Result of SIM4 for
pF1KA1275
seq1 = pF1KA1275.tfa, 3531 bp
seq2 = pF1KA1275/gi568815592r_75195913.tfa (gi568815592r:75195913_75514972), 319060 bp
>pF1KA1275 3531
>gi568815592r:75195913_75514972 (Chr6)
(complement)
1-276 (100001-100276) 99% ->
277-450 (152056-152229) 100% ->
451-629 (161256-161434) 100% ->
630-3435 (199771-202576) 99% ->
3436-3493 (206076-206133) 100% ->
3494-3531 (219023-219060) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAGATCTCGAAACCAAGGTGGTGAAAGTGCATCTGATGGGCATATCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAGATCTCGAAACCAAGGTGGTGAAAGTGCATCTGATGGGCATATCTC
50 . : . : . : . : . :
51 CTGTCCCAAGCCCTCCATCATCGGCAATGCTGGTGAAAAAAGTCTCTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTGTCCCAAGCCCTCCATCATCGGCAATGCTGGTGAAAAAAGTCTCTCAG
100 . : . : . : . : . :
101 AAGATGCAAAAAAGAAGAGGAAATCAAATAGGAAGGAGGATGATGTCATG
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AAGATGCAAAAAAGAAGAAGAAATCAAATAGGAAGGAGGATGATGTCATG
150 . : . : . : . : . :
151 GCCTCAGGAACTGTCAAACGACACCTAAAAACATCTGGAGAATGTGAACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GCCTCAGGAACTGTCAAACGACACCTAAAAACATCTGGAGAATGTGAACG
200 . : . : . : . : . :
201 AAAAACTAAGAAATCCCTGGAGTTATCCAAAGAAGACCTCATCCAACTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 AAAAACTAAGAAATCCCTGGAGTTATCCAAAGAAGACCTCATCCAACTAC
250 . : . : . : . : . :
251 TCAGTATAATGGAAGGGGAGTTGCAG GCCAGAGAAGATGTG
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
100251 TCAGTATAATGGAAGGGGAGTTGCAGGTA...CAGGCCAGAGAAGATGTG
300 . : . : . : . : . :
292 ATCCACATGCTGAAGACAGAGAAAACCAAGCCTGAGGTTCTGGAGGCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152071 ATCCACATGCTGAAGACAGAGAAAACCAAGCCTGAGGTTCTGGAGGCTCA
350 . : . : . : . : . :
342 TTACGGGTCTGCGGAGCCAGAGAAAGTGCTGCGGGTCCTGCACCGAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152121 TTACGGGTCTGCGGAGCCAGAGAAAGTGCTGCGGGTCCTGCACCGAGATG
400 . : . : . : . : . :
392 CCATTCTTGCCCAGGAGAAATCCATAGGAGAAGATGTCTATGAGAAACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152171 CCATTCTTGCCCAGGAGAAATCCATAGGAGAAGATGTCTATGAGAAACCG
450 . : . : . : . : . :
442 ATTTCAGAG CTGGACAGACTTGAGGAAAAACAGAAAGAAAC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
152221 ATTTCAGAGGTA...CAGCTGGACAGACTTGAGGAAAAACAGAAAGAAAC
500 . : . : . : . : . :
483 CTACCGGCGCATGCTAGAGCAGCTGTTGCTGGCCGAGAAGTGTCATAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161288 CTACCGGCGCATGCTAGAGCAGCTGTTGCTGGCCGAGAAGTGTCATAGGC
550 . : . : . : . : . :
533 GCACCGTATACGAGTTAGAGAACGAGAAGCATAAACACACTGACTACATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161338 GCACCGTATACGAGTTAGAGAACGAGAAGCATAAACACACTGACTACATG
600 . : . : . : . : . :
583 AACAAGAGCGACGACTTCACCAACCTGCTGGAGCAGGAGCGGGAGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
161388 AACAAGAGCGACGACTTCACCAACCTGCTGGAGCAGGAGCGGGAGAGGTA
650 . : . : . : . : . :
630 GTTAAAAAAGCTCCTTGAACAAGAAAAGGCTTATCAAGCCCGCA
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161438 ...TAGGTTAAAAAAGCTCCTTGAACAAGAAAAGGCTTATCAAGCCCGCA
700 . : . : . : . : . :
674 AAGAAAAGGAAAATGCTAAACGACTCAATAAACTAAGAGATGAGCTTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199815 AAGAAAAGGAAAATGCTAAACGACTCAATAAACTAAGAGATGAGCTTGTT
750 . : . : . : . : . :
724 AAACTCAAATCCTTTGCACTCATGCTGGTGGATGAAAGACAAATGCACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199865 AAACTCAAATCCTTTGCACTCATGCTGGTGGATGAAAGACAAATGCACAT
800 . : . : . : . : . :
774 TGAACAACTTGGCCTGCAAAGCCAGAAAGTACAGGATCTTACTCAGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199915 TGAACAACTTGGCCTGCAAAGCCAGAAAGTACAGGATCTTACTCAGAAGC
850 . : . : . : . : . :
824 TGAGGGAAGAAGAAGAGAAGCTCAAAGCCATTACTTCCAAATCCAAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199965 TGAGGGAAGAAGAAGAGAAGCTCAAAGCCATTACTTCCAAATCCAAAGAA
900 . : . : . : . : . :
874 GACAGACAGAAATTGCTCAAGTTAGAAGTGGACTTTGAACACAAGGCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200015 GACAGACAGAAATTGCTCAAGTTAGAAGTGGACTTTGAACACAAGGCTTC
950 . : . : . : . : . :
924 GAGGTTTTCTCAAGAGCATGAAGAGATGAACGCTAAACTGGCTAATCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200065 GAGGTTTTCTCAAGAGCATGAAGAGATGAACGCTAAACTGGCTAATCAAG
1000 . : . : . : . : . :
974 AGTCTCACAATAGGCAACTTAGACTCAAGCTGGTTGGCTTAACCCAAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200115 AGTCTCACAATAGGCAACTTAGACTCAAGCTGGTTGGCTTAACCCAAAGA
1050 . : . : . : . : . :
1024 ATCGAGGAGCTAGAAGAGATCAACAAAAATCTGCAGAAGGCAGAGGAAGA
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
200165 ATCGAGGAGCTAGAAGAGACCAACAAAAATCTGCAGAAGGCAGAGGAAGA
1100 . : . : . : . : . :
1074 ACTTCAAGAATTAAGAGATAAAATTGCCAAAGGAGAATGTGGAAACTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200215 ACTTCAAGAATTAAGAGATAAAATTGCCAAAGGAGAATGTGGAAACTCTA
1150 . : . : . : . : . :
1124 GCCTCATGGCAGAAGTGGAAAATCTTCGAAAGCGTGTGCTTGAAATGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200265 GCCTCATGGCAGAAGTGGAAAATCTTCGAAAGCGTGTGCTTGAAATGGAA
1200 . : . : . : . : . :
1174 GGTAAAGATGAGGAGATCACTAAAACTGAATCCCAGTGTAGGGAATTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200315 GGTAAAGATGAGGAGATCACTAAAACTGAATCCCAGTGTAGGGAATTGAG
1250 . : . : . : . : . :
1224 GAAGAAGCTGCAAGAGGAAGAACACCATAGTAAGGAGCTCAGACTTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200365 GAAGAAGCTGCAAGAGGAAGAACACCATAGTAAGGAGCTCAGACTTGAAG
1300 . : . : . : . : . :
1274 TTGAGAAGCTACAGAAGAGAATGTCTGAACTAGAGAAATTGGAAGAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200415 TTGAGAAGCTACAGAAGAGAATGTCTGAACTAGAGAAATTGGAAGAAGCA
1350 . : . : . : . : . :
1324 TTTAGCAAGAGTAAATCTGAGTGCACCCAGCTACATTTAAATCTGGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200465 TTTAGCAAGAGTAAATCTGAGTGCACCCAGCTACATTTAAATCTGGAGAA
1400 . : . : . : . : . :
1374 AGAAAAGAACTTAACCAAAGACCTGCTAAATGAATTGGAGGTGGTCAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200515 AGAAAAGAACTTAACCAAAGACCTGCTAAATGAATTGGAGGTGGTCAAGA
1450 . : . : . : . : . :
1424 GTCGAGTTAAAGAATTGGAATGTTCTGAAAGTAGATTGGAAAAGGCTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200565 GTCGAGTTAAAGAATTGGAATGTTCTGAAAGTAGATTGGAAAAGGCTGAA
1500 . : . : . : . : . :
1474 TTAAGCCTAAAAGATGATCTTACCAAGTTGAAGTCATTTACCGTGATGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200615 TTAAGCCTAAAAGATGATCTTACCAAGTTGAAGTCATTTACCGTGATGCT
1550 . : . : . : . : . :
1524 GGTTGATGAAAGGAAAAATATGATGGAAAAAATAAAACAAGAAGAGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200665 GGTTGATGAAAGGAAAAATATGATGGAAAAAATAAAACAAGAAGAGAGAA
1600 . : . : . : . : . :
1574 AAGTGGATGGACTCAATAAAAATTTTAAGGTGGAACAAGGAAAAGTTATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200715 AAGTGGATGGACTCAATAAAAATTTTAAGGTGGAACAAGGAAAAGTTATG
1650 . : . : . : . : . :
1624 GATGTAACTGAAAAACTAATTGAAGAAAGTAAGAAACTTTTAAAACTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200765 GATGTAACTGAAAAACTAATTGAAGAAAGTAAGAAACTTTTAAAACTAAA
1700 . : . : . : . : . :
1674 ATCTGAAATGGAGGAAAAAGTATACAACTTGACAAGAGAAAGAGATGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200815 ATCTGAAATGGAGGAAAAAGTATACAACTTGACAAGAGAAAGAGATGAGT
1750 . : . : . : . : . :
1724 TGATAGGCAAATTGAAAAGTGAAGAAGAAAAATCCTCTGAATTAAGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200865 TGATAGGCAAATTGAAAAGTGAAGAAGAAAAATCCTCTGAATTAAGCTGC
1800 . : . : . : . : . :
1774 AGTGTTGACTTACTAAAGAAGAGACTTGATGGTATAGAGGAAGTGGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200915 AGTGTTGACTTACTAAAGAAGAGACTTGATGGTATAGAGGAAGTGGAAAG
1850 . : . : . : . : . :
1824 AGAAATAACAAGAGGAAGGTCACGAAAAGGGTCTGAGCTCACCTGCCCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200965 AGAAATAACAAGAGGAAGGTCACGAAAAGGGTCTGAGCTCACCTGCCCGG
1900 . : . : . : . : . :
1874 AAGATAATAAGATTAAGGAACTAACACTTGAAATTGAGAGACTGAAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201015 AAGATAATAAGATTAAGGAACTAACACTTGAAATTGAGAGACTGAAGAAA
1950 . : . : . : . : . :
1924 CGTCTCCAACAATTGGAAGTGGTCGAAGGGGATTTGATGAAGACAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201065 CGTCTCCAACAATTGGAAGTGGTCGAAGGGGATTTGATGAAGACAGAAGA
2000 . : . : . : . : . :
1974 TGAGTATGATCAGCTGGAACAGAAATTTAGAACTGAGCAGGATAAGGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201115 TGAGTATGATCAGCTGGAACAGAAATTTAGAACTGAGCAGGATAAGGCTA
2050 . : . : . : . : . :
2024 ACTTCCTCTCTCAACAACTAGAGGAGATCAAGCACCAAATTGCCAAGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201165 ACTTCCTCTCTCAACAACTAGAGGAGATCAAGCACCAAATTGCCAAGAAT
2100 . : . : . : . : . :
2074 AAAGCAATAGAGAAGGGTGAGGTTGTGAGCCAGGAAGCTGAACTGAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201215 AAAGCAATAGAGAAGGGTGAGGTTGTGAGCCAGGAAGCTGAACTGAGACA
2150 . : . : . : . : . :
2124 CAGATTTCGGTTGGAAGAAGCTAAAAGTCGAGACTTAAAAGCCGAAGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201265 CAGATTTCGGTTGGAAGAAGCTAAAAGTCGAGACTTAAAAGCCGAAGTAC
2200 . : . : . : . : . :
2174 AAGCTCTTAAAGAGAAGATTCACGAATTAATGAACAAAGAAGATCAGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201315 AAGCTCTTAAAGAGAAGATTCACGAATTAATGAACAAAGAAGATCAGCTT
2250 . : . : . : . : . :
2224 TCTCAGCTCCAGGTAGATTATTCTGTACTTCAACAAAGATTTATGGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201365 TCTCAGCTCCAGGTAGATTATTCTGTACTTCAACAAAGATTTATGGAAGA
2300 . : . : . : . : . :
2274 AGAAAATAAGAACAAAAACATGGGGCAGGAGGTTCTCAATCTGACCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201415 AGAAAATAAGAACAAAAACATGGGGCAGGAGGTTCTCAATCTGACCAAAG
2350 . : . : . : . : . :
2324 AGTTGGAGCTTTCCAAGCGCTACAGCAGAGCTCTTAGGCCCAGTGTGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201465 AGTTGGAGCTTTCCAAGCGCTACAGCAGAGCTCTTAGGCCCAGTGTGAAT
2400 . : . : . : . : . :
2374 GGAAGAAGAATGGTGGATGTTCCTGTGACGTCAACTGGAGTCCAAACTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201515 GGAAGAAGAATGGTGGATGTTCCTGTGACGTCAACTGGAGTCCAAACTGA
2450 . : . : . : . : . :
2424 TGCAGTCAGCGGTGAAGCAGCAGAGGAAGAAACGCCAGCTGTATTCATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201565 TGCAGTCAGCGGTGAAGCAGCAGAGGAAGAAACGCCAGCTGTATTCATAC
2500 . : . : . : . : . :
2474 GGAAATCCTTCCAGGAAGAAAATCATATTATGAGTAATCTTCGGCAGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201615 GGAAATCCTTCCAGGAAGAAAATCATATTATGAGTAATCTTCGGCAGGTG
2550 . : . : . : . : . :
2524 GGATTGAAGAAACCCGTGGAAAGATCTTCTGTTCTAGACAGGTATCCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201665 GGATTGAAGAAACCCGTGGAAAGATCTTCTGTTCTAGACAGGTATCCTCC
2600 . : . : . : . : . :
2574 AGCAGCAAATGAGCTCACTATGAGAAAGTCTTGGATTCCATGGATGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201715 AGCAGCAAATGAGCTCACTATGAGAAAGTCTTGGATTCCATGGATGAGAA
2650 . : . : . : . : . :
2624 AGAGGGAAAACGGCCCCTCCATCACTCAGGAGAAAGGGCCCCGAACAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201765 AGAGGGAAAACGGCCCCTCCATCACTCAGGAGAAAGGGCCCCGAACAAAT
2700 . : . : . : . : . :
2674 TCCAGTCCAGGGCACCCAGGAGAGGTAGTCCTTTCACCAAAGCAGGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201815 TCCAGTCCAGGGCACCCAGGAGAGGTAGTCCTTTCACCAAAGCAGGGCCA
2750 . : . : . : . : . :
2724 GCCCCTGCATATTCGAGTGACACCAGACCACGAGAACAGCACTGCGACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201865 GCCCCTGCATATTCGAGTGACACCAGACCACGAGAACAGCACTGCGACTT
2800 . : . : . : . : . :
2774 TGGAGATAACAAGCCCGACATCTGAAGAATTTTTTTCTAGTACCACTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201915 TGGAGATAACAAGCCCGACATCTGAAGAATTTTTTTCTAGTACCACTGTC
2850 . : . : . : . : . :
2824 ATTCCTACCTTAGGGAATCAGAAACCAAGAATAACCATTATTCCATCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201965 ATTCCTACCTTAGGGAATCAGAAACCAAGAATAACCATTATTCCATCACC
2900 . : . : . : . : . :
2874 AAACGTTATGCCTCAAAAACAAAAAAGTGGAGATACTACTCTTGGCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202015 AAACGTTATGCCTCAAAAACAAAAAAGTGGAGATACTACTCTTGGCCCAG
2950 . : . : . : . : . :
2924 AACGAGCCATGTCCCCAGTCACAATTACTACATTTTCCAGAGAGAAGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202065 AACGAGCCATGTCCCCAGTCACAATTACTACATTTTCCAGAGAGAAGACT
3000 . : . : . : . : . :
2974 CCAGAAAGTGGAAGAGGCGCATTTGCAGACAGGCCCACATCCCCTATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202115 CCAGAAAGTGGAAGAGGCGCATTTGCAGACAGGCCCACATCCCCTATTCA
3050 . : . : . : . : . :
3024 GATAATGACGGTGTCTACATCAGCAGCACCAGCTGAGATTGCAGTTTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202165 GATAATGACGGTGTCTACATCAGCAGCACCAGCTGAGATTGCAGTTTCTC
3100 . : . : . : . : . :
3074 CCGAATCCCAGGAAATGCCCATGGGACGGACAATCCTCAAAGTCACCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202215 CCGAATCCCAGGAAATGCCCATGGGACGGACAATCCTCAAAGTCACCCCA
3150 . : . : . : . : . :
3124 GAAAAACAGACTGTTCCAACTCCAGTACGGAAATACAACTCCAATGCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202265 GAAAAACAGACTGTTCCAACTCCAGTACGGAAATACAACTCCAATGCCAA
3200 . : . : . : . : . :
3174 TATCATAACCACAGAGGACAATAAAATTCACATTCACTTAGGGTCTCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202315 TATCATAACCACAGAGGACAATAAAATTCACATTCACTTAGGGTCTCAGT
3250 . : . : . : . : . :
3224 TCAAACGGTCCCCTGGGACTTCAGGTGAAGGAGTCAGTCCAGTTATTACT
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202365 TTAAACGGTCCCCTGGGACTTCAGGTGAAGGAGTCAGTCCAGTTATTACT
3300 . : . : . : . : . :
3274 GTCCGACCAGTAAACGTGACAGCCGAAAAGGGGGTTTCCACCGGCACTGT
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
202415 GTCCGACCAGTAAACGTGACAGCCGAAAAGGAGGTTTCCACCGGCACTGT
3350 . : . : . : . : . :
3324 CCTTCGCTCTCCCAGGAATCACCTCTCCTCACGGCCTGGTGCAAGCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202465 CCTTCGCTCTCCCAGGAATCACCTCTCCTCACGGCCTGGTGCAAGCAAAG
3400 . : . : . : . : . :
3374 TGACGAGCACTATCACCATAACACCGGTCACAACGTCATCTGCTCGAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202515 TGACGAGCACTATCACCATAACACCGGTCACAACGTCATCTGCTCGAGGA
3450 . : . : . : . : . :
3424 ACCCAGTCAGTG TCAGGACAAGACGGGTCATCCCAGCGGCC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
202565 ACCCAGTCAGTGGTG...CAGTCAGGACAAGACGGGTCATCCCAGCGGCC
3500 . : . : . : . : . :
3465 TACACCCACCCGCATTCCTATGTCAAAAG AAAGCATCATCA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
206105 TACACCCACCCGCATTCCTATGTCAAAAGGTA...TAGAAAGCATCATCA
3550 . : . : .
3506 TTCACCAGTTACGAATGAACTCCAGA
||||||||||||||||||||||||||
219035 TTCACCAGTTACGAATGAACTCCAGA