Result of SIM4 for
pF1KA1230
seq1 = pF1KA1230.tfa, 3033 bp
seq2 = pF1KA1230/gi568815586f_27533397.tfa (gi568815586f:27533397_27792879), 259483 bp
>pF1KA1230 3033
>gi568815586f:27533397_27792879 (Chr12)
1-64 (100001-100064) 100% ->
65-270 (101514-101719) 100% ->
271-362 (112666-112756) 97% ->
363-471 (114338-114446) 99% ->
472-603 (116614-116745) 100% ->
604-696 (121326-121418) 100% ->
697-789 (121747-121839) 100% ->
790-904 (123220-123334) 100% ->
905-966 (127488-127549) 100% ->
967-1042 (130966-131041) 100% ->
1043-1197 (133770-133924) 100% ->
1198-1313 (138035-138150) 100% ->
1314-1370 (139031-139087) 100% ->
1371-1431 (140371-140431) 100% ->
1432-1461 (140796-140825) 100% ->
1462-1633 (143032-143203) 100% ->
1634-1784 (146093-146243) 100% ->
1785-1913 (146537-146665) 100% ->
1914-2064 (148150-148300) 100% ->
2065-2176 (148991-149102) 100% ->
2177-2265 (149219-149307) 100% ->
2266-2388 (153989-154111) 100% ->
2389-2514 (154902-155027) 100% ->
2515-2703 (155619-155807) 100% ->
2704-2883 (158353-158532) 100% ->
2884-2949 (159195-159260) 100% ->
2950-3033 (159400-159483) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGATGAGTGATGCAAGTGACATGTTGGCTGCAGCGTTGGAGCAGATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGATGAGTGATGCAAGTGACATGTTGGCTGCAGCGTTGGAGCAGATGGA
50 . : . : . : . : . :
51 TGGTATCATAGCAG GTTCTAAGGCTCTGGAATATTCCAATG
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
100051 TGGTATCATAGCAGGTG...TAGGTTCTAAGGCTCTGGAATATTCCAATG
100 . : . : . : . : . :
92 GGATTTTTGATTGCCAATCTCCCACCTCTCCATTCATGGGAAGTTTGCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101541 GGATTTTTGATTGCCAATCTCCCACCTCTCCATTCATGGGAAGTTTGCGA
150 . : . : . : . : . :
142 GCTCTGCACCTTGTGGAAGACCTGCGTGGATTGTTAGAGATGATGGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101591 GCTCTGCACCTTGTGGAAGACCTGCGTGGATTGTTAGAGATGATGGAAAC
200 . : . : . : . : . :
192 AGATGAGAAAGAAGGCTTGAGATGCCAGATCCCAGATTCAACAGCAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101641 AGATGAGAAAGAAGGCTTGAGATGCCAGATCCCAGATTCAACAGCAGAAA
250 . : . : . : . : . :
242 CGCTTGTTGAATGGCTTCAGAGTCAAATG ACAAATGGACAC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
101691 CGCTTGTTGAATGGCTTCAGAGTCAAATGGTA...CAGACAAATGGACAC
300 . : . : . : . : . :
283 CTACCAGGGAACGGAGATGTGTATCAAGAAAGGCTGGCACGTTTAGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112678 CTACCAGGGAACGGAGATGTGTATCAAGAAAGGCTGGCACGTTTAGAAAA
350 . : . : . : . : . :
333 TGATAAAGAATCCCTCGTTCTTCAGGTAAG TGTGTTAACAG
|||||||||||||||||||||||||| ||->>>...>>>|||||||||||
112728 TGATAAAGAATCCCTCGTTCTTCAGGCAA GTG...AAGTGTGTTAACAG
400 . : . : . : . : . :
374 ACCAGGTGGAGGCTCAGGGAGAGAAGATTCGAGATTTGGAGTTTTGTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114349 ACCAGGTGGAGGCTCAGGGAGAGAAGATTCGAGATTTGGAGTTTTGTCTT
450 . : . : . : . : . :
424 GAAGAGCACAGAGAGAAGTTGAATGCCACAGAAGAAATGCTGCAGCAG
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||>>
114399 GAAGAGCACAGAGAGAAGGTGAATGCCACAGAAGAAATGCTGCAGCAGGT
500 . : . : . : . : . :
472 GAGCTTCTAAGTAGGACATCCTTAGAAACTCAGAAGTTGGATC
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114449 A...TAGGAGCTTCTAAGTAGGACATCCTTAGAAACTCAGAAGTTGGATC
550 . : . : . : . : . :
515 TGATGGCTGAAATATCTAACTTGAAGTTGAAACTGACAGCTGTAGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116657 TGATGGCTGAAATATCTAACTTGAAGTTGAAACTGACAGCTGTAGAGAAG
600 . : . : . : . : . :
565 GACAGATTGGATTATGAAGATAAGTTCAGAGACACAGAG GG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
116707 GACAGATTGGATTATGAAGATAAGTTCAGAGACACAGAGGTG...CAGGG
650 . : . : . : . : . :
606 GCTGATTCAGGAGATCAATGATTTGAGGTTAAAAGTTAGTGAAATGGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121328 GCTGATTCAGGAGATCAATGATTTGAGGTTAAAAGTTAGTGAAATGGACA
700 . : . : . : . : . :
656 GTGAGAGACTTCAGTATGAAAAAAAGCTTAAATCAACCAAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
121378 GTGAGAGACTTCAGTATGAAAAAAAGCTTAAATCAACCAAAGTA...CAG
750 . : . : . : . : . :
697 TCTTTAATGGCCAAACTTTCTAGCATGAAAATCAAGGTGGGTCAGATGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121747 TCTTTAATGGCCAAACTTTCTAGCATGAAAATCAAGGTGGGTCAGATGCA
800 . : . : . : . : . :
747 GTATGAAAAGCAGCGGATGGAACAAAAATGGGAGTCACTGAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
121797 GTATGAAAAGCAGCGGATGGAACAAAAATGGGAGTCACTGAAGGTG...T
850 . : . : . : . : . :
790 GATGAACTGGCATCTTTAAAAGAACAACTAGAAGAAAAGGAATCTGAA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123218 AGGATGAACTGGCATCTTTAAAAGAACAACTAGAAGAAAAGGAATCTGAA
900 . : . : . : . : . :
838 GTAAAAAGGCTACAAGAAAAATTGGTTTGCAAGATGAAAGGAGAAGGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123268 GTAAAAAGGCTACAAGAAAAATTGGTTTGCAAGATGAAAGGAGAAGGGGT
950 . : . : . : . : . :
888 TGAAATTGTTGATAGAG ACATCGAAGTACAAAAAATGAAAA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
123318 TGAAATTGTTGATAGAGGTA...CAGACATCGAAGTACAAAAAATGAAAA
1000 . : . : . : . : . :
929 AAGCTGTGGAGTCCTTGATGGCAGCAAATGAAGAAAAG GAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
127512 AAGCTGTGGAGTCCTTGATGGCAGCAAATGAAGAAAAGGTA...TAGGAT
1050 . : . : . : . : . :
970 CGGAAAATAGAAGATCTTCGACAGTGCCTGAACAGGTACAAGAAAATGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130969 CGGAAAATAGAAGATCTTCGACAGTGCCTGAACAGGTACAAGAAAATGCA
1100 . : . : . : . : . :
1020 AGACACGGTGGTACTGGCCCAAG GCAAAGATGGAGAATATG
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
131019 AGACACGGTGGTACTGGCCCAAGGTA...TAGGCAAAGATGGAGAATATG
1150 . : . : . : . : . :
1061 AAGAGCTGCTCAATTCCAGTTCCATCTCCTCTTTGCTGGATGCACAGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133788 AAGAGCTGCTCAATTCCAGTTCCATCTCCTCTTTGCTGGATGCACAGGGT
1200 . : . : . : . : . :
1111 TTCAGTGATCTGGAGAAAAGTCCATCACCCACTCCAGTAATGGGATCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133838 TTCAGTGATCTGGAGAAAAGTCCATCACCCACTCCAGTAATGGGATCTCC
1250 . : . : . : . : . :
1161 CAGTTGTGACCCATTTAACACAAGTGTTCCCGAAGAG TTCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
133888 CAGTTGTGACCCATTTAACACAAGTGTTCCCGAAGAGGTA...CAGTTCC
1300 . : . : . : . : . :
1202 ATACTACCATCTTGCAAGTTTCCATCCCTTCATTATTGCCAGCAACTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138039 ATACTACCATCTTGCAAGTTTCCATCCCTTCATTATTGCCAGCAACTGTA
1350 . : . : . : . : . :
1252 AGCATGGAAACTTCTGAAAAATCAAAGTTGACTCCTAAGCCAGAGACTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138089 AGCATGGAAACTTCTGAAAAATCAAAGTTGACTCCTAAGCCAGAGACTTC
1400 . : . : . : . : . :
1302 ATTTGAAGAAAA TGATGGAAACATAATCCTTGGTGCCACTG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
138139 ATTTGAAGAAAAGTA...TAGTGATGGAAACATAATCCTTGGTGCCACTG
1450 . : . : . : . : . :
1343 TTGATACCCAACTGTGTGATAAACTTTT AACTTCAAGTCTG
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
139060 TTGATACCCAACTGTGTGATAAACTTTTGTA...TAGAACTTCAAGTCTG
1500 . : . : . : . : . :
1384 CAGAAGTCCAGCAGCCTGGGCAATCTGAAGAAAGAGACATCTGATGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
140384 CAGAAGTCCAGCAGCCTGGGCAATCTGAAGAAAGAGACATCTGATGGGGT
1550 . : . : . : . : . :
1432 GAAAAGGAAACTATTCAGAAGACTTCAGAG GACA
>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
140434 G...CAGGAAAAGGAAACTATTCAGAAGACTTCAGAGGTA...CAGGACA
1600 . : . : . : . : . :
1466 GAGCTCCGGCAGAAAGCAGGCCATTTGGGACCCTTCCTCCCAGGCCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143036 GAGCTCCGGCAGAAAGCAGGCCATTTGGGACCCTTCCTCCCAGGCCCCCA
1650 . : . : . : . : . :
1516 GGGCAGGACACCTCCATGGATGACAACCCCTTCGGCACTCGAAAAGTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143086 GGGCAGGACACCTCCATGGATGACAACCCCTTCGGCACTCGAAAAGTCAG
1700 . : . : . : . : . :
1566 ATCTTCCTTTGGCCGGGGCTTTTTTAAAATCAAAAGTAACAAGAGAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143136 ATCTTCCTTTGGCCGGGGCTTTTTTAAAATCAAAAGTAACAAGAGAACAG
1750 . : . : . : . : . :
1616 CAAGTGCACCAAACTTAG CTGAAACAGAAAAAGAGACAGCA
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
143186 CAAGTGCACCAAACTTAGGTA...TAGCTGAAACAGAAAAAGAGACAGCA
1800 . : . : . : . : . :
1657 GAGCACCTAGATCTGGCTGGTGCTTCTTCTCGGCCAAAAGATTCACAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146116 GAGCACCTAGATCTGGCTGGTGCTTCTTCTCGGCCAAAAGATTCACAGAG
1850 . : . : . : . : . :
1707 GAACAGTCCCTTCCAGATACCGCCTCCATCTCCAGATTCCAAAAAGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146166 GAACAGTCCCTTCCAGATACCGCCTCCATCTCCAGATTCCAAAAAGAAAT
1900 . : . : . : . : . :
1757 CCAGAGGTATCATGAAACTCTTTGGAAA ACTTAGGAGAAGT
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
146216 CCAGAGGTATCATGAAACTCTTTGGAAAGTA...TAGACTTAGGAGAAGT
1950 . : . : . : . : . :
1798 CAATCAACTACATTCAACCCAGATGACATGTCTGAGCCTGAATTCAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146550 CAATCAACTACATTCAACCCAGATGACATGTCTGAGCCTGAATTCAAAAG
2000 . : . : . : . : . :
1848 AGGAGGGACAAGGGCAACCGCGGGGCCCCGATTAGGTTGGTCTCGAGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146600 AGGAGGGACAAGGGCAACCGCGGGGCCCCGATTAGGTTGGTCTCGAGACT
2050 . : . : . : . : . :
1898 TGGGACAGTCTAACAG TGACTTGGATATGCCATTTGCCAAG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
146650 TGGGACAGTCTAACAGGTA...TAGTGACTTGGATATGCCATTTGCCAAG
2100 . : . : . : . : . :
1939 TGGACCAAGGAGCAGGTTTGCAATTGGCTGATGGAACAGGGCTTGGGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148175 TGGACCAAGGAGCAGGTTTGCAATTGGCTGATGGAACAGGGCTTGGGCTC
2150 . : . : . : . : . :
1989 GTACCTGAATTCTGGCAAGCACTGGATTGCATCTGGCCAAACGCTTTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148225 GTACCTGAATTCTGGCAAGCACTGGATTGCATCTGGCCAAACGCTTTTGC
2200 . : . : . : . : . :
2039 AGGCTTCTCAACAAGATCTAGAGAAG GAACTTGGAATCAAG
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
148275 AGGCTTCTCAACAAGATCTAGAGAAGGTG...CAGGAACTTGGAATCAAG
2250 . : . : . : . : . :
2080 CATTCACTTCATCGAAAGAAACTCCAGCTAGCACTCCAAGCCCTGGGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149006 CATTCACTTCATCGAAAGAAACTCCAGCTAGCACTCCAAGCCCTGGGATC
2300 . : . : . : . : . :
2130 TGAAGAAGAAACCAATCATGGGAAGCTGGATTTCAACTGGGTCACTA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
149056 TGAAGAAGAAACCAATCATGGGAAGCTGGATTTCAACTGGGTCACTAGTA
2350 . : . : . : . : . :
2177 GATGGTTGGATGACATTGGCCTCCCTCAATATAAGACCCAGTTT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149106 ...TAGGATGGTTGGATGACATTGGCCTCCCTCAATATAAGACCCAGTTT
2400 . : . : . : . : . :
2221 GATGAAGGACGGGTTGATGGTCGAATGCTACATTACATGACTGTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
149263 GATGAAGGACGGGTTGATGGTCGAATGCTACATTACATGACTGTTGTA..
2450 . : . : . : . : . :
2266 GATGACTTACTGTCTCTGAAGGTTGTAAGTGTGCTACACCATCTCA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149313 .CAGGATGACTTACTGTCTCTGAAGGTTGTAAGTGTGCTACACCATCTCA
2500 . : . : . : . : . :
2312 GTATCAAAAGGGCCATCCAGGTCCTGAGGATCAATAACTTTGAACCAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154035 GTATCAAAAGGGCCATCCAGGTCCTGAGGATCAATAACTTTGAACCAAAC
2550 . : . : . : . : . :
2362 TGTCTACGGAGGCGGCCATCTGATGAG AATACCATCGCCCC
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
154085 TGTCTACGGAGGCGGCCATCTGATGAGGTA...TAGAATACCATCGCCCC
2600 . : . : . : . : . :
2403 ATCAGAAGTTCAGAAGTGGACTAACCATCGAGTGATGGAGTGGCTGCGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154916 ATCAGAAGTTCAGAAGTGGACTAACCATCGAGTGATGGAGTGGCTGCGCT
2650 . : . : . : . : . :
2453 CCGTGGACTTGGCAGAATATGCGCCCAATCTCAGAGGCAGTGGTGTCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154966 CCGTGGACTTGGCAGAATATGCGCCCAATCTCAGAGGCAGTGGTGTCCAT
2700 . : . : . : . : . :
2503 GGTGGGCTCATG GTTCTAGAGCCTCGTTTTAACGTAGAAAC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
155016 GGTGGGCTCATGGTA...CAGGTTCTAGAGCCTCGTTTTAACGTAGAAAC
2750 . : . : . : . : . :
2544 AATGGCTCAGTTATTGAACATCCCACCCAATAAGACTTTGCTGCGAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155648 AATGGCTCAGTTATTGAACATCCCACCCAATAAGACTTTGCTGCGAAGAC
2800 . : . : . : . : . :
2594 ATTTGGCCACTCATTTCAACCTTCTGATTGGGGCTGAGGCACAGCACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155698 ATTTGGCCACTCATTTCAACCTTCTGATTGGGGCTGAGGCACAGCACCAG
2850 . : . : . : . : . :
2644 AAGCGAGATGCCATGGAGCTGCCGGATTATGTACTTCTAACAGCTACTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155748 AAGCGAGATGCCATGGAGCTGCCGGATTATGTACTTCTAACAGCTACTGC
2900 . : . : . : . : . :
2694 CAAAGTGAAG CCAAAGAAACTTGCCTTTAGCAATTTTGGGA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
155798 CAAAGTGAAGGTT...AAGCCAAAGAAACTTGCCTTTAGCAATTTTGGGA
2950 . : . : . : . : . :
2735 ATTTGAGAAAGAAGAAACAGGAAGATGGTGAAGAATATGTTTGTCCAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158384 ATTTGAGAAAGAAGAAACAGGAAGATGGTGAAGAATATGTTTGTCCAATG
3000 . : . : . : . : . :
2785 GAATTGGGACAGGCATCAGGAAGTGCATCTAAGAAAGGATTTAAACCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158434 GAATTGGGACAGGCATCAGGAAGTGCATCTAAGAAAGGATTTAAACCTGG
3050 . : . : . : . : . :
2835 TTTGGATATGCGCCTGTATGAGGAAGATGATTTGGACCGGTTAGAGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
158484 TTTGGATATGCGCCTGTATGAGGAAGATGATTTGGACCGGTTAGAGCAGG
3100 . : . : . : . : . :
2884 ATGGAAGATTCAGAAGGGACAGTGAGACAGATAGGTGCATTC
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158534 TA...CAGATGGAAGATTCAGAAGGGACAGTGAGACAGATAGGTGCATTC
3150 . : . : . : . : . :
2926 TCTGAAGGCATCAACAATCTGACG CACATGTTAAAAGAAGA
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
159237 TCTGAAGGCATCAACAATCTGACGGTG...CAGCACATGTTAAAAGAAGA
3200 . : . : . : . : . :
2967 TGACATGTTTAAAGATTTTGCTGCCCGTTCCCCCAGTGCCAGCATTACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159417 TGACATGTTTAAAGATTTTGCTGCCCGTTCCCCCAGTGCCAGCATTACAG
3250 . : .
3017 ATGAAGACTCAAACGTT
|||||||||||||||||
159467 ATGAAGACTCAAACGTT