAGGCGGTG...AAGGTGACAGAGCTGTCAGAGCAGG
2800 . : . : . : . : . :
2675 TGCTGCAGATGCGGGAAGGACTGCAGTCACTTCGCCAGGCTGTGCAGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117960 TGCTGCAGATGCGGGAAGGACTGCAGTCACTTCGCCAGGCTGTGCAGCTT
2850 . : . : . : . : . :
2725 GTCCTGGCGCCCCACAGGGAGGGTCCGTGCCCTCGGGCATCGGGAGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118010 GTCCTGGCGCCCCACAGGGAGGGTCCGTGCCCTCGGGCATCGGGAGAGGG
2900 . : . : . : . : . :
2775 GCCGTGCCCAGCCAGCACCTCCGGGCTTCTGCAGCCTCTGTGTGTGGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118060 GCCGTGCCCAGCCAGCACCTCCGGGCTTCTGCAGCCTCTGTGTGTGGACA
2950 . : . : . : . : . :
2825 CTGGGGCATCCTCCTACTGCCTGCAGCCCCCAGCTGGCTCTGTCTTGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118110 CTGGGGCATCCTCCTACTGCCTGCAGCCCCCAGCTGGCTCTGTCTTGAGT
3000 . : . : . : . : . :
2875 GGGACTTGGCCCCACCCTCGTCCGGGGCCTCCTCCCCTCATGGCACCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118160 GGGACTTGGCCCCACCCTCGTCCGGGGCCTCCTCCCCTCATGGCACCCTG
3050 . : . : . : . : . :
2925 GCCCTGGGGTCCCCCAGCGTCTCAGAGCTCCCCCTGGCCTCGAGCCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118210 GCCCTGGGGTCCCCCAGCGTCTCAGAGCTCCCCCTGGCCTCGAGCCACAG
3100 . : . : . : . : . :
2975 CTTTCTGGACCTCCACCTCAGACTCAGAGCCCCCTGCCTCAGGAGACCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118260 CTTTCTGGACCTCCACCTCAGACTCAGAGCCCCCTGCCTCAGGAGACCTC
3150 . : . : . : . : . :
3025 TGCTCTGAGCCCAGCACCCCTGCCTCCCCTCCTCCTTCTGAGGAAGGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118310 TGCTCTGAGCCCAGCACCCCTGCCTCCCCTCCTCCTTCTGAGGAAGGGGC
3200 . : . : . : . : . :
3075 TAGGACTGGGCCCGCAGAGCCTGTGAGCCAGGCTGAGGCTACCAGCACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118360 TAGGACTGGGCCCGCAGAGCCTGTGAGCCAGGCTGAGGCTACCAGCACTG
3250 . : . : . : . : . :
3125 GAGAGCCCCCACCAGGGTCAGGGGGCCTGGCCTTGCCCTGGGACCCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118410 GAGAGCCCCCACCAGGGTCAGGGGGCCTGGCCTTGCCCTGGGACCCCCAC
3300 . : . : . : . : . :
3175 AGCCTGGAGATGGTGCTTATTGGCTGCCATGGCTCTGGCACAGTCCAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118460 AGCCTGGAGATGGTGCTTATTGGCTGCCATGGCTCTGGCACAGTCCAGTG
3350 . : . : .
3225 GACCCAGGAAGAAGGCACAGGGGTC
|||||||||||||||||||||||||
118510 GACCCAGGAAGAAGGCACAGGGGTC