seq1 = pF1KA1248.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KA1248/gi568815584r_20917599.tfa (gi568815584r:20917599_21123315), 205717 bp

>pF1KA1248 1071
>gi568815584r:20917599_21123315 (Chr14)

(complement)

1-75  (100001-100075)   100% ->
76-181  (100819-100924)   100% ->
182-302  (101134-101254)   100% ->
303-365  (101437-101499)   100% ->
366-426  (102472-102532)   100% ->
427-513  (102734-102820)   100% ->
514-570  (103340-103396)   100% ->
571-674  (103574-103677)   100% ->
675-719  (104156-104200)   100% ->
720-771  (104502-104553)   100% ->
772-819  (104812-104859)   100% ->
820-855  (105077-105112)   100% ->
856-907  (105278-105329)   100% ->
908-1071  (105554-105717)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGCTGCAGGAGGTGCAGATCACAGAGGAGAAGCCACTGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGCTGCAGGAGGTGCAGATCACAGAGGAGAAGCCACTGTTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGACAGACGCCTGAGGCGGCCAAG         ACTCACTCTGTGGAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100051 AGGACAGACGCCTGAGGCGGCCAAGGTT...CAGACTCACTCTGTGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACCATACGGCTCTGTCACTTTCACTGTCTATGGCACCCCCAAACCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100835 CACCATACGGCTCTGTCACTTTCACTGTCTATGGCACCCCCAAACCCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGCCCAGCGATCCTTACCTACCACGATGTGGGACTCAACT         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100885 CGCCCAGCGATCCTTACCTACCACGATGTGGGACTCAACTGTA...TAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAAATCTTGCTTCCAGCCACTGTTTCAGTTCGAGGACATGCAGGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101135 TAAATCTTGCTTCCAGCCACTGTTTCAGTTCGAGGACATGCAGGAAATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCAGAACTTTGTGCGGGTTCATGTGGATGCCCCTGGAATGGAAGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101185 TTCAGAACTTTGTGCGGGTTCATGTGGATGCCCCTGGAATGGAAGAGGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCCCTGTGTTCCCTTTGGG         ATATCAGTACCCATCTCTGGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101235 GCCCCTGTGTTCCCTTTGGGGTA...CAGATATCAGTACCCATCTCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCAGCTTGCAGACATGATCCCTTGCGTCCTGCAGTACCTAAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101458 CCAGCTTGCAGACATGATCCCTTGCGTCCTGCAGTACCTAAAGTG...CA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    366  TTTCTCTACAATAATTGGAGTTGGTGTTGGAGCTGGAGCCTACATCCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102471 GTTTCTCTACAATAATTGGAGTTGGTGTTGGAGCTGGAGCCTACATCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCGAGATATGCT         CTTAACCACCCGGACACTGTTGAAGGTCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 102521 GCGAGATATGCTGTA...CAGCTTAACCACCCGGACACTGTTGAAGGTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGTCCTCATCAACATTGATCCCAATGCCAAGGGTTGGATGGATTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102763 TGTCCTCATCAACATTGATCCCAATGCCAAGGGTTGGATGGATTGGGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCCACAAG         CTAACAGGCCTCACCTCTTCCATTCCGGAGATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102813 CCCACAAGGTT...TAGCTAACAGGCCTCACCTCTTCCATTCCGGAGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ATCCTTGGACATCTTTTCAGCCAG         GAAGAGCTCTCTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103373 ATCCTTGGACATCTTTTCAGCCAGGTA...CAGGAAGAGCTCTCTGGAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TTCTGAGTTGATACAAAAGTACAGAAATATCATTACACATGCACCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103591 TTCTGAGTTGATACAAAAGTACAGAAATATCATTACACATGCACCCAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TGGATAACATTGAATTGTACTGGAACAGCTACAACAA         CCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103641 TGGATAACATTGAATTGTACTGGAACAGCTACAACAAGTG...TAGCCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 CGAGACCTGAACTTTGAGCGTGGAGGTGATATCACCCTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 104160 CGAGACCTGAACTTTGAGCGTGGAGGTGATATCACCCTCAGGTA...TAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 GTGTCCTGTGATGCTGGTGGTAGGAGACCAAGCACCTCATGAAGATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104502 GTGTCCTGTGATGCTGGTGGTAGGAGACCAAGCACCTCATGAAGATGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 TG         GTGGAATGTAACTCAAAACTGGACCCCACCCAGACCTCG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104552 TGGTT...CAGGTGGAATGTAACTCAAAACTGGACCCCACCCAGACCTCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 TTCCTCAAG         ATGGCTGACTCCGGAGGTCAGCCCCAGCTGAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 104851 TTCCTCAAGGTC...CAGATGGCTGACTCCGGAGGTCAGCCCCAGCTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    852 TCAG         CCAGGCAAGCTGACCGAGGCCTTCAAGTACTTCCTGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105109 TCAGGTG...CAGCCAGGCAAGCTGACCGAGGCCTTCAAGTACTTCCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    893 AAGGCATGGGCTACA         TGGCCTCATCCTGCATGACTCGCCTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105315 AAGGCATGGGCTACAGTG...CAGTGGCCTCATCCTGCATGACTCGCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    934 TCCCGGTCTCGTACAGCCTCTCTGACCAGTGCAGCATCCGTTGATGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105580 TCCCGGTCTCGTACAGCCTCTCTGACCAGTGCAGCATCCGTTGATGGCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    984 CCGGTCCCGCTCTCGCACCCTGTCCCAGAGCAGCGAGTCTGGAACTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105630 CCGGTCCCGCTCTCGCACCCTGTCCCAGAGCAGCGAGTCTGGAACTCTTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1034 CTTCGGGGCCCCCGGGGCACACCATGGAGGTCTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105680 CTTCGGGGCCCCCGGGGCACACCATGGAGGTCTCCTGT